Unidad 2. Dominio Bacteria

Biologa Celular
Programa desarrollado
Licenciatura / Ingeniera en: Biotecnologa
Programa de la asignatura Biologa celular
Clave: 200920415 190920415
ESAD
Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa
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Unidad 2. Dominio Bacteria

Presentacin de la unidad Una forma prctica de definir la vida es estudiando las interacciones entre un ser vivo con su medio, el flujo entre lo que dicho organismo toma de su medio y lo que le regresa; el cual es un flujo energtico y puede entenderse como termodinmica. Un ser vivo posee una estructura organizada y compleja, que mantiene ordenada por medio de la homeostasis, crece, se reproduce heredando sus caractersticas almacenadas en el ADN y muere. El dominio bacteria es un aspecto de la vida que debemos conocer en el proceso de estudio de la unidad bsica de la vida la clula-, de modo que podamos en lo sucesivo construir cognitivamente las estructuras bsicas y luego las complejas en el mundo de los pequeos organismos en este caso las bacterias. Propsitos Al trmino de la unidad, comprenders la necesidad de incorporar los conocimientos generales de la biologa celular, la importancia de la estructura y su relacin con el metabolismo celular, lo cual posteriormente te permitir desarrollar habilidades para la investigacin, resolucin de problemas y toma de decisiones.
Propsitos
Diferenciar a los organismos bacterianos para identificar las diferentes caractersticas metablicas del dominio bacteria mediante el anlisis de sus caractersticas especficas, estructurales y metabolismo.
2.1. Caractersticas estructurales Las clulas procariontes (procarionte proviene de los vocablos griegos Pro, que significa Antes de y Karion, que significa nuez o ncleo) fueron las primeras en aparecer en la escala evolutiva, se caracterizan porque no tienen ncleo delimitado por una membrana, ni organelos. Su genoma circular, es decir, la cadena de ADN est unida por sus extremos formando una estructura similar a una dona o un aro, est disperso por el citoplasma y en comparacin con el genoma de una clula eucarionte como las nuestras es muchsimo ms pequeo. A continuacin hablaremos de estas diferencias con ms detalle.
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Micrografa electrnica de transmisin. ADN bacteriano, se puede apreciar su conformacin circular. El segmento sealado con verde corresponde a una secuencia que se ha anexado por medio de tcnicas moleculares al ADN bacteriano para que esta produzca una protena. De esta manera se ha podido sintetizar artificialmente hormonas humanas como la insulina. Photosciencelibrary.com 12-Nov-2011
2.1.1. Estructura celular Las bacterias estn presentes en todos lados: Hay bacterias en el aire que respiramos, en el agua que bebemos, en el suelo, en tu almohada, en nuestro cuerpo, en los geiseres, en todos lados. Nos hemos acostumbrado a coexistir con ellas principalmente porque no las vemos, pero nos damos cuenta de su existencia cuando se hacen presentes en algunos aspectos de nuestra vida. Cuando la comida se echa a perder despide un olor caracterstico producto del metabolismo de las bacterias, cuando nos enfermamos del estmago, por ejemplo puede ser porque una bacteria patgena ha crecido en nuestros intestinos, cuando sufrimos alguna herida y por un mal cuidado esta se inflama y produce una sustancia turbia y de mal olor que conocemos como pus, es producto de las bacterias. Algunas bebidas como el tepache, el pulque, alimentos como el yogurt, la leche blgara, los chongos zamoranos, el queso, entre otros, son productos del metabolismo bacteriano. Como puedes ver, las bacterias forman parte de nuestra vida en formas que ni te imaginas. Pero, Sabes como son, cuanto miden, como viven, que hacen? Todos hemos utilizado alguna vez un metro, sabemos que un metro, tiene 100 centmetros, y que un centmetro se divide en 10 milmetros, nuestros ojos pueden ver sin problema los milmetros, son la unidad de longitud ms pequea que podemos apreciar en cualquier regla escolar y podemos medir muchas cosas con ella. Sin embargo, para medir cosas ms pequeas necesitamos unidades ms pequeas, como la Micra o micrmetro ( m). Un micrmetro es la milsima parte de un milmetro. Definitivamente no podemos verla Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 3
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a simple vista. Imagnate un milmetro y prtelo en mil porciones iguales y tendrs un micrmetro o micra, esta es la unidad de medida que nos permitir estudiar a las bacterias. El tamao de una bacteria oscila entre los 0.2 m de dimetro y 2 a 8 m de largo. Como te puedes dar cuenta su tamao es microscpico y por eso no podemos verlas a simple vista, pero estn siempre presentes.
