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Bioqumica
Universitat de Valncia
Curso 2004-05
1o de Qumica, Grupo E
Prof.: Jess Salgado Benito
http://www.uv.es/salgado/bioquimica/
De Biologa General
Molculas sillares: aminocidos, nucletidos, cidos grasos y azcares
La clula. Clulas procariotas y eucariotas. Orgnulos principales de las
clulas eucariotas
Examen en Abril
Temas 7-12
Bioenergtica
Metabolismo
Examen en Junio
Evaluacin
Exmenes
Mnimo para aprobar: 5 puntos sobre 10
Examen
Eval. Continua
Final
(6x0.6)+(5x0.4)=3,6+2=5,6
(6x0.6)+(7x0.4)=3,6+2,8=6,4
6,4
(6x0.6)+(9x0.4)=3,6+3,6=7,2
7,2
10
(6x0.6)+(10x0.4)=3,6+4=7,4
7,4
Biomolculas
Grupos funcionales
Tipos de biomolculas
Monmeros
Macromolculas
Aminocidos y protenas
Azcares
Monosacridos y
polisacridos
Qu es la Bioqumica?
La Bioqumica estudia las bases moleculares de
la vida
Composicin qumica de las formas de vida y su
funcionamiento
Pretende resolver preguntas fundamentales
Qu es la vida? Origen de la vida
Biomedicina, Biotecnologa
Qu es la Vida?
Unidad dentro de la diversidad
Todos organismos vivos
Se componen de las misma clase de molculas (molculas
biolgicas)
Funcionan de manera semejante
Responden a las mismas leyes Fsicas y Qumicas que rigen el
Universo
Organizacin
Jerrquica de
Organismos
Multicelulares
Sistema
(aparato digestivo)
rgano
(hgado)
Tejido
(tejido heptico)
Organismo
Clula
(hepatocito)
Orgnulo
(ncleo)
Molcula
(DNA)
tomo
(carbono)
Qu es la Vida?...
La clula es la unidad fundamental de
organizacin y funcionamiento de la vida
La vida necesita informacin biolgica
Necesaria para su organizacin, funcionamiento y
replicacin
Es una informacin estructural
Secuencia de los genes --> protenas --> funciones
Organismos Vivos
Todas las especies vivas se componen de
clulas
Tipos de clulas
Procariotas (sin ncleo)
Eucariotas (con ncleo y orgnulos celulares)
Tipos de organismos
Tres dominios
Bacterias
Arqueas
Eucariotas
11
La Clula Procariota
12
13
14
15
Biomolculas
Inorgnicas
Agua 50-95%
Iones (Na+, K+, Mg2+, Ca2+, ...) 1%
Orgnicas
Derivados de hidrocarburos
Combinaciones de carbono (principal), hidrgeno, oxgeno,
nitrgeno, fsforo y azufre.
Forman enlaces covalentes estables
Prof. J. Salgado (UVEG - 2005)
Familia
Estructura
Grupo
Alcoholes
R OH
Hidroxilo
Aldehdos
O
||
R C H
Carbonilo
Cetonas
O
||
.R C R
Carbonilo
cidos
O.
||.R C OH
Carboxilo
Aminas
R NH2
Amino
Amidas
O.
||...R C NH2
Amido
R SH
Tiol
O----||----R C O R
ster
Tioles
steres
Propiedades
17
Biomolculas Orgnicas
Monmeros
Aminocidos
grupo amino + carboxilo +
cadena lateral
Azcares sencillos
polihidroxialdehdos o
polihidroxicetonas
Macromolculas
Protenas
polmeros de aminocidos
Polisacridos
polmeros de
monosacridos
cidos grasos
cidos monocarboxlicos
con un nmero par de
tomos de carbono
Nucletidos
azcar (ribosa) + base
nitrogenada + fosfato
cidos Nucleicos
polmeros de nucletidos
DNA, RNA
18
Aminocidos y Protenas
Los aminocidos se distinguen por sus cadenas laterales
Naturaleza hidrofbica o hidroflica, tamao, grupos funcionales
20 -aminocidos formadores de protenas
Polipptido
Unin de varios aminocidos por enlaces peptdicos
Pptido: unos pocos aminocidos
poca riqueza estructural
19
Aminocidos y Protenas
Polipptido
Algunos -aminocidos
Enlaces peptdicos
Glutamina
Glicina
Valina
Fenilalanina
Lisina
Serina
Cadena polipeptdica
desplegada
Cadena plegada
20
Azcares
Monosacridos
Segn sean aldehdos o
cetonas:
Aldosas
Ribosa, glucosa, galactosa
Cetosa
Aldosa
Cetosas
Fructosa
D-Glucosa
Segn el nmero de
carbonos
Triosas
Tetrosas
Pentosas
Hexosas
Enlace
hemiacetlico
Formas lineales en
equilibrio con hemiacetales
cclicos
-D-Glucopiranosa
-D-Glucopiranosa
21
Disacridos y Polisacridos
Uniones por enlace glucosdico
Disacridos
Sacarosa, lactosa, maltosa
Oligosacridos
Rafinosa (trisacrido)
Polisacridos
Homopolisacridos
Heteropolisacridos
En pptidoglucanos
Glucosaminoglucanos
En glucoprotenas
Glucgeno
22
cidos Grasos
Saturados
Estearato
Cabeza
polar
Insaturados
Oleato
Cola hidrocarbonada
23
Lpidos
Triacilglicerol
Acilo 1
Fosfatidilcolina
(fosfolpido)
colina
Acilo 2
Glicerol
Colesterol
Acilo 3
Micela
Bicapa
24
cido ribonucleico
(RNA)
Ribosa
Adenina (A)
Guanina (G)
Pirimidinas
Timina (T)
Citosina (C)
Uracilo (U)
Enlace
fosfodister
3
Enlace
fosfodister
Nucletido
Adenosintrifosfato (ATP)
Ribosa
25
Distinta electronegatividad de
OeH
Molcula polar
Dipolos de enlace
+
Enlace de H
Dipolo neto
27
Tipos
Interacciones inicas
Enlaces de hidrgeno
Interacciones dipolares
Fuerzas de van der Waals
Interacciones hidrofbicas
28
Interacciones Inicas
Entre tomos o grupos
cargados
Atraccin entre iones de carga
opuesta
Repulsin entre iones de la
misma carga
Dependen de
En macromolculas, dan
lugar a puentes salinos
Estabilizan el plegamiento
Intervienen en interacciones
intermoleculares
Na+
Cl
Na+
Na+
Cargas
F=
Constante
dielctrica
del medio
COO Puente
salino
+
NH3
29
El Enlace de Hidrgeno
hidroxilo
dador y agua
aceptor
carbonilo
aceptor y
agua dador
carbonilo
aceptor y
amida dador
Grupos
complementar
ios de bases
de DNA
Dadores
H2O, OH, NH, NH2,
SH
Aceptores
Enlace de
hidrgeno
fuerte
Enlace de
hidrgeno
dbil
30
Interacciones Dipolares
Dbil
F 1/r3
Dipolo permanente
dipolo permanente
C=O
C=O
Dipolo permanente
dipolo inducido
C=O
Ms dbil
F 1/r5
Mucho ms
dbil
F 1/r6
31
Solapamiento de
nubes electrnicas:
Repulsin
Repulsin
A
0
Atraccin
Energa (KJ/mol)
Mxima atraccin
-1
A
0
0.2
atraccin
no
interaccin
Cerca:
Lejos:
B
0.4
r (nm)
0.6
0.8
32
Hielo:
Red rgida con nmero
mximo de enlaces de H
33
Disolucin de
iones en agua
Iones (electrolitos)
Se disuelven a travs de
esferas de solvatacin
Esfera de
solvatacin
Molculas polares
Se disuelven por interacciones
dipolo-dipolo y enlaces de
hidrgeno
Molculas hidrfobas
(apolares)
No se disuelven en agua
Se agrupan entre ellas
El agua se organiza alrededor
de ellas formando un
clatrato (efecto hidrofbico)
Molculas de agua
del entorno
Estructura de un clatrato
Molculas de
agua muy
organizadas
Agrupacin de
molculas
hidrfobas
34
Tema 2
Aminocidos
Un -aminocido es un
cido carboxlico con un
grupo amino y un grupo
R en el carbono
R --> cadena lateral
Dos estereoismeros
posibles
Enantimeros L y D
Slo la forma L se
encuentra en protenas
L-Alanina
D-Alanina
Aminocidos
Estndar
Se representa
normalmente el estado
de protonacin a pH
7,0
Los aminocidos se
clasifican segn las
propiedades de sus
cadenas laterales (a pH
7,0)
Glicina
Fenilalanina
Alanina
Triptfano
Valina
Leucina
Metionina
Cisteina
Isoleucina
Prolina
Serina
Treonina
Aminocidos cidos
Tirosina
Asparagina
Glutamina
Aminocidos bsicos
Atencin a los
Glutamato
Lisina
Arginina
3
Histidina
Glicina
Gly, G
Alanina
Ala, A
Leucina
Leu, L
Metionina
Met, M
Cadena lateral
ciclada. Implica
restricciones
conformacionales
(Iminocido)
Valina
Val, V
Isoleucina
Ile, I
Prolina
Pro, P
4
Aminocidos Aromticos
No polar
(Hidrofbico)
Polar
Fenilalanina
Phe, F
Tirosina
Tyr, Y
No polar
(Hidrofbico)
Triptfano
Trp, W
5
Serina
Ser, S
Treonina
Thr, T
Tirosina
Tyr, Y
Asparagina
Asn, N
Cisteina
Cys, C
Puede
encontrarse
cargado a
pH>9
Puede
encontrarse
cargado a pH>8,5
Grupo -SH es
muy reactivo. Dos
molculas de Cys
se oxidan formado
cistina mediante
un puente
disulfuro (-S-S-).
Glutamina
Gln, Q
6
Se encuentra
cargado a pH<7
H+
Lisina
Lys, K
Arginina
Arg, R
Histidina
His, H
7
Aspartato
Asp, D
Glutamato
Glu, E
8
Aminocidos no Estndar
Aminocidos distintos de los 20 estndar y
derivados de stos realizan funciones
biolgicas importantes como mensajeros o
precursores
Neurotransmisores
-aminobutrico (GABA), derivado de la Gln
serotonina, derivado del Trp
Hormonas
tiroxina, derivado de la tirosina
cido indol actico, derivado del triptfano
Importante para la
unin de calcio en
proteasas de la
cascada de
coagulacin
-carboxiglutamato
Posibilitan la
formacin de la
estructura reticular
del colgeno
4-hidroxiprolina
5-hidroxilisina
La fosforilacin en residuos
con grupos hidroxilo (Ser,
Tyr, Thr) regula la actividad
de muchas protenas
o-fosfoserina
10
Carga neta 0
Carga neta +1
K1; pK1
Forma catinica
Carga neta -1
K2; pK2
Forma zwitterinica
(neutra)
Forma aninica
11
-carboxilo
pK1=2-3
-amino
pK2=9-11
Lys y Arg
pKR> pK2
12
Carga -2
cido
glutmico
pK2=9.9
Carga -1
pKR=4.3
pK1=2.2
Carga 0
Carga +1
Equivalentes de OH13
Los aminocidos
polimerizan formando
polipptidos mediante
enlaces peptdicos
Formacin de un Dipptido
Dos aminocidos
El enlace peptdico es un
enlace amida formado por
unin del grupo -carboxilo
y el grupo -amino de dos
aminocidos
Los aminocidos unidos se
llaman residuos de
aminocido
Los residuos se nombran
con la terminacin il
comenzando por el extremo
N-terminal
Enlace peptdico
N-terminal
C-terminal
14
Estructuras de resonancia
del enlace peptdico
C
CN
O
C=N
O-
C
CN
O
trans
C
CN
cis
15
Pptidos
Son polmeros de unos pocos aminocidos
Ejemplos de algunos pptidos importantes
Glutatin (-glutamil-L-cisteinilglicina)
Agente reductor. Protege a las clulas de productos
oxidantes derivados del metabolismo del O2
Oxitocina
Hormona sexual. Estimula la secrecin de la leche y la
contraccin muscular uterina durante el parto
Protenas
Transporte
Almacenamiento
Detoxificacin
17
Tipos de Protenas
Segn su forma
Fibrilares
Globulares
Segn su composicin
Simples
Conjugadas
Constan de una cadena polipeptdica y un grupo prosttico
apoprotena --> slo la cadena polipeptdica
holoprotena --> polipptido + grupo prosttico
glucoprotenas
lipoprotenas
metaloprotenas
hemoprotenas
fosfoprotenas
18
Conformacin de la cadena
polipeptdica
Secuencia de aminocidos
Plegamiento local
Estructura terciaria
Estructura cuaternaria
Carbono
Cadena
lateral
Estructura secundaria
Plegamiento global
Carbono
Plano
amidapeptdico
Organizacin multimrica de
varias cadenas
19
Estructura Primaria
Se define por la secuencia de
aminocidos
Especfica de cada protena
Las protenas homlogas tienen
secuencias y funciones semejantes
La comparacin de secuencias permite
establecer relaciones evolutivas
Estructura primaria
de la insulina
Mutaciones -->variaciones en la
secuencia
Los aminocidos invariables son
importantes para la funcin
Las mutaciones conservadoras son
cambios entre aminocidos qumicamente
semejantes
Algunas mutaciones se relacionan con
enfermedades --> enfermedades
moleculares (patologa molecular)
20
Estructura Secundaria
Patrones repetitivos de
conformacin local de la cadena
polipeptdica
Dependen de los valores de los
rotmeros y
Carbono
Cadena
lateral
21
Conformaciones Prohibidas
El choque estrico (solapamiento de los radios de van der Waals) al girar los
rotmeros y impide gran nmero de conformaciones. Las
conformaciones posibles se representan en el diagrama de Ramachandran
Conformacin Posible
Choque
de los
grupos CO
Choque
de los
grupos NH
=0o, =180o
=180o, =0o
Choque
-NH con
-CO
=-60o, =180o
Grupos -CO lejos entre
ellos y lejos de la
cadena lateral R
=0o, =0o
22
Diagrama de Ramachandran
Distribucin de
ngulos y en un
polipptido de
polialanina
(grados)
Cadenas
Hlice
(a izquierdas)
Hlice
(a derechas)
(grados)
En blanco, valores
prohibidos
En azul, valores
posibles.
Tipos principales de
estructura secundaria
hlice
lminas
23
Hlice (3,613)
Vista desde arriba
Conformacin helicoidal a
derechas
=-60o, =-40o - -50o
3,6 residuos por vuelta
avance de 5,4 por vuelta
4
3
Residuo i+4
Residuo i
Cadenas
laterales hacia
afuera
3,6 residuos
5,4
(1,5 por residuo)
13 tomos por cada bucle cerrado
por un enlace de H
Estabilidad de la Hlice
Contribucin principal: enlaces de hidrgeno entre grupos CO y -NH peptdicos (cada residuo i con i+4)
No es posible en los tres primeros residuos de los extremos
Se estabilizan por enlaces de H con grupos de cadenas laterales
Hidrofbicas
25
Hoja
Alineamiento de segmentos
polipeptdicos en confor-macin
extendida (cadenas )
Hoja
Paralela
Peor orientacin de
enlaces de H (ms dbiles)
Paralela
Antiparalela
Enlaces de H mejor orientados
(ms fuertes)
26
Esquemas de Hojas
Antiparalela
Paralela
Cadenas laterales
27
Giros
Cambian la direccin de la
cadena 180o
Conectan entre s cadenas
antiparalelas
Glicina
Varios tipos
Tipo I
Tipo II (Gly en 3a posicin)
Tipo I
Tipo II
28
Estructuras Supersecundarias
Unidades
Meandro
Unidad
Barril
Llave griega
29
Estructura Terciaria
Estructura tridimensional global
que asume una protena al
plegarse
30
Dominios Estructurales
Son unidades estructuralmente independientes que
presentan caractersticas y funciones definidas
Hlice E
Ca2+
Hlice F
Mano EF
Configuracin
hlice-vuelta-hlice
que se une
especficamente a
iones Ca2+
Dedo de Zn
Habitual en
protenas que
unen DNA
Cremallera de
leucinas
31
Interacciones
hidrofbicas
Puentes
disulfuro
Interacciones
covalentes
Presentes slo en
algunos casos
Enlaces de
hidrgeno
32
Entorno
acuoso
membrana
Entorno
lipdico
Arg
Asp
Lys
Glu
Asn
Gln
His
Tyr
Pro
Ser
Gly
Thr
Ala
Trp
Cys
Val
Leu
Ile
Met
Phe
Polar
Escala de
hidrofobicidad
de Engelman
Hidrofbico
33
Factores fsicos
Fraccin desnaturalizada
Renaturalizacin
Desnaturalizacin
nativa
El plegamiento depende
de las condiciones del
medio
Temperatura
Presin
Factores qumicos
pH
Disolventes orgnicos
Agentes caotrpicos
(urea, cloruro de
guanidinio)
Es reversible y
cooperativo
Temperatura (C)
34
renaturalizacin
desnaturalizacin
Ovillo estadstico
Irregular, variable, abierta
Ausencia de estructura 2ria
Pocos enlaces intramoleculares
Residuos hidrofbicos expuestos
Efecto hidrofbico
Contribucin entrpica al
plegamiento
N
Regular, compacta
Estructura 2ria
Abundancia de enlaces
intramoleculares
Puentes de H
Enlaces inicos
Interacciones de van der
Waals
Residuos hidrofbicos no
expuestos
35
Plegamiento in vivo
Sntesis de protenas
mRNA
ribosoma
Cys
Cadena
naciente
Pro
Cys
Cys
Peptidil-prolil isomerasas
36
Estructura Cuaternaria
Asociacin no covalente de
varias cadenas
polipeptdicas
Subunidades=monmeros=protmeros
Las subunidades se organizan
de manera simtrica
Ventajas de la asociacin
Estructura cuaternaria de
la hemoglobina
Homo-oligmero de cuatro
subunidades (tetrmero
2x)
Mayor estabilidad
Regulacin alostrica
Estabilidad
Mismo tipo de enlaces que
estructura terciaria
1
37
Ejemplos
Colgeno (en tejido
conectivo de vertebrados)
Queratina (en piel, pelo y
uas)
Fibrona de la seda
Globulares
Forma ms o menos
esfrica
Ricas en estructura
secundaria
Flexibles, y dinmicas
Mltiples funciones
Ejemplos
Hemoglobina
Inmunoglobulinas
(anticuerpos)
Enzimas
38
El Colgeno
Protena ms abundante de
vertebrados
Red fibrosa de tropocolgeno
Tropocolgeno
Abundancia de Pro y Gly
Secuencia G-X-Y
X e Y suelen ser Pro e hidroxi-Pro
En Y tambin abunda hidroxi-Lys
Hlice triple de
tropocolgeno
Tres hlices a
izquierdas
Entrecruzamiento de unidades
de tropocolgeno
Por derivados aldehdo de Lys
39
Estriaciones
640 (64 nm)
Cadena
polipeptdica
Norleucina (residuo
de Lys sin grupo amino)
Estriaciones
640 (64 nm)
Tropocolgeno
Residuo de
hidroxilisina
Cadena
polipeptdica
Uniones hidoxilisinonorleucina
40
Residuo
4-hidroxiprolil
Residuo
3-hidroxiprolil
Residuo
5-hidroxilisil
41
-Queratina
Estructura del Pelo
Unidad
estructural
Hlice
Dos hlices
enrolladas a
izquierdas
Clulas
Dmero
Protofilamento
Filamento
intermedio
Protofibrilla
Protofilamento
Hlices
enrolladas
Hlice
Protofibrilla
Reduccin
Rizado
Oxidacin
42
Fibrona de la Seda
Fibras formadas por
hojas antiparalelas
polar
apolar
apolar
Flexible y resistente al
estiramiento
polar
43
Tema 3
Interaccin
Protena/Ligando
Generalidades
Fraccin de saturacin
Cooperatividad
Alosterismo
Protenas transportadoras de
oxgeno
Mioglobina y Hemoglobina
Curvas de saturacin de O2
Origen molecular de la
cooperatividad
Efectores alostricos de la
hemoglobina. Origen
molecular del alosterismo
2,3-BPG
Efecto Bohr
CO2
Variantes naturales y
patologa molecular de la
hemoglobina
Dinmica y Funcionalidad
La funcionalidad de las Protenas depende de
sus propiedades dinmicas
Flexibilidad
Las protenas no son estructuras rgidas
Su flexibilidad depende de un gran nmero de enlaces
dbiles
Cambios conformacionales
Son pequeas variaciones de la estructura terciaria
Sirven para regular la actividad de las protenas
Prof. J. Salgado (UVEG - 2005)
Interacciones
Unin reversible de ligandos
Interacciones reversibles protena-protena
Se estabilizan mediante enlaces dbiles
Complejo PL
P = enzima
L = sustrato, activador,
inhibidor
Sitio de
unin
En sealizacin
P = receptor
L = hormona
En transporte
P = transportador
L = O2, lpido, azcar, etc.
