INSTITUTO TECNOLOGICO DE ACAPULCO DEPTO.

DE INGENIERIA BIOQUIMICA BIOQUIMICA DEL NITROGENO Y REGULACION GENETICA PROFESOR: ALEJANDRO RAMOS OSORIO CUESTIONARIO No.2 MARTHA LIDIA PEREZ VAZQUEZ No. CONTROL: 11320465 5 SEMESTRE

CUESTIONARIO DE EXAMEN

BIOQUIMICA DEL NITROGENO

1.- Escriba la estructura de los nucletidos de la purina Bases nitrogenadas purinicas: Adeninana (A) y la Guanina (G)

2.- Escriba la estructura de los nucletidos de la pirimidina Bases nitrogenadas pirimidinicas: Citosina (C), timina (T) y Uracilo (U)

3.- Mencione los desoxirribonucletidos y la diferencia que tienen con los ribonucletidos
El cido ribonucleico (RNA) es un cido nucleico formado por una cadena de ribonucletidos. Est presente tanto en las clulas procariotas como en las eucariotas, y es el nico material gentico de ciertos virus (virus ARN). El ARN celular es lineal y de hebra sencilla, pero en el genoma de algunos virus es de doble hebra. El ARN est formado por una cadena de monmeros repetitivos llamados nucletidos. Los nucletidos se unen uno tras otro mediante enlaces fosfodister cargados negativamente. Cada nucletido est formado por una molcula de monosacrido de cinco carbonos (pentosa) llamada ribosa(desoxirribosa en el ADN), un grupo fosfato, y uno de

cuatro posibles compuestos nitrogenados llamados bases: adenina, guanina, uracilo (timina en el ADN) y citosina.

La comparativa entre el ADN Y el ARN est en su pentosa el ARN posee una ribosa y el ADN una desoxirribosa, las purinas del ARN son la adenina y la guanina y en el ADN son la Adenina y la Guanina, las pirimidinas del ARN son la citosina y el Uracilo, y en el ADN son la Citosina y la Timina, la cadenas del ADN son dobles. 4.- Mencione los procesos de degradacin de los cidos nucleicos. INTRACELULAR Recambio de las especies de RNA Reparacin del ADN MUERTE CELULAR INGESTION DE CIDOS NUCLEICOS DE LOS ALIMENTOS Ribonucleasa pancretica Desoxiribonucleasa pancretica Intestino delgado

5.- Describe el proceso de sntesis de los nucletidos derivados de la purina

Biosntesis del Nucletido de Purina

El sitio principal de la sntesis de purina est en el hgado. La sntesis de los nucletidos de purina comienza con el PRPP y conduce al primer nucletido completamente formado, inosina-5'-monofosfato (IMP). Esta va est representada grficamente abajo. La base de purina sin la ribosa unida es la hipoxantina. La base de purina es construida sobre la ribosa mediante varias reacciones de amidotransferasa y transformilacin. La sntesis de IMP requiere de cinco moles de ATP, dos moles de glutamina, un mol de glicina, un mol de CO2, un mol de aspartato y dos moles de formato. Las partes de formil son llevadas en el tetrahidrofolato (THF) en forma de N5,N10- metenil-THF y N10- formil-THF.

Nombres de las Enzimas: 1. glutamina phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase 2. glycinamide ribotide sintasa 3. glycinamide ribotide transformylase 4. formylglycinamide sintasa 5. aminoimidazole ribotide sintasa 6. aminoimidazole ribotide carboxilasa 7. succinylaminoimidazolecarboxamide ribotide sintasa 8. adenylosuccinate liasa 9. aminoimidazole carboxamida ribotide transformylase 10. IMP cyclohydrolase El IMP representa un punto de ramificacin para la biosntesis de purina, porque puede ser convertido en AMP o GMP a travs de dos distintas vas de reaccin. La

va que conduce a AMP requiere energa en forma de GTP; aquella que lleva a GMP requiere energa en forma de ATP. La utilizacin de GTP en la va a la sntesis de AMP permite que la clula controle las proporciones de AMP y de GMP para que sean aproximadamente equivalentes. La acumulacin del exceso de GTP llevar a una sntesis acelerada de AMP a partir del IMP, a expensas de la sntesis de GMP. Inversamente, puesto que la conversin de IMP a GMP requiere de ATP, la acumulacin del exceso de ATP conduce a la sntesis acelerada de GMP sobre la sntesis de AMP.

