Consigna de aprendizaje # 1

Definicin de bioqumica:
Bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos,
especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de
otras pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que
sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa
(catabolismo) y generar biomolculas propias (anabolismo).
Biocompuestos y su clasificacin:
Son los componentes que forman a los seres vivos y que mantienen el
funcionamiento de los diversos sistemas vitales.Se los denomina biocompuestos
o biomolculas, por su trascendencia en el mantenimiento de la vida.

Varan en sus propiedades fsico-qumicas, en su estructura y en su configuracin
espacial. Estas variantes determinan su accin biolgica en los seres vivos como
fuentes energticas, catalizadores, reguladores metablicos y material gentico.

Los bioelementos son las molculas constituyentes de los seres vivos formadas
por slo cuatro elementos que son el hidrgeno, oxgeno, carbono, y nitrgeno,
representando el 97,6 % de los tomos de los seres vivos.

Facilitan la posibilidad de que con pocos elementos se den una variedad de
grupos funcionales (alcoholes, aldehdos, cetonas, cidos, aminas, etc.) con
propiedades qumicas y fsicas diferentes.

Clasificacin de los bioelementos

Segn la naturaleza qumica los bioelementos pueden ser:

Bioelementos inorgnicos: Que no slo son formadas por los seres vivos, pero
son muy importantes para ellos. Como el agua, la biomolcula ms abundante,
los gases (oxgeno, dixido de carbono) y las sales inorgnicas: aniones como
fosfato (HPO4), bicarbonato (HCO4-) y cationes como el amonio (NH4+).

Bioelementos orgnicos o principios inmediatos: Que son sintetizadas solamente
por los seres vivos y tienen una estructura a base de carbonos. Como los
Glcidos (glucosa, glucgeno, almidn), los lpidos (cidos grasos, triglicridos,
colesterol, fosfolpidos, glucolpidos), las protenas (enzimas, hormonas,
hemoglobina, inmunoglobulinas etc.), los cidos nucleicos (ADN ARN)y los
metabolitos (cido pirvico, cido lctico, cido ctrico, etc.)

Segn el grado de complejidad estructural los bioelementos pueden ser:

Precursoras: molculas de peso bajo molecular, como el agua (H2O), anhdrido
carbnico (CO2) o el amonaco (NH3).

Intermediarios metablicos: molculas como el oxaloacetato, piruvato o el citrato,
que posteriormente se transforman en otros compuestos.

Unidades estructurales Tambin llamadas unidades constitutivas de
macromolculas como los monosacridos (en celulosa, almidn), aminocidos (de
las protenas), nucletidos (de los cidos nucleicos), glicerol y cidos grasos (en
grasas).

Macromolculas: de peso molecular alto como los ya citados almidn, glucgeno,
protenas, cidos nucleicos, grasas, etc.

Los tipos de Biocompuestos son:

GLCIDOS
La glucosa es la biomolcula combustible ms importante para la mayor parte de
los organismos y es tambin la unidad estructural bsica o precursora de los
polisacridos ms abundantes.

La celulosa es el componente estructural predominante en los tejidos fibrosos y
leosos de las plantas.

El almidn se encuentra en cantidades muy grandes en las plantas, de las que
constituye la forma principal de combustible de reserva.

PROTENAS
Desde un punto de vista qumico son polmeros grandes o son poliamidas y los
monmeros de los cuales derivan son los cidos a - aminocarboxlicos
(aminocidos). Una sola molcula de protena contiene cientos e incluso miles de
unidades de aminocidos, las que pueden ser de unos veinte tipos diferentes. El
nmero de molculas protenicas distintas que pueden existir, es casi infinito. Es
probable que se necesiten decenas de miles de protenas diferentes para formar y
hacer funcionar un organismo animal; este conjunto de protenas no es idntico al
que constituye un animal de tipo distinto.
Importancia Biolgica de las protenas.

Su importancia biolgica la podemos resumir as:
Son las sustancias de la vida, pues constituyen gran parte del cuerpo animal.

Se les encuentra en la clula viva.

Son la materia principal de la piel, msculos, tendones, nervios, sangre, enzimas,
anticuerpos y muchas hormonas.

Dirigen la sntesis de los cidos nucleicos que son los que controlan la herencia.
Divisin de los diferentes grupos de los compuestos orgnicos:
La lnea que divide las molculas orgnicas de las inorgnicas ha originado
polmicas e histricamente ha sido arbitraria, pero generalmente, los compuestos
orgnicos tienen carbono con enlaces de hidrgeno, y los compuestos
inorgnicos, no. As el cido carbnico es inorgnico, mientras que el cido
frmico, el primer cido carboxilico, es orgnico. El anhdrido carbnico y
el monxido de carbono, son compuestos inorgnicos. Por lo tanto, todas las
molculas orgnicas contienen carbono, pero no todas las molculas que
contienen carbono son molculas orgnicas.
Compuesto orgnico o molcula orgnica es una sustancia qumica que
contienecarbono, formando enlaces carbono-carbono y carbono-hidrgeno. En
muchos casos contienen oxgeno, nitrgeno, azufre, fsforo, boro, halgenos y
otros elementosmenos frecuentes en su estado natural.
Las molculas orgnicas pueden ser de dos tipos:
Molculas orgnicas naturales: son las sintetizadas por los seres vivos, y se
llaman biomolculas, las cuales son estudiadas por la bioqumica y
las derivadas del petrleo como los hidrocarburos.
Molculas orgnicas artificiales: son sustancias que no existen en la naturaleza
y han sido fabricadas o sintetizadaspor el hombre, por ejemplo los plsticos.