Estructuras citoplsmicas: Como ya mencionamos, las clulas procariontes carecen de organelos delimitados por membranas, como mitocondrias, cloroplastos, retculos endoplsmicos y ncleo, sin embargo, se pueden apreciar ciertas estructuras con actividad metablica importante, muchas de sus enzimas estn ancladas a la membrana, sin embrago es muy comn observar que estos microorganismos almacenen materiales de reserva en grnulos en forma de polmeros, por ejemplo, el exceso de carbono (C) es almacenado en forma de polmeros de glucosa como almidn y glucgeno donde estas molculas sirven como una posterior fuente de carbono cuando es necesario sintetizar protenas y cidos nuclicos (ADN, ARN), otro ejemplo sera la acumulacin de grnulos de fosfato como reserva de este compuesto para sintetizar ATP, que es la principal fuente de energa de todas las clulas (procariontes y eucariontes) Otras estructuras que pueden asemejar a organelos que se pueden encontrar en las bacterias son los CARBOXISOMAS, que son un tipo particular de vesculas delimitadas por protenas contienen enzimas como la ribulosadifosfato carboxilasa, que es la enzima encargada de fijar CO2 en algunas bacterias auttrofas (que son capaces de generar su propio alimento por medio de reacciones qumicas como la fotosntesis). Los MAGNETOSOMAS son vesculas delimitadas por magnetita (Fe3O4) que son empleadas por algunas bacterias orientarse con respecto al campo magntico de la tierra de manera Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 4
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semejante a como se orientan las brjulas hacia el norte, este fenmeno se conoce como magnetotaxia. Las VESCULAS DE GAS, son muy particulares en bacterias acuticas como las cianobacterias, permitindoles la flotacin. Nucleoide: Es la estructura equivalente al ncleo, carece de membrana (en las clulas eucariontes, el ncleo est delimitado por una membrana que contiene todo el material gentico) En el nucleoide se ubica el nico cromosoma bacteriano que consta de una sola molcula circular de ADN aunque existen bacterias como Borriela burgodorferi y en algunos organismos de la familia Streptomyces que presenta un cromosoma lineal, por lo general el ADN bacteriano se encuentra unido a una regin particular de la membrana celular conocida como MESOSOMA, el cual est involucrado en la separacin del material gentico durante la divisin bacteriana. Microscope electrnica de transmisin de Bacillus Membrana celular: megaterium mostrando el nucleoide en azul, mesosoma en La membrana bacteriana presenta la tpica estructura en gris, membrana plasmtica en prpura y pared elular en forma de bicapa lipdica, como su rojo. Scinecephotolibrary.com 12-Nov-2011 nombre lo dice, consta de dos capas de fosfolpidos con protenas ancladas a esta estructural la principal diferencia entre las membranas celulares procarionte y eucariontes es la presencia de colesterol, en las bacterias esta molcula no est presente, solo se puede apreciar en las membranas eucariontes. Como en toda regla, existe una excepcin, ya que las bacterias conocidas como micoplasmas incorporan el colesterol tomndolo de su medio ya que no lo pueden sintetizar como lo hacen los animales. El colesterol, en las membranas eucariontes tiene funciones importantes, como brindarle estabilidad y elasticidad a la membrana, adems de intervenir en procesos de transporte de sustancias contenidas en vesculas. En las membranas de las clulas eucariontes, existen molculas parecidas al colesterol llamadas Hopanoides, estas molculas de naturaleza lipdica tienen la misma funcin que el colesterol y tambin se intercalan en la membrana plasmtica procarionte.
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Diagrama de la membrana celular de una bacteria gram negativa, se puede apreciar la membrana lipdica en forma de bicapa, las protenas membranales, el espacio peripsmico formado entre la capa externa de la mambrana y la pared de peptidoglicano. Extrada de: (www.photosciencelibrary,com 12Nov-2011
Los RIBOSOMAS forman parte de la maquinaria de sntesis de protenas, estn compuestos por dos subunidades, la ms pequea, denominada 30S (S se refiere al coeficiente de sedimentacin de Svedverg, que se obtiene al medir la velocidad de sedimentacin de una molcula o partcula en suspensin cuando se somete a ultra centrfuga, entre ms pequea sea la molcula tardar ms tiempo en sedimentarse.) es la encargada de presentar la molcula de ARNm (ARN mensajero) a la subunidad ribosomal 50S, que es la ms grande y es en donde se lleva a cabo el proceso de sntesis de una protena. Brevemente el proceso es como sigue: Los genes son segmentos en el ADN que contienen la receta para sintetizar una protena, es decir, en el gen se encuentra la secuencia de aminocidos especfica para esa protena. Cuando la bacteria necesita una protena en particular, busca su gen dentro de su ADN, al encontrarlo construye una molcula de ARNm a partir de la secuencia genmica del ADN, este ARNm tiene el orden de aminocidos de la protena y se dirige al RIBOSOMA donde esta secuencia ser traducida y se adicionarn los aminocidos que indica la molcula de ARNm. Imagina que tu eres un pastelero, y quieres hacer un pastel en particular, entonces de diriges a tu recetario de pasteles, pero este recetario est escrito en francs, entonces tienes que traducir la receta que elegiste al espaol y despus drsela a tu ayudante para que haga el pastel, el ayudante traducir la receta en un pastel delicioso. Tomando en cuenta esta analoga, el recetario en francs es el ADN, cada receta equivale a un gen que codifica para una protena especfica que sera el pastel. Como no te sirve la receta en francs porque tu ayudante no lee francs, necesitas traducirla al espaol, la clula traduce el ADN en francs al ARNm que est en espaol, ya en el idioma correcto, tu ayudante que sera el ribosoma adiciona los ingredientes en la secuencia que marca la receta, del mismo modo que el ribosoma adiciona los ingredientes de la protena, que seran los aminocidos, los aminocidos son transportados por otra molcula de ARN que se conoce como ARN de transferencia o ARNt, cuya funcin es llevar a los aminocidos hasta el ribosoma donde se sintetizar la protena. Los aminocidos se unen entre si, como si fueran las cuentas de un rosario por medio de un enlace covalente que se conoce como enlace peptdico.