Los pasos esenciales limitantes en la biosntesis de purina ocurren en los dos primeros pasos de la va. La sntesis de PRPP por la PRPP sintetasa es inhibida por los nucletidos de purina 5' (predominantemente AMP y GMP). Los efectos combinados de esos dos nucletidos son mucho mayores, e.g., la inhibicin es mxima cuando se logra la concentracin correcta de los nucletidos de adenina y guanina. La reaccin de amidotransferasa catalizada por la PRPP amidotranferasa, tambin se inhibe alostricamente por la unin con el ATP, ADP y AMP en un sitio inhibitorio y por la unin de GTP, GDT y GMP en otro. Al contrario la actividad de la enzima es estimulada por PRPP. Adicionalmente, la biosntesis de purina es regulada en las vas de ramificacin de IMP a AMP y a GMP. La acumulacin del exceso de ATP conduce a la sntesis acelerada de GMP, y el exceso de GTP conduce a la sntesis acelerada de AMP.

6.- Describe el proceso de sntesis de los nucletidos derivados de la pirimidina

Biosntesis del Nucletido de Pirimidina

La sntesis de las pirimidinas es menos compleja que la de las purinas, puesto que la base es mucho ms simple. La primera base terminada se deriva a partir de una mol de glutamina, una mol de ATP y una mol de CO2 (que forman carbamoil fosfato) y una mol de aspartato. Una mol adicional de glutamina y ATP son requeridas en la conversin de UTP a CTP. La va de la biosntesis de pirimidina esta diagramada abajo. El carbamoil fosfato usado para la sntesis del nucletido de pirimidina se deriva de la glutamina y del bicarbonato, dentro del citosol, contrariamente al carbamoil fosfato del ciclo de la urea que se deriva del amonaco y del bicarbonato en la mitocondria. La reaccin del ciclo de la urea es catalizada por la carbamoil fosfato sintetasa I (CPSI) mientras que el precursor del nucletido de pirimidina es sintetizado por la CPS-II. El carbamoil fosfato es entonces condensado con el aspartato en una reaccin catalizada por la enzima limitante de la biosntesis del nucletido de pirimidina, la Aspartato transcarbamoilasa (ATCasa).

Enzima nombres: 1. aspartato transcarbamoylase, ATCase 2. carbamoil aspartato deshidratasis 3. dihidroorotato deshidrogenasa 4. orotato phosphoribosyltransferase 5. orotidine-5'-fosfato carboxilasa

La sntesis de pirimidina difiere de dos maneras significativas de la sntesis de purinas. Primero, la estructura de anillo est configurada como una base libre, que no se construye encima de PRPP. El PRPP es agregado a la primera base completamente formada de pirimidina (cido ortico), formando el orotato monofosfato (OMP), que es posteriormente decarboxilado a UMP. Segundo, no hay ramificacin en la va de la sntesis de pirimidina. El UMP es fosforilado dos veces para producir UTP (el ATP es el donante de fosfato). La primera fosforilacin es catalizada por la uridilato cinasa y el segundo por la nuclesido difosfato cinasa que ubicuita. Finalmente el UTP es aminado

por la accin de la CTP sintasa, generando CTP. Los nucletidos de timina son a su vez derivados por la sntesis de novodesde dUMP o mediante vas de salvamento a partir de la deoxiuridina o deoxitinidina.

7.- Describe el proceso de degradacin de los nucletidos derivados de la purina El proceso comn en vertebrados es la produccin de cido rico. Los cidos nucleicos se degradan en AMP. El AMP proviene de IMP y en la degradacin mediante desaminacin por la Adenina desaminasa y da IMP. El IMP da Hipoxantina. La HGRP la pueden reciclar. Si no, mediante la xantinaoxidasa, se oxida y forma xantina dando agua oxigenada. Utiliza Fe y Mo como metales implicados en el proceso cataltico. La forma oxidada de la xantina es el cido rico. Los primates eliminan el exceso de purina en cido rico. El resto de mamferos, excepto los dlmatas (que s que forman cido rico), procesan el cido rico mediante una descarboxilacin oxidativa mediante la uricasa da la alantona.

