Temas 14.

Estructura y funcin de los cidos nucleicos

Composicin qumica: azcares, fosfato y bases nitrogenadas Estructura y propiedades de las bases pricas y pirimidnicas Nuclesidos y nucletidos Estructura de los cidos nucleicos. DNA y RNA

cidos Nucleicos
El DNA es el constituyente primario de los cromosomas de las clulas y es el portador del mensaje gentico. La funcin del RNA es transcribir el mensaje gentico presente en el DNA y traducirlo a protenas. Las protenas son las molculas que finalmente ejecutarn las "instrucciones" codificadas en los cidos nucleicos. Dogma central de la Biologa Molecular

Componentes de los cidos nucleicos

Fosfato(s)

cido Azcar + Base Nitrogenada neutro bsico

Nucletido

+ Nuclesido

Componente cido: Fosfatos

cido ortofosfrico

Componentes de los nucletidos

Componente neutro: Azcares

Ribosa

Desoxirribosa

Componentes de los nucletidos

Componente bsico: Bases Nitrogenadas

pirimidina

imidazol

Pirimidina

Purina

Componentes de los cidos nucleicos

Componente bsico: Bases Nitrogenadas Bases Purnicas (o Pricas)
pirimidina imidazol

NH2

NH2

Bases Pirimidnicas
O CH3 NH2 O

Propiedades fisicoqumicas de las bases nitrogenadas Existencia de dipolos Hidrofobicidad Disposicin coplanar de los enlaces de cada anillo (C-N y C-C)

Tautomera o isomera dinmica C

O

N
4

O HN1
O
6

3N 1 2

N
9

Carcter bsico Absorcin de la luz en el ultravioleta

N H

N O
1

Propiedades fisicoqumicas de las bases nitrogenadas

Absorcin de la luz en el ultravioleta
Debido a su carcter aromtico Mximo absorcin cerca de 260 nm

Bases nitrogenadas Protenas A260 = 1,8 A280

Absorcin mxima 260 nm Absorcin mxima 280 nm A260 = 2,0 A280

DNA

RNA

Otras bases de inters biolgico y clnico

Las bases nitrogenadas tienen poco inters bioqumico como sustancias libres, salvo en las vas biosintticas y degradativas de los cidos nucleicos.

El cido rico es un derivado prico que constituye el producto final de la degradacin de purinas.

Anlogos sintticos, terapia antiviral Cafena

Aciclovir (9-(2-hidroximetil)guanina Ganciclovir (9-(1,3-dihidroxi-2-proposimetil)guanina

Antitumorales sintticos Teofilina

5-fluorouracilo

Nuclesidos

Fosfato(s)

cido Azcar + Base Nitrogenada neutro bsico

Nucletido

+ Nuclesido

ribosa Azcar desoxirribosa

ribonuclesidos desoxirribonuclesidos

Nuclesido

enlace N-glicosdico

purnica Base Nitrogenada pirimidnica

nuclesidos purnicos nuclesidos pirimidnicos

Nuclesidos

Nuclesidos
Nuclesidos purnicos Nuclesidos pirimidnicos

adenosina

desoxiadenosina

citidina

desoxicitidina

guanosina

desoxiguanosina

uridina

Timidina (desoxitimidina)
Desoxirribonuclesidos

Ribonuclesidos

Desoxirribonuclesidos

Ribonuclesidos

Nuclesidos

citidina

desoxicitidina

uridina

Timidina (desoxitimidina)

Otros nuclesidos de inters biolgico y clnico

puromicina (antibitico) arabinosiladenina (antiviral y anticancergeno) AZT - derivado de timina (antirretroviral)

Nucletidos

Nucletido = nuclesido + fosfato(s) = base nitrogenada + azcar + fosfato(s)

purnica Base Nitrogenada nucletidos purnicos

pirimidnica
enlace N-glicosdico

nucletidos pirimidnicos

ribosa Fosfato(s)
enlace(s) fosfato

ribonucletidos desoxirribonucletidos

Azcar desoxirribosa

nuclesido
Fosfato

desoxiadenosina monofosfato (dAMP) cido desoxiadenlico

Nucletidos
Nuclesidos-monofosfato componentes del ARN (ribonucletidos)
Purnicos Pirimidnicos

Nuclesidos-monofosfato componentes del ADN (desoxirribonucletidos)

