ESTRUCTURA Y ANALISIS DEL ADN O DNA

Salvo la excepcin de alguno virus, el DNA es el material gentico de todos los seres vivos de la tierra, est en todas partes del cuerpo, en el ncleo de cada una de las celular que lo conforman. Hay una copia de la molcula de DNA con nuestra informacin gentica, todos los humanos somos genticamente idnticos en un 99.9% pero el 1*1000 restante es el que nos hace individuos diferentes. ADN = DNA = ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO Abreviado como DNA, es un tipo de acido nucleico, una macromolcula que hace parte de todas las clulas, la informacin gentica transmitida por el DNA es usada en el desarrollo y el funcionamiento de los organismos vivos y tambin es responsable de la transmisin hereditaria. La estructura del DNA proporciona la base para almacenar y expresar la informacin gentica, y al decir que el DNA es un polmero de nucletidos se debe especificar:

QUE ES UN POLIMERO? Es un compuesto formado por muchas unidades simples conectadas entre s, el ejemplo prctico seria (un tren formado por muchos vagones), cada vagn es un nucletido y cada nucletido est formado por 1 azcar (desoxirribosa) 1 base nitrogenada que puede ser:

A T

: Adenina : Timina

C G

: Citocina : Guanina

1 grupo fosfato que acta como enganche de cada vagn con el siguiente

NUCLEOTIDO

AZUCAR

base Nitrogenada

NUCLEOTIDO

AZUCAR

base Nitrogenada

EL GRUPO FOSFATO ACTUA COMO ENLACE EN LA ESTRUCTURA

NUCLEOTIDO

AZUCAR

base Nitrogenada

NUCLEOTIDO

AZUCAR

base Nitrogenada

DESOXIRRIBOSA

DEXTROGINA LEVOGIRA

cuerpo o sustancia que desva la luz polarizada a la derecha. cuerpo o sustancia que desva la luz polarizada a la izquierda.

LO QUE DISTINGUE CADA NUCLEOTIDO DE OTRO ES LA BASE NITROGENADA Haciendo de esta manera la secuencia de DNA especifica al nombrar solo las secuencias, la disposicin secuencial de estas bases a lo largo de la cadena, es la que codifica la informacin gentica, ejemplo: Una secuencia de DNA puede ser: ATGCTAGATCGA, representndose en los seres vivos, las estructura DNA como una doble cadena de nucletidos esta unida entre s por unas conexiones llamadas puentes de hidrogeno. El DNA al ser bicatenario (que tiene 2 cadenas), siempre tendr una cadena original (de la clula madre) y una cadena complementaria. Ambas cadenas formando la estructura DNA se denomina hlice (altahlice). Los pares de las bases que se pueden combinar son: A-denina con T-imina C-itocina con G-uanina T-imina con A-denina G-uanina con C-itocina

Para que la informacin gentica que contiene el DNA pueda ser utilizado por la clula debe ser copiado en unas cadenas de nucletidos ms cortos y con unas unidades diferentes llamadas RNA. Para que una molcula atienda a la funcin del material gentico debe poseer 4 caractersticas principales: replicacin, almacenaje de la informacin, expresin de esta informacin y variacin por mutacin.

 REPLICACION: Es una de las facetas del ciclo celular, una propiedad fundamental de todos los organismos vivos, cuando el material gentico de las clulas se ha replicado se reparte de forma equitativa en las clulas hijas, en la formacin de los gametos el material gentico tambin se replica, pero se reparte de manera que cada clula recibe solo la mitad del material gentico llamado este proceso como MEIOSIS, ejemplo: 1. El primer paso para la replicacin es: Abrir la hlice = para que se pueda copiar el DNA se deben separar una a cada lado para darle acceso a la enzima encargada de la replicacin que es ADN o DNA polimerada: Es la encima encargada de copiar la secuencia de DNA y generar las cadenas nuevas, ejemplo: Cuando la cadena se abre formando una burbuja, es conocida como horquilla de replicacin.

- El proceso de replicacin debe ser exacto, no puede permitirse errores, pues sucedera: mirando la horquilla nos damos cuenta que la enzima se equivoco y en vez de poner una A, coloco una C, estando as esta cadena replicada mutada, pues la consecuencia de un DNA mutado seria: mas protenas=la clula morira, y en efectos benficos=tambin podra hacer una mejora en la especie. Segundo paso: la enzima debe copias la informacin DNA (replica del DNA) generando la secuencia e incorporando los nucletidos que hacen falta, ejemplo: en la primera cadena se pondr la enzima leyendo los nucletidos y en la cadena naciente se incorporara los nucletidos de la nueva cadena naciente a la que esta copiando. - La enzima se ubicara en la cadena 5de la cadena inicial, copindose a la derecha, y se ubicara en la cadena complementaria 3copiandose para cada nucletido ya existente en la cadena original o inicial as se copia el DNA

LA REPLICACION DEL DNA: TIENE 2 FORMAS DE DENOMINARLA. BIDIRECCIONAL: porque son las 2 cadenas que se copian (una de la otra) SEMICONSERVATIVA: porque se conserva para cada cadena de DNA nueva. La mitad de la cadena original o de la clula madre, ejemplo

