Bioqumica

Ciencia que estudia las bases qumicas de la vida .Ciencia que se encarga del estudio de los constituyentes qumicos de las
clulas vivas y las reacciones o procesos a los que son sometidos
Metabolismo
Metabolismo celular: Grupo de reacciones qumicas que conllevan a la sntesis y degradacin de macromolculas en el
interior celular (metabolismo celular)
Metabolismo intermediario: Destino de los componentes de la dieta despues de la digestin y absorcin (varios
intermediarios de modo escalonado)
utas Metabolicas
!ecuencia de reacciones qumicas consecutivas catali"adas en"im#ticamente
Catablica
$Degradacin$%&ergnicas
'nablica
$!ntesis $%ndergnica
'n(iblica
$%ncruci)adas metablicas
*rimera ley de la termodinamica
obert Mayer +,-+
.a energa no puede ser creada ni destruida. %n cualquier proceso (sico o qumico la energa total del sistema m#s el medio
(energa total del universo) permanece constante.
/ioenergetica.
0uncin de estado
!istema
%ntorno
1niverso
primera ley de la termodinamica
%nerga 1niverso 2 %nerga sistema 3 %nerga entorno
%nerga permanece constante
%nerga se trans(orma de una clase a otra4 se trans(iere de un sistema a su entorno y viceversa
%nerga total de un sistema (%t) 2 %c 3 %p 3 1
%t 2 1
51 2 q 6 7
7 2 p 58
51 2 q 6 p 58
51 3 p 58 2 q
Cambio calrico ocurrido a presin constante se denomina %9:'.*;' (<)
5< 2 51 3 p 58
%ntalpa: Cantidad de calor absorbido durante un proceso qumico medido a presin constante.
%&otrmica: 5< negativa4 libera calor
%ndotrmica: 5< positiva 4 absorbe calor
!%G19D' .%= D% .' :%M>D;9'M;C'
?:odo proceso termodin#micamente (avorable (espont#neo) tiende a aumentar la entropa del universo@
%9:>*;' (!): De(inida como desorden4 a mayor entropa4 mayor desorden molecular.
5!universo 2 5!sistema 3 5!entorno A
*roporciona un criterio para predecir la direccin de cualquier proceso
%quilibrio: %stado de m#&ima entropa
5! di(cil de cuanti(icar
5! relacionada con la variacin de la energa interna por medio de la %9%G;' .;/% D% G;//! (G)
BG 2 B< 6 (: & B!)
BG 2 %nerga disponible para reali"ar traba)o biolgico
B! 2 %nerga utili"ada para reali"ar traba)o entrpico (aumentar entropa del universo)
%nergia libre de G;//!
%st#ndar:
Haga clic
para
modificar
el estilo
de texto
del patrn
Segundo
nivel
Tercer nivel
Cuarto nivel
Quinto nivel
:emperatura: CD EC 2 CF, EG
*resin 2 + atms(era 2 HIA mm<g
Concentraciones de sustancias en disolucin 2 + Molar
p< 2 A
!e denota BGE
*ropio de cada reaccin
%st#ndar
BGE negativo 2 %&ergnica
!entido directo de la reaccin espont#neo
BGE positivo 2 %ndergnico
!entido inverso de la reaccin espont#neo
%st#ndar biolgico p< 2 H !e denota BGEJ
eal
Concentraciones en condiciones reales
BGreal
BG 2 BGE 3 C4AKAK : log L*DMnNL*;Mm
BG 2 BGE 3 +KI- log L*DMnNL*;Mm
BG 2 BGE 3 +KI- log O
9os permite predecir el sentido de la reaccin que se est# reali"ando
estado estacionario
%stado din#mico en el que las concentraciones de las sustancias pertenecientes al sistema permanecen constantes pero con
valores di(erentes a los del estado de equilibrio.
