CLASE 1, 5TO PARCIAL BIOQUIMICA

El metabolismo, los diferentes componentes: carbohidratos, aminocidos, lpidos, nucletidos tienen una integracin en
cada una de las clulas. En la regulacin metablica hay un mecanismo de induccin y de represin que tienen que ver
con el comando central y forman parte de la informacin gentica.
Todo al final en nuestro metabolismo est programado en el cdigo o en la informacin gentica que cada una de
nuestras clulas forme. El hecho de que una clula haga gluconeognesis en mayor cantidad que otra es porque tienen
una informacin ya codificada, predeterminada y especializada en ella. Quin da eso? La informacin gentica, el
genoma que tienen nuestras clulas.
Vean que la informacin est contenida en el ADN, el ADN puede duplicarse y se llama a este proceso duplicacin o
replicacin del ADN. Esto generalmente se hace cuando vamos a hacer una nueva clula y por supuesto l recoge la
informacin que lo ha llevado a sobrevivir. Y cuando l sirve de molde para hacer una sntesis del ARN, hablamos de una
transcripcin y la transcripcin da origen al RNAm, RNAt y al RNAr.
El RNAm porta la informacin de las protenas, luego da un proceso donde se sintetizan las protenas y se llama
traduccin o sntesis de las protenas. Vamos a traducir la informacin contenida en nucletidos lo traducimos y los
volvemos secuencias de aminocidos y en determinadas protenas, cada una de las cuales tiene una caracterstica propia
de la funcin que va a desempear, por ejemplo si es una enzima, si es una estructura, si es una hormona, si es un
receptor o lo que sea lo va a realizar. Eso est contenido en esa informacin que se encuentra permanentemente en
movimiento, es decir, esta vigilante. Vean DNA, RNA crea una protena y esta va y cumple su funcin, en este caso es
una hemoglobina: esta es la informacin que tenemos, lo vamos llevando y cuando miramos un poquito ms arriba
vemos que esta secuencia de DNA est contenida en unas estructuras que contienen esa informacin importante, que
se denominan cromosomas.
Los cromosomas forman parte del genoma y del material gentico que est contenido generalmente en el ncleo;
dnde ms hay material gentico que realiza esa funcin? En la mitocondria, hablamos de esa caracterstica del DNA.
El DNA presenta:
- 4 unidades monomricas.
- 2 bases pricas: desoxiadenilato y desoxiguanilato. Ya sabemos por qu decimos desoxiguanilato y adenilato porque
sabemos dnde est la sustitucin del hidroxilo en la pentosa.
- 2 bases piridimdinicas: desoxitimidilato y desoxicitidilato. Estas bases se unen parcialmente formando tiras de
polmeros por enlaces intermedios, enlaces 3,5 fosfodiester. Recordar que estamos hablando de nucletidos, estos
tienen un azcar, su base y fosforo. Donde est el fosforo se une y forma el enlace fosfodiester.
- Es un polielectrolito negativo.
- Polaridad: de 5`OH o fosfato 3OH o fosfato (5`3`). El por supuesto comienza, 5 lo deja libre y pega el 3 con el otro 5,
entonces el primero que vamos a observar es el 5, quede el 3 ac que se va a unir con el 5 de la otra base, hasta que al
final queda libra la porcin 3, entonces se lee de 5 a 3.
Estos datos son importantes podemos ver como se forma el enlace fosfodiester, vean, 5, ac est la posicin 3, 5, 4, 3,
luego se pega al 5 del otro y as sucesivamente. Entonces, la polaridad del DNA es de 5 a 3 y as lo vamos secuenciando;
este es el cido fosfrico, la glucosa y la base. Y ac tenemos 4 desoxibase, las cuales no contienen uracilo.
Cuando nosotros miramos el DNA tenemos que concluir que: el DNA es una secuencia de 2 filas que estn pegadas una
al lado de la otra en forma anidada antiparalela. Lo que significa que un extremo es 53 y el otro es 35.
Tiene una caracterstica interesante y es que hay un apareamiento que no se hace al azar, sino que el apareamiento se
hace guardando la siguiente caracterstica:
* Donde haya una Adenina l se aparea con una Timina, es decir, donde haya un desoxiadenilato se pega a un
desoxitimidilato y viceversa.
* Donde hay un desoxiguanilato se pega a un desoxicitidilato
Lo cual significa que cuando nosotros examinamos las 2 filas vamos a concluir con la observacin descargada, que dice:
que la concentracin de DNA y desoxiadenilato es exactamente igual a la concentracin de desoxitimidilato, y la
concentracin de desoxiguanilato es igual a la concentracin de desoxicitidilato. Por qu? Porque cuando se saca la
cuenta, usted mira un cistinato y en el frente tendr un guanilato, y al contrario tambin.