ALMACENAJE DE LA INFORMACION GENETICA: La caracterstica del almacenaje debe verse como un repertorio de informacin gentica, est claro que aunque la mayora de las clulas contienen un juego completo de DNA en cualquier momento solo expresan una parte de su potencial gentico, ejemplo: las bacterias, estas activan muchos genes en respuesta a condiciones ambientales especificas, desactivndolos cuando esas condiciones cambian. El lenguaje Amico del material gentico debe ser capaz de realizar esta tarea, ya que esta almacena informacin que se transmite a las clulas y organismos descendientes. - EL DNA nos define como animales, como especie y como individuos. La gentica actualmente es muy utilizada en la resolucin de inconvenientes del ser humano como pruebas biolgicas de paternidad, identificacin de cadveres, parentesco, relaciones de abuso. El DNA puede ser extrado de cualquier parte del cuerpo_ un rgano, la saliva, dentadura, sangre (por lo que tiene glbulos blancos), orina, semen, cabellos, entre otros - EL RNA, las molculas del RNA se copian exactamente del DNA mediante el proceso de transcripcin, una vez procesados en el ncleo celular, las molculas de RNA pueden salir al citoplasma para su utilizacin posterior. La informacin contenida en el RNA se interpreta usando el cdigo gentico que especifica la secuencia de los

aminocidos de las protenas segn una correspondencia de un triplete de nucletidos (codn) para cada aminocido: cada combinacin de 3 bases es un codn de DNA, esto es la informacin gentica: (esencialmente que protenas se van a producir en cada momento del ciclo de la vida de la clula). Ejemplo: DNA RNA PROTEINA =
RNA MENSAJERO

CELULA

NUCLEO

La molcula del ADN transporta su informacin gentica a la molcula de RNA, y la molcula de RNA sale del ncleo, va al citoplasma de la clula para transformar esta informacin gentica en la protena, este es el proceso de transcripcin del DNA al RNA mensajero. Para cumplir este proceso se necesita: - Lo primero que vamos a necesitar es el DNA porque acta por un lado como molde para que se pueda saber que nucletidos incorporar en esa molcula nueva de RNA. - Por otro lado, el DNA contiene muchos genes, uno tras otro, con lo cual lo que nos preguntamos cuando vemos la molcula de DNA que es doble cadena y esta entrelazada en una doble hlice, dibujamos las dos cadenas y luego los genes, luego se genera una molcula de RNA que copie la informacin de un gen particular. Ejemplo: (gen de la Actina, que es una protena que est involucrada en la arquitectura de la clula) y se necesitara un mRNA (mensajero). Ejemplo: Siempre delante del gen que se copia existe un sitio que se llama promotor, esta secuencia se denomina secuencia TATA- es la que permite que se unan all unas protenas muy importantes llamadas FACTORES DE TRANSCRIPCION: se unen al promotor. Los factores de transcripcin ms importantes serian: TF II, es uno de los ms importantes, TBP (protena de unin a TATA)

- Es importante que estas protenas se unan al promotor para indicar que necesita iniciarse el proceso de transcripcin. - Al estar ya todas unidas, permiten que se adhiera la enzima RNA polimerasa. - Las hebras de DNA siempre estarn unidas en su modelo doble hlice, y para abrirse para entrar todas las protenas, la enzima que se ocupa de abrir las cadenas son las HELICASAS. - Los nucletidos que forman parte del RNA son: con la base nitrogenada. Uracilo: U, a los nucletidos que contienen estas bases son: G,C. UTD-GTP-CTP-ATP: estos son los diferentes nucletidos que se van a la cadena naciente del RNA y se dice que son con la letra T porque contienen 3 grupos fosfatos que al unirse al RNA van a perder y se quedaran con un solo: UMP-CMP-GMP-AMP. COMO SABE LA ENZIMA QUE YA SE TERMINO? Sabe porque ya hay una secuencia de terminacin, la RNA polimerasa sale del lugar despegndose de la molcula de RNA y entonces el RNA que se formo tambin se despega y pueda como una nica cadena - El RNA polimerasa siempre sintetiza esta molcula de RNA en la direccin de 5a 3al RNA mensajero de las dos hebras de mRNA, la que va a estar copiando es la 3a 5(cadena complementaria).

LA EXPRESION DE LA INFORMACION GENETICA ALMACENADA: Este es un proceso complejo y la base para el concepto de flujo de informacin en la clula veremos a continuacin un esquema simplificado de este concepto. El suceso inicial es la transcripcin de DNA, cuyo resultado es la sntesis de 3 tipos de molculas de ARN o RNA: mRNA: RNA mensajero rRNA: RNA ribosmico tRNA: RNA transferente
De ellos los mRNA: RNA mensajeros se traducen en protenas, cada tipo de mRNA es el producto de un gen especifico y dirige la sntesis de una protena diferente. La traduccin: se realiza en unin con los ribosomas que contienen rRNA y en ella tambin participa el tRNA que actua como adaptador para convertir la informacin qumica del mRNA en los aminocidos que forman las protenas. en conjunto estos procesos sirven para el dogma central de la gentica molecular. El DNA fabrica el RNA y este a su vez produce las protenas.