En sistema inmunolgico
P = anticuerpo
L = antgeno
Sitio de unin
Especfico y definido
Interacciones P-L
Enlaces dbiles:
Hidrofbicos
Inicos
Enlaces de H
van der Waals
Otros
4
Fraccin de Saturacin
Para un solo sitio:
P+L
Constante de
disociacin
Definimos
Fraccin de
Saturacin Y :
PL
Unin
fuerte
Unin dbil
0,5
K d
Kd
Kd
[L]
Definicin
de Kd
De las expresiones
anteriores
Ecuacin de una
hiprbola
Cooperatividad
Para varios sitios
P+L
PL + L
PL2 + L
PLn-1 + L
K1
K2
K2
Kn
PL
PL2
PL3
Sitios equivalentes e
independientes
K1 = K2 = Kn = L
c=1
Sitios equivalentes y
dependientes
Supercooperatividad +
Todos simultneamente
PLn
P + nL
PLn
c = n
Prof. J. Salgado (UVEG - 2005)
Cooperatividad +
K1 > K 2 > K n
1 < c < n
c coeficiente de Hill
Cooperatividad
K1 < K 2 < K n
0 < c < 1
6
L representa la afinidad
del conjunto
Para el conjunto No cabe
hablar de Kd
Curva sigmoidea
1
Unin fuerte
(ltimo sitio)
n
Uni
l
dbi )
n
Uni er sitio
(prim
0,5
cooperativa
Kd
K d
[L]
Alosterismo Homotrpico
Existe alosterismo
cuando:
Hay ms de un sitio de
unin
La unin en un sitio afecta
a la afinidad en otros
(dependientes)
Efecto alostrico
homotrpico
Sitios equivalentes
Mismo ligando en los
distintos sitios
Protenas multimricas
Cada sitio en una
subunidad proteica
Es el caso de
cooperatividad
R
R
T
T
R
T
R
R
L
8
Alosterismo Heterotrpico
Efecto alostrico
heterotrpico
Sitios no equivalentes
Distintos ligandos
Cada uno su sitio
especfico
Sustrato
Positivo activacin
Negativo inhibicin
Se deben a cambios
conformacionales
inducidos por la unin del
efector
Sirven como mecanismo
de regulacin
Sustrato
Curvas de Alosterismo
Solo heterotrpico
Activacin o inhibicin y
no cooperatividad
Homo y heterotrpico
Cooperatividad + activacin o
inhibicin
Activador
Activador
Aumenta la afinidad
Afinidad, cooperatividad
Inhibidor
Inhibidor
Disminuye la afinidad
+ Activador
+ Inhibidor
0
Kd
Slo
cooperatividad
+ Activador
0,5
Kd
Afinidad, cooperatividad
Kd
[L]
+ Inhibidor
0,5
0
L
[L]
10
Mioglobina
Hemoprotena monomrica
Funcin:
Almacenamiento de O2 en
el msculo
Hemoglobina
Hemoprotena tetramrica
Cada cadena es muy
similar a la mioglobina
Hemoglobina
Funcin:
Transporte de O2 y CO2
entre los pulmones y los
tejidos
11
Fe2+-protoporfirina IX
Fe2+
Histidina
proximal
Histidina
distal
Desoxi-Hb
hemo
Cavidad
hidrofbica
O2
Fe2+
Oxi-Hb
O2
Fe2+
His proximal
12
El transporte es
Y
eficaz si la
saturacin en
los tejidos es
mucho menor
que en los
pulmones
Muy afn
Poco afn
mala
Eficiencia del
transporte
regular
pO2
pO2
La mayor eficacia se
consigue con un
comportamiento
cooperativo
(sigmoideo)
Eficiencia del
transporte
buena
Cooperatividad
(R)
(Hemoglobina)
(T)
pO2
pO2
13
Le hemoglobina es un
dmero de dmeros
Interfase 11- 22
Interacciones inicas en
forma desoxi (T)
La unin de O2 en una
subunidad provoca:
Desplazamiento del Fe2+
en el plano del grupo
hemo
Cambio conformacional
transmitido a las
subunidades vecinas
(Transicin TR)
Transmisin del
cambio a
otras
subunidades
Interfase 11- 22
Desoxihemoglobina
Oxihemoglobina
14
Transicin T R en la Hemoglobina
1. Unin de O2 a una subunidad
Cambia sta de T a R
2. Reordenamiento de la
interfase 11-22
3. Cambio conformacional
transmitido a las subunidades
vecinas
Giro de 15 de 11 con
respecto a 22
Disminucin de cavidad
entre 1 y 2
4. Transicin T R en
subunidades vecinas
Forma R
(oxi)
Forma T
(desoxi)
2
1
15
Acentan cooperatividad
Mejoran la efectividad del transporte
16
+
+
+
Carga negativa
Sin 2,3-BPG
- +
sin 2,3-BPG
con 2,3-BPG
0,5
0
P50O2
p50O2
pO2 (torr)
17
pH 7,2 (en
los tejidos)
Mayor afinidad
Protn
aadido
18
carbamato
Origen molecular
Tejidos
Pulmones
19
Hemoglobina 2 2
Cadenas en lugar
de
+
+
+
- +
+
Eritrocitos
del feto (2
2)
Eritrocitos
maternos
(2 2)
El O2 fluye desde la
oxihemoglobina materna a la
desoxihemoglobina del feto
20
Enzimas
Tema 4
Catalizadores Biolgicos
Catalizador:
Aumenta la velocidad de
reaccin
No vara G de la reaccin
Facilita la reaccin en
condiciones no extremas
No se consume durante la
reaccin
Los catalizadores
biolgicos son:
Casi siempre protenas
(enzimas)
Excepcionalmente RNA
cataltico (zibozimas)
Proteasa
Pptido o
protena
1011 veces ms rpida
La especifidad depende de R1
2
El Centro Activo
Las enzimas son
especficas por sus
sustratos
Interaccin precisa enzimasustrato
Sitio de interaccin: centro
activo
Hendidura tridimensional
Zona pequea de la enzima
Propiedades especiales para
la unin y catlisis del
sustrato
Uracilo
(parte del
Sustrato)
Treonina
Serina
tro
n
e
iv
t
c
a
Ribonucleasa
El Estado de Transicin
Explicacin termodinmica
La reaccin transcurre
a travs de un estado
de transicin (S*)
Intermedio entre S y P
Mayor energa que S
Estado de
transicin
Barrera de energa de
activacin
Reduce la energa de
activacin
Acelera la reaccin
S* es complementario
con el centro activo
S*
P
Energa de
activacin
(No catalizada)
(catalizada)
Energa libre
La enzima facilita la
formacin de S*
S*
Sustrato (S)
De
reaccin
Producto (P)
Progreso de la reaccin
4
Sustrato
Complejo ES
Reconocimiento molecular
Enzima
Ajuste inducido
(Koshland, 1958)
La unin del sustrato
induce un cambio en el
centro activo que aumenta
la complementariedad
Reconocimiento molecular
dinmico
Estado de
transicin
Sustrato
Complejo ES
Enzima
5
Tipos de Enzimas
Oxidoreductasas
Catalizan reacciones de
oxidoreduccin
Deshidrogenasas,
oxidasas, oxigenasas,
reductasas, peroxidasas
Transferasas
Catalizan transferencias de
grupos
Transcarboxilasas,
transaminasas,
transmetilasas
Hidrolasas
Catalizan la rotura de
enlaces por adicin de agua
Esterasas, fosfatasas,
peptidasas
Liasas
Catalizan la eliminacin de
grupos para formar un
doble enlace
Descarboxilasas,
deshidratasas,
desaminasas
Isomerasas
Catalizan reordenamientos
moleculares
Epimerasas, mutasas
Ligasas
Catalizan formaciones de
enlace entre dos sustratos,
con energa aportada por la
hidrlisis de ATP
6
Cofactores Enzimticos
Componentes no proteicos requeridos
para la actividad de la enzima
Apoenzima + cofactor = holoenzima
Dos tipos
Iones metlicos
Mg2+, Zn2+, Cu2+, Mn2+, ...
Coenzimas
Molculas orgnicas pequeas, muchas son
derivadas de las vitaminas
Su carencia produce enfermedades
Velocidad de reaccin
En condiciones de
equilibrio
A
Consumo
de A
k1
k -1
Formacin
de B
En el equilibrio v = 0
Prof. J. Salgado (UVEG - 2005)
Velocidad
Constante de
velocidad
8
k1
k2
B = Intermediario
C
k
2
Si k2 << k1, entonces B
C
y la velocidad depende slo de k2
k1
k -1
k2
E+S
k1
k -1
ES
k2
E+P
Complejo
enzima-sustrato
(intermediario)
Fase de catlisis:
transformacin de S en P y
recuperacin de E
Es el paso limitante
Constante de
disociacin del
complejo ES
Constante
cataltica (kcat)
10
concentracin de sustrato
Parte de los siguientes supuestos
1. P no se convierte en S
2. K2 << k-1
Concentracin
Estado Estacionario
Equilibrio
Tiempo
12
Ecuacin de Michaelis-Menten
E+S
k1
k -1
ES
k2
E+P
Velocidad Inicial:
En el estado estacionario:
Constante
de Michaelis
V0 alcanza el valor mximo
cuando [ES]=[E]total
Ecuacin de Michaelis
(curva hiperblica):
13
[E]total,se
[S]3
Producto
[S]4
[S]2
[S]1
Tiempo
Velocidad de reaccin
Equilibrio
14
Inverso
1/ V0
Pendiente:
KM / Vmax
1/ Vmax
Recta
Ordenada en
el origen
Pendiente
1/ [S]
-1/ KM
15
Significado de la KM
Dos significados
KM es la [S] para cual V0 = Vmax
Representa la [S] necesaria para que ocurra una catlisis
significativa
E+S
k1
k -1
ES
k2
E+P
1 / kcat es el tiempo
Unidades
: M s-1
Unidades:
M
Unidades:
s-1
necesario para la
conversin de una molcula
de sustrato en producto (un
ciclo cataltico)
17
En estas condiciones
Inhibicin Enzimtica
Inhibicin: Disminucin de la actividad de
una enzima por accin de un inhibidor
Irreversible
El inhibidor se une fuertementa a la enzima
Ejemplos:
La ampicilina: Modifica covalentemente una
transpeptidasa responsable de la sntesis de la pared
celular bacteriana
La aspirina: Modifica covalentemente una
ciclooxigenasa que produce seales inflamatorias
Reversible
El inhibidor se une a la enzima por enlaces dbiles, y el
complejo EI se encuentra en equilibrio con las formas
libres
19
Inhibidor
competitivo
Sustrato
Aumenta (KM
KM )
aparente
>
Velocidad de reaccin
Compite con el
sustrato
Sin inhibidor
[S]
20
Sustrato
Se une en un sitio
distinto del sitio activo
Vmax disminuye
Vmax
aparente
< Vmax
No afecta a La KM
Sin inhibidor
Velocidad de reaccin
[S]
21
Inhibicin no competitiva
+ Inhibidor
competitivo
1/Vmax
Sin
inhibidor
+ Inhibidor
no competitivo
-1/KM
-1/KMap
Sin
inhibidor
-1/Vmaxap
1/Vmax
-1/KM
22
Regulacin lenta
Control de la disponibilidad y de la vida media de la
enzima
Regulacin rpida
Control alostrico
Modificacin covalente
Reversible
Irreversible
23
Isoenzimas
Son distintas formas de una misma
enzima
Enzimas homlogas presentes en un
mismo organismo
24
Enzimas Alostricas
Contienen varios centros y
varias subunidades
Centros activos
Centro reguladores
Efecto alostrico
A travs de cambios
conformacionales
[sustrato]
Alosterismo homotrpico
Entre centros equivalentes
Cooperatividad
Curvas sigmoides
No siguen la cintica de
Michaelis-Menten
Estado R
V
Estado T
Alosterismo heterotrpico
De centros reguladores sobre
centros activos
sustrato
26
Ruta de 9 pasos
ATCasa
+
Carbamilfosfato
in
c
iv a
ci
Purinas
Produccin energtica
ib i
ATP
N-carbamilaspartato
h
-in
tro
Re
t
Ac
Aspartato
Citidin trifosfato
CTP
27
Estructura de la ATCasa
Estructura cuaternaria:
dos trmeros catalticos + tres dmeros reguladores
28
Estado T
(menos activo)
Mecanismos de cooperatividad
y de activacin:
Los sustratos y los activadores
estabilizan las formas de alta
afinidad (o formas R)
Estado R
(ms activo)
29
Inhibicin
Activacin
Modificacin Covalente
Irreversible
Activacin por
rotura proteoltica
de precursores
inactivos
(zimgenos)
Enzimas de la
digestin
Cascada de
coagulacin
Activacin de
caspasas en
apoptosis
Reversible
Unin covalente de
un grupo qumico
que altera las
propiedades
catalticas de la
enzima
Fosforilacindesfosforilacin
Oxidacin-reduccin
Acetilacindesacetilacin
31
Cascada de la Coagulacin
32
Desfosforilacin
Eliminacin de grupo fosforilo de protena
fosforilada
Catalizada por protena fosfatasa
33
Glucosa-6-P + ADP
Hexoquinasa
Inhibicin
Retroinhibicin
34
Estructura y Funcin de
los cidos Nucleicos
Tema 5
J. Salgado (UVEG - 2005)
3
Azcar
Azcar
Fosfato
Ribosa
En RNA
En DNA
J. Salgado (UVEG - 2005)
Desoxirribosa
Azcar
Fosfato
Azcar
Fosfato
Azcar
Fosfato
Fosfato
Esqueleto azcar-fosfato
cido
desoxirribonucleico
tomos numerados
con primas
cido ribonucleico
2
Purina
Adenina (A)
Guanina (G)
Pirimidinas
Pirimidina
Citosina (C)
tomos numerados
sin primas
Uracilo (U)
Timina (T)
En el DNA se encuentran A,
G, C y T
En el RNA se encuentran A,
G, C y U
3
Enlace -glicosdico
1
Adenosina
Ribosa
Enlace fosfoster
Adenosina 5-trifosfato
o adenilato 5-trifosfato
(5-ATP)
En el DNA: desoxiadenilato,
desoxiguanitato, desoxicitidilato,
desoxitimidilato
Ribosa
4
Esqueleto azcarfosfato
DNA
Esqueleto azcarfosfato
RNA
5
Desde arriba
Dos cadenas
antiparalelas
complementarias
Doble hlice a derechas
Surco
mayor
Surco
menor
Cadenas
azcarfosfato
Bases
Apiladas
Guanina
Citosina
Adaptado a la anchura
de la hlice
Facilita la replicacin
Los apareamientos
errneos causan
mutaciones
Adenina
Timina
8
Efecto hidrofbico
Interacciones hidrofbicas entre las bases apiladas en el centro
de la hlice
Absorbancia
La temperatura de
fusin (Tm) depende de
la proporcin de pares
CG frente a A=T
El proceso es reversible
y cooperativo
En las clulas est
catalizado por enzimas
helicasas, e implica la
hidrlisis de ATP
Efecto hipercrmico:
La absorbancia a 260
nm de las bases
apiladas en la doble
hlice es menor que en
las hebras sencillas
Cadena
sencilla
Doble
hlice
Curva de fusin
Cadena sencilla
Absorbancia
Al calentar el DNA se
separan las dos
hebras de la doble
hlice
Doble
hlice
Temperatura
de fusin
Temperatura
10
DNA A
En DNA parcialmente deshidratado
11 pb por vuelta, dimetro=26
Semejante a los dplex de RNA y RNA/DNA
DNA Z
Hlice a izquierdas
12 pb por vuelta, dimetro=18
Puede aparecer en zonas con repeticiones CG
Posible funcin en la regulacin de la expresin gnica
11
Superenrollamiento
Surge al girar una cadena doble de DNA
cuyos extremos estn fijos
Superenrollado
12
Superenrollamiento in vivo
El superenrollamiento es un proceso catalizado
que requiere energa de la hidrlisis de ATP
Llevado a cabo por las topoisomerasas
Topoisomerasas de tipo I
Catalizan el relajamiento del DNA superenrollado por corte de
una de las hebras
Topoisomerasas de tipo II
Introducen superenrollamiento negativo por corte y giro de las
dos hebras
En procariotas
En eucariotas
Asociacin del DNA a ncleos sucesivos de protenas
Superenrollamiento solenoidal compacto
13
Genomas
Se llama genoma al conjunto completo de informacin
gentica de un organismo
Se hereda de generacin en generacin
Codificado en secuencias de cidos nucleicos
Organizado en cromosomas
Cada cromosoma contiene una sola molcula de DNA
En eucariotas
En virus
Genoma de DNA o RNA, de cadena simple o doble, circular o lineal
14
El Cromosoma Bacteriano
Forma una estructura
llamada nucleoide
DNA circular de cadena
doble, superenrollado y
unido a un ncleo central
proteico
Tetrmeros de la
protena HU
Poliaminas catinicas
Bucle
relajado
Le permite comprimirse
en un espacio pequeo
Cromosoma extendido
(3x106 pb) 1,5 mm
Cromosoma
empaquetado 2 m
Centro
proteico
15
Cromosomas Eucariotas
Cromosoma
Cromatina
Dimetro del
cromosoma
Fibra
condensada
Histonas
Nucleosoma
DNA
16
Nucleosomas
Ncleo de
histonas
DNA
conector
DNA
enrollado
(145 pb)
17
Tipos de RNA
RNA mensajero (mRNA)
Se transcribe en el ncleo a partir de la secuencia de DNA de
los genes. Su secuencia ser leda en el citoplasma para dar
lugar a protenas especficas
Estructura primaria
5
3
Estructura secundaria
Bucle
Brazo
Regin palindrmica
(autocomplementaria)
Estructura
terciaria de
un tRNA
19
Bucle TC
Extremo
CCA
Bucle
DHU
Bucle del
anticodn
3
5
Brazo aceptor
Bucle TC
Bucle DHU
Brazo TC
Brazo DHU
Brazo
variable
Brazo del
anticodn
20
Subunidad 50S
Ribosoma (70S,
2700 kDa)
Subunidad 30S
21
22
Tema 5
J. Salgado (UVEG - 2005)
23
replicacin
DNA
transcripcin
RNA
traduccin
Protenas
24
Replicacin
Sntesis de copias
nuevas de DNA a partir
de un molde
preexistente
La replicacin es semiconservadora
Cada hebra de una cadena
doble de DNA sirve de
molde para la sntesis de
una hebra complementaria
Cebador (primer)
Pequeo fragmento de RNA (~5 nucletidos) con el grupo 3-OH libre, unido al
DNA molde (sintetizado por la primasa del primosoma)
Precursores activados
Desoxinucletidos 5-trifosfato (dATP, dGTP, dTTP, dCTP)
DNA-polimerasas
Catalizan la formacin de enlaces fosfodister dirigida por un molde de DNA