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Representacin de la sntesis de protenas, se puede apreciar al ribosoma formado por las sub unidades 30S y 50S, una molcula de ARNm que est siendo traducida, as como el ARNr que acarrea a los aminocidos hasta el ribosoma para unirlos mediante un enlace peptdico. Extrada y modificada de: Photosciencelibrary.com. 12-Nov-2011
Las principales funciones de la membrana bacteriana son: a) PERMEABILIDAD Y TRANSPOTE La membrana es una estructura semipermeable, esto quiere decir que solo permite el paso hacia adentro o hacia afuera de la bacteria de ciertas molculas, en este caso como las caras interna y externa de la membrana son hidroflicas pueden atravesarla algunas molculas solubles en agua como iones (Fe, Ca, Na, K, entre otros)algunos nutrientes y el agua misma, sin embargo, existen molculas necesarias para el metabolismo bacteriano que no son hidroflicas o que son muy grandes para atravesar la membrana por s mismas y que sin embargo necesitan entrar o salir como azcares, para estos casos existen mecanismos de transporte que discutiremos en el apartado de metabolismo bacteriano. 2.1.2 Estructura del Genoma
El genoma es el material gentico que contiene un organismo, este material gentico est compuesto por una doble cadena de ADN, que significa cido Desoxirribonucleico, es un cido porque su carga neta es negativa (-) el prefijo desoxi hace alusin a la molcula de azcar de cinco carbonos, la desoxirribosa, que forma parte del esqueleto de la cadena de ADN y nuclico porque esta molcula se encuentra en el ncleo (en el caso de las bacterias en el nucleoide). El ADN tiene forma de doble hlice, muy parecida a una escalera de caracol, donde los barandales de la escalera seran el esqueleto de ribosa y fosfato, mientras que los peldaos estaran formados por las bases nitrogenadas. Existen cuatro bases nitrogenadas, para el ADN son GUANINA y ADENINA que son bases pricas o purinas, y estn formadas por dos anillos cclicos, las dos bases restantes son la TIMINA y CITOSINA a las cuales se les llama pirimdicas o pirimidinas.
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Representacin de las bases nitrogenadas que conforman al ADN, ntese que las purinas contienen dos anillos aromticos, mientras que las pirimidinas solo presentan uno. Extrada de: http://benitobios.blogspot.com/2007_09_16_archive.ht ml 12- Nov- 2011
A estas bases nitrogenadas se les adiciona, para el caso del ADN una molcula de desoxirribosa y un grupo fosfato, para conformar a un NUCLETIDO, que es la unidad estructural del ADN. Representacin de los cuatro nucletidos que conforman al ADN. La desoxirribosa se une al la base nitrogenada por medio de su carbono 1, mientras que el ATP se adiciona al carbono 5 del azcar. Ntese que en el carbono 3 del azcar se encuentra un grupo OH, esta molcula es vital para el proceso de polimerizacin del ADN. Extrada de: http://biologiaciclocelular.blogspot.com/2009_03_01_a rchive.html 12-Nov-2011
Para que la doble hlice de ADN pueda construirse es necesario polimerizar a los nucletidos entre si, este proceso se lleva a cabo formando un enlace que se conoce como Fosfodiester en donde el grupo fosfato que est unido al carbono 5de la desoxirribosa se enlaza con el grupo OH que se encuentra en el carbono 3de la ribosa del nucletido al cual se va a unir, este patrn de crecimiento de 5hacia 3 sirve para darle orientacin a las cadenas ya que en muchos procesos, como la replicacin de ADN se lleva a cabo en esta direccin. Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 8
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Cada hebra de la doble hlice presenta orientacin diferente, una cadena est acomodad en direccin 53y la otra al revs, 35como si se tratara de una carretera de dos carriles donde un carril corre de norte a sur (35) y la otra lo hace de sur a norte (53) por esta caracterstica se dice que son antiparalelas. Las cadenas de la doble hlice de ADN se mantienen unidas entre si por medio de puentes de hidrgeno, los puentes de hidrgeno no son enlaces qumicos propiamente dicho, ya que se forman mediante la interaccin electrosttica entre las nubes electrnicas de dos tomos de hidrgeno, esta interaccin no es al azar, la Guanina de una cadena solo puede unirse a la Citocina de la otra cadena formando tres puentes de hidrgeno, mientras que la Adenina de una cadena solo puede interactuar con la Timina de la otra cadena mediante la formacin de dos puentes de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno son muy frgiles, sin embargo a lo largo de la cadena de ADN se forman cientos de miles de puentes de hidrgeno, si sumas la fuerza de cada uno obtienes un gran poder cohesivo, este poder es lo que le da la estabilidad a la unin entre las dos cadenas antiparalelas del ADN.