Purnicos Pirimidnicos

Nucletidos
Nuclesidos-Monofosfato: NMP Nuclesidos-Difosfato: NDP

dAMP AMP

dADP ADP

Nuclesidos-Trifosfato: NTP

dATP ATP

Funciones de los nucletidos

Compuestos ricos en energa que participan en intercambios energticos

ATP

ADP

Actan como seales qumicas

Componentes estructurales de cofactores e intermediarios metablicos

AMPc

NAD+

Constituyentes de los cidos nucleicos

Niveles estructurales de los cidos nucleicos

Estructura primaria Polmero lineal formado por la unin de numerosos nucletidos mediante enlaces fosfodister. Estructura secundaria Disposicin espacial relativa de los nucletidos que se encuentran prximos en la secuencia. DNA Doble cadena polinucleotdicas RNA Protuberancias, bucles y horquillas en determinadas regiones de la molcula Estructuras de orden superior Todas aquellas de orden superior a los niveles primario y secundario. DNA Resultantes del superenrollamiento y de la asociacin con protenas bsicas (cromatina, cromosomas). RNA Plegamiento tridimensional definido (tRNA).

Estructura primaria
Polmeros de nucletidos unidos mediante 5 enlaces covalentes 3- 5fosfodister. Secuencia en direccin 5 3

base

base

5...-P-osa-P-osa-P-osa-P-osa-... 3
5
ARN Ribonucletidos Fosfato Azcar Purinas ADN Desoxirribonucletidos

base

base

enlazando los monmeros (enlace fosfodister) Ribosa Adenina, A Guanina, G 2-Desoxirribosa

Citosina, C
Pirimidinas Uracilo, U Timina, T

OH

Estructura primaria
RNA
O
-

DNA A
Extremo 5
O
-

O P O CH2 O O O OH

O P O CH2 O O O O P O CH2 O O

O P O CH2 O O O OH

O O P O CH2 O O

O P O CH2 O O O OH

O O P O CH2 O O

O P O CH2 O O OH OH

Extremo 3

OH

Estructura secundaria Cristalografa de rayos X del DNA (1951-1953)

Estudiada por: L.Pauling (Caltech) M.Wilkins y R.E.Franklin (Londres) J.D.Watson y F.H.C.Crick (Cambridge)
Periodicidad a 0,34 nm Periodicidad a 3,4 nm Estructura helicoidal (forma en X)

Watson y Crick elaboraron el modelo de doble hlice

DNA-B: Doble hlice

Cada una de las hebras es un polinucletido entrelazado con el otro en sentido antiparalelo

3,4

El eje ribosa-fosfato se sita hacia el exterior de la doble hlice, en contacto con el solvente

36

Las bases nitrogenadas se sitan, apiladas, en planos aproximadamente perpendiculares al eje de la doble hlice, hacia el interior de la estructura, en un entorno hidrofbico.

20

ADN-B: Complementaridad de las bases nitrogenadas

H
O (H3C)
4 1 3N H

N
6

H N
9

N1

A A
O

T/U
O

T/U

N
4

O HN1
O
6

C
O

3N 1 2

N
9

N O
1

G
C

H
1

DNA-B: Antiparalelismo de las hebras

5
T
-

5
O - P O
O CH2 O O O - P O O CH2 O O O - P O O CH2 O O O O P O CH2 O O
GUANINA CITOSINA

3
CH2 O

3
A G C

P O O O

C G

O
TIMINA ADENINA

CH2 O

G
-

C
A G T

P O O O O

T C

CITOSINA

GUANINA

CH2 O

P O O O O

G
T

C
A T

ADENINA

CH2 O

TIMINA

P O O

DNA-B: Polianin

Residuos de pentosa (hidroflicos) en la superficie de la doble hlice perpendiculares a las bases

Fuerza de unin por enlace de H

Grupos fosfato (ionizados), en la superficie de la doble hlice: a pH fisiolgico el DNA es un polianin

Interacciones con el agua

Fuerzas hidrofbicas de apilamiento de bases

Distintos tipos DNA

DNA-A DNA-B DNA-Z

los surcos son ms parecidos en anchura

Ms corta

surco mayor estrecho y profundo surco menor ancho y superficial

Ms larga
el surco mayor no existe, es muy poco profundo

19

bases algo inclinadas: 9

surco menor, profundo y estrecho

dextrgira

levgira

Estructuras superiores: cromatina y cromosomas

Estructura del RNA

Mensajero Transferencia Ribosmico

Estructura del RNA

RNA de transferencia RNA ribosmico

DNA bacteriano