La alantona, en algunos animales, puede hidrolizarla y abrir el ciclo (alantoato). Los peces telesteos eliminan las bases pricas en alantoato. El alantoato son 2 ureas enganchadas a un esqueleto de 2 C. Algunos anfibios y peces rompen el alantoato en 2 ureas ms glioxilato. Algunos invertebrados marinos, rompen la urea y la transforman en CO2 + NH4+. El cido rico, segn la especie animal, significa cosas diferentes. En los primates indica la excrecin de purina. En el resto de mamferos es la funcin de excrecin de purinas. En aves y anfibios terrestres es el mecanismo de eliminacin del amonio que proviene de aminocidos. 8.- Describe el proceso de degradacin de los nucletidos derivados de la pirimidina Los nucletidos purnicos se degradan por una va en la que el grupo fosfato se pierde por accin de una 5nucleotidasa. El AMP se transforma en adenosina, que luego es desaminada por la adenosina desaminasa para dar inosina. La inosina se hidroliza dando su base purnica hipoxantina y D-ribosa. La hipoxantina se oxida sucesivamente a xantina y luego a cido rico por accin de la xantina oxidasa, una flavoprorena que contiene un tomo de molibdeno y cuatro centros Fe-S en su grupo prosttico. El oxgeno molecular es el aceptor de electrones en esta compleja reaccin. El catabolismo del GMP tambin proporciona cido rico como producto final. El GMP se hidroliza primero para dar el nuclesido guanosina, que a continuacin se descompone dando guanina libre. La guanina sufre un desplazamiento hidroltico de su grupo amina para convertirse en xantina, que a su vez se transforma en cido rico, por accin de la xantina oxidasa. El cido rico se encuentra a pH fisiolgico como urato, que es el producto final de excrecin del catabolismo de las purinas en el hombre, siendo excretado como tal en la orina.

9.- Describe el proceso de sntesis de los desoxirribonucletidos En vez de ser sintetizados de novo, a partir de precursores que contengan desoxibases, los desoxiribonucletidos, son sintetizados a partir de sus ribonucletidos correspondientes mediante la reduccin de su C2. La reaccin es catalizada por la familia de las ribonucletido reductasas, que se clasifican en tres clases, todas ellas remplazan el grupo hidroxilo de la posicin 2de la ribosa con H, va un mecanismo de radical libre. Todos los eucariontes, excepto algunas especies unicelulares sintetizan ribonucletido reductasa tipo I. Los desoxirribonucletidos no se sintetizan de novo, sino a partir de la reduccin de los ribonucletidos. NDP dNDP

Catalizada por la ribonucletido difosfato reductasa mediante un mecanismo complejo de radical libre. El dador ltimo de los electrones es el NADPH

tiorredoxina 2 rutas glutarredoxina La sntesis culmina con la fosforilacin de los dNDPs a dNTPs.