En esta figura se pueden ver algunas estructuras de la doble hlice del ADN, se aprecia la ubicacin y direccin de los enlaces fosfodiester entre el fosfato 5 y el oh 3de dos nucletidos vecinos, se pueden apreciar la formacin de puentes de hidrgeno, Adenina (A) y Timina (T) interactan por medio de dos puentes de hidrgeno, mientras que la Citocina (C) y la Guanina (G) interactan formando tres puentes de hidrgeno
Representacin esquemtica del ADN donde se puede ver que las cadenas son antiparalelas ya que una se orienta en direccin 53mientras que la cadena complementaria lo hace en direccin opuesta 35. Se Aprecia la interaccin AT y GC formando 2 y 3 puentes de hidrgeno respectivamente. Extrada de: ALBERTS 2002. 12-Nov-2011
En una clula eucarionte como las nuestras, nuestro material gentico se encuentra organizado en cromosomas, estas estructuras estn formadas por ADN lineal, esta es la gran diferencia entre el genoma eucarionte y el procarionte, mientras que en primero las molcula de ADN son lineales, en los procariontes el ADN est en forma circular, en primer lugar porque es muchsimo ms pequeo, y en segundo lugar porque de este Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 9
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modo es ms eficiente el proceso de replicacin y de sntesis de protenas. Al ADN circular de las bacterias se le conoce como Plsmidos. Representacin del ADN bacteriano, se puede apreciar la tpica estructura de doble hlice en una espiral continua de forma circular, a este tipo de configuracin del ADN bacteriano se le conoce como plsmidos. Extrada de: Photosciencelibrary.com 12-Nov-2011
Tema 2.1.3 Estructura Extracelular
Los superhroes pueden crear campos de fuerza, estos pueden funcionar como extensiones de su cuerpo y su principal funcin es protegerlos, envolverlos, funcionan como barreras que impiden el paso del ataque enemigo manteniendo al superhroe a salvo, seguro y sobre todo impide que sus condiciones internas cambien, mantenindose constantes, entonces un campo de fuerza favorece la homeostasis del superhroe.
Extrada de: http://www.zastavki.com /pictures/ 1680x1050/2010/3Dgraphics_Force_field_020947_.jpg12Nov 2011
Las bacterias, al igual que un superhroe tiene un campo de fuerza que tal vez sea su estructura anatmica ms importante y vital ya que las protege, les da forma, interviene en su metabolismo y las resguarda de la lisis o ruptura celular lo que para la bacteria representara la muerte, este campo de fuerza se conoce como PARED CELULAR. Los componentes principales de la pared celular bacteriana son el cido Nacetilmurmico, la N-acetilmuramina que son polmeros de azucares, cadenas de aminocidos (pptidos) y pentaglicina (solo para fines informativos).
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Diagrama de la estructura bsica de la pared celular bacteriana, como puedes ver, tiene forma de red, esta estructura se repite varias veces en la pared celular, el grosor de esta va a depender de la especie. Tomada y adaptada de: http://www.iquimicas.com/bacterias-definicion-yestructura/ 12-Nov-2011
A pesar de que la estructura de peptidoglicano es ms o menos conservada en la pared celular de las bacterias existen diferencias que nos permiten marcar una gran divisin entre las bacterias. La tincin de gram inventada por Christian Gram en 1884, hace ya mucho tiempo y consiste a groso modo en someter a la bacteria a estudiar a un tratamiento con violeta de genciana, seguido de un tratamiento con yoduro y un lavado final con alcohol, este mtodo nos permite ubicar a las bacterias en dos grupos, las bacterias grampositivas que se tien de color azul violceo, y las bacterias gramnegativas, que se tien de color rojos rosceos. Estas diferencias en la coloracin se deben a que la pared de las bacterias gramnegativas y grampositivas son diferentes.
Representacin de la pared celular de una bacteria grmpositiva, ntese la gruesa capa de peptidoglucano en estrecha relacin con la membrana celular bacteriana Figuras extraidas de: http://nuevastactaticasbacterias.blogspot.com/20 10/06/tipos-de-clasificaciones-de-bacterias.html 12-Nov-2011
Representacin de la pared celular de una bacteria gramnegativa. Como se puede observar, la pared celular de peptidoglicano es delgada en comparacin de la pared gramnegativa, adicional a la pared de pptidoglucano se encuentra una segunda membrana celular conocida como membrana externa.
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Actividad 1. Con meln o con sanda. Descripcin: Tabla con las principales caractersticas de las bacterias Gram negativas y positivas. En esta actividad ampliars tus conocimientos sobre las diferencias que existen entre las bacterias gram positivas y gram negativas para poder aplicar este conocimiento en tu prctica diaria y elegir el organismo que cubra mejor tus necesidades, tomando en cuenta lo anterior se te solicita lo siguiente: 1. Investiga los principales filos que corresponden a cada grupo, gram positivas y gram negativas, 2. Identifica sus caractersticas principales tomando en cuenta los siguientes aspectos a. Morfologa de la pared celular b. Metabolismo c. Evolucin 3. Con la informacin que obtuviste elabora una base de datos que contenga dos entradas: Diferencias en el metabolismo bacteriano en funcin al grupo que pertenecen Diferencias a nivel evolutivo Nota: Te exhortamos atentamente a abstenerte de cualquier accin de plagio o copia de contenidos, ya que tu facilitador(a) puede detectar esta situacin sin dificultad, tu formacin exige que desde esta etapa todo producto o tarea que reportes sea totalmente original y propio de tu iniciativa y creatividad, con el fin de que en lo sucesivo esta actitud se proyecte directamente en tu prctica profesional. 2.1.4 Importancia de los biofilms Una de las cosas que las bacterias hacen mejor es formar colonias ya que se dividen muy rpido y de manera muy eficiente, una bacteria es capaz de dividirse ms o menos cada 20 minutos creciendo de manera exponencial hasta donde el espacio y la cantidad de nutrientes en el medio se lo permitan. Para poder formar colonias las bacterias necesitan estar juntas, para esto segregan polmeros orgnicos que son una mezcla de azucares. Este polmero funge como pegamento que las mantiene unidas entre ellas y les permite posicionarse y colonizar cualquier superficie formando una capa protectora por donde circulan agua, nutrientes y metabolitos. Las tuberas, los ductos de aire acondicionado, piedras, cuerpos de agua dulce y salada, drenajes, zondas hospitalarias, cnulas y agujas hipodrmicas, las superficies inertes de las prtesis biomdicas, nuestros intestinos, los dientes formando placa dentobacteriana, la superficies de los lentes de contacto, heridas mal cuidadas, alimentos. Prcticamente cualquier superficie es susceptible de convertirse en el lecho de un biofilm. Te parece importante el estudio de los biofilms? Sin duda!, los biofilms representan por lo general un problema serio de contaminacin, es por eso que los estudios sobre estos estn orientados a la comprensin de su dinmica para poder prevenir su crecimiento y poder evitar problemas de contaminacin en todos los medios donde las bacterias crecen. Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 12