(actividad polimerasa 5 3) y la correccin de errores (exonucleasa 3 5)
Requieren Mg2+ y un cebador con su extremo 3-OH libre
Tres tipos:
DNA polimerasa I (Pol I): Elimina el cebador mediante una actividad exonucleasa 5
3 y sintetiza DNA en su lugar
DNA polimerasa II (Pol II): Funcin desconocida (quiz similar a la Pol I)
DNA polimerasa III (Pol III): Sntesis de la nueva cadena de DNA a partir del cebador
J. Salgado (UVEG - 2005)
Otras enzimas
Primasa: RNA polimerasa que sintetiza el cebador. Forma parte del primosoma
Helicasa (Dna B): Separa las dos hebras del DNA dplex. Requiere ATP
Girasa (topoisomerasa II): Genera superenrollamiento negativo. Requiere ATP
Ligasa: Une fragmentos nuevos sintetizados
26
secuencias ricas en
AT en tandem
horquilla de
replicacin
tetrmeros
SSB
ojo de
replicacin
girasa
girasa
en las horquillas
de replicacin
ATP
ADP+Pi
helicasa
27
Protenas SSB
Primosoma
Cebador
Siempre en direccin 53
La hebra gua se sintetiza de
manera continua
La hebra retardada forma un
bucle donde la sntesis de DNA
ocurre de manera discontinua en
fragmentos de Okazaki
Girasa
Helicasa
Fragmentos
de Okazaki
Primasa
Holoenzima
DNA Pol III
DNA Pol I
3
5
Hebra
gua
DNA ligasa
Hebra
retardada
5
3
5
3
3 5
28
La maquinaria
de replicacin
Replisoma
Avance de la
horquilla
Girasa
(topoisomerasa)
Helicasa
Cebador
Primosoma
Protena
abrazadera
Cebador
(RNA)
Fragmento de
Okazaki
Dmero de
Pol III
Protena
Pol I
pinza
Sintetiza la
cadena gua
Sintetiza la
cadena retardada
Protenas de
Unin a cadena
simple (SSB)
Cadena
gua
Ligasa
Cadena
retardada
29
Mutaciones
Cambios en la secuencia del
DNA. Tipos:
Citosina
Tautmero imino
de Adenina
Dmero de timina
30
Mecanismos de Reparacin
El nivel de fidelidad de las
copias de DNA es muy alto,
debido a:
La especificidad enzimtica
de la maquinaria replicativa
La correccin de errores de
las DNA polimerasas mediante
prueba de lectura
Detectan nucletidos
incorrectos y los eliminan
hacia atrs (actividad
exonucleasa 35)
Los mecanismos de
reparacin post-replicativos
Reparacin directa
Reparacin por escisin de
bases
Reparacin por escisin de
nucletidos
Reparacin directa
La regin daada se corrige
in situ
La DNA fotoliasa utiliza
energa de la luz para
eliminar los dmeros de
pirimidina formados por
radiacin UV
Replicacin en Eucariotas
Ms compleja y ms lenta
que en procariotas
Por el mayor tamao y
complejidad del genoma
Mltiples orgenes de
replicacin
Cada uno representa una
unidad de replicacin
(replicn) bidireccional
, inicia la sntesis
, funcin de reparacin
, elongacin
, papel desconocido
, replicacin del genoma
mitocondrial
Ciclo celular
Comienza la
sntesis de DNA
La replicacin se encuentra
regulada de acuerdo con el
ciclo celular
Sntesis de DNA limitada a
la fase S, y coordinada con
la divisin celular (mitosis)
Comienza la
mitosis
32
Expresin Gnica
Genes
DNA
(genoma)
Transcripcin
Sntesis de los RNA a partir de
DNA molde
Traduccin
Cromosoma
Transcrito
Traduccin
Transcripcin
Expresin de la informacin
gentica (secuencias de
DNA)
Protena
(proteoma)
Transcripcin
Sntesis de RNA a partir de un
molde de DNA
Siempre se da en la direccin
53
No requiere cebador
Implica segmentos cortos
(regiones codificadoras) que
no se transcriben necesariamente
de manera simultanea
Ocurre mltiples veces a lo
largo de la vida de la clula
RNA polimerasa
Enrollamiento
Hebra molde
Hebra codificadora
Desenrollamiento
Punto de
elongacin
34
Unidad de transcripcin
Promotor
Terminador
-35 -10 +1
-10
+1
RNA polimerasa
Secuencia
Consenso
(caja TATA o Pribnow)
Inicio de la
transcripcin
RNA polimerasas
Nucletidos activados
CTP, GTP, ATP, UTP
De procariotas
De eucariotas
35
DNA desenrollado
(abiertos 17 pb)
RNA polimerasa
36
X
3
P P P
YTP
OH
Enlace
fosfodister
Burbuja de transcripcin
RNA polimerasa
5. Avance de la burbuja
La hlice de DNA se va
desenrollando por
delante y enrollando
por detrs
El factor se suelta.
2 contina hasta la
terminacin
Y
3
P P P
OH
PPi
Enrollamiento
Hebra molde
Hebra codificadora
Desenrollamiento
Punto de
elongacin
37
Seal de terminacin
Regin palindrmica
(autocomplementaria)
Oligo poliU
7. Disociacin
DNA/RNA
Factor
(hexmero)
RNA
RNA polimerasa
38
Genes de expresin
constitutiva
Son transcritos
continuamente
Genes inducibles
Su transcripcin vara
segn las condiciones o
las necesidades
metablicas
Se regulan a travs de
centros operadores
secuencias reguladoras
cercanas al promotor
Centros de
control
Genes
estructurales
Promotor
Operador
Genes estructurales
40
En ausencia de lactosa
No hay inductor
El represor sin inductor se une al
operador
Impide a la RNA polimerasa
transcribir z, y, a
En ausencia de lactosa
RNA pol bloqueada
En presencia de lactosa
RNA pol no bloqueada
En presencia de lactosa
Se forma el inductor alolactosa
El represor con inductor inactiva
al represor
Los genes z, y, a se transcriben
Inductor
-galactosidasa
Alolactosa
(o molcula
anloga)
Permeasa
Transacetilasa
Metabolismo de
la lactosa
41
En ausencia de Trp
RNA pol no bloqueada
p trpR
mRNA
p o trpL
trpE
trpD
trpC
trpB
trpA
mRNA
En ausencia de triptfano
El represor no puede unirse al
operador
La RNA polimerasa transcribe los
genes relacionados con la
sntesis de Trp
En presencia de Trp
En presencia de Trp
El Trp se une al represor
Enzimas de la
sntesis del Trp
Represor
inactivo
p o trpL
trpE
trpD
trpC
trpB
trpA
mRNA
Represor
activo
Trp
(corepresor)
42
Ribonucleasa III
rRNA 16S
En procariotas
Los mRNA no se procesan
Los rRNA y tRNA se
obtienen por corte y
modificacin de
transcritos primarios
J. Salgado (UVEG - 2005)
Ribonucleasa III
1- Corte
5
tRNA
3OH
2- adicin de CCA
5
Intervienen RNAs
catalticos
tRNA
CCA-3OH
3- Modificacin de bases
5
tRNA
maduro
CCA-3OH
43
Transcripcin en Eucariotas
Tiene lugar en el ncleo
Existen tres tipos de RNA polimerasas (cada una
reconoce un tipo de promotor)
RNA polimerasa I
Sintetiza precursores de los rRNA
RNA polimerasa II
Sintetiza precursores de los mRNA
Procesado en Eucariotas
En los pre mRNA se modifican los
extremos 5 y 3
Casquetes 5: en el extremo 5 se
aade 7-metilguanosina y se metilan
algunas ribosas
En el extremo 3 se aade una cola de
poli(A) de ~250 residuos
Maduracin:
Eliminacin de intrones por corte y
empalme
5
Pre mRNA
7-metilguanosina
2-metilribosa
3
Exn 1
Intrn
Exn 2
Pre mRNA
Complejo
U4-U5-U6
Espliceosoma
45
Traduccin
Sntesis de protenas a
partir de un molde de
mRNA
Expresin de protenas
en procariotas
En procariotas ocurre
inmediatamente despus de
la transcripcin
El transcrito primario sirve
de mRNA
Transcripcin y traduccin
pueden ocurrir
simultneamente
Ribosoma
Protena
naciente
Expresin de protenas
en eucariotas
Ncleo
Procesado
Transcrito
primario
Citosol
Transporte
Ribosoma
Protena
naciente 46
Ribosoma
Complejo ribonucleoproteico de rRNA y protenas
Une el mRNA molde y los distintos tRNA
Cataliza la formacin de los enlaces peptdicos de la nueva protena
tRNA
Especficos para cada uno de los 20 aminocidos (al menos uno por
aminocido)
Transportan los aminocidos activados hasta el ribosoma
Aminoacil-tRNA sintetasas
Activan y unen un aminocido a cada tRNA
Especficas para cada aminocido
Interpretan el cdigo gentico
Requieren ATP
48
El Cdigo Gentico
Primera posicin
(extremo 5)
Segunda posicin
Tercera posicin
(extremo 3)
49
Codn
Cdigo
estndar
Cdigo
mitocondrial
50
Los tRNA
Molculas adaptadoras
Se unen a codones especficos y
transportan aminocidos
especficos
Anticodn y sitio del aminocido
estn en brazos opuestos
tRNA de la alanina
Nuclesidos modificados
UH2: dihidrouridina
I: inosina
mG: metilguanosina
m2G: dimetilguanosina
T: ribotimidina
ml: metilinosina
: pseudouridina
3
Sitio de
unin
del
aminocido
Aminoacil-tRNA
Intermediario de la sntesis de
protenas
ster de tRNA+aminocido
51
Aminoacil-tRNA
tRNA
Adenina
3
aminocido
52
Complejo treonil-tRNA
sintetasa
Aminoacil-tRNA
sintetasa
Sitio de
revisin
Brazo
aceptor
Conocen e interpretan el
cdigo gentico
tRNA
Sitio de
activacin
Lazo del
anticodn
Reconocimiento
Especfico del
Lazo del anticodn
53
El Ribosoma (Procariota)
Coordina las interacciones
entre el molde (mRNA) y el
adaptador (tRNA)
Complejo supramolecular de
RNA y protenas
La funcionalidad principal se
debe a los rRNA (ribozimas)
Tres tipos de rRNA (5S, 16S,
23S) procedentes de un
transcrito comn (30S)
Dos subunidades
Grande (50S)
Pequea (30S)
Funcin de reconocimiento
Sitio de formacin
del enlace peptdico
(formado por RNA)
54
50S
Sitio P
Para la unin del peptidil-tRNA
Sitio E
Sitio de salida del tRNA recin
descargado
30S
E
o ti o P ti o A
i
t
Si
Si
Si
Caractersticas de la Traduccin
La direccin de la sntesis de protenas es siempre
N-terC-ter
El mRNA molde se lee en direccin 53
El aminocido que se incorpora viene determinado
slo por las interacciones codn-anticodn
Excepto en el caso del 1er aminocido, donde se reconoce
especficamente un aminoacil-tRNA de iniciacin por el
factor de iniciacin 2 (IF2)
Se reconocen principalmente las dos primeras bases del
codn (balanceo de las bases)
Subunidad 30S
Factores de iniciacin
Previamente se ensambla un
complejo de 30S que
contiene:
El ensamblaje es ayudado
por los factores de iniciacin
IF1, IF2, IF3
Requiere GTP
Complejo de iniciacin 70S
58
GTP
EF-Tu
EF-Ts
GDP + Pi
Translocacin
EF-G
GTP
GDP + Pi
59
Requiere GTP
Iniciacin
TEMA 6
Introduccin a la Bioenergtica
1. Repaso de conceptos importantes
2. Acoplamiento entre las reacciones endergnicas y
exergnicas
3. Sistema ATP/ADP
4. Termodinmica del transporte a travs de membrana
5. Teora quimiosmtica
6. ATP sintasa
Introduccin a la Bioenergtica
La formacin o ruptura de cada biomolcula lleva
asociado un cambio de energa. La Termodinmica es el
campo de la qumica que estudia esos cambios de energa.
El objetivo de la termodinmica es predecir si una
reaccin ocurrir espontneamente: si continuar sin
necesidad de aporte energtico una vez ha comenzado.
Los sistemas biolgicos no vulneran la segunda ley de la
termodinmica.
G = H-TS
Una reaccin es espontnea cuando G es negativo.
Concepto de reaccin endergnica y exergnica
La G estndar biolgica (G):Reacciones que se producirn
en las condiciones:
1M de concentracin de solutos.
pH 7.0 ([H+]= 10-7 M)
25C
1 at de presin
C+D
[C] [D]
[A] [B]
En el equilibrio, GR = 0
GR = - RT ln Keq
Segn la concentracin de sustratos y productos en la
clula (o en un compartimento de sta), el signo de G
puede cambiar
Reacciones acopladas
Muchos procesos bioqumicos endergnicos se realizan
gracias al acoplamiento a reacciones exergnicas.
por ejemplo:
1. glucosa-6-P fructosa-6-P
2. fructosa-6-P + ATP fructosa-1,6-bisP + ADP
G(kcal/mol)
+ 0.4
- 3.4
- 3.0
Sistema ATP-ADP
ATP suministra energa libre para conducir muchas reacciones
endergnicas
Los otros nuclesidos trifosfato (GTP, UTP y CTP) pueden dirigir
reacciones de forma anloga al ATP, aunque el ATP se encuentra en mucha
mayor concentracin en las clulas
enlaces anhdrido
fosfrico
**
AMP
ADP
+
Fosfato inorgnico (Pi)
G
ATP + H2O
ADP + Pi
-30.5 kJ/mol
ATP + H2O
AMP + PPi
-32.2 kJ/mol
AMP + H2O
Adenosina + Pi
-14.0 kJ/mol
*
**
*
Pirofosfato
inorgnico (PPi)
ATP
creatina quinasa
ATP + creatina
Potencial de
transferencia
GT = RTln(Cd/Cf) + GT
fuera
GT = 0, en procesos de difusin
Potencial electroqumico
GT = RTln(Cd/Cf) + Z F
dentro
fuera
A*
TRANSPORTE ACTIVO
G = 0: no hay movimiento
Diferencias en la concentracin, carga y el aporte acoplado de energa qumica
son las fuerzas que permiten el transporte de molculas a travs de membranas.
* Si es negativo y Z positivo, G es negativo: en la clula est favorecida
la entrada de cationes y la salida de aniones
Mecanismos de transporte
Transporte pasivo o difusin. Segn las
Transporte facilitado. Difusin acelerada,
gracias a protenas que forman canales o
transportan molculas
Velocidad de transporte
diferencias de concentracin.
Alcanza la velocidad
mxima cuando
todos los
transportadores
estn ocupados
Transporte
facilitado
Transporte
pasivo
Diferencia de concentracin
a travs de membrana
Transporte activo
Utiliza energa para bombear molculas contra un gradiente de
concentracin (la clula consume el 25% de su ATP para este proceso).
9 Bombas de iones (ej. bomba de sodio-potasio)
9 Sistemas de co-transporte
antiporte (en sentidos opuestos)
simporte (en el mismo sentido)
9 Transporte por modificacin (despues de un transporte pasivo,
la molcula es modificada covalentemente)
Bomba de sodio-potasio: un
modelo de transporte activo
[Na+]= 140 mM
[K+] = 5 mM
Fluido extracelular
[Na+]= 10 mM
[K+] = 100 mM
La ATP sintasa
Transforma la energa libre asociada a un gradiente de protones
en energa qumica en forma de ATP
Los protones regresan a favor de su gradiente de concentracin y
provocan la rotacin de un elemento del complejo
F1
F0
ATP Sintasa(F1)
El desplazamiento rotacional conduce a
la sntesis y liberacin del ATP
TEMA 7.a
Cadena de Transporte Electrnico
Mitocondrial
1. Introduccin y repaso:
La mitocondria
Potencial de transferencia de electrones
2. Transportadores electrnicos
3. Organizacin y funcionamiento de la cadena
respiratoria mitocondrial
4. Sntesis acoplada del ATP: fosforilacin oxidativa
5. Control respiratorio y desacopladores
G`= -nFE`
n es el nmero de electrones transferidos
F: cte de Faraday, 96.48 kJ/mol V
Transportadores electrnicos
Los electrones proceden de la oxidacin de nutrientes que, por la accin
de deshidrogenasas, son transferidos a aceptores universales
Principales familias de transportadores electrnicos:
1.
2.
Flavinas
3.
Quinonas
4.
Complejos hierro-azufre
5.
Grupos hemo
6.
Iones cobre
Implicadas en transferencias
de 1 2 electrones
Implicados en transferencias
de 1 solo electrn
Transportadores electrnicos
flavoprotenas
quinonas
Transportadores electrnicos
todos participan en
transferencias de 1
electrn
Citocromo tipo c
Es un transportador de electrones
mvil que se desplaza por la bicapa
lipdica de la membrana interna
mitocondrial.
Lleva dos electrones y dos protones,
tomados del complejo I o del complejo
II, hasta el complejo III.
El gradiente de protones
favorece el funcionamiento de
los dos transportadores:
1. El translocador ADP-ATP
2. La translocasa de fosfato
Tcnicas de estudio de la
cadena respiratoria
consumido
Preparacin de partculas
submitocondriales
Adicin de ADP
Agotamiento
del ADP
Tiempo
El consumo de O2 de una suspensin de
mitocondrias permite seguir el
funcionamiento de la cadena respiratoria
anaerobiosis
Tiempo (minutos)
Suspensin de mitocondrias, respirando
en condiciones normales
glutamato
Oxgeno (tomos)
Oxgeno (tomos)
glutamato
oligomicina
anaerobiosis
Tiempo (minutos)
Suspensin de mitocondrias, respirando
en presencia de inhibidores (oligomicina)
y desacopladores (DNP)
TEMA 7.b
Cadena de transporte electrnico
fotosinttica y fotofosforilacin
oxidativa
1.