<ay energa disponible para reali"ar traba)o biolgico4 di(erente a lo que ocurre en equilibrio.
eacciones bioquimicas
eversibles: .os reactivos originan los productos y estos4 una ve" (ormados pueden regenerar los reactivos de partida
;rreversibles: .os reactivos originan los productos y estos4 una ve" (ormados no pueden regenerar los reactivos
Cercanas y ale)adas del equilibrio
compuestos ricos en energia
;ntermediarios metablicos cuyo potencial de trans(erencia de grupo es in(erior a $H GcalNmol
*otencial de trans(erencia de grupo: Cantidad de energa libre que el compuesto es capa" de ceder a otra sustancia )unto con
el grupo trans(erido
clasi(icacion
P0os(oanQdridos
$':*4 G:*4 1:*4 C:*
P'cil(os(atos
$+4K$bis(os(oglicerato
P%nol(os(atos
$0os(oenolpiruvato
P0os(oguanidas
$Creatn (os(ato ((os(#geno)
P:rans(eridores de grupos acilos
$Derivados de Co' (ormados por enlaces tiol$ester
P:rans(eridores de grupos metilos
$!$'denosil$metionina
':*
*otencial de trans(erencia de grupos vara segRn la reaccin de trans(erencia
*otencial de trans(erencia de grupo (os(ato: %nerga libre que el compuesto es capa"
de ceder a otra sustancia )unto con el grupo trans(erido.
1,3 bisfosfoglicerato
BGEJ 2 $++4, GcalNmol
BGEJ 2 $C4C GcalNmol
0os(ato en posicin K puede adquirir el mismo
nRmero de (ormas resonantes que el (os(ato libre
.a carga residual negativa del o&geno del grupo carbonilo carga positivamente
el carbono el cual succiona electrones del o&geno comRn con el (os(ato
Fosfoenolpiruvato
BGEJ 2 $+-4, GcalNmol
0os(orilacin de grupo enol impide la (ormacin de grupo ceto m#s estable
%nlace (os(oenlico impide resonancia del (os(ato
Compuestos ricos energa como marcadores de destino metablico
PMarcadores del proceso metablico al que se destina un sustrato
P'ctivacin de #cidos grasos a 'cilCoa
$econocimiento de en"imas espec(icas
$1tili"acin de energa del enlace
P'ctivacin de amino#cidos a aminoacil$'M* previo a la (ormacin de enlace peptdico
P1nin de monosac#ridos a 1D* y GD* para activarlos y ser reconocidos por sus en"imas.
Enzimas
P*rotenas activas sinteti"adas por la clula con la (uncin de catali"ar reacciones qumicas
P9ecesidad celular de catali"adores
P'(ectan la velocidad de reaccin de una reaccin mas no modi(ican la constante de equilibrio ni las caractersticas
termodin#micas del sistema
P9o se modi(ican una ve" (inali"ada la reaccin
P8elocidad de reaccin:
$Cantidad de material inicial (sustrato)4 trans(ormado en compuesto (inal (producto) por unidad de tiempo
en"ima
!ustrato S producto
Caractersticas generales
PConstituidas por mas de +AA amino#cidos
PDisminuyen la energa de activacin
P!e requieren mnimas cantidades
PCapacidad de regulacin
P'lta especi(icidad molecular
$!itio de unin del sustrato
$!itio cataltico
$!itio alostrico
Sitio de union al sustrato
%speci(icidad con respecto al sustrato (absoluta y relativa)
!itios de unin en la super(icie de la en"ima
!itios de unin se (orman con la estructura terciaria de la en"ima
!uper(icie ideal para unir un sustrato
S!" C#!#$!C"
!itio activo
esponsable de la accin biolgica de la en"ima
;ntegrado o contiguo al sitio de unin aunque tambin puede estar ale)ado.
Contiene grupos qumicos implicados en la cat#lisis
%"&E$"S &E '("( E()%# S'S!*#!"
PModelo de la llave y cerradura
PModelo del a)uste inducido
%EC#(S%" &E #CC"( E()%#!C#
/arrera energtica entre sustrato y producto:
P%nerga requerida para:
$'lineamiento de grupos reaccionantes
$0ormacin de estados de transicin inestables
$0ormacin de enlaces
$>tras trans(ormaciones requeridas en cada reaccin espec(ica
*ara llevar a cabo la reaccin las molculas deben sobreponerse a esta barrera4 alcan"ando un estado de energa superior
E(E*+# &E #C!,#C"(
Di(erencia de energa entre el estado basal y el estado de transicin
' mayor energa de activacin menor velocidad de reaccin
.a en"imas actRan disminuyendo la energa de activacin
%EC#(S%" &E #CC"( E()%#!C#
*aso +: % 3 !