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Micrografa electrnica que muestra una cerda de cepillo dental siendo colonizada por bacterias, un ejemplo de biofilm. Extrada de: www.photosciencelibrary.com 12-Nov-2011
Micrografa electrnica de transmisin mostrando bacterias formadoras de placa dentobacteriana, u ejemplo de biofilm. Extrada de: www.photosciencelibrary.com 12-Nov-2011
2.2 Metabolismo Bacteriano
El metabolismo bacteriano es muy diverso y muy particular, desde siglos atrs el ser humano se aprovecha de estas particularidades metablicas desde un principio para producir alimento como cremas, quesos, alcohol, vinagre, entre otros a baja escala, sin embargo a travs del estudio y manipulacin del metabolismo bacteriano se ha podido elevar a nivel industrial la elaboracin de diferentes productos. 2.2.1 Caractersticas funcionales
El metabolismo bacteriano a nivel evolutivo se ha especializado influenciado por dos factores primordiales, El ambiente en el que se desarrolla la bacteria y el alimento de la bacteria. Dentro de las caractersticas ambientales se encuentran, la ausencia o presencia de oxgeno, la temperatura, si el ambiente es acutico o terrestre, entre otros. Sustratos existen muchsimos, hay bacterias que metabolizan compuestos ricos en nitrgeno, azufre, fsforo, azcares, grasas y aceites de diferentes tipos y orgenes, bacterias que fotosintetizan como las plantas. Esta diversidad se ha desarrollado a nivel evolutivo favoreciendo la aparicin, conservacin y especializacin de enzimas. A continuacin ejemplificaremos algunos procesos metablicos utilizados con frecuencia en la industria Fermentacin. Bsicamente la fermentacin es el proceso por el cual los carbohidratos se oxidan en ausencia de oxgeno para generar energa. A nivel industrial se explotan dos tipos de fermentacin: fermentacin alcohlica y fermentacin lctica, en ambos procesos se toma como punto de partida o sustrato a la glucosa o diversos azcares como lactosa, fructosa, sacarosa, entre otros azucares contenidos en el medio por ejemplo, los jugos frutales, o lacteos. Existen bacterias que son capaces de llevar este proceso de manera natural.
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Fermentacin alcohlica Alcohol: puede ser metanol Fermentacin Lctica cido lctico
Descripcin del metabolito o producto principal
Algunos microorganismos que la llevan a cabo Sustratos principales Ruta metablica
Zymomonas, Thermoanaerobacter Azcares
Lactobacillus sp
Leche y derivados lcteos (lactosa, glucosa)
Extrada de: http://recursos.cnice.mec.es 12-Nov-2011 Productos finales Etanol Quesos, yogut, jocoque, lacteos
Como puedes darte cuenta, ambas rutas metablicas se parecen, en primer lugar ambas rutas comparten el sustrato inicial, que es la glucosa o azcar, esta molcula de seis tomos de carbono se somete a un proceso metablico llamado gluclisis, en donde a travs de varias reacciones enzimticas se obtienen dos molculas de tres carbonos llamada piruvato, para fines prcticos, la gluclisis es el proceso metablico por el cual se rompe una molcula de 6 carbonos en dos molculas de tres carbonos que sirve como segundo sustrato para otra reaccin metablica, en la fermentacin alcohlica el piruvato se transforma en alcohol y dixido de carbono, mientras que en la fermentacin lctica se convierte en cido lctico y dixido de carbono. En la industria alimenticia estos procesos metablicos bacterianos se emplean a gran escala para producir alcoholes y derivados lcteos para consumo humano. Otros productos elaborados a nivel industrial donde interviene el metabolismo bacteriano Producto Lacteos tipo yacult Crema agria Yogur Requeson Caf (procesamiento) Aceitunas e conserva Salsa de soya Microorganismo Lactobacilus acidophilus Lactococcus, Leuconostoc Streptococcus, Lactobacillus bulgaricus Lactococcus Erwinia dissolvens Leuconostoc mesenteroides Lactobacillus delbrueckii 14
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Acetona y butanol Aminocidos Metano cloranfenicol (antibitico) Eritromicina (antibitico) Vinagre Prednisolona Clostridium acetobutylicum Corynebacterium glutamicum Methanobacterium Streptomyces venezuelae Streptomyces erythraeus Acetobacter Corynebacteriums simplex
Actividad 2. Algo me huele mal Descripcin: Mapa conceptual con los conceptos bsicos de la fermentacin aerbica y anaerbica. Esta actividad te permitir reforzar y afianzar tus conocimientos sobre las dos vas de fermentacin ms utilizadas en la industria con la finalidad de que tengas un buen dominio de estas y puedas implementarlas en tus actividades profesionales. Con base en lo anterior se te pide que desarrolles lo siguiente: Investiga los aspectos generales de cada proceso de fermentacin Sustratos Sucesin de reacciones metablicas y condiciones necesarias para el proceso Enzimas participantes Productos intermedios obtenidos Productos finales Algunos microorganismos que la lleven a cabo A partir de la informacin que obtuviste elabora un mapa conceptual que explique secuencialmente como se lleva a cabo cada proceso de fermentacin desde que el microorganismo entra en contacto con el sustrato hasta que se obtiene el producto final haciendo nfasis en: 1. Sustratos 2. Sucesin de reacciones metablicas y condiciones necesarias para el proceso 3. Enzimas participantes 4. Productos intermedios obtenidos 5. Productos finales. Plasma tu trabajo en un documento realizado en Word cubriendo ampliamente todos y cada uno de los puntos que se te solicitan. 2.2.2 Principales Enzimas Bsicamente una enzima es una protena que cataliza o realiza la conversin de un sustrato en un producto diferente, esto lo hace la bacteria de forma natural como parte de su metabolismo, actualmente se ha logrado manipular sido metabolismo a favor del desarrollo de las industrias.