Introduccin:
2.
3.
4.
5.
6.
cloroplasto
absorcin
Estado
excitado
electrones
Estado
fundamental
Transferencia electrnica
H+ del
estroma
2H+
2H+
O2
4H+
H+ liberados al lumen
del tilacoide
Transportadores de electrones
fotosintticos
En el fotosistema II (semejante al de bacterias prpura) intervienen:
Feofitina (Ph) es el primer aceptor de los electrones
Plastoquinonas (QA y QB). Transportan 2 electrones y dos protones tomados del estroma
Complejo citocromo b6f que bombear los protones al lumen tilacoide, segn un ciclo Q.
Plastocianina (PC). Transportador mvil de 1 electrn, hidrosoluble, con Cu.
O2 + 2 NADPH + 2 H+
Potencial de reduccin, V
Fotofosforilacin cclica
Es una va alternativa para el
flujo de electrones que permite
regular la proporcin
NADH/ATP.
Solo funciona el fotosistema I
y no hay reduccin de NADP+
pero se forma ATP.
No se liberar oxgeno
Fotosntesis en procariotas
En procariotas los fotosistemas, la ATP sintasa y la
cadena de transporte electrnico se encuentran en la
membrana plasmtica. Forma un compartimento delimitado
por la pared bacteriana externa.
Muchos procariotas poseen un solo fotosistema.
Algunas bacterias utilizan dadores de electrones distintos
del H2O, como el SH2.
TEMA 8
Vas centrales del metabolismo
intermediario
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
Esquema general
del metabolismo
Las rutas son distintas para el
catabolismo y el anabolismo,
porque:
para que se d una va debe
ser exergnica.
es necesario controlar los
flujos en funcin del estado
energtico del organismo.
Principales mecanismos de
control metablico
9 Control de la actividad de las enzimas
9 Control de los niveles de las enzimas
9 Compartimentalizacin celular
9 Regulacin por seales extracelulares (hormonas,
factores de crecimiento)
El acetil-CoA
Estructura del CoA
Funciones
10
(ATP)
11
12
13
14
TEMA 9
Metabolismo de los hidratos de
carbono
1.
2.
3.
4.
Glicolisis y gluconeognesis
Destinos del piruvato
Ruta oxidativa de los fosfatos de pentosa
Metabolismo del glucgeno
Etapas de la
glicolisis
La glucosa es un combustible muy
importante para la mayora de
organismos.
La va de oxidacin de la glucosa se
denomina glicolisis
Toda la va tiene lugar en el citoplasma, en
eucariotas, y consta de tres etapas
Reaccin
fosforilacin
isomerizacin
fosforilacin
ruptura
isomerizacin
Deshidratacin
Fosforilacin a
nivel de sustrato
8
Gluconeognesis
Consiste en la sntesis de glucosa a partir
de piruvato o aminocidos.
Est catalizada por los mismos enzimas
que la ruta de glicolisis excepto en 3 vas
alternativas:
1.
2.
3.
10
11
12
13
Fermentacin alcohlica
Se produce en levaduras
14
Fermentacin lctica
El ciclo de Cory
ETAPA
OXIDATIVA
Ruta de
glicolisis
ETAPA NO
OXIDATIVA
20
Biosntesis de glucgeno
El glucgeno es un polmero ramificado de
glucosa. Constituye la reserva de glucosa de los
tejidos animales (principalmente hgado y msculo)
Su sntesis est catalizada por la glucgeno sintasa
que forma un enlace glucosdico entre unidades de
glucosa (activadas en forma de UDP-glucosa) con el
extremo no reductor del polmero de glucgeno.
Posteriormente, la enzima ramificadora formar
las ramificaciones
22
La enzima desramificadora
completa el proceso.
23
24
25
TEMA 10
Fijacin autotrfica del CO2
1. Ciclo de Calvin
2. Metabolismo del almidn
Ciclo de Calvin
Es el proceso de fijacin del CO2 atmosfrico que realizan los organismos
autotrofos para sintetizar azcares. Consta de 3 etapas:
Etapa I: Fijacin del CO2.
Etapa II: Reduccin y
produccin de azcares.
Etapa III: Regeneracin
del aceptor de CO2 (ribulosa
1,5-bisfosfato).
El rendimiento neto del ciclo ser
de una triosa-P por cada 3
molculas de CO2 asimiladas.
3
Biosntesis de
sacarosa
TEMA 11
Metabolismo de lpidos y de
aminocidos
1.
2.
3.
4.
5.
6.
cido
graso
La carnitina y un transportador
facilita la entrada del acilo en la
mitocondria.
reduccin
Deshidratacin
reduccin
7 malonil-CoA + 7 ADP + 7 Pi + 14 H+
En total:
8 acetil-CoA+ 7 ATP + 14 NADPH +6 H+
Palmitato + 14 NADP+ + 8 CoA + 6 H2O + 7 ADP + 7 Pi
Degradacin de aminocidos
Los aminocidos se interconvierten o degradan durante: a) la eliminacin de
protenas celulares; b) la eliminaci de las protenas de la dieta; c) el ayuno
prolongado.
Etapas de la degradacin:
1. Separacin del grupo -amino. Se realiza por dos tipos de reacciones:
9
Transaminacin
Desaminacin oxidativa
2.
3.
transaminacin
desaminacin oxidativa
aspartato + -cetoglutarato
oxalacetato + glutamato
aspartato aminotransferasa
Alanina + -cetoglutarato
piruvato + glutamato
alanina aminotransferasa
Las aminotransferasas (transaminasas) canalizan el -amino
de muchos aminocidos hacia el -cetoglutarato.
Son reacciones reversibles. Tambin sirven para sintetizar
aminocidos.
Las aminotranferasas contienen de grupo prosttico el
piridoxal fosfato.
Glutamato deshidrogenasa
Ciclo de la urea
Convierte amonio (intramitocondrial)
en urea, una molcula menos txica.
Slo se produce en el hgado y
participan enzimas mitocondriales y
citoslicas.
transaminaciones
gluconeogenesis
glicolisis
Integracin del
metabolismo en
mamferos
Nutriente
almacenado
Nutriente
preferido
Nutriente que
exporta
Cerebro
ninguno
glucosa (cuerpos
ninguno
cetnicos en ayuno)
Msculo (reposo)
glucgeno
cidos grasos
ninguno
Msculo
(ejercicio)
ninguno
glucosa
lactato, alanina
Corazn
ninguno
cidos grasos
ninguno
Tejido adiposo
triacilgliceroles
cidos grasos
cidos grasos,
glicerol
Hgado
glucgeno,
triacilgliceroles
aminocidos,
glucosa, cidos
grasos
cidos grasos,
glucosa, cuerpos
cetnicos
Das de ayuno
Terminologa
file:///D:/QUIM/gree
mediante enlaces
(1->4).
la forma ionizada
hexadecenoico.
del
cido
palmitoleico.
El
nombre
sistemtico
es
cis-9-
file:///D:/QUIM/gree
cidos grasos
-3: cidos grasos que se encuentran en
cantidades relativamente grandes de aceites de pescado en comparacin con las
cantidades de carnes rojas. Estos cidos tienden a disminuir las concentraciones
sricas de colesterol y de triacilgliceroles.
cidos poliprticos: cidos capaces de donar ms de un protn.
Acil-ACP: donador de grupos acilo en la sntesis bacteriana del cido fosfatdico a
partir del glicerol-3-fosfato .
Acil-CoA: la forma ms comn en la que los grupos acilo reaccionan en la sntesis de
los lpidos acilados.
Aciltransferasas: enzimas que catalizan la transferencia de grupos acilo en la
sntesis de los lpidos.
Acoplamiento: fenmeno de unin de dos procesos a otro de tal manera que
resultan ser interdependientes.
Acoplamiento quimiosmtico: modelo aceptado de manera general, propuesto por
Peter Mitchell, que explica la sntesis de ATP en la fosforilacin oxidativa.
ACP (protena transportadora de acilo): grupo acilo transportador que se utiliza
en la biosntesis de los cidos grasos.
ACS: una secuencia de par de base 11, 5-TTTTATATTTT-3 localizada en mltiples
copias de una secuencia ARS de levadura.
Actina: membrana proteica perifrica de los eritrocitos que ayuda a unir la espectrina
a la membrana por sus extremos y que forma complejos con una tropomiosina
eritrocitaria especfica.
Actina: una protena que, combinada con la miosina, ATP y calcio, proporciona
movimientos contrctiles en una clula.
Actina F: polmero helicoidal alargado de actina que resulta de la unin de ATP por el
monmero de actina.
Actina G: forma monomrica de la actina.
Actinomicina D: molcula que inhibe la transcripcin intercalndose entre los pares
de bases G-C adyacentes.
Activacin antergrada: hace referencia a los metabolitos en una ruta que activan
alostricamente a enzimas que estn por delante de ellos en la ruta en la que se
metabolizan. Por ejemplo, la fructosa-1-6-bisfosfato activa la piruvato quinasa
alostricamente mediante un mecanismo antergrado.
Activador alostrico: efector heteroalostrico que desplaza el equilibrio TR hacia el
estado R.
Adenililacin/desadenililacin: mecanismo de modificacin covalente que regula la
glutamina sintetasa. En el interior de esta, un residuo de tirosina especfico (cercano
al lugar activo) reacciona con el ATP para formar un ster entre el grupo hidroxilo
fenlico y el fosfato del AMP resultante. En la glutamina sintetasa se pueden encontrar
doce lugares adenililados. El efecto que se produce es acumulativo. La inhibicin est
correlacionada con la cantidad de adenililacin. La enzima que cataliza la reaccin es
un complejo de adenilil transferasa y una protena reguladora denominada PII.
Adenilato ciclasa: enzima que cataliza la conversin de ATP en AMP cclico. La
actividad de la adenilato ciclasa est estimulada por la activacin de la protena G .
5-adenosilcobalamina: una de las dos formas de la vitamina B12 con actividad
enzimtica que se ocupa de la isomerizacin del glutamato a -metilaspartato.
Adipocitos: clulas que estn especializadas en el almacenamiento de triacilgliceroles
y en su liberacin a la sangre en forma de cidos grasos y glicerol, cuando sea
necesario.
ADN: ADN es la sigla de cido desoxirribonucleico.
desoxirribonucletidos y transporta informacin gentica.
Es
un
polmero
de
ADN fotoliasa: enzima que repara los dmeros de ciclobutano pirimidina en presencia
de luz visible.
ADN girasa: topoisomerasa de tipo II de E. coli capaz de relajar una molcula de ADN
superenrollado e introducir giros superhelicoidales negativos en ella.
ADN ligador: trmino que describe la parte del ADN localizada entre los nucleosomas
sucesivos en la cromatina.
ADN ligasa: enzima que cataliza la unin covalente del extremo 5 de una cadena al
extremo 3 de otra. La enzima cataliza la formacin de enlaces fosfodister entre los
extremos y es muy importante para la unin de los fragmentos de Okazaki.
ADN polimerasa I: una ADN polimerasa en E. coli con una actividad 5 -> 3
exonucleasa (muy til para eliminar los fragmentos de Okazaki), una actividad 3 ->
que
contiene
necesidad se debe a una mutacin que inactiva una enzima necesaria para la sntesis
endgena de la sustancia.
Axn: prolongacin en forma de hebra que se extiende a partir de una clula nerviosa
por la que se transmiten los impulsos a otras clulas nerviosas o a clulas efectoras,
como las musculares o las glandulares. La mayor parte de las clulas nerviosas tienen
un solo axn. Hay otras extensiones ms cortas que reciben los impulsos de otras
neuronas y a las que se denomina dendritas.
Axn presinptico: clula nerviosa que transporta el potencial de accin al bulbo
terminal.
Axonema: en un cilio, un haz de microtbulos muy organizado envuelto por una
prolongacin de la membrana plasmtica.
Axones: prolongaciones que permiten a una clula nerviosa conectar con otra.
Azida: inhibidor del transporte electrnico que funciona inhibiendo la citocromo
oxidasa (complejo IV). Este compuesto reacciona con la forma oxidada del complejo.
Azcares: tambin denominados sacridos. Molculas cuya estructura general es
(CH2O)n. Los azcares ms comunes son la glucosa y la galactosa.
Bacitracina: antibitico que destruye bacterias al interferir en la sntesis del
peptidoglucano mediante la inhibicin de la conversin del undecaprenol pirofosfato en
undecaprenol fosfato.
Bacterias desnitrificantes: bacterias que catabolizan el NH3 en N2.
Bacterias gramnegativas: bacterias que no retienen el colorante de Gram (un
complejo de yodo).
Bacterias grampositivas: bacterias que retienen el colorante de Gram (un complejo
de yodo).
Bacteriocinas: protenas codificadas por bacterias. Se liberan por el organismo y
destruyen a otras bacterias.
Bacterioclorofila b: un tipo de clorofila de las bacterias fotosintticas.
Balance del nitrgeno negativo: condicin del metabolismo del nitrgeno, que se
observa en la vejez, la inanicin y determinados estados patolgicos, en la que la
ingestin diaria de nitrgeno es inferior a la de la prdida.
Balance del nitrgeno positivo: condicin del metabolismo del nitrgeno, que se
observa durante el embarazo, el crecimiento de un nio o la recuperacin despus de
un perodo de inanicin, en la que la ingestin diaria de nitrgeno iguala las prdidas
diarias excesivas.
Banda A: regin del sarcmero que abarca la longitud total de los filamentos gruesos.
Contiene filamentos gruesos, extremos de filamentos finos adyacentes y la zona H.
Bandas I: regin entre los extremos de los filamentos gruesos adyacentes. Contiene
lneas Z.
Barrera de energa libre: la diferencia entre la energa libre de una molcula en su
estado inicial y la energa libre de la molcula en su estado activado.
file:///D:/QUIM/gree
Bucle T
file:///D:/QUIM/gree
-Caroteno:
accesorio de las plantas.
Cascada de caspasas: una cascada proteoltica que surge del hecho de que las
enzimas pueden fragmentarse en el lado carboxilo del aspartato y de que sta es
precisamente la forma en la que se activa la enzima precursora inactiva.
Cascada quinasa: hace referencia a la cascada reguladora implicada en el control
hormonal de las acciones celulares mediadas por el cAMP. Se denomina cascada
quinasa porque la regulacin definitiva se produce como resultado de la accin de una
serie de enzimas de quinasa que aaden fosfatos a otras molculas.
Cascada reguladora: sistema regulador que controla la modificacin covalente de las
enzimas, ms frecuentemente cuando la unin de una nica molcula hormonal a la
superficie de la clula tiene como consecuencia la rpida activacin de muchas
molculas enzimticas mediante la modificacin covalente. La cascada reguladora
generalmente comporta la fosforilacin (por ejemplo: el sistema regulador que
controla la modificacin covalente de la glucgeno fosforilasa en la que una serie de
fosforilaciones de un conjunto de enzimas proporciona una gran amplificacin de una
seal procedente de la unin de una nica molcula hormonal con la superficie celular,
dando como resultado la activacin rpida de muchas molculas enzimticas).
Caspasas: familia de proteasas que se rompen en el lado carboxilo del aspartato (casp-ase) y se sintetizan como precursores inactivos que pueden activarse mediante
dicha ruptura. As pues, una vez desencadenada la activacin, existe la posibilidad de
que se produzca una cascada de caspasas.
Catablico: hace referencia a los procesos metablicos que degradan las molculas
complejas a otras ms sencillas, liberando energa. La gluclisis es una ruta
catablica.
Catabolismo: la suma de todos los procesos metablicos mediante los cuales las
molculas complejas se degradan a otras ms sencillas, y que incluye los procesos
mediante los cuales las molculas se degradan para proporcionar energa celular.
Catalasa: enzima que cataliza la reaccin: 2H2O2 -> 2H2O + O2.
Catalizador: sustancia que aumenta la rapidez o velocidad de una reaccin qumica,
sin verse alterada ella misma en el proceso global.
Catecolaminas: una clase de molculas dihidroxiladas como la dopa, la dopamina, la
noradrenalina y la adrenalina, que derivan de la tirosina en los animales.
Catepsinas: grupo de proteasas lisosmicas diseadas para actuar en un medio
cido.
cdc2: una serina/treonina quinasa de la levadura cuya activacin necesita de la
asociacin con ciclinas. Una ciclina activa esta protena al comienzo de la fase S y otra
la reactiva al principio de la mitosis.
Clulas B: clulas linfticas producidas por los linfocitos B en la respuesta inmunitaria
humoral.
Clulas de Schwann: clulas especializadas que envuelven un axn en capas de una
membrana de mielina aislante.
Clulas espumosas: clulas inmunes rellenas de colesterol que contribuyen a la
formacin de las placas aterosclerticas.
Clulas T: clulas linfticas producidas por el timo que participan en la respuesta
inmunitaria celular.
Clulas T destructoras: principales participantes en la respuesta inmunitaria celular,
tambin denominadas clulas T citotxicas.
Clulas exocrinas: clula que segrega una sustancia que se excreta a travs de un
conducto hacia el tubo digestivo o hacia el exterior del organismo.
Celulasas: una clase de enzimas que catalizan la ruptura del enlace (1->4) de la
celulosa. Se encuentran en las bacterias del aparato digestivo de los rumiantes, en los
protozoos del intestino de las termitas y en muchos hongos.
Celulosa: polmero de unidades de glucosas unidas mediante enlaces (1->4).
Centrifugacin diferencial: tcnica que se emplea para separar las estructuras,
tales como los orgnulos celulares, tomando como referencia su tamao.
Centro asimtrico: (centro de quiralidad) en lo que respecta a los compuestos
orgnicos, un tomo de carbono que tiene cuatro sustituyentes distintos fijados a l.
Un grupo como ste no puede superponerse a su propia imagen especular y puede
existir, por tanto, en dos enantimeros.
Centro de reaccin: parte del aparato fotosinttico en el que el electrn excitado
procedente de la estimulacin luminosa se transfiere a un aceptor de electrones
Coenzimas: pequea molcula orgnica que se une a una enzima y que es esencial
para su actividad, pero que no sufre una alteracin permanente por la reaccin. La
mayor parte de estos compuestos derivan metablicamente de las vitaminas.
Coenzima A: coenzima implicada en las reacciones de transferencia de grupos acilo.
Coenzima Q (ubiquinona o CoQ): aceptor electrnico de los complejos I y II de la
cadena respiratoria. Dona electrones al complejo III.
Colecalciferol (vitamina D3): la forma ms abundante de la vitamina D. No es
necesario ingerirla en el alimento. Se obtiene mediante la conversin del 7deshidrocolesterol, un intermediario en la biosntesis del colesterol.
Colestanol: un derivado totalmente saturado del colesterol.
Colesterol: componente lipdico importante de las membranas que tambin est
involucrado en la aterosclerosis. Acta como precursor de las hormonas esteroides.
Colesterol bueno: trmino utilizado para describir las HDL que se basa en el hecho
de que la concentracin elevada de HDL contrarresta la aterognesis.
Colesterol malo: trmino utilizado para describir las LDL que se basa en el hecho de
que la concentracin elevada de LDL conduce a la aterosclerosis.
Complejo ATP sintasa: tambin denominado complejo V.