10.- Describe el proceso de sntesis del timidilato Biosntesis de Timidilato. La timidilato sintasa es una enzima metiltransferasa homodimricaque interviene en la sntesis de timidilato Esta reaccin es un paso fundamental para la formacin de desoxitimidina 5'-trifosfato, la cual es necesaria para la correcta sntesis y reparacin de ADN. En seres humanos, es el producto de la expresin del gen TYMS localizado en el brazo corto del cromosoma 18. Tambin es una enzima que cataliza el paso de 2-deoxiuridina fosfato a timidina-5fosfato, una reaccin que requiere folato como cofactor. Esta sntesis constituye uno de los pasos clave para la sntesis de timidina, un nucletido que interviene en la sntesis del DNA. Con esta enzima es posible la metilacin del dUMP produciendo dTMP y de esta forma la sntesis de desoxirribonucletidos. La importancia de esta enzima es que al ser inhibida por alguna sustancia baja los niveles de dTMP que es un precursor esencial para la sntesis del ADN, al no poder metilarse el dUMP para formar el dTMP necesario en la sntesis del ADN para las nuevas clulas en divisin, reduce la divisin celular rpida que se da en los tejidos con cncer. Estas sustancias que inhiben a la timidilato sintasa son utilizadas en medicamentos contra el cncer. El desoxitimidilato (dTMP) se forma a partir de la UMP en cuatro pasos. La UMP se fosforila a UDP, que se reduce a dUDP, y el dUDP se desfosforila a dUMP, que a continuacin se metila. UMP UDP dUDP dUMP dTMP La conversin de dUDP a dUMP puede hacerse por dos rutas. La dUDP puede reaccionar con ADP en presencia de la nucleosido monofosfato cinasa para formar dUMP y ATP. dUDP + ADP dUMP + ADP La dUDP tambin se puede fosforilar a dUTP a expensas de ATP por accin de la nucleosido difosfato cinasas. Entonces la dUTP se hidroliza rpidamente a dUMP + PPi por accin de la desoxiuridina trifosfato difosfohidrolasa (dUTPasa) .La hidrlisis rpida de la dUTP evita que se incorporen forma accidental al ADN en vez de dTTP. El dCMP tambin puede ser una fuente de dUMP por hidrlisis catalizada por la dCMP desaminasa. dCMP + H2O dUMP + NH4 La conversin de dUMP en dTMP es catalizada por la enzima timidilato sintasa. (Como la timina est casi exclusivamente en ADN, se suele usar los nombres triviales timidina y timidilato en vez de desoxitimidina y desoxitimidilato). En esta reaccin, el 5,10metilentetrahidrofolato es el donador del grupo con un carbono. El grupo metilo unido a carbono (C-CH3) en el dTMP est ms reducido que el grupo metileno, con puente de

nitrgeno (N-CH2-N) en el 5,10-metilentetrahidrofolato, cuyo estado de oxidacin equivale al de un grupo hidroximetilo unido al nitrgeno coenzima que dona una unidad de carbono, sino tambin es el agente reductor para la reaccin conocida en la que la transferencia de una unidad de carbono de un derivado de tetrahidrofolato de cmo resultado su oxidacin en el N-5 y el C-6, para producir dihidrofolato. El dihidrofolato debe convertirse a tetrahidrofolato antes de que la coenzima pueda aceptar otra unidad de carbono para participar en ms reacciones de transferencia. El doble enlace 5,6 del hidrofolato se reduce con la NADPH en una reaccin catalizada por la dihidrofolato reductasa. La serina hidroximetiltransferasa catalizada entonces la transferencia del grupo CH2OH de la Serina tetrahidrofolato, para regenerar el 5,10metilentetrahidrofolato. En la mayora de los organismos, la timidilato sintasa y la dihidrofolato reductasa son polipptidos distintos. Sin embargo, en los protozoarios las dos actividades enzimticas estn contenidas en la misma cadena de polipptidos. El dihidrofolato producido se cataliza del sitio activo de la timidilato sintasa al sitio activo de la dihidrofolato reductasa. Por interacciones entre las cargas de una regin con carga positiva en la superficie de la enzima bifuncional, y el dihidrofolato con carga negativa (recurdese que contiene varios residuos de y-glutamato), el producto se dirige hacia el siguiente sitio activo. Tambin se puede sintetizar dTMP por va de la recuperacin de la timidina (desoxitimidina), catalizada por la timidina cinasa, dependiente de ATP. Con frecuencia se utiliza timidia radioactiva como trazador muy especfico para vigilar la sntesis intracelular del ADN, porque entra con facilidad a las clulas y su principal destino metablico es la conversin a timidilato e incorporacin al ADN.

BIBLIOGRAFIA: http://docencia.izt.uam.mx/japg/RedVirtualJAP/CursoDRosado/4_Metabolismo/4%20PurinasyPirimidinas/2-MetabolismodePirimidinas.pdf http://www.canal-h.net/webs/sgonzalez002/Bioquimic/SINTESISNUCL.htm http://acemucsc.galeon.com/articulos/Bioquimica/nucleotidos.htm http://es.wikipedia.org/wiki/Pirimidina http://themedicalbiochemistrypage.org/es/nucleotide-metabolism-sp.php#top