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Enzima
funcin
Subtilisina Proteasa, enzima que rompe otras protenas en fragmentos ms pequeos
Microorganismo del que proviene Bacillus licheniformis
alfaamilasa
el almidn en molculas de maltosa Enzima que corta el ADN
Bacillus subtilis
EcoR1
Eschlerichia coli
ADNpol
Sintetiza molculas de ADN cuando la bacteria va a dividirse
Esclerichia coli
Industria de aplicacin detergentes de uso domstico, cosmticos y procesamiento de alimentos, cosmticos, lquidos limpiadores de lentes de contacto Produccin de jarabes de maz para la industria refresquera Biotecnologa y biologa molecular en los procesos de manipulacin Gentica Biotecnologa y biologa molecular en los procesos de manipulacin Gentica
Estos son algunos ejemplos de enzimas bacterianas aplicadas en la industria, sin embargo, gracias a las tcnicas de biologa molecular se ha podido manipular a las bacterias introduciendo en su genoma genes de otros organismos para producir muchas enzimas a esta tecnologa se le conoce como ADN recombinante. Dentro de las enzimas producidas por estas bacterias transgnicas se encuentran la insulina humana, hormona del crecimiento humana, por mencionar algunas.
2.3 Ciclo celular Un ciclo es una secuencia de eventos que se repiten dos o ms veces de manera secuencial e inalterable. En la primaria te hablaron del ciclo de la vida, donde para un organismo implicara, el nacer, crecer, reproducirse y morir, no se puede cambiar esta secuencia ya que no se puede primero morir y despus reproducirse y crecer, suena obvio pero vale la pena mencionarlo para entender la importancia de la sucesin de eventos en un ciclo, como lo es el ciclo celular bacteriano, el cual involucra tambin el nacer, crecer, reproducirse y eventualmente morir. 2.3.1 Fases del ciclo celular En las bacterias hablar de ciclo celular es sinnimo de ciclo de vida: Crecimiento: antes de poder dividirse la bacteria debe tener el tamao suficiente para darle origen a dos nuevas clulas bacterianas que en principio sern mucho ms Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 16
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pequeas que la clula que les dio origen, pero tendrn el tamao mnimo necesario para conservar sus funciones vitales y desempear su metabolismo, si una bacteria se dividiera antes de alcanzar su tamao adulto por nombrarlo de alguna manera, las nuevas bacterias estaran condenadas a muerte porque no contaran con el tamao mnimo necesario para sobrevivir. Sntesis y Replicacin: Para que la divisin celular bacteriana tenga xito primero debe duplicar todo su contenido para que cada clula hija tenga todo lo necesario para vivir, esto implica un proceso de sntesis de todos sus componentes como enzimas y la duplicacin de su material gentico para asegurarse de que cada hija reciba una copia exacta de todo su genoma, este es un proceso vital e involucra un enorme gasto de energa para la bacteria ya que debe asegurarse de que se copie todo el material gentico perfectamente para disminuir el riesgo de mutaciones. Recordemos que el cromosoma de una bacteria como E.coli es circular, este cromosoma contiene marcas que le dicen a la clula por donde iniciar la copia del material gentico, esta marca se conoce como Ori C, u origen de replicacin, es una secuencia especfica dentro del ADN bacteriano que le indican a las protenas encargadas de la replicacin como la ADN polimerasa donde iniciar a duplicar el material. Como puedes observar, este proceso es bidireccional y corre hacia ambos sentidos del cromosoma circular, al final se obtienen dos copias idnticas del cromosoma original.
Extraido y adaptado de: http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Replicacion/Replic acion.htm 12-Nov-2011
Divisin celular: en este proceso, la clula se divide en dos mitades equivalente donde a cada una le toca la mitad de todo el contenido de la bacteria, principalmente una copia completa del cromosoma circular recin sintetizado, cuando el proceso de divisin ha terminado, las nuevas clulas se separan quedando lista para iniciar nuevamente el ciclo con la fase de crecimiento.