Complejos de captacin de luz: forman parte del aparato fotosinttico. Cada uno
de ellos es un complejo proteico de mltiples subunidades que contiene mltiples
molculas de pigmento antena y un par de molculas de clorofila que actan como
centro de reaccin, atrapando los cuantos de energa excitados por la absorcin de la
luz.
Complejo de Golgi: apilamiento de vesculas membranosas planas que se encuentra
en el citoplasma de las clulas eucariotas. Acta como centro de direccionamiento de
las protenas destinadas a la secrecin, a los lisosomas o a la membrana celular;
realiza unas funciones similares para los lpidos de la membrana y modifica y termina
las porciones de oligosacridos de las glucoprotenas. En el se produce la maduracin
de las glucoprotenas, de otros componentes de las membranas y de los vasos
secretores.
Complejo de troponina: tres protenas (troponinas I, C y T) que forman una
estructura que controla el acceso de las cabezas de miosina a la actina, regulando as
la formacin de puentes cruzados y la contraccin muscular.
Complejo enzima-sustrato: intermediario en la catlisis enzimtica en la que el
sustrato est unido en el lugar activo de la enzima o prximo al estado de transicin.
Complejo F0F1: complejo ATP sintasa, tambin denominado complejo V.
Complejo nitrogenasa: sistema enzimtico responsable de la reduccin del N2.
Complejo promotor abierto: complejo producido como resultado de un
desenrollamiento muy dependiente de la temperatura de varios pares de bases de
ADN mediante la ARN polimerasa durante la iniciacin de la transcripcin.
Complejo promotor cerrado: complejo producido como resultado de la interaccin
inicial entre la ARN polimerasa y el promotor.
file:///D:/QUIM/gree
(1->4).
file:///D:/QUIM/gree
Dipolo inducido: una molcula, como el benceno, con una forma simtrica y sin
momentos dipolares en ausencia de interacciones externas puede tener una ligera
redistribucin de la carga electrnica, debido a la interaccin con un campo elctrico.
Esto provoca la formacin de un dipolo inducido en la molcula simtrica.
Dipolo permanente: las molculas, como el agua, que tienen una distribucin
asimtrica de la carga electrnica, debido a la geometra molecular y a las diferencias
de electronegatividad entre los tomos, son dipolos permanentes.
Disacridos: hidratos de carbono que contienen dos porciones de azcar.
Diterpeno: trmino aplicado al terpeno derivado del geranilgeranil pirofosfato.
Dodecil sulfato sdico (SDS): detergente sinttico que no precipita en el agua
dura.
Dolicol fosfato: lpido sobre el que se ensamblan las glucoprotenas ligadas por N.
Dominio: una parte de una cadena polipeptdica que se pliega sobre s misma para
formar una unidad compacta que contina siendo reconocible dentro de la estructura
terciaria de toda la protena.
Dominio constante: parte de una inmunoglobulina que es idntico para todos los
anticuerpos de una clase determinada.
Dominio variable: parte de una inmunoglobulina que vara en la secuencia de
aminocidos y la estructura terciaria de un anticuerpo a otro.
Donador electrnico: la molcula que se oxida en las reacciones que implican
oxidacin y reduccin. Por ejemplo, en la reaccin del ciclo del cido ctrico succinato
+ FAD <=> fumarato + FADH2, el succinato es el donador electrnico.
dUTPasa: enzima que fragmenta dUTP a dUMP ms PPi. Es importante para reducir la
cantidad de dUTP en la clula, por lo que se dispone de menor cantidad para la ADN
polimerasa durante la replicacin del ADN.
Ecuacin de Goldman: ecuacin que tiene en cuenta la permeabilidad de la
membrana para los diferentes iones en la determinacin del potencial de la
membrana.
Ecuacin de Henderson-Hasselbalch: pH = pKa + log ( [A-]/[HA] ).
Ecuacin de Michaelis-Menten: ecuacin que proporciona la velocidad de una
reaccin catalizada por una enzima en funcin de las concentraciones de sustrato y
enzima, as como de dos constantes que son especficas para una determinada
combinacin de enzima y sustrato: una constante de velocidad, kcat, para la
produccin cataltica del producto cuando la enzima est saturada, y la constante de
Michaelis, KM.
Ecuacin de Nernst: ecuacin que relaciona el potencial elctrico que existe a travs
de una membrana con las concentraciones de iones presentes a ambos lados de la
misma.
Edicin del ARN: proceso que afecta a los mARN mitocondriales de algunos
eucariotas unicelulares, que comporta la insercin o eliminacin de residuos de uridina
en los mensajes durante los pasos del proceso. Aparentemente, las inserciones estn
Elementos que responden a las hormonas (HRE): lugares del ADN en los que el
complejo hormona-receptor interacciona para afectar a la transcripcin de los genes.
Enantimeros:
(tambin
denominados
ismeros
pticos)
estereoismeros
configuracionales que no son imgenes especulares superponibles entre s. La
denominacin de ismeros pticos procede del hecho de que los enantimeros de un
compuesto desvan la luz polarizada en direcciones contrarias.
Encefalinas: pptidos pequeos que actan como neurohormonas responsables de la
falta de sensibilidad al dolor experimentada en situaciones de gran estrs o shock.
Entre ellas se incluyen ejemplos como la -endorfina, la met-encefalina y otras.
Endergnico: en un sistema no aislado, un proceso que se acompaa de un cambio
positivo de la energia libre (G) y que, por tanto, no est favorecido
termodinmicamente.
Endocitosis: proceso mediante el cual las clulas captan molculas grandes del
medio extracelular.
Endonucleasa apirimidnica: enzima que reconoce un lugar apirimidnico en el ADN
y rompe el enlace fosfodister en el lado 5 de la porcin de desoxirribosa.
Endonucleasas de restriccin: enzimas que catalizan la ruptura de la doble cadena
de ADN en secuencias de bases especficas.
Endosoma: en la endocitosis mediada por receptores, el nombre que reciben varias
vesculas revestidas de clatrina que se fusionan tras su absorcin en una clula.
Endorfinas: pptidos pequeos que actan como neurohormonas responsables de la
falta de sensibilidad al dolor experimentada en situaciones de gran estrs o shock.
Enediol: intermediario en una reaccin qumica en la que los dos carbonos de un
enlace doble se unen a los grupos hidroxilo. Este intermediario se produce en la
reaccin catalizada por la triosa fosfato isomerasa.
Energa de interaccin: la energa de interaccin, U, para dos partculas cargadas es
la energa necesaria para separarlas desde una distancia, r, a una distancia infinita. Es
una medida de la energa requerida para superar las fuerzas electrostticas entre
file:///D:/QUIM/gree
ellas. U = k*(q1q2)/(
son las cargas.
file:///D
Enlace peptdico: enlace que liga sucesivos aminocidos para formar un pptido.
Consiste en un enlace amida entre el grupo -carboxilo de un aminocido y el grupo
file:///D:/QUIM/gree
alcanzada
por una
hlice
entre
unidades de
polmeros
puede
producir
travs del estado de transicin. Esta ruta modificada tendr un estado como ste, que
es considerablemente inferior al estado de activacin de la reaccin sin catalizar.
Esteroides: grupo de sustancias formadas a partir del colesterol. Incluye diversas
hormonas importantes, entre las que se encuentran las hormonas sexuales de los
animales superiores.
Estereoismeros: molculas que contienen un centro de asimetra y que pueden
existir en formas isomricas tridimensionales distintas.
Esterol: una clase de esteroides con un grupo alcohol. Incluye el colesterol.
Estrgenos: grupo de hormonas esteroideas (estrona y estradiol), que mantienen las
caractersticas sexuales femeninas.
Estroma: estructura del cloroplasto que es anlogo a la matriz mitocondrial. Est
formado en el espacio entre la grana y la membrana mitocondrial interna. Es el lugar
donde se producen las reacciones oscuras de la fotosntesis.
Estructura 9+2: esquema de disposicin de los microtbulos en la parte interna de
un axonema.
Estructuras de clatrato: las molculas hidrfobas, que se disuelven en soluciones
acuosas, forman estructuras similares a las del hielo, denominadas estructuras de
clatrato, en lugar de capas de hidratacin que se forman mediante las molculas
hidrfilas.
Estructura primaria: para un cido nucleico, la secuencia de bases que hay en su
interior.
Estructura secundaria: plegado local del armazn de un polmero lineal para formar
una estructura de repeticin regular. Las formas B y Z de la hlice de ADN son
ejemplos de ello.
Estructura terciaria: estructura de plegado a gran escala en un polmero lineal que
es de un orden superior al de la estructura secundaria. Para las molculas de ARN, la
estructura terciaria es la forma tridimensional especfica en la que se pliega toda la
cadena.
Estructura secundaria: plegado local del armazn de un polmero lineal para formar
una estructura de repeticin regular. Las formas B y Z de la hlice de ADN y las
estructuras de hlice y lmina de los polipptidos son ejemplos de ello.
Etileno: una hormona
adenosilmetionina.
vegetal
que
procede
del
grupo
metionilo
de
la
S-
mediante
Exn: regiones del ARN eucariota que se unen por la accin de corte y empalme, y
aparecen en el ARN maduro final.
Exones: regin de la secuencia codificante de un gen que se traduce a una protena
(a diferencia de los intrones, que no se traducen). La denominacin procede del hecho
de que los exones son las nicas partes de un transcrito de ARN que se observan
fuera del ncleo de las clulas eucariotas.
Exonucleasa V (tambin denominada nucleasa RecBCD): protena de la
recombinacin de E. coli que se une en una ruptura de doble cadena en el ADN de
doble cadena y utiliza una actividad helicasa para desenrollar y degradar parcialmente
el ADN. Facilita la carga de RecA a un extremo 3.
Expansin clonal: mecanismo que permite la produccin a gran escala de
anticuerpos especficos. Las clulas B y T, producidas por el cuerpo, presentan
especificidades de antgenos generadas aleatoriamente. Cuando un antgeno
determinado se introduce en el cuerpo, induce la proliferacin tan slo en las clulas B
y T que son especficas para este. As pues, el antgeno selecciona las clulas que
provocarn una respuesta inmunitaria frente a este, estimulndolas para experimentar
una proliferacin clonal.
Explosin respiratoria: un rpido aumento de la captacin de oxgeno por los
leucocitos al engullir una clula bacteriana invasora. Se utiliza el oxgeno para generar
perxido de hidrgeno y superxido dismutasa para destruir al invasor.
Extremos cohesivos: secuencias cortas de oligonucletidos al final de un fragmento
de ADN. Son complementarias a las secuencias de los oligonucletidos al final de otro
fragmento de ADN.
Factor IX: protena de la sangre (tambin denominada factor de Christmas) que,
cuando el factor XI la activa, acta con el factor VII, el factor VI, y el factor tisular
para activar el factor X.
Factor V: protena de la sangre que acta junto con el factor X para activar la
protrombina en la trombina.
Factor VIII: protena de la sangre ausente en la hemofilia clsica. Acta junto con el
factor IX para ayudar en la activacin del factor X .
Factor X: protena de la sangre que, tras la activacin realizada por los factores IX,
VIII, VII y el factor tisular, acta con el factor V para convertir la protrombina inactiva
en trombina.
Factor XI: protena de la sangre que, cuando el factor XII la activa, cataliza la
activacin del factor IX .
Factor XII: protena de la sangre que, cuando las protenas quiningeno y calicrena
la activan, cataliza la activacin del Factor XI. Este factor tambin recibe el nombre de
factor de Hageman.
Factor XIII: protena de la sangre que convierte la fibrina II en fibrina I .
Factor de proliferacin que deriva de las plaquetas (PDGF): factor de
crecimiento que interacciona con los receptores de la superficie celular para estimular
la hidrlisis del fosfatidilinositol.
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
uniones (14)
con varias ramificaciones mediante enlaces
(16) [polmero de -D-glucopiranosa unido en enlaces (1->4) con ramificaciones
file:///D:/QUIM/gree
en la configuracin (1->6)].
almacenamiento de glucosa en los animales.
Es la forma ms importante de
Glucgeno fosforilasa: una enzima del msculo esqueltico que cataliza la ruptura
de los residuos de la glucosa a partir del glucgeno mediante la ruptura y fosforilacin
de los residuos de los extremos no reductores durante la glucogenlisis. La enzima
est regulada por la modificacin covalente fosforilacin-desfosforilacin.
Glucogenlisis: movilizacin (degradacin) del glucgeno.
Glucolpido: tipo de compuestos en los cuales los sacridos estn unidos a los lpidos
de la membrana. Se trata de una subclase de antgenos de los grupos sanguneos.
Gluclisis: ruta inicial del catabolismo de los hidratos de carbono, en la que una
molcula de glucosa se degrada a dos molculas de piruvato, con una produccin neta
de molculas de ATP y la reduccin de dos molculas de NAD+ a NADH. En condiciones
aerobias, estas molculas de NADH se reoxidan mediante la cadena de transporte
electrnico; en condiciones anaerobias, se utiliza un aceptor de electrones diferente.
Gluclisis aerobia: hace referencia a la gluclisis que tiene lugar en condiciones
donde hay transporte de electrones y fosforilacin oxidativa. Esto significa que el
oxgeno debe estar presente.
Gluclisis anaerobia: hace referencia a la gluclisis que tiene lugar en condiciones
de ausencia de oxgeno. Cuando tiene lugar la gluclisis anaerobia, el NADH ha de
reciclarse en NAD+. Esto ocurre normalmente con la produccin de lactato a partir de
piruvato (animales y algunas bacterias) o con la produccin de etanol a partir de
piruvato (levadura).
Gluconeognesis: biosntesis de hidratos de carbono a partir de precursores de tres
y cuatro carbonos, que generalmente no tienen naturaleza de hidratos de carbono
Glucoprotenas: protenas con cadenas de oligosacridos o polisacridos unidas a
ellas de forma covalente.
Glucoprotena ligada por O: glucoprotena en la que el oligosacrido est unido
(ms comnmente) a la protena a travs de la unin N-acetilgalactosamina-serina (o
treonina).
Glucosaminoglucanos: grupo de polisacridos de la piel y del tejido conjuntivo de
los animales vertebrados. Estos compuestos forman una matriz para mantener unidos
los componentes proteicos de estos tejidos.
Glucsidos: tipo de compuestos que se forma mediante la eliminacin de agua entre
el hidroxilo anomrico de un monosacrido cclico y el grupo hidroxilo de otro
compuesto.
Glutatin: antioxidante biolgico que reduce qumicamente azufres oxidados a
protenas. Tambin ayuda a reducir los perxidos.
5,10-
Hormona
corticotrpica
suprarrenal
(ACTH,
tambin
denominada
file:///D:/QUIM/gree
Intrones: regiones del ARN eucariota que se eliminan del producto final del producto
del ARN final por la accin de corte y empalme.
Invasin de la cadena: proceso que ocurre en la recombinacin homloga en la que
una parte no apareada de una cadena de ADN invade una regin de un dplex de otro
ADN.
Ion perferrilo: intermediario hierro-oxgeno muy reactivo generado como resultado
de la accin P450. Este grupo muy reactivo puede captar un tomo de hidrgeno,
incluso de un sustrato poco reactivo como un hidrocarburo.
Ion superxido: especie reactiva que se genera como consecuencia de la reduccin
de un electrn de O2, para formar O2-.
Ionforo: molcula que permite el movimiento de las molculas cargadas a travs de
una membrana.
Ionforos: sistemas de transporte (por poros o por transportadores) que facilitan el
transporte de iones a travs de la membrana.
Islotes de Langerhans: agrupaciones de las clulas del pncreas que actan como
tejido endocrino. Existen cuatro tipos de clulas diferentes.
Ismeros configuracionales: diferentes estructuras tridimensionales de una
molcula que s suponen rotura y formacin de enlace (enantimeros y
diatereoismeros).
Ismeros conformacionales: diferentes estructuras tridimensionales de una
molcula que no suponen rotura de enlace, slo giro alrededor del enlace C-C (forma
eclipsada, alternada, gauche, anti, forma de silla, bote). A menudo aparecen a partir
de procesos moleculares inhibidores, tales como la ciclacin.
Isomerasas: una de las seis clases de enzimas reconocidas por la Comisin de
Enzimas de la Unin Internacional de Bioqumica y Biologa Molecular (IUBMB). Esta
enzima cataliza reordenamientos intramoleculares.
Isopreno: compuesto generalizado de cinco carbonos a partir de los cuales se forman
los isoprenoides.
Isoprenoides (terpenos): una clase de lpidos que se producen uniendo una o
varias unidades de isopreno. Los terpenos incluyen los siguientes compuestos:
esteroides, cidos biliares, vitaminas liposolubles y otros compuestos.
Isopropil tiogalactsido (IPTG): inductor sinttico del opern lactosa.
Isoproterenol: un agonista que se utiliza para el tratamiento del asma. Interacciona
con una clase especfica de receptores adrenrgicos.
Isozimas: formas diferentes de la
deshidrogenasa tiene varias isozimas.
misma
enzima.
Por
ejemplo,
la
lactato
Jabn: tipo de compuestos producidos al hidrolizar las grasas con lcalis como NaOH
o KOH.
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se
une
la
file:///D:/QUIM/gree
modelo
Modelo de opern: modelo originalmente propuesto por Jacob y Monod que era una
hiptesis de unificacin de la transcripcin en organismos procariotas.
Modelo del mosaico fluido: modelo, originariamente propuesto por S. J. Singer y G.
L. Nicholson, que describe la estructura de la membrana celular, segn el cual las
protenas estn incluidas en una bicapa fosfolipdica y tienen libertad de movimiento
en el plano de la membrana.
Modelo secuencial de alosterismo: modelo que explica la cooperacin (despus del
modelo de Koshland, Nemethy y Filmer) en la que la presencia de una subunidad de
hemoglobina portadora de oxgeno favorece la formacin del estado de unin fuerte
de las subunidades adyacentes, cuyos lugares de unin del oxgeno no estn ocupados
an. Estos modelos se caracterizan por la existencia de molculas con algunas
subunidades en estado dbil y otras en estado fuerte.
Modificacin covalente: un medio para regular la actividad de algunas enzimas. En
el caso de la glucgeno fosforilasa o la piruvato quinasa, la modificacin covalente
implica aadir o quitar un grupo fosfato. Cuando la glucgeno fosforilasa contiene
fosfatos, se dice que est en la forma activa. Por otro lado, cuando la piruvato quinasa
est fosforilada es menos activa.
Molculas de pigmento antena: conjunto de molculas a travs de las cuales la
energa capturada (en forma de electrn excitado) de un fotn de luz puede discurrir
antes de llegar al centro de reaccin. La mayor parte de las clorofilas actan como
molculas antena.
Momento dipolar: las molculas que tienen una distribucin asimtrica de la carga
son dipolos. La magnitud de la asimetra se denomina momento dipolar de una
molcula.
Monocapas: reordenamiento de las molculas, normalmente en la superficie de un
lquido, en el que slo est presente una nica capa de dichas molculas.
Monosacrido: molculas monomricas pequeas de hidratos de carbono, que
comprenden los azcares simples.
Monxido de carbono: molcula con una forma parecida al oxgeno, que est unida
a la mioglobina y a la hemoglobina de forma ms fuerte que el oxgeno. Es un gas
txico que bloquea la respiracin. Inhibidor del transporte electrnico que funciona
mediante la inhibicin de la citocromo oxidasa (complejo IV). Este compuesto
reacciona con la forma reducida del complejo.