Cmo se hacen las uniones? Por puentes de hidrogeno (PH). Entonces, donde se encuentra adenilato y timidilato hay
un doble puente de hidrogeno (2 PH). Los puentes de hidrgenos no son enlaces peptdicos, son enlaces ms dbiles que
permiten su separacin. Pero cuando usted mira guanilato y cistidilato se encuentra 3 PH, obviamente que la cadena
estaba mucho ms adherida (ms pegada) donde se encuentra guanilato y cistidilato.
En cambio donde se encuentra Adenina y Timina son 2 PH y se pueden separar ms fcilmente.
En las estructura del DNA existen varias formas, en una forma son ms altas las Adenosin adenuriada complementada
entre s en forma de doble hlice o conformada anti paralelamente, en cada extremo del DNA vamos a tener un extremo
5 y el otro 3, uno en molde y el otro anti molde. Qu significa esto? Que en el momento que se va a hacer la
duplicacin del DNA, o la transcripcin del DNA una de las dos tiras, no las dos simultneamente, sirve de molde para
que se haga transcripcin o se haga replicacin, es decir, la replicacin se la hago a una tira y se la puedo hacer a la otra
pero cada una se hace por separado, no se hace simultneamente, que digamos, va a hacer la lectura las dos juntas, hay
una maquinaria enzimtica para hacer la de la tira uno y la de la tira 2. De la que se est haciendo la replicacin en un
momento determinado esa es la tira molde y la otra es la anti molde pero tambin la anti molde puede servir de molde.
La informacin que nosotros tenemos como esta empaquetada toda esta informacin, esta es la secuencia de DNA, que
estn enrolladlos sobre s mismo, se une a una protena denominada histona, esta se dobla ms, esta se dobla an ms,
hacen esto, esto se enrolla sobre s mismo, y al final ellos estn empaquetados en un cromosoma, se calcula que cuando
uno desenrolla completamente un cromosoma, que es una molcula que nosotros no vemos en microscopio podemos
teirla pero no es tan fcil verla es una micro molcula, el microscopio electrnico la puede detectar, bueno cuando se
estira puede medir aproximadamente 1,72 metros, y nosotros no tenemos 1, tenemos 22 pares.
Entonces la clula hace todo este empaquetamiento, se dobla sobre si misma hasta que forma lo que ya hemos dicho.
Conformacin de las clulas eucariotas: del DNA existen 6 formas estructurales helicoidales (A, B, C, D, E, Z), de ellos la
forma B es la ms frecuente y fue descrita por Watson y Crick en 1954. En la imagen vemos la forma B y la forma Z, sin
embargo la forma ms conocida y ms estudiada y la que est ms frecuentemente presente de la forma estructural de
cmo se presenta el DNA es la forma Z donde el DNA se muestra enrollado como 2 pilas de monedas que van
paralelamente.
El DNA tiene un giro a la derecha de 3,4 nm con 10 pares de bases planares apiladas para semejar 2 series de monedas
colocadas a cada lado unidas entre s por PH y pos dos listones alrededor que son los enlaces fosfodiester.
En la imagen se ve la estructura, los puentes de hidrogeno que pueden ser dobles o triples por lo que ya hemos
mencionado y por fuera se ve es el enlace fosfodiester.
La fibra del DNA en solucin es viscosa, es decir, cuando nosotros colocamos el DNA en una solucin se convierte en un
material viscoso.
Si nosotros sometemos ese material a altas temperaturas o concentraciones bajas de sales se desnaturaliza y se
pierde la viscosidad, separndose las dos tiras y aumentando la absorbancia ptica de las bases puricas y pirimidinicas.
Hay una hipercromicidad de la desnaturalizacin por perdida de la viscosidad (deja de ser transparente y viscoso como la
gelatina y se convierte en licuado como el agua pero adquiere color, eso significa hipercromicidad de la
desnaturalizacin por perdida de la viscosidad) y eso es fcilmente detectable.
La formamida desestabiliza los PH entre las bases disminuyendo la temperatura de fusin. Si usted le pone mucha
temperatura lo desnaturaliza irreversiblemente, pero si usted le agrega formamida el disminuye la constante dielctrica,
es decir, la capacidad de formar los puentes de hidrogeno y si antes necesitaba 70 para desnaturalizarse, ahora
necesita 40 para separarlo, pero no lo desnaturaliza y puede trabajar con ese DNA separado NO desnaturalizado.