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Diagrama representativo del ciclo celular de E.coli, se pueden apreciar las fase de crecimiento, el inicio de la divisin y la separacin de las nuevas clulas para iniciar nuevamente el ciclo. Cabe mencionar que se hace referencia a polos celulares, en este caso se hace referencia a la parte frontal y posterior del cuerpo de la clula, esta polaridad de adelante y atrs no solo es importante para llevar a cabo el proceso de divisin, si no todo el metabolismo. Tomada y adaptada de: http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1 371/journal.pbio.0030045. 12-Nov-2011 Imgenes de Alberts, (2002).
Actividad 3. La invasin. Descripcin: Mapa conceptual que describa las relaciones entre las diferentes estrategias reproductivas bacterianas. Con esta actividad profundizars tu conocimiento sobre las diferentes estrategias reproductivas de las bacterias. Para obtener este beneficio se te solicita que desarrolles lo siguiente: 1. Investiga las estrategias de reproduccin sexual y asexual bacteriana 2. Identifica los aspectos principales de cada estrategia reproductiva, ya sea sexual o asexual 3. Identifica las situaciones o los momentos en los que la bacteria decide que estrategia reproductiva llevar a cabo 4. Con base en tu investigacin desarrolla un mapa conceptual que describa las relaciones entre las diferentes estrategias reproductivas. Tu mapa deber hacer nfasis en: Descripcin de las estrategias Diferencias entre estrategias Finalidad de cada estrategia Situaciones en las que se lleva a cabo cada estrategia. Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 18
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2.3.2 Regulacin del ciclo celular.
El ciclo celular es controlado por indicadores que le avisan a la bacteria si ya est lista para dividirse. Un indicador es el tamao, si es muy pequea no podr dividirse, el otro control es la cantidad de material gentico, solo hasta que la bacteria ha replicado total y fielmente su material gentico puede considerarse lista para dividirse.
En promedio el ciclo celular de E.coli dura alrededor de 60 minutos, pero puede ser menos dependiendo de las condiciones ambientales como la humedad y temperatura as como de la disposicin de espacio y nutrientes. En el presente esquema se aprecian los puntos crticos para dar sucesin al ciclo celular. Extrado de: Prescott. 2ooo 2.3.3 Expresin gentica En las bacterias, los genes estn agrupados dentro del ADN circular en funcin del proceso metablico, es decir, todos los genes que estn involucrados en un proceso en particular se encuentran uno tras de otro en el ADN en una unidad gentica llamada OPERN. El opern es una unidad funcional del genoma que regula la expresin de un conjunto de genes. Por lo general estos operones son inducibles y regulables, esto quiere decir que solo cuando se les necesita se van a expresar y el tiempo que se expresen est en funcin de las necesidades de la bacteria. Es frecuente que el propio producto del metabolismo al que corresponden los genes sea el que le avise a la bacteria cuando detenerse si este producto llega a la concentracin necesaria par la bacteria. Un ejemplo csico es el opern del triptfano, esta molcula es un aminocido y la bacteria tiene un opern especial para la sntesis del triptfano y funciona como sigue: En las bacterias, por ejemplo E. coli, los genes que codifican para las enzimas que sintetizan el aminocido triptfano estn arreglados en un opern donde se encuentran adyacentes uno del otro dentro del cromosoma y son transcritos mediante un promotor nico a partir del cual se sintetiza una sola molcula de mRNA, sin embargo, cuando este aminocido est presente en el medio y es censado por la clula, esta ya no necesita mantener activa la maquinaria de sntesis de triptfano, por lo que la apaga.
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Dentro del promotor que dirige la transcripcin se encuentra un elemento regulador llamado OPERADOR que es reconocido por una protena represora, el REPRESOR DE TRIPTFANO que es miembro de la familia hlice-vuelta-hlice. EL promotor y el operador estn configurados de tal manera que cuando el represor est posado sobre el operador bloquea el acceso de la ARNpol hacia el promotor, impidiendo la expresin de la maquinaria enzimtica productora de triptfano. El bloqueo de la expresin es regulado de la siguiente manera: Para unirse a su operador en el ADN, la protena represora necesita tener dos molculas de triptfano unidas a ella, la unin del triptfano, La unin del triptfano modifica el motivo hlice-vuelta-hlice del represor de tal manera que se pueda presentarse apropiadamente en el surco mayor de ADN anclndose sonde la molcula de ADN . Sin triptfano, el motivo experimenta un giro interno que impide que la protena se una al operador. As, el represor de triptfano y el operador forman un dispositivo simple que modula la produccin de las enzimas involucradas en la sntesis de triptfano encendiendo y apagando la maquinaria de acuerdo a la disponibilidad de este aminocido. Debido a que la forma activa que puede unirse al ADN sirve para reprimir la transcripcin de los genes a este tipo de regulacin se le conoce como control negativo mediado por un represor transcripcional. En esta figura, se pueden apreciar el grupo de cinco genes que son transcritos en una sola molcula de ARNm de una vez, esta caracterstica permite su expresin de manera controlada y coordinada, a este tipo de grupos gnicos se les conoce como OPERON Modelo de encendido y apagado del opern de triptfano. Si la concentracin intracelular de triptfano es baja La ARNpol se une al promotor y transcribe los cinco genes del opern, por el contrario, si el nivel de este aminocido es alto, Se activa el represor de triptfano unindose al operador, bloqueando el acceso de la ARNpol al promotor, liberndolo en cuanto los niveles de triptfano desciendan de nuevo.