Mononucletido de flavina (FMN): grupo prosttico de NADH deshidrogenasa.
Monoterpeno: trmino que hace referencia a un terpeno derivado del geranil
pirofosfato.
Motivo hlice-vuelta-hlice: estructura proteica localizada en el complejo CRPcAMP-ADN. Es una estructura comn en las protenas reguladoras de la unin al ADN.
Mucinas: glucoprotenas que se encuentran en cantidades abundantes en las
secreciones salivares y que contienen muchos glucanos cortos con enlaces O-.
Msculo blanco: una de las dos categoras de msculo estriado. Se utiliza para
movimientos ocasionales frecuentemente rpidos.
file:///D:/QUIM/gree
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100C
o superiores.
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con el entorno.
E = q - w.
Procesividad: para una ADN o una ARN polimerasa, el nmero medio de nucletidos
incorporados por proceso de unin entre la polimerasa y un extremo 3 cebador.
Describe la tendencia de una polimerasa a permanecer unida a un molde.
Procolgeno: forma del colgeno de reciente traduccin en la que se produce la
hidroxilacin y la adicin de residuos de azcares, pero en el que no se ha formado la
triple hlice.
Produccin pre-estado estacionario: perodo de tiempo inicial en una reaccin
enzimtica previo al establecimiento de las condiciones del estado estacionario.
Durante este perodo de tiempo, se puede producir un estallido de producto
rpidamente.
Profase: una parte del ciclo celular mittico durante el cual se produce la
condensacin de los cromosomas, la formacin del huso y la desintegracin de al
envoltura nuclear.
Progestgenos: un grupo de hormonas esteroideas que regula los fenmenos que se
producen durante el embarazo y son los precursores de todas las dems hormonas
esteroideas.
Proinsulina: polipptido de 81 residuos que es el precursor inmediato de la insulina.
Procede de la preproinsulina.
Promotor: secuencia de ADN reconocida por la ARN polimerasa, dando lugar a la
iniciacin de la transcripcin.
Propranolol: un antagonista de otra clase de receptores adrenrgicos, que controlan
la presin arterial y la frecuencia cardaca.
Proteasas: (tambin denominadas enzimas proteolticas) encimas que rompen los
enlaces peptdicos de un polipptido. Muchas presentan especificidad para una
determinada secuencia de aminocidos.
Proteasoma: proteasa grande dependiente de ATP que se encuentra en el citosol
eucariota. complejos proteolticos que degradan las protenas ubiquitinadas.
Protenas: se puede pensar que las protenas son cadenas polipeptdicas maduras.
Las protenas, al igual que los polipptidos, son una cadena de aminocidos unidos por
enlaces peptdicos, pero difieren de los polipptidos en que estn plegadas en la
configuracin tridimensional apropiada y/o en que estn modificadas. Las protenas
pueden tener una o ms cadenas polipeptdicas.
Protenas asociadas a los microtbulos (MAPs): protenas que se unen a los
microtbulos.
Protenas cromosmicas no histonas: una enorme variedad de protenas, como las
polimerasas y otras enzimas nucleares, las protenas receptoras hormonales y las
protenas reguladoras de muchos tipos que se encuentran en el ncleo eucariota
asociado con el ADN.
Protena de ensamblaje: protena de la superficie del retculo endoplsmico rugoso
que une al ribosoma a la protena con la secuencia seal en la superficie, de manera
que la protena puede insertarse en la membrana.
Protenas de fusin: protenas codificadas por genes que se han fusionado juntos in
vitro a partir de dos o ms orgenes, haciendo posible la recombinacin de los lugares
de unin y los lugares catalticos de formas novedosas.
Protena de la banda 4.1: protena perifrica de la membrana del eritrocito que se
encuentra en las uniones de espectrina.
Protena de unin al ADN de cadena nica (SSB, tambin denominada
protena desestabilizadora de la hlice): protena de E. coli que se une al ADN
para estabilizar una estructura en la que las superficies de enlace de hidrgeno de las
bases del ADN tienen una orientacin espacial orientada hacia los nucletidos
entrantes.
Protena del canal aninico (protena de la banda 3): protena integral de la
membrana del eritrocito. Est ligada a la espectrina mediante una protena
denominada aducina. La funcin de esta protena es permitir el paso de los iones
bicarbonato y cloruro a travs de la membrana y, de este modo, facilita el transporte
de dixido de carbono por la hemoglobina. Puede asociarse con la gliceraldehdofosfato deshidrogenasa. El dominio N-terminal de esta protena est relacionado con la
protena perifrica, ankirina.
Protenas del complejo principal de histocompatibilidad (protenas MHC): una
clase de molculas parecidas a las inmunoglobulinas que se encuentran en la
superficie de las clulas infectadas y que son el objetivo de unin de las clulas T.
Protenas fibrosas: una clase de protenas que se caracteriza por su forma alargada
o filamentosa. La mayora de estas protenas desempea funciones estructurales en
las clulas y los tejidos animales: mantienen las cosas juntas.
Protenas G: una clase de protenas que transducen las seales recibidas en el
file:///D:/QUIM/gree
receptor adrenrgico
para catalizar la sntesis del AMP cclico.
Protena receptora de cAMP (CRP): protena de E.coli que interacciona con cAMP y
que sufre un cambio conformacional que incrementa su afinidad por varias secuencias
de ADN, incluyendo un lugar en el opern lac adyacente al lugar de unin de la ARN
polimerasa.
Protena SecB: una chaperona molecular implicada en la secrecin de los
polipptidos procariotas.
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file:///D:/QUIM/gree
(1->4).
file:///D:/QUIM/gree
-queratinas
file:///D:/QUIM/gree
-queratinas
file:///D:/QUIM/gree
Replicn: agrupacin del ADN que incluye la secuencia de nucletidos en los que se
inicia la replicacin del ADN y los genes estructurales para las protenas cuya accin
sobre la secuencia de origen inicia la replicacin en ese punto.
Replisoma: complejo de replicacin multiproteico del ADN.
Representacin de Eadie-Hofstee: grfica de la actividad enzimtica que se
obtiene mediante la representacin de V/[S] frente a V, donde V es la velocidad de
reaccin .
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
/ (1-
file:///D:/QUIM/gree
= lugares de
mayora con cinco carbonos. La ruta es una fuente de ribosa para los nucletidos y de
NADPH para la biosntesis
Ruta de novo: trmino utilizado para describir reacciones bioqumicas sintticas en
las que los productos estn completamente creados a partir de materiales sin refinar,
en oposicin a los productos creados mediante la reconstruccin de un substrato
procedente de la degradacin del producto. Estos ltimos productos pertenecen a los
procesos denominados rutas de salvamento.
Ruta de salvamento: trmino utilizado para describir reacciones bioqumicas
sintticas en las que los productos se crean mediante la reconstruccin de un sustrato
resultante de la degradacin del producto (o producto relacionado).
Ruta del glioxilato: ruta metablica central presente slo en algunos organismos.
Evita las descarboxilaciones oxidativas del ciclo del cido ctrico
Rutas centrales: rutas del metabolismo que son bsicamente las mismas en muchos
organismos distintos. Proporcionan una explicacin al fenmeno de las cantidades
relativamente grandes de transferencia de masa y de generacin de energa que se
producen en el interior de una clula. Son las rutas principales desde el punto de vista
cuantitativo.
ruvA: protena implicada en la recombinacin de E. coli. Es una protena de unin del
ADN, cuya especificidad la dirige hacia la estructura de Holliday de cuatro cadenas.
ruvB: protena implicada en la recombinacin de E. coli. Es una protena motora que
requiere ATP, y que se une a dos brazos opuestos de la unin de Holliday y los gira en
direcciones opuestas, forzando la migracin de brazo al dirigir el movimiento rotativo
de las otras dos cadenas hacia la unin.
ruvC: protena implicada en la recombinacin de E. coli. Inicia la resolucin de la
estructura de Holliday mellando dos cadenas.
ruvD: un componente de la helicasa del sistema de reparacin por escisin de
nucletidos de E. coli.
30S: trmino que hace referencia a la subunidad pequea de los ribosomas
procariotas. Su denominacin se basa en su tamao. -S es una unidad de fuerza
centrfuga relacionada con el tamao. Esta subunidad contiene 21 protenas diferentes
y una sola molcula de rARN 16S.
40S: la subunidad ribosmica pequea en las clulas eucariotas. Contiene el rARN
18S.
50S: trmino que hace referencia a la subunidad grande de los ribosomas procariotas.
Su denominacin se basa en su tamao. -S es una unidad de fuerza centrfuga
relacionada con el tamao. Esta subunidad contiene 31 protenas diferentes y dos
molculas de rARN, un rARN 23S y un rARN 5S.
60S: la subunidad ribosmica grande en las clulas eucariotas. Contiene los rARN
28S, 5S, y 5,8S.
80S: el ribosoma eucariota completo, que contiene una subunidad 40S y otra 60S, as
como rARN asociados.
Sacridos: compuestos que poseen una estructura con la frmula simple, (CH2O)n,
aunque existen algunas excepciones, tales como las molculas que contienen grupos
amino, sulfato y fosfato. Tambin denominados hidratos de carbono.
Sales biliares: compuestos formados por la combinacin de un cido biliar en un
enlace amida con un aminocido. Sustancias detergentes secretadas por la vescula
biliar. Proceden del colesterol y ayudan a emulsionar las grasas tras una comida.
Salting in: efecto de una cantidad moderada de iones, que aumenta la solubilidad de
las protenas en una solucin.
Salting out: efecto de un exceso de iones que hacen que las protenas se precipiten a
partir de la solucin.
Salvaje: forma no mutante e inalterada de un gen en un organismo.
Saponificacin: proceso de produccin de un jabn en el que las grasas se hidrolizan
con lcalis como NaOH o KOH.
Sarcmero: unidad bsica contrctil del msculo estriado.
Saxitoxina: neurotoxina que contienen los dinoflagelados marinos responsables de la
marea roja. Se une al canal de sodio de las clulas nerviosas.
SecA: una ATPasa implicada en la secrecin de las protenas E. coli. Se une al poro
secretor y utiliza tanto la hidrlisis del ATP como el gradiente de potencial
electroqumico a travs de la membrana para facilitar la translocacin de la protena
fuera de la clula.
Secretina: sustancia que se libera en la porcin superior del intestino delgado y que
acta en el estmago estimulando el flujo del jugo gstrico como ayuda para la
digestin.
Secuencia de consenso: para un grupo de secuencias de nucletidos o aminocidos
que presentan semejanza pero que no son idnticas (por ejemplo, las secuencias de
una familia de secuencias genticas reguladoras relacionadas), una secuencia artificial
construida eligiendo para cada posicin el residuo que se encuentra aqu con ms
frecuencia en las secuencias estudiadas.
Secuencias de replicacin autnoma (ARS): secuencias de los cromosomas de la
levadura. Son esenciales para la replicacin de los plsmidos.
Secuencia lder: para una protena, una secuencia hidrfoba corta N-terminal que
provoca una translocacin de la protena en una membrana celular o a travs de ella.
Secuencias seal: un segmento de los aminocidos altamente hidrfobos en el
trmino amino de los genes bacterianos que apuntan al polipptido para la secrecin
(exportacin a travs de la membrana celular).
Secuencias Shine-Dalgarno: una secuencia conservada y comn en los mARN de
los procariotas que ayuda a orientar el ribosoma para que comience la traduccin. La
secuencia se sita justo antes del codn de comienzo de AUG y es complementaria al
extremo 3' del rARN 16S en el ribosoma.
Sedoheptulosa: una heptosa importante en la ruta de las pentosas fosfato.
la
infeccin
prolongada
del
virus
de
la
Sndrome disneico neonatal: condicin que se presenta en los recin nacidos que
no son capaces de sintetizar o secretar el agente tensioactivo pulmonar.
Sirohemo: porfirina de hierro parcialmente reducida que se encuentra en la nitrito
reductasa.
Simetra C2: tipo de simetra de doble plegado en la que las unidades se relacionan
unas con las otras mediante un eje binario (tambin llamado eje diado). Cada una de
las subunidades est rotada 180 con respecto a la otra.
Simetra C3: tipo de simetra de triple plegado en la que las unidades se relacionan
unas con las otras mediante un eje triple. Cada una de las subunidades est rotada
120 con respecto a la otra.
Simetra C4: tipo de simetra de cudruple plegado en la que las unidades se
relacionan unas con las otras mediante un eje cuaternario. Cada una de las
file:///D:/QUIM/gree
Simetra D2: tipo de simetra en la que las unidades estn relacionadas unas con las
otras mediante un eje cuaternario en un plano y las unidades del otro plano tienen
una simetra binaria con respecto al primer plano.
sistema
de
transduccin
de
seal
que
emplea
Sitio A: lugar de unin del tARN situado en la subunidad 50S del ribosoma. Durante la
traduccin, este lugar mantiene al tARN entrante junto con el aminocido para unirse
a la cadena peptdica en crecimiento.
Sitio E: lugar de unin del tARN situado en la subunidad 50S del ribosoma. Durante la
traduccin, el tARN que acaba de transferir su pptido al siguiente tARN se desplaza a
este lugar durante un breve perodo de tiempo antes de realizar su salida.
Sitio P: lugar de unin del tARN situado en la subunidad 50S del ribosoma. Durante la
traduccin, este lugar mantiene al tARN fijado a la cadena peptdica en crecimiento. El
tARN iniciador tambin ocupa este lugar en la iniciacin de la traduccin.
SNARES: protenas en las membranas de una vescula que se empareja con una
protena complementaria en la membrana diana.
Solucin de Fehling: solucin alcalina de Cu(II) que se utiliza para oxidar una aldosa
en un cido aldnico.
Succinato-coenzima Q reductasa: otro trmino para el complejo II de la cadena
respiratoria.
Superenrollamiento: para una doble hlice de ADN, una estructura que se produce
cuando las vueltas de las dos cadenas, una alrededor de la otra, cuyo nmero supera
o es inferior al nmero de vueltas existente en la confirmacin helicoidal ms estable.
Tan slo una hlice que es circular o est fijada de algn otro modo en ambos
extremos puede mantener el superenrollamiento.
Sustrato: sustancia sobre la que acta una enzima.
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
globina
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
fetales y, por
file:///D:/QUIM/gree
Tau (
): protena asociada a los microtbulos (MAP) que se
encuentra en el tejido neuronal. La fosforilacin de tau da lugar a su disociacin de los
microtbulos y su desestabilizacin. La hiperfosforilacin de tiene como resultado
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
file:///D:/QUIM/gree
subunidad de la protena
Gi. Esta toxina causa la tos ferina, la
reduccin de glucosa en sangre y produce la hipersensibilidad a la histamina.
Toxina del clera: toxina de Vibrio cholerae que rompe el NAD+ y transfiere su parte
file:///D:/QUIM/gree
de la Gs.
Traduccin: proceso llevado a cabo por los ribosomas que consiste en la sntesis de
un polipptido dirigida por un mARN, de manera que la secuencia de nucletidos del
mARN se traduce (se convierte) en una secuencia de aminocidos de la protena.
Trans-dominante: mutacin en un genoma que puede afectar a la expresin
gentica de otros. Un ejemplo claro es una mutacin en el gen represor lac que afecta
a secuencias a las que se une el represor.
file:///D:/QUIM/gree
glutamato
en
determinadas
protenas
para
dar
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Cuestiones de Bioqumica
Tema 1
Tabla 1
Tipo de enlace
Covalente
Energa
(kJ mol-1)
50 210
Inico
4 80
Puente de hidrgeno
4 30
24
0,5 3
kq1q2
, donde q1 y q2 son las cargas
r
Tabla 2
Medio
Constante
dielctrica
Agua
78,5
Metanol
32,6
Etanol
24,3
Cloroformo
4,8
Benceno
2,3
Hexano
1,9
Vaco
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Cmo crees que sern los enlaces de hidrgeno en medio acuoso en comparacin con
un medio hidrofbico? (NOTA: la molcula de agua tiene mucha tendencia a formar
enlaces de hidrgeno)
3) Dibuja una curva de valoracin con NaOH del aminocido glicina (+H3NCH2COO), cuyos
valores de pKa son, para el grupo amino 9,6 y , para el grupo carboxilo 2,34.
a) Cul es el grupo cido y cul el grupo bsico en esta molcula? Se trata de
cidos/bases fuertes o dbiles? Escribe sus equilibrios de ionizacin.
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Cuestiones de Bioqumica
Tema 2
1) Para cada uno de los siguientes aminocidos: Ala, Trp, Cys, Thr, Tyr, Gln, Asp, Glu, Lys, Arg, His.
a) Escribe los equilibrios de ionizacin (protonacin/desprotonacin) y calcula sus puntos
isoelctricos.
b) Dibuja sus curvas de valoracin indicando la posicin de todos los pKa y del pI
correspondientes a cada caso.
2) Completa la siguiente tabla indicando qu tipo de carga neta (positiva, negativa o nula) tendr
cada aminocido a cada pH indicado.
pH:
1,0
2,1
4,0
10,0
AMINOCIDO
Glicina
Aspartato
Lisina
Histidina
Tirosina
Cisteina
Arginina
Triptfano
3) Cmo podramos distinguir, mediante una valoracin sencilla una disolucin que contiene el
tetrapptido Leu-Asp-Phe-Gly de una mezcla equimolar de Leu, Asp, Phe y Gly? Cul de las dos
disoluciones sera mejor tampn?
4) Se dispone del pptido Gly-Asp-Trp-Lys en una disolucin a pH 6,0.
a) Formula la estructura de la forma inica predominante
b) Cuntos ml de NaOH 0,1 M se necesitarn para pasar el pptido a la forma que
predominara a pH 12,5?
5) La glicina es un aminocido muy conservado en la evolucin de las protenas, y muy a menudo
es irremplazable. Propn una explicacin posible teniendo en cuenta el papel estructural de este
aminocido. Cita algn ejemplo para apoyar tu explicacin.
6) Comenta la siguiente frase:
La adicin de un inhibidor de la enzima prolina hidroxilasa a la dieta de una rata provoca fragilidad
en sus vasos sanguneos, lesiones en la piel y encas sangrantes. Estos sntomas son parecidos a los
ocasionados por deficiencia de vitamina C.
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90
80
70
60
50
40
30
20
10
1
pH
9 10 11 12
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b) Describe con detalle las carcatersticas estructurales del tipo de conformacin que has
predicho En qu tipo de interacciones podra basarse su estabilidad? Qu grupos
qumicos participaran en esas interacciones y porqu?
c) En qu tipo de medio crees que se encontrara un pptido o una protena que tuviera esta
secuencia?
d) Supn que el residuo A de la posicin 8 se sustituye por una prolina y el residuo F de la
posicin 10 se sustituye por una glicina afectaran tales sustituciones a la estructura que
propones?
e) Supn que cada uno de los residuos F se sustituye por un aspartato Alterara sto la
estructura secundaria del fragmento peptdico? Porqu? Cambiara su preferencia por el
entorno que has propuesto en el apartado c)? Porqu?