*aso C: %$!
*aso K: %;
*aso -: %*
*aso D: % 3 *
ES-ECFC&#& E()%#!C#
P'bsoluta: %n"ima acepta un solo sustrato
Pelativa: %n"ima puede aceptar m#s de un sustrato
PDe (uncin: 1n mismo compuesto puede ser sustrato de varias en"imas que lo modi(ican de di(erente (orma. Di(erente
sitio cataltico
P'bsoluta
D$Glucosa D$Glucosa I$*
Pelativa
D$Glucosa D$Glucosa I$*
D$Manosa D$Manosa I$*
D$0ructosa D$0ructosa I$*
C.'!;0;C'C;>9 D% .'! %9T;M'!
+.$>&ido$reductasas
C.$ :rans(erasas
K.$ <idrolasas
-.$ .iasas (.iberacin de grupos4 (ormando dobles enlaces)
D.$ ;somerasas
I.$ .igasas (1nin de molculas con Qidrlisis de ':*)
".ido/reductasas
!(')reducido !(/)o&idado S!(')o&idado !(/)reducido
!*#(SFE*#S#S
!(')$G 3 !(/) S !(') 3 !(/)$G
0&*"$#S#S
'$/ 3 <C> S '$< 3 /$><
$#S#S
CU$C= S U$= 3 C2C
$+#S#S
1nin de dos molculas acoplada a la Qidrlisis de un enlace del ':*
C(E!C# 1'%C#
P%studia la velocidad de reaccin y los (actores que la determinan en una reaccin qumica
P8elocidad de reaccin
$apide" con que se consume un sustrato
$apide" con que se (orma un producto
P*rimer orden
Depende de un solo sustrato
P!egundo orden
Depende de dos sustratos
P>rden cero
%s independiente de la concentracin de sustrato
A =
Sustrato
B=
Producto
P8%.>C;D'D :'/'V>
82 3 d (productos) 82 $ d (reactantes)
dt dt
8%.>C;D'D 8%.>C;D'D
'*';C;>9 D%!'*';C;>9
P8%.>C;D'D D% 19' %'CC;>9 W1;M;C' %! D;%C:'M%9:% *>*>C;>9'. ' .' C>9C%9:'C;>9
(L M) D% .>! %'CC;>9'9:%! (!1!:':>) : .%= D% 'CC;>9 D% M'!'!
S+(FC#&" &E 2m
PConcentracin de sustrato necesaria para alcan"ar la mitad de la velocidad m#&ima
PConstante de a(inidad
PCaracterstica de una en"ima y particular para un sustrato
P9o vara con la concentracin de la en"ima
-rocesos que regulan la velocidad de una reaccin en medios biolgicos
Pp< P:emperatura PConcentracin de sustrato PConcentracin de en"ima P;nQibidores
in3ibidor enzimatico
;nQibidores
P'(ectan la cintica de la reaccin en"im#tica
PDisminuyen la velocidad de la reaccin por
$;nter(erir con la unin del sustrato a la en"ima
$;nter(erir con la con(ormacin de la en"ima
$;nter(erir con el comple)o en"ima sustrato
!ipos de in3ibidores
P;rreversibles
Peversibles
$Competitivo
$9o competitivo
$'competitivo
Inhibicion enzimatica
Pcompetitiva. P no competitiva. P acompetitiva.
Inhibicion competitiva
%structura del inQibidor similar a la del sustrato
Competencia por el sitio de unin al sustrato
'umento aparente de la Gm
Disminucin de la a(inidad por el sustrato
8ma& no se modi(ica.
Inhicion no competitiva
9o compiten el sustrato y el inQibidor
9o Qay relacin estructural entre el sustrato y el inQibidor
1nin a un sitio distinto al sitio de unin del sustrato
Disminucin de la 8ma&
Gm se mantiene igual
Inhibicion acompetitiva
!e une solo al comple)o en"ima sustrato
Comple)o (ormado no se trans(orma en producto
Disminucin de Gm
Disminucin de 8ma&