DNA
Transcripcin

mRNA

rRNA

tRNA

RIBOSOMA

TRADUCCION PROTEINA

VARIACION POR MUTACION: El material gentico tambin debe ser la base de nueva variabilidad para los organismos por el proceso de mutacin, si ocurre un cambio en la composicin Amica del DNA, la alteracin se reflejara en la transcripcin y en la traduccin afectando a menudo a la protena especificada: si una mutacin est presente en los gametos, esta pasara a las futuras generaciones y con el tiempo podra extenderse a la poblacin. - LA VARIACION GENETICA que incluye reordenaciones a menudo dentro y entre cromosomas proporciona la materia prima para la evolucin.

- Nos damos cuenta que en el momento de copiar la enzima a la siguiente cadena complementaria, en vez de copiar una A: Adenina, copio una C:Citocina, generando un cambio en la conformacin de la estructura y generando una mutacin.

- Las consecuencias podran ser: 1. Mas cantidad de protenas, siendo estas esenciales para la vida de la clula = la clula morira. 2. En efectos benficos: la mutacin hara una mejora para la especie. - Estando estas mutaciones asociadas a la replicacin del DNA. - Explicacin: maduracin del ARN TRANSCRIPCION - Proceso biolgico del ARN mensajero - El ADN: transfiere su informacin gentica al ARN que es el que sale al citoplasma para poder hacer el proceso de traduccin de protenas que es donde se van a generarse todas aquellas protenas que se necesitan para el funcionamiento de la clula: este proceso de la transcripcin finaliza con la generacin de la molcula del ARN mensajero (mRNA) pero al estar inmaduro se har ADN mARN citoplasma = traduccin

Transcripcin. No puede salir al citoplasma hasta no estar maduro. Se necesita: PROCESO DE MADURACION. 1. El proceso de corte y empalme splicing 2. Adiccin de la caperuza (cap): esto es en el extremo sprima del ARN que se forma recientemente.

3. Adiccin de una cola de Poli A (Poli Adenina) se inserta en el extremo 3del ARN mensajero. - Para poder explicar el proceso de maduracin se debe saber que es: EXONES: son aquellas secuencias que contienen informacin para que se sintetice la protena. Intrones: son aquellas secuencias que no contienen informacin para que se sintetice la protena.

El SPLICING= es la tarea de remover los intrones. Exones intrones Se cortan y queda exones

=exones =intrones

El ADN solo tiene un 1.5% de su informacin gentica que codifica para las protenas, el 98.5% est compuesto por secuencia del tipo de INTRONES por los promotores y las secuencias que acompaan a los genes y tambin el 70% serian los componentes EXTRAGENICOS. - Secuencias de nucletidos que no codifican para ninguna protena. Solamente 1.5%

Este ARN mensajero es el que va a ir al citoplasma y va a codificar con toda su informacin para generar la protena.

- El SPLICING se hace con un grupo de protenas en forma de complejo que se llaman: SPLICEOSOMA: es un complejo de protenas que remueve los intrones, los corta y los empalma de nuevo para generar esta molcula que solo tienen EXONES, existen algunos INTRONES que se hacen AUTOSPLICING (proceso que aun no est estudiado pero que se pueden cortar entre ellos, no necesitan de este complejo de protenas). - EL CAP: (encapuchamiento) nos imaginamos la hebra de ADN doble cadena, y luego la hebra del ARN y al sintetizarse el extremo 5prima que es el primero que queda libre dentro de todo el proceso de enzima de transcripcin que se llama el ARN polimerasa II, adems de generar esta nueva hebra de mARN tiene otras funciones, como por ejemplo: que es una enzima que puede tener unidas unos grupos, este grupo

que participan del encapuchamiento del mARN, este grupo que se cria al extremo 5en realidad es un nucletido modificado, es una GUANINA METILADA. Grupo metilo: CH3 es una guanina como el grupo: GTPA como el que esta incorporado en el GMP ARN y va a estar modificado con un grupo metilo y produce el encapuchamiento.

Y por un lado el ARN: - Tenga estabilidad= cuando salga al citoplasma no sea degradado por las encimas que lo quieren romper. - Ayuden en el transporte hacia el citoplasma. Esto ocurre en el extremo 5, este grupo de protenas asociadas son reguladas por el ARN polimerasa y participan en el encapuchamiento del mensajero. PROCESO DE POLI ADENILACION: del extremo 3del mARN es un proceso que ocurre cuando se finaliza la sntesis de este mARN y consta de una larga fila de PoliAdelinatos que son los nucletidos que tienen la base nitrogenada a la Adenina, que poda estar presente en cualquier lugar del mARN en el extremo 3tiene una cola larga, estos sern los procesos para la maduracin del mARN. A-A-A-A-A.