12) A partir del siguiente fragmento peptdico: Val-Thr-Ile-Tyr construir una lmina antiparalela y otra
paralela. Sealar claramente los grupos amino y carboxilo terminal, los enlaces peptdicos y los
enlaces de hidrgeno intercadena.
a) podran existir en este caso interacciones estabilizadoras de la estructura entre cadenas
laterales? Si la respuesta es afirmativa seala de qu tipo seran esas interacciones y entre
qu residuos y/o grupos se daran.
b) Si sustituimos la Thr por Lys y la Tyr por Arg afectaramos en algo la estabilidad de las
estructuras ? Porqu? Y si sustituimos Thr por Lys y Tyr por Glu?
c) Qu secuencia elegiras para conectar las dos cadenas en la hoja antiparalela mediante
un giro de tipo I?
13) Las secuencias de la figura corresponden a las dos cadenas de la insulina, una protena dimrica
con funcin hormonal.
Cadena A
G-I-V-E-Q-C-C-A-S-V-C-S-L-Y-Q-L-E-N-Y-C-N
Cadena B
F-V-N-Q-H-L-C-G-S-H-L-V-E-A-L-Y-L-V-C-G-E-R-G-F-F-Y-T-P-K-A
a) La insulina es una protena soluble Cul de sus aminocidos crees que se encuentra con
mayor probabilidad expuesto al entorno acuoso? Cules se tendern a protegerse de
dicho entorno?
b) Qu residuos de aminocido pueden participar en enlaces de hidrgeno? Indica si
presentan grupos potencialmente dadores o aceptores y cules son stos.
c) Qu residuos pueden participar en enlaces inicos (puentes salinos)? Indica en qu
rangos de pH pueden tener lugar esas interacciones y porqu.
d) Qu residuos pueden participar en puentes disulfuro? Cuntos puentes disulfuro
intracadena e intercadena pueden existir como mximo?
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ANEXO
Valores de pK de los 20 aminocidos proteicos
Aminocido
pK1
pK2
Gly
2,4
9,8
Ala
2,3
9,9
Val
2,3
9,6
Leu
2,4
9,6
Ile
2,4
9,7
Met
2,3
9,2
Phe
1,8
9,1
Pro
2.0
10.6
Ser
2,1
9,2
Thr
2,6
10,4
Cys
1,8
10,8
Asn
2,0
8,8
Gln
2,2
9,1
Tyr
2,2
9,1
Trp
2,4
9,4
Asp
2,0
10,0
3,9
Glu
2,2
9,7
4,3
His
1,8
9,2
6,0
Lys
2,2
9,2
10,8
Arg
1,8
9,0
12,5
pKR
8,3
10,9
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Cuestiones de Bioqumica
Tema 3
1) La hemoglobina es una carta tetramrica compuesta por dos subunidades y dos subunidades .
Las estructuras de estas subunidades se parecen mucho a la cadena polipeptdica de la
mioglobina. Sin embargo, si comparamos la superficie de ambas protenas, algunos residuos
polares de la superficie de la mioglobina estn reemplazados, en lugares equivalentes, por
residuos hidrofbicos en la hemoglobina.
a) Cmo puede estar de acuerdo esta observacin con el hecho de que los residuos
hidrofbicos se disponen hacia el interior de las protenas globulares?
b) En este sentido qu puede decirse sobre la naturaleza de las interacciones que
determinan la estructura cuaternaria de la hemoglobina?
2) La hemoglobina es una de las protenas ms estudiadas. En humanos se conocen decenas de
variantes en su secuencia (mutaciones), algunas de las cuales afectan negativamente a la
funcin de transporte de oxgeno y se denominan hemoglobinopatas. En la tabla del ANEXO I se
resumen las mutaciones caractersticas de algunas variantes de hemoglobina, as como sus
consecuencias.
a) Comenta a qu se debe el efecto de la mutacin caracterstica de la hemoglobina
Hiroshima
b) Cul es la consecuencia de la mutacin presente en la hemoglobina Bibba sobre su
estructura cuaternaria. Dibuja la curva de la funcin de saturacin por O2 correspondiente a
esta hemoglobina junto a la curva de la hemoglobina normal.
c) Ordena la hemoglobina normal y las variantes de hemoglobina de la tabla segn sus
valores de punto isoelctrico
3) La electroforesis es una tcnica de separacin de
protenas en un campo elctrico. En una de las
variantes de esta tcnica, las protenas se depositan
sobre una membrana humedecida con tapn a pH
7,0 y se aplica un campo elctrico entre ambos
extremos. Como consecuencia, las protenas que
posean carga positiva a ese pH migrarn hacia el
polo negativo (ctodo), y las que tengan carga
negativa migrarn hacia el polo positivo (nodo). La
figura de la derecha representa el resultado de
someter una muestra de hemoglobina normal a
electroforesis. La banda oscura es la posicin que
alcanza la hemoglobina al final del experimento.
a) Seala sobre esa figura qu posicin ocuparan cada una de las variantes de hemoglobina
de la tabla del ANEXO I.
4) Comentar la siguiente frase:
La hemoglobina mutante Rahere tiene un residuo de Thr que sustituye a la Lys 82 de la cadena
normal. Este cambio afecta al lugar de unin del 2,3-BPG, de manera que la P50O2 (presin parcial
de O2 a la que se alcanza una saturacin del 50%) no es de 25 torr, como en la hemoglobina normal,
sino de 10 torr.
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Hemoglobina F
Hemoglobina A
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ANEXO I
Algunas de las mutaciones de cambio de sentido equivocado de las hemoglobinas humanas
Denominacin
S
Posicin
mutada
Cambio
GluVal
Consecuencia
Explicacin
Drepanocitosis (anemia
falciforme)
87
HisTyr
141
ArgHis
74
GlyAsp
Hiroshima
146
HisAsp
St. Etienne
92
HisGln
St. Lukes
95
ProArg
Disociacin
Bibba
136
LeuPro
Disociacin
Suresnes
Shepherds
Bush
La carga negativa aportada por el Asp en esta zona reduce la unin del 2,3-BPG
Se altera un puente salino en el estado desoxi y se elimina una His que participa
en el efecto Bohr
El enlace normal entre la hlice F8 y el FeII se pierde, y la Gln, polar, tiende a
abrir la cavidad donde se encuentra el grupo hemo
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Cuestiones de Bioqumica
Tema 4
1) Una reaccin enzimtica puede escribirse como dos reacciones sucesivas, donde el complejo ES
es el intermediario en la conversin del sustrato en producto. En determinadas condiciones, la
primera de las reacciones anteriores alcanza virtualmente el equilibrio, mientras que la segunda
puede considerarse como el paso limitante de la reaccin.
a) Teniendo en cuenta las premisas anteriores, escribe un esquema general para la
conversin de un sustrato S en producto P. Seala sobre ese esquema cules son las
constantes de velocidad que habran de considerarse, e indica cul es la constante
cintica que define la velocidad global de la reaccin.
b) En qu consiste el estado estacionario? Cules son las condiciones que deben de
cumplirse para que ste se alcance?
c) Deduce la expresin de V en funcin de [S] propuesta por MICHAELIS-MENTEN. Escribe cada
paso hasta llegar a la ecuacin final. Si necesitas establecer asunciones especiales, indica
claramente cules son stas
d) A qu tipo de funcin corresponde la ecuacin anterior? Represntala, indicando sobre la
grfica los parmetros principales
2) En una determinada enzima, un residuo de Ala se encuentra localizado en la hendidura dnde se
une el sustrato. Una mutacin, que consiste en la sustitucin de este residuo por uno de Gly, no
afecta a la actividad de la enzima. Sin embargo, el cambio de la Ala por Glu conduce a la prdida
completa de la actividad. Sugiere una explicacin para estas observaciones.
3) La eficiencia cataltica de muchas enzimas depende del pH. La quimotripsina muestra un valor
mximo de k cat K M a pH 8,0 (Figura 1).
Figura 1
Figura 2
k cat
KM
KM
k cat
9 10 11
9 10 11
pH
pH
4) La figura siguiente muestra esquemticamente algunos residuos del centro activo de la papaina.
El sustrato N-etilmaleimida (NEM) reacciona rpidamente con el grupo aninico tiolato de la Cys
25 del centro activo.
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Cuestiones TEMA 4
His
Cys25
Asp
N:
HN
HS
a) En cul de las siguientes condiciones crees que reaccionar mejor la Cys con el sustrato
NEM: a pH 5,0 o a pH 7,5?
b) Cabra esperar que la Cys 25 de la papaina fuese ms reactiva frente al NEM que otras
Cys de la protena? Razona tu respuesta.
5) De qu manera afecta a una enzima que se comporta segn la cintica de MICHAELIS un inhibidor
reversible y uno irreversible? Utiliza representaciones grficas para comparar la actividad de la
enzima en ausencia y en presencia de cada tipo de inhibidor Podras utilizar una dilisis para
distinguir ambos tipos de inhibidores?
7) Si el nmero de recambio de una enzima es 100 s-1 cunto tiempo necesita esta enzima para
transformar 1 mol de sustrato en producto?
azucar
ATP
Azucar fosfato
ADP
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Cuestiones TEMA 4
6 mM ,
Esta enzima puede emplear diversos sustratos, entre ellos glucosa, para la cual K M
2 mM . Si el nmero de recambio es el mismo para ambos sustratos
y fructosa, cuya K M
por cul de ellos mostrar la enzima ms especificidad?
V max
V0
C
B
A
12)La aspartato transcarbamoilasa (ATCasa) es una enzima formada por seis subunidades catalticas y
seis reguladoras que cataliza el primer paso de la ruta de la sntesis de pirimidinas, segn la
siguiente reaccin:
Carbamoilfosfato
Asp
Pi
N carbamoilaspartato
a) Se supone que un residuo de His del sitio activo es importante para la estabilidad del
estado de transicin de los sustratos unidos. Predecid la dependencia de la velocidad
cataltica con el pH, aceptando que la interaccin en la que participa la His es esencial, y
domina el perfil de variacin de la actividad enzimtica de la ATCasa con el pH
V 0 - CTP
Figura 2
V0
CTP
+ CTP
Asp
Asp
Figura 3
% Actividad
Figura 1
Relacin molar
PALA ATCasa
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Cuestiones TEMA 4
B
A
[S]
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Cuestiones de Bioqumica
Tema 5
1) Enumera las principales diferencias entre el DNA y el RNA
a) en cuanto a su composicin qumica
b) en cuento a su estructura
c) en cuanto a su funcin
2) En un DNA de doble cadena:
a) Tienen las dos cadenas complementarias la misma composicin de bases?
b) Es cierta la igualdad A+G=C+T?
c) Si la proporcin de adenina es del 28% cul es la proporcin correspondiente a las otras
bases?
d) Si el fragmento de DNA contiene 1000 pb, de las cuales un 58% son G+C cuntos
residuos de desoxitimidina tiene?
3) Las histonas son protenas nucleares bsicas.
a) Qu cadenas laterales de aminocidos contribuyen a la unin de las histonas al DNA?
b) Contribuye la unin de las histonas a la estabilizacin de la estructura del DNA?
Porqu?
4) La Figura 1 representa las curvas de fusin
(desnaturalizacin) de tres molculas de cido
desoxiribonucleico: poli(AT), poli(GC) y de un DNA
natural.
Figura 1
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Cuestiones TEMA 5
7) El genoma de E. coli tiene aproximadamente 4.2 Mpb y contiene unos 2000 genes. El genoma
de un mamfero puede tener unos 3 Gpb, y se transcriben unos 50000 genes. Si, como media,
un gen en la bacteria tiene 2000 pb de longitud
a) cul es el porcentaje del genoma bacteriano que no se transcribe?
b) Cul es la proporcin del genoma de mamferos que constituyen los exones (fragmentos
codificantes)? Supn que el tamao de sus productos gnicos es tambin 2 kb.
8) La RNasa P es una ribonucleoprotena responsable de la maduracin de los precursores de los
tRNA. El tratamiento de la RNasa P con proteasas no afecta a su actividad, mientras que la
capacidad cataltica se pierde completamente en presencia de RNasa A. Explca porqu.
9) La anemia falciforme es una enfermedad gentica causada por una mutacin en el gen que
codifica la cadena de la hemoglobina humana. Dicha cadena contiene un residuo de Val en
posicin 6, en lugar de Glu, como corresponde a la hemoglobina normal Qu cambio en el gen
justifica probablemente esta sustitucin (consultar el ANEXO I)?
11) Cuando a un sistema acelular (in vitro), activo en la sntesis proteica, se le aade un
polirribonucletido artificial formado por un triplete repetido (por ejemplo, poli[XYZ], siendo X,
Y, Z cualquiera de los cuatro ribonucletidos) se suele obtener una mezcla de dos o tres
polipptidos
a) Por qu?
b) Predice los productos de la traduccin de un poli(GUA) y de de un poli(UUA).
12) Si se descubriera una especie que poseyera una DNA polimerasa con actividad polimerizadora
en direccin 3' --> 5', adems de la actividad 5' --> 3'
a) qu actividades enzimticas y qu protenas ya no seran necesarias para la replicacin
del DNA en esa supuesta especie?
b) Cules seran las caractersticas generales de la replicacin en ese supuesto nuevo
organismo?
13) Se ha efectuado un anlisis de la
composicin en bases nitrogenadas de
los genomas de dos bacterifagos, cuyos
resultados se recogen en la Tabla 1 Qu
conclusiones puedes sacar sobre la
estructura de estas dos molculas?
Tabla 1
fago
T7
26.30%
23.70%
23.80%
26.20%
X174
24.60%
24.10%
18.50%
32.80%
14) Teniendo en cuenta el cdigo gentico (ANEXO I), indicad, justificando la respuesta, posibles
mutaciones puntuales, es decir, que afecten a un nico nucletido, que tengan como resultado:
a) Una protena con secuencia inalterada
b) Una mutacin conservativa (cambio de un aminocido por otro con propiedades similares)
c) Una mutacin no conservativa
d) Una protena ms larga que la protena salvaje
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Cuestiones TEMA 5
ANEXO I
Cdigo gentico estndar
Segunda base
1
Base
U
UUU
UUC
UUA
UUG
CUU
CUC
CUA
CUG
AUU
AUC
Phe
Leu
Leu
Leu
Ile
UCU
UCC
UCA
UCG
CCU
CCC
CCA
CCG
ACU
ACC
AUA
Ile
ACA
AUG
Met
ACG
GUU
G
GUC
GUA
GUG
Val
Val
GCU
GCC
GCA
GCG
A
UAU
Ser
UAC
UAA
Ser
UAG
CAU
Pro
CAC
CAA
Pro
CAG
Thr
Thr
Ala
Ala
AAU
AAC
AAA
AAG
GAU
GAC
GAA
GAG
3
Base
G
Tyr
Stop
His
Gln
Asn
Lys
Asp
Glu
UGU
UGC
Cys
U
C
UGA
Stop
UGG
Trp
CGU
CGC
CGA
CGG
AGU
AGC
AGA
AGG
GGU
GGC
GGA
GGG
Arg
Arg
Ser
Arg
Gly
Gly
U
C
A
G
U
C
A
G
U
C
A
G
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Cuestiones TEMA 5
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Cuestiones bioenergtica
Cuestiones Bioenergtica
TEMA 6: Introduccin a la Bioenergtica
1. Caminar consume aproximadamente 65 kcal/km. Para la hidrlisis de ATP
(ADP + Pi), la reaccin que impulsa la contraccin muscular, G es -7.3
kcal/mol (-30.5 kJ/mol).
a. Calcula cuantos gramos de ATP deben producirse para caminar 1 km.
b. La sntesis de ATP est acoplada a la oxidacin de la glucosa (G =
686 kcal/mol). Cuntos gramos de glucosa se metabolizan realmente
para producir esta cantidad de ATP? (supn que solo se utiliza la
oxidacin de la glucosa para generar ATP y que se emplea el 40 % de la
energa generada en este proceso para fosforilar el ADP. El peso
molecular de la glucosa es 180 g y el del ATP 507 g).
2. Cul es el sentido de cada una de las reacciones siguientes si todas las
sustancias reaccionantes estn presentes inicialmente en cantidades
equimoleculares? Utilizar los datos de la tabla de G dada en clase.
a. ATP + creatina
creatina fosfato + ADP
b. ATP + fructosa
c. ATP + piruvato
fosfoenolpiruvato + ADP
d. ATP + glucosa
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Cuestiones bioenergtica
Cuestiones Bioenergtica
TEMA 7a: Cadena de transporte electrnico mitocondrial
1. Cmo se puede explicar, de acuerdo con la teora quimiosmtica, que el 2,4dinitrofenol estimule indefinidamente el consumo de oxgeno en una suspensin
de mitocondrias?. Por qu la inyeccin de 2,4-dinitrofenol a una rata provoca el
aumento inmediato de la temperatura corporal?.
2.
3.
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Cuestiones bioenergtica
Pgina 3 de 3.
Cuestiones bioenergtica
Cuestiones metabolismo
Cuestiones metabolismo
8. Louis Pasteur, estudiando la fermentacin alcohlica de la levadura, observ que la adicin de
oxgeno a un cultivo anaerobio originaba una drstica reduccin en la velocidad de consumo de
glucosa. Este efecto puede ser contrarrestado por la adicin de 2,4-dinitrofenol.
a. Por qu disminuye el consumo de glucosa en presencia de oxgeno?. Justifica la
respuesta en trminos de enzimas concretos.
b. Por qu el 2,4-dinitrofenol contrarresta este efecto?
9. En un cultivo bacteriano anaerobio se sabe que se acumula lactato a medida que progresa la
fermentacin. Decide cul de las siguientes situaciones son verdaderas o falsas:
a. Casi seguro que el cultivo est creciendo en glucosa ya que existen pocos otros
compuestos que puedan ser fermentados por las bacterias.
b. El (los) producto(s) de la fermentacin no estn ms oxidados que los productos de
partida ya que no hay aceptor de electrones externo.
c. El cultivo no puede producir CO2.
d. Si se hace entrar aire y se burbujea continuamente el cultivo, el nivel de lactato
continuar aumentando.
10. Se ha observado que cuando ciertas levaduras se cultivan en un medio deficiente en hierro, la
produccin de etanol aumenta respecto a la de un cultivo aerobio normal. Da una interpretacin
bioqumica a este hecho.
11. Tras un ejercicio muscular intenso la concentracin de lactato en sangre aumenta mucho. Cul
es la causa de esto?. Al cabo de un periodo corto de tiempo, dicho lactato vuelve el nivel
normal. Cul es su destino?.
12. Por qu los animales no almacenan grandes cantidades de glucgeno en el msculo cuando se
les alimenta con una dieta rica en azcares?.
13. Las siguientes frases son ciertas? Justificalo
a. El enzima que cataliza la sntesis y la degradacin de fructosa-2,6-bisfosfato, el efector
alostrico ms potente de fosfofructoquinasa-1 y fructosa-1,6-bisfosfatasa, est fosforilado
o desfosforilado en respuesta a seales hormonales.
b. Ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa osigenasa (RuBisCO) participa de forma importante en
el metabolismo de los animales en tanto que proporciona el poder reductor (NADPH) que
necesitan para la biosntesis de cidos grasos.
c. El AMPcclico es el nico segundo mensajero que se conoce y, adems siempre se
encuentra a la misma concentracin en el espacio extracelular, donde ejerce sus efectos
glucogenognicos.
d. Una funcin principal del ATP es suministrar energa para procesos endergnicos, no
favorables, tales como el del transporte de electrones desde el agua hasta el NADP+ en la
fotosntesis.