2.4 Origen del Domino Bacteria La clasificacin de los organismos se basaba principalmente en su bioqumica, su metabolismo y su morfologa, sin embargo debido al desarrollo alcanzado por la biologa molecular en 1965 se propuso un mtodo diferente utilizando secuencias genticas, conocido como filogenia molecular.
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2.4.1 Aspectos evolutivos Para 1977, el Dr. Carl R. Woese, en sus anlisis filogenticos empleando el RNA ribosomal como medida evolutiva, encontr que dentro de las procariotas haba un grupo que a nivel molecular era contrastante, el Archaea. Como consecuencia del descubrimiento, en 1990, plante la necesidad de crear un nuevo taxn (grupo jerrquico de clasificacin) llamndolo Dominio, el cual reagrupa a los seres vivos en 3 tres diferentes dominios: Archaea , Bacteria y Eukarya. Este sistema de los tres dominios, propuesto por Woese, se basa en las diferencias encontradas entre las secuencias de nucletidos en el ARNr, la estructura de los lpidos de la membrana celular y adems en la sensibilidad a los antibiticos. El comparar la estructura del ARNr es especialmente til ya que las molculas de ARNr realizan siempre la misma funcin en todos los organismos, por lo que su estructura cambia muy poco a lo largo del tiempo. Debido a ello, las similitudes y diferencias en la secuencia de nucletidos en el ARNr son un buen indicador de cmo se encuentran relacionados los organismos entre s. El sistema propone que una clula ancestral comn dio origen a tres tipos de clulas diferentes y cada una est representada por un dominio. Bacteria En la actualidad la clasificacin taxonmica de las bacterias est basada principalmente en las secuencias del gen rrs que codifica para la subunidad 16S de rARN. El dominio Bacteria (Eubacteria) corresponde a seres unicelulares procariontes que presentan membranas compuestas de lpidos, predominando diesteres de diacil glicerol, adems de contener una pared celular con peptidoglicanos, estas son sensibles a los antibiticos adems de que contienen rARN y regiones de tARN claramente diferentes de Archaea y Eukarya. En este grupo se incluyen a mycoplasmas, cianobacterias, bacterias Grampositivas y bacterias Gramnegativas. 2.4.1 Principales fila
Extrada de: http://erasmus.ugr.es/filo/bacteria.htm Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 21
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Cierre de unidad Es seguro que en este punto tu concepto sobre las bacterias ha cambiado, ya que descubriste que a pesar de que en apariencia son organismos simples y pequeos, son capaces de llevar a cabo procesos metablicos complejos y muy tiles y aplicables en diferentes aspectos de la industria. Es importante tomar en cuenta que eventualmente tu podrs ser capaz de abordar el estudio de estos microorganismos a nivel bioqumico y molecular y podrs proponer estrategias para poder aprovechar su metabolismo o modificarlo para hacer ms eficiente algn proceso industrial y tambin proponer alternativas de control de crecimiento bacteriano con aplicacin en el campo de la Ecologa. Evidencia de Aprendizaje. De lo simple a lo complejo Descripcin: Principales diferencias entre una bacteria y una clula eucarionte. 1. Esta actividad te servir para tener ms claras las diferencias entre una clula procarionte y una eucarionte a nivel anatmico, metablico y evolutivo. Para esta actividad se te pide que realices lo siguiente: 2. Investiga las caractersticas que definen a una clula procarionte y a una eucarionte en los siguientes aspectos Anatoma Metabolismo Evolutivo
3. Con base en la informacin que recabaste construye una tabla comparativa donde expliques ampliamente las diferencias entre ambas clulas haciendo nfasis en los siguientes aspectos Diferencias anatmicas (extracelulares, intracelulares, morfolgicas, estructurales, y genmicas) Diferencias metablicas (puedes tomar como ejemplo las diferencias en el metabolismo de la glucosa de ambas clulas) Diferencias a nivel evolutivo 4. Elabora tu tabla en un documento de texto con la extensin que te permita abordar ampliamente cada uno de los aspectos que se te solicitan
Fuentes de consulta Stevens, A. (2006). Histologa Humana. Elsevier. Lodish, H. et.al. (2006). Biologa celular y molecular. Panamericana. Montuenga, L., et.al. (2009). Tcnicas en Histologa y Biologa Molecular. USA: Elsevier. Ciencias de la Salud, Biolgicas y Ambientales | Biotecnologa 22
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Bibliografa complementaria
Alberts. B. et al. (2002). Biologa Molecular de la Clula (3a Ed.). Editorial Omega. Robertis, De R. (2004). Fundamentos de Biologa celular y Molecular de De Robertis.(4 Ed. ). Argentina: Editorial el Atenco. Audesirk. T. et. Al. (2008). Biologa, La vida en la Tierra (8a Ed.). Mxico: Prentice Hall. Moreno. J. (2008,10). Prebiticos en las frmulas para lactantes. Podemos modificar la respuesta inmune? Barcelona: An. Pediatr. Cavagnaria. B. (2010, 4). Animales transgnicos: usos y limitaciones en la medicina del siglo XXI. Arch. Argent Pediatr. Erijman, L, et,al. (2011). Impacto de los recientes avances en el anlisis decomunidades microbianas sobre el control del proceso de tratamiento de efluentes. Revista Argentina de Microbiologa.
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Licenciatura / Ingeniera en: Biotecnologa

Programa de la asignatura Biologa celular

Clave: 200920415 190920415

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