Taller virtual # 1

Licenciatura en Fisioterapia Bioqumica

Prof. Jos A. Snchez A. 12/4/2014

Indicaciones Generales. Colocar fondo de papel verde, indicar nombre y cdula.
Sustentar todas las partes sealadas en el taller utilizando el software e internet.

I Parte. Presentar la estructura tridimensional de la alanina
II Parte. Confeccione un enlace peptdico entre la cisteina y la prolina.
Defina el concepto de enlace peptdico
III Parte. Presente una tabla sobre los aminocidos esenciales, con nombre y estructura.
IV Parte. Confeccione la estructura de 1 metil 3 bromo benceno. Seale los componentes de la estructura.
Defina la funcin del grupo carboxilo y el grupo amino en los amonicidos.












DIOS TE BENDIGA

Nombre: Lourdes E. Gonzlez
4-770-1911
Fisioterapia III Semestre

I parte. Estructura de la alanina






II parte. Enlace peptdico entre la cistena y la prolina


Automtica
Manual

Cys - Pro


Defina el concepto de enlace peptdico

EL ENLACE PEPTDICO

La unin de dos o ms aminocidos (AA) mediante enlaces amida origina los pptidos. En los
pptidos y en las protenas, estos enlaces amida reciben el nombre de enlaces peptdicos y son el
resultado de la reaccin del grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de otro, con eliminacin
de una molcula de agua (Figura de la derecha).
El enlace peptdico (-CO-NH-) se representa
normalmente como un enlace sencillo. Sin embargo,
posee una serie de caractersticas que lo aproximan
ms a un doble enlace. Como el nitrgeno es menos
electronegativo que el oxgeno, el enlace C-O tiene
un 60% de carcter de doble enlace mientras que el enlace C-N tiene un 40%. Por tanto, los
enlaces C-O y N-C del enlace peptdico tienen caractersticas intermedias entre el enlace sencillo y
el enlace doble. De hecho, las distancias interatmicas medidas en los enlaces C-O y C-N son
intermedias entre las del enlace sencillo y el doble enlace. Esta disposicin atmica est
estabilizada por resonancia (Figura de la derecha), de forma que los seis tomos implicados en la
formacin del enlace peptdico estn contenidos en el mismo plano (Figura izquierda de la tabla
inferior).
Otra consecuencia importante de la resonancia es que incrementa la polaridad del
enlace peptdico y se establece un momento dipolar (Figura derecha de la tabla
superior). Por este motivo, cada enlace peptdico puede participar en dos puentes
de hidrgeno. En uno de ellos, el grupo -NH- acta como donador de hidrgeno y
en el otro, el grupo -CO- acta como receptor de hidrgeno. Esta propiedad
contribuye notablemente al plegamiento tridimensional de las protenas, tal y
como veremos ms adelante.
El carcter parcial de doble enlace impide la libre rotacin del enlace que une los
tomos de C y N en el enlace peptdico (Figuras central e izquierda de la tabla
inferior). Esta rigidez del doble enlace limita las posibilidades conformacionales de
los pptidos. Existen dos configuraciones posibles (Figura derecha de la tabla
inferior):
Configuracin cis: los dos Ca se sitan del mismo lado del doble enlace.
Configuracin trans: los dos Ca se sitan a distinto lado del doble enlace.
Normalmente, la configuracin trans est favorecida. Slo en el caso de que el segundo AA del enlace
peptdico sea la prolina puede resultar favorecida la configuracin cis.
Los pptidos slo podrn cambiar de conformacin mediante el giro en torno a los enlaces sencillos en los que
intervienen los Ca tetradricos (Figura de la derecha).
En cada AA, el Ca puede establecer dos ngulos de torsin con los planos de los dos enlaces peptdicos
contiguos: los llamados f (phi) y y (psi) (Figura de la derecha):
el ngulo phi (f) es la rotacin en torno al enlace Ca-N
el ngulo psi (y) es la rotacin en torno al enlace C-Ca
Como estos son los nicos grados de libertad que presenta la estructura, la conformacin de la cadena
polipptdica queda completamente definida cuando se conocen los valores de y y de f para cada AA.
En la estructura de un pptido o de una protena, cada AA presenta un valor de f y otro de y determinados. Es
el tamao fsico de los tomos o grupos de tomos presentes en las cadenas laterales el que determina los
posibles valores que pueden adoptar los ngulos phi (f) y psi (y).
Cuando se representan los valores de phi (f) y psi (y) de cada AA se obtiene la grfica de Ramachandran
(Figura de la izquierda), en la que se distinguen tres regiones con valores "permitidos" de los ngulos de
torsin ya que no dan lugar a impedimentos estricos en la estructura.
Estas regiones corresponden a los dos tipos de elementos estructurales mayoritarios presentes en las
protenas: la estructura b y la a-hlice.












III Parte. Presente una tabla sobre los aminocidos esenciales, con nombre y
estructura.













IV Parte. Confeccione la estructura de 1 metil 3 bromo benceno. Seale los
componentes de la estructura.


Defina la funcin del grupo carboxilo y el grupo amino en los aminocidos.

Los cidos carboxlicos son funciones con grado de oxidacin tres, es decir, en un mismo tomo de
carbono se insertan un grupo oxo (=O) y un grupo hidroxilo (-OH), formando un grupo carboxilo.
Se nombran sistemticamente sustituyendo la terminacin -o del hidrocarburo de procedencia por
el sufijo -oico, pero la mayora posee nombres vulgares consagrados por el uso. El grupo carboxilo
es el responsable de la polaridad de la molcula y de la posibilidad de establecer enlaces de
hidrgeno. El hidrgeno del hidroxilo puede disociarse y el compuesto se comporta como un cido.
Esta disociacin se ve favorecida por la resonancia del in carboxilato, ya que el doble enlace se
deslocaliza y la carga negativa se distribuye entre los dos tomos de oxgeno.
En la misma molcula pueden existir varios grupos carboxilo. El nmero de estos grupos se indica
con los prefijos di, tri, tetra, etc. Los cidos monocarboxlicos de cadena larga se llaman tambin
cidos grasos
Bromo