14. Cul es el efecto de cada una de las siguientes situaciones sobre la velocidad a la que el
glucgeno es metabolizado?.Aumento en la concentracin de Ca+2
a. Aumento en la concentracin de glucagn en sangre
b. Aumento del nivel de glucosa en sangre
c. La activacin de la glucgeno fosforilasa fosfatasa.
15. Qu similaridades y diferencias hay entre la acumulacin de cido lctico en clulas
musculares de mamferos y la de etanol en levaduras fermentadoras?.
Cuestiones metabolismo
16. La glucosa que entra en una clula es rpidamente fosforilada a glucosa-6-fosfato. Indica tres
destinos metablicos para esta molcula. En qu circunstancias se dara cada uno de ellos?.
Nombra los enzimas reguladores implicados en estas vas y escribe la reaccin que catalizan.
1.
2.
3.
4.
5.
6.
Cofactor
NAD+
FAD
CoASH
Lipoamida
TPP
Biotina
7. NADH
8. FADH2
9. NADPH
Funcin qumica
Transportador de grupos acilo activados
Transportador de CO2 activado
Oxidacin de grupos hidroxilo
Reacciones reductoras para la sntesis de cidos grasos
Oxidacin para formar dobles enlaces carbono-carbono
Transportador de grupos acilo activados acoplado con
oxidacin-reduccin
Reduccin de dobles enlaces carbono-carbono
Reduccin de grupos carbonilo
Descarboxilacin de -cetocidos
Regulacin
Activacin alostrica por ADP; inhibido
por NADH, succinil-CoA, ATP
Inhibida por succinilCoA, ATP
Estimulada por AMP, CoA
Estimulada por ADP, inhibida por ATP
CO2
luz
14
CO2
oscuridad
14
CO2
Y
Y
tiempo
X
tiempo
Cuestiones metabolismo
glicolisis
I
ATP
Oxidacin de
cidos grasos y
de aminocidos
Ciclo del
cido ctrico
II
IV sntesis
utilizacin V
ADP
VI
Cadena de
transporte
electrnico
III
a.
b.
c.
d.
e.
Cuestiones metabolismo
h. Indica otro proceso que no est mostrado en el esquema y que est tambin relacionado
con IV.
7. Localiza las rutas metablicas que se indican, en los compartimentos celulares siguientes: 1)
citosol; 2) mitocondria; 3) glioxisoma; 4) membrana interna mitocondrial; 5) en parte en el
citosol y en parte en la mitocondria; 6) estroma; 7) membrana plasmtica de bacterias.
(
(
(
(
(
) glicolisis
) sntesis de urea
) ciclo del cido ctrico
) ruta de los fosfatos de pentosa
) -oxidacin de cidos grasos
(
(
(
(
(
) fosforilacin oxidativa
) formacin de cuerpos cetnicos
) sntesis y degradacin del glucgeno
) gluconeognesis
) sntesis de cidos grasos
9. Tras un perodo de inanicin (ayuno prolongado) se observa que los niveles plasmticos de
cidos grasos y cuerpos cetnicos aumentan, mientras que el nivel de glucosa plasmtica
disminuye, como se indica en la figura. Interpreta el significado metablico de estas
observaciones.
Cuestiones metabolismo
10. En relacin a interacciones entre los principales rganos que metabolizan combustibles:
a. Seala con flechas, en la figura, los metabolitos que son incorporados y exportados por
cada rgano.
b. Indica las principales vas del metabolismo energtico que estn implicadas con los
metabolitos que se consideran en la figura y la participacin de los distintos rganos en
estas vas.
Cuestiones metabolismo
11. Del esquema del metabolismo intermediario que se presenta nombra:
a. Los enzimas a que se refieren los nmeros 1-11
b. Las rutas o procesos metablicos de que se trata A-E
c. Los intermediarios o productos finales que se forman a-f
Cuestiones metabolismo
14. La tabla siguiente muestra la actividad (mmols de sustrato/ min, g tejido) de algunos enzimas
de los msculos pectorales de paloma y de gallina. Cual o cuales son, en ltimo trmino, los
principales combustibles metablicos para la produccin de ATP en el tejido muscular de cada
una de estas aves?. Justifica la respuesta y relacionala con su capacidad de vuelo y el color de
su carne.
enzima
paloma gallina
hexoquinasa
glucgeno fosforilasa
fosfofructoquinasa-1
citrato sintasa
lactato deshidrogenasa
triacilglicerol lipasa
3.0
18.0
24.0
100.0
5.0
70.0
2.3
120.0
143.0
15.0
30.0
10.0
15. Explica por qu los pacientes con una deficiencia en glucosa-6-fosfatasa heptica son
hipoglucmicos.
16. Nuestras tierras son sobrevoladas en primavera por ms de 50 millones de pajaros migratorios.
Estos animales necesitan una reserva energtica que les permita volar largas distancias de
forma ininterrumpida. Se conocen casos de pjaros migratorios que vuelan sobre el mar 2400
km sin detenerse, 60 h de vuelo a 40 km/h. El ndice de grasa de estos animales justo antes de
iniciar el viaje se aproxima a 3, mientras que en otros pjaros que vuelan distancias cortas o no
migran el ndice de grasa es de 0.3. Durante las 60 h de viaje no se observa casi degradacin de
protenas. Cual es la fuente de energa principal de estas aves y qu ventajas puede tener
frente a otras reservas energticas posibles?. Seala esquemticamente cmo obtienen ATP
estos animales. De donde obtienen el agua necesaria para compensar las prdidas a travs del
aparato respiratorio. (el ndice de grasa es la relacin entre el peso seco de toda la grasa
corporal y el peso seco no grasa).
17. Durante el ejercicio intenso la glicolisis suministra el ATP necesario para la contraccin
muscular. La reaccin catalizada por la lactato deshidrogenas, aunque no suministra ATP, es
esencial en este proceso. Cul es la funcin de esta reaccin?.
18. Explica y/o comenta las siguientes frases
a. Cuando se toman aminocidos en exceso en la dieta, los atomos de carbono de estos
aminocidos son convertidos en hidratos de carbono y/o grasas.
b. Mutantes de E. coli deficientes en F-1,6-Bpasa no pueden crecer en glicerol o succinato y
muestran un requerimiento absoluto por hexosas.
c. Despues de un ayuno prolongado los niveles en sangre de cidos grasos y de cuerpos
cetnicos aumentan mientras que los de glucosa disminuyen.
19. De las siguientes rutas metablicas
a. ruta oxidativa de los fosfatos de pentosa
b. ciclo del cido ctrico
c. -oxidacin de los cidos grasos
d. gluconeognesis
Cuestiones metabolismo
e.
f.
g.
h.
i.
j.
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Test de Autoevaluacin
Tema 1
1. Cul de las siguientes molculas no se encuentra en las membranas biolgicas?
[
[
[
[
[
] a) Protena
] b) Polisacrido
] c) cido desoxirribonucleico (DNA)
] d) Colesterol
] e) Fosfatidiletanolamina
] a) Amino
] b) ster
] c) Carbonilo
] d) Amido
] e) Imidazol
] a) Carbonilo
] b) Hidroxilo
] c) ster
] d) Carboxilo
] e) Aldehdo
SH
NH 2
[ ] c) OH
[ ] d) CO NH R
[ ] e) CO OR
[ ] a)
[ ] b)
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] a) Hidrofbico
] b) cido fuerte
] c) Polar y oxidable en presencia de oxgeno
] d) Polar e ionizable a pH bsico
] e) Polar e ionizable a pH cido
] a) Lpido
] b) Azcar
] c) cido graso
] d) Glicrido
] e) Aminocido
es un:
] a) cido graso
] b) Glicrido
] c) Lpido
] d) Monosacrido
] e) Aminocido
] a) A pH muy bsico
] b) A pH muy cido
] c) A cualquier valor de pH
] d) A pH neutro
] e) A pH 8
] a) A pH muy bsico
] b) A pH muy cido
] c) A cualquier valor de pH
] d) A pH neutro
] e) A pH 8
] a) A pH muy bsico
] b) A pH muy cido
] c) A cualquier valor de pH
] d) A pH neutro
] e) A ningn valor de pH
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14. Las principales diferencias qumicas entre los cidos nucleicos DNA y RNA son:
[ ] a) El DNA presenta un grupo hidroxilo en los carbonos 2', y el RNA presenta un H en la misma
posicin.
[ ] b) Las bases del DNA pueden ser A, T, C o G, mientras que en el RNA pueden ser A, U, C o
G.
[ ] c) El RNA presenta un grupo hidroxilo en los carbonos 2', y el DNA presenta un H en la misma
posicin.
[ ] d) En el DNA, el carbono 5' de la primera unidad nuclesido de la cadena se encuentra
fosforilado, y el carbono 3' de la ltima unidad nuclesido se encuentra libre. En el RNA la
situacin es la opuesta.
[ ] e) Slo b) y c) son correctas.
15. La molcula de agua es una molcula polar, buena formadora de enlaces de hidrgeno
debido a:
[
[
[
[
[
] a) Su geometra lineal
] b) La simetra de sus distribucin electrnica
] c) La presencia de H unido a O
] d) La cercana de otras especies dadoras o aceptoras de H
] e) Su geometra tetradrica, y la asimetra de la distribucin de sus electrones de enlace
] a) Dipolo-dipolo
] b) Empaquetamiento entre las cadenas aclicas de los lpidos en una micela
] c) Dipolo-dipolo inducido
] d) Puente salino entre un grupo amino y un grupo carboxilo
] e) Agua-grupo hidroxilo
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Test de Autoevaluacin
Tema 2
1. El efecto hidrofbico consiste en que:
a) El interior de las clulas es predominantemente no polar
b) Las membranas no pueden ser atravesadas por el agua
c) Por razones termodinmicas, los grupos apolares tienden a organizarse excluyendo al agua
d) Los aminocidos con cadena lateral apolar forman puentes de hidrgeno con facilidad
e) Las interacciones entre cadenas laterales de aminocidos apolares son ms fuertes que las
interacciones inicas
2. Un pptido tiene la siguiente composicin: Asp3, Ala, Glu, His, Leu2, Pro, Gly4, Lys2. Su
carga a pH 12 ser:
a) +4
b) 5
c) -15
d) +5
e) -4
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R1(3)
H(8)
H(10)
O(13)
a) Los tomos 1, 2, 4, 6 y 7 se
|
|
|
||
encuentran en el mismo plano
(1)
(4)
(6)
(9)
(11)
N C C N C
C(14)
b) Los tomos 4 y 11 son C
|
|
||
|
c) Los grupos 3 y 12 estn siempre
(2)
(5)
(7)
(12)
H
H
O
R
2
en conformacin cis con
respecto al enlace peptdico
formado entre los tomos 6 y 9
d) El enlace entre los tomos 8 y 9 es parcialmente doble
e) 5 y 8 pueden actuar como dadores en enlaces de hidrgeno
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Test de Autoevaluacin
Tema 3
1. En relacin con la estructura de la hemoglobina y la mioglobina:
a) En la oxi-hemoglobina el ion Fe se encuentra en estado de oxidacin +3
b) No es importante que el grupo hemo se encuentre en un ambiente apolar, a fin de prevenir la
oxidacin del ion ferroso
c) En la oxi-hemoglobina el oxgeno est unido al residuo de histidina proximal
d) En ambas protenas son muy abundantes los residuos de prolina
e) Tanto en la hemoglobina como en la mioglobina el oxgeno se une al grupo hemo por
coordinacin directa con el ion Fe2+
4. En una protena monomrica con un sitio de unin especfico para cada uno de los tres
ligandos distintos A, B y C:
a) Puede existir cooperatividad, pero no alosterismo
b) No puede existir ni cooperatividad ni alosterismo
c) Puede existir alosterismo, pero slo heterotrpico
d) Puede existir alosterismo, pero slo homotrpico
e) No puede existir alosterismo, porque no es oligomrica
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saturacin () ser 1
d) La curva de Y frente a [L] ser siempre hiperblica, mientras que la curva de frente a [L] ser
siempre sigmoidea
e) Las curvas de Y frente a [L] y de frente a [L] sern ambas siempre hiperblicas
9. El CO2
a) es un regulador alostrico de la hemoglobina, que acta aumentando su afinidad por el
oxgeno
b) se une a la hemoglobina en el grupo hemo
c) se une en una cavidad situada entre las subunidades de la hemoglobina, donde se encuentran
varios residuos cargados positivamente
d) es un efector alostrico negativo de la hemoglobina, que estabiliza la especie desoxi (o forma
T), disminuyendo la afinidad por el oxgeno y acentuando el efecto cooperativo
e) es abundante en los pulmones, donde compite con el oxgeno por la unin a la hemoglobina
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Test de Autoevaluacin
Tema 4
1. Con respecto a los cofactores enzimticos.
a) Todas las enzimas los requieren para ser activas
b) Su unin a la enzima nunca es covalente
c) Las enzimas son tan especficas, que no existen dos enzimas distintas que utilicen el mismo
tipo de cofactor
d) Pueden ser iones metlicos o molculas orgnicas
e) Son inhibidores alostricos de las enzimas a las que se unen
a) 12 mM
b) 25 mM
c) 2 mM
d) 8 mM
e) 4 mM
V max de una enzima
a) es la velocidad de la mayora de las reacciones que ocurren en la clula
b) aumenta al aumentar la concentracin de sustrato
c) no est relacionada con su nmero de recambio
d) slo se alcanza a concentraciones muy elevadas de enzima
6. La
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KM
KM
KM
KM
e)
KM
10. El centro activo de una enzima contiene un residuo de Glu cuyo pKa es 4.4, y une un
sustrato con carga positiva. Por lo tanto se puede decir que la actividad de la enzima
a) no depende del pH
b) aumentar a pH > 4,4
c) ser mnima a pH=4,4
d) ser mxima a pH=4,4
e) aumentar a pH < 4,4
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Test de Autoevaluacin
Tema 5
1. En relacin con la estructura del DNA. Cul de las siguientes afirmaciones es FALSA?
a) Las dos cadenas polinucleotdicas se enrollan alrededor de un eje comn
b) Los enlaces de hidrgeno entre A y T, y entre C y G mantienen las dos cadenas unidas
c) Las prurinas y pirimidinas se localizan el el interior de la hlice, y el esqueleto fosfodister en
el exterior
d) Los anlisis de composicin de bases del DNA de muchas especies muestran que la
purinas
es igual a la unidad
relacin molar
pirimidinas
e) La secuencia de cada cadena de la doble hlice vara independientemente de la otra
RNA
3. Acerca de la biosntesis de protenas:
a) Cada aminocido reconoce su propio codn a travs de su interaccin directa con el RNA
molde
b) El cdigo gentico est degenerado, ya que muchos tripletes codifican para ms de un
aminocido
c) El cdigo gentico se lee en direccin 3'-->5'
d) La secuencia de SHINE-DALGARNO interviene en la traduccin de los mRNAs procariticos
e) La actividad peptidiltransferasa, responsable de la formacin del enlace peptdico en los
ribosomas, reside en protenas ribosomales
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a) AATGGCAAT
b) UAACGGUAA
c) TAACGGTAA
d) AAUGGCAAU
e) otra (escribir cul)
AMP
c) El codn AUG es reconocido nicamente por el tRNA iniciador
d) En la formacin de cada nuevo enlace peptdico intervienen un peptidil-tRNA y una
aminoacil-tRNA situados en los sitios P y A del ribosoma, respectivamente
e) La terminacin implica la unin de un tRNA terminador al codn de parada del mRNA
8. La replicacin del DNA se lleva a cabo por unas enzimas llamadas genricamente
a) polimerasas
b) fosfatasas
c) quinasas
d) deshidrogenasas
e) exonucleasas
9. La transcripcin del DNA
a) es la sntesis de nuevas molculas de DNA
b) es el proceso opuesto a la replicacin
c) consiste en la degradacin regulada del DNA
d) es un mecanismo regulado de sntesis de protenas
e) se inicia en la regin promotora de un gen
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Soluciones Test
Tema 2
1: c; 2: b; 3: e; 4: c; 5: c; 6: a; 7: c; 8: b; 9: e; 10: d
Tema 3
1: e; 2: e; 3: c; 4: c; 5: e; 6: b; 7: d; 8: a; 9: d; 10: b
Tema 4
1: d; 2: b; 3: d; 4: d; 5: a; 6: e; 7: b; 8: c; 9: c; 10: b; 11: e; 12: e; 13: d; 14: c; 15: d; 16: b
Tema 5
1: e; 2: b; 3: d; 4: c; 5: c (hay una errata, en "c" donde dice transcripcin, debe decir traduccin); 6: d; 7:
d; 8: a; 9: e; 10:b; 11: a; 12: a; 13: d; 14: e; 15: e (5'-AUUGCCAUU-3')
file:///D|/QUIM/BIOQ/SOLUCIONES_TEST.HTML31/08/2006 3:54:33
Pgina 1 de 4
Test bioenergtica
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Test bioenergtica
Pgina 3 de 4
Test bioenergtica
Pgina 4 de 4
Test bioenergtica
d. FMN
e. O2
19. Los siguientes transportadores intervienen en la cadena fotoelectrnica excepto
a. Plastoquinona
b. Plastocianina
c. Citocromo oxidasa
d. Citocromo b/f
e. ferredoxina
1-e
2-d
3-d
4-c
5-b
6-b y e
7-a
8-b y c
9-e
10-d
11-a
1a, 2a, 3c, 4e, 5b, 6c, 7a,8a, 9c,10b, 11d, 12a, 13e
7. El citrato
a. Suministra el CO2 que se requiere para la formacin del malonil-CoA en
el proceso de biosntesis de los cidos grasos
b. Su nivel regula el metabolismo de carbohidratos y de lpidos
c. Es un intermediario del ciclo del cido ctrico que no participa en
mecanismos de la regulacin metablica
d. Transporta grupos acetilo desde el citosol a la matriz mitocondrial
e. Nada de lo anterior es cierto
8. Cul de los siguientes compuestos sirve como aceptor de grupos amino
procedentes de la degradacin de muchos aminocidos?.
a. Glutamina
b. Asparraguina
c. -cetoglutarato
d. Glutmico
e. Oxalato
9. La eliminacin de los grupos -amino de los aminocidos para su conversin en
urea en los mamferos, puede ocurrir por
a. Transaminacin y desaminacin oxidativa
b. Transamidacin
c. Oxido-reduccin
d. Desaminacin reductiva
e. Hidrlisis
10. En relacin con el ciclo de la urea
a. No requiere ATP
b. Ocurre en todos los organismos vivos
c. La alanina es uno de sus intermediarios
d. Todas las reacciones del ciclo tienen lugar en el mismo compartimento
subcelular.
e. Su producto se excreta en un tejido distinto del que lo forma
11. En relacin a la principal funcin de diferentes vas metablicas
a. La gliclisis heptica controla el nivel de glucosa en sangre
b. La ruta de los fosfatos de pentosa proporciona NADH para procesos
biosintticos
c. La funcin de la gluconeognesis es la formacin de reserva energtica
en el rin
d. La degradacin de cidos grasos proporciona energa va la formacin de
NADH y de FADH2
e. La funcin del ciclo del cido ctrico es la fijacin del CO2 en
carbohidratos