Grupos orgnicos:
Grupo
funciona
l
Serie
homlog
a
Frmul
a
Estructura Prefijo Sufijo Ejemplo
Grupo
hidroxilo
Alcohol R-OH

hidroxi- -ol

Etanol
Grupo
alcoxi (o
ariloxi)
ter R-O-R'

-oxi- R-il R'-il ter

ter etlico
Grupo
carbonilo
Aldehdo
R-
C(=O)H

formil-
-al

-
carbaldehdo
2


Etanal
Cetona
R-
C(=O)-
R'
oxo- -ona

Propanon
a
Grupo
carboxilo
cido
carboxlic
o
R-
COOH

carboxi- cido -ico

cido
actico
Grupo
acilo
ster
R-COO-
R'

-
iloxicarbonil
-
R-ato de R'-
ilo

Acetato de
etilo
Funciones nitrogenadas
Amidas, aminas, nitrocompuestos, nitrilos. Presencia de enlaces carbono-
nitrgeno: C-N, C=N CN
Grupo
funcional
Tipo de
compuest
o
Frmu
la
Estructura Prefijo Sufijo Ejemplo
Grupo
amino
Amina R-NH
2


amino- -amino
Isobutilamina
Imina
R-
NCH
2


_ _

Grupos a
mino
y carbonil
o
Amida
R-CO-
NR
2


_ _

Acetamida
Imida
R-
C(=O)
N(-R')-
R"

_ _
Tetrametiletildi
imida
Grupo
nitro
Nitrocompu
esto
R-NO
2


nitro- _

Nitropropano
Grupo
nitrilo
Nitrilo o
cianuro
R-CN

ciano- -nitrilo

Isocianuro R-NC

alquil
isocianur
o
_

Tert-butil
isocianuro
Isocianato
R-
NCO

alquil
isocianat
o
_

Isotiocianat
o
R-
NCS

alquil
isotiocia
nato


Grupo azo
Azoderivad
o
R-
N=N-
R'

azo- -diazeno

Diazoderiv
ado
R=N=
N

diazo- _

Diazometano
Azida R-N
3


azido- -azida

Sal de
diazonio
X
-
R-
N
+
N
_
...uro de
...-
diazonio
_ Hidrazina
R
1
R
2
N
-
NR
3
R
4


_ -hidrazina

_
Hidroxilami
na
-NOH

_
-
hidroxila
mina

Funciones halogenadas
Compuestos por carbono, hidrgeno y halgenos.
Grupo funcional Tipo de compuesto
Frmula del
compuesto
Prefijo

Grupo haluro Haluro R-X halo- _
Grupo acilo Haluro de cido R-COX Haloformil- Haluro de -olo

Grupos que contienen azufre

Grupo
funcional
Tipo de
compuesto
Frmula del
compuesto
Prefijo Sufijo
Grupo sulfuro Tioter o sulfuro R-S-R' alquiltio-

R-SH Tiol

mercapto- -tiol
R-SO-R' Sulfxido _ _ _
R-SO
2
-R' Sulfona _ _ _
_ cido sulfnico RSO
3
H sulfo-
cido -
sulfnico

Organofosfatos

Grupo
funciona
l
Tipo de
compuest
o
Frmula Estructura
Prefij
o
Sufij
o
Ejemplo

Fosfinato
de sodio
PR
3


_ _


_ P(=O)R
3


_ _


Fosfinito P(OR)R
2


_ _ [[Archivo:|75px|]]

Fosfinato
P(=O)(OR)R
2


_ _


Fosfonito P(OR)
2
R

_ _


Fosfonato
P(=O)(OR)
2
R

_ _


Fosfito P(OR)
3


_ fosfito

Grupo
fosfato
Fosfato
P(=O)(OH)
2
R

_ _


Fosforano PR
5


_ _

















Consigna de aprendizaje # 2

Aminocido:
Un aminocido es una molecula organica entre un grupo amino(-NH
2
)y un grupo
carboxilo(-COOH).
Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades de su cadena
lateral:
Neutros polares, polares o hidrfilos: serina (Ser, S), treonina (Thr, T), cistena
(Cys, C), glutamina (Gln, Q), asparagina (Asn, N), tirosina (Tyr, Y).
Neutros no polares, apolares o hidrfobos: alanina (Ala, A), valina (Val, V),
leucina (Leu, L), isoleucina (Ile, I), metionina (Met, M), prolina (Pro, P),
fenilalanina (Phe, F), triptfano (Trp, W) y glicina (Gly, G).
Con carga negativa o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu,
E).
Con carga positiva o bsicos: lisina (Lys, K), arginina (Arg, R) e histidina (His,
H). fenilalanina (Phe, F), tirosina (Tyr, Y) y triptfano (Trp, W) (ya incluidos en
los grupos neutros polares y neutros no polares).











Esquemas de formacin y unin de las protenas:


Unin de las protenas:
















Consigna de aprendizaje #3
Definicin de cintica:
La cintica qumica es un rea de la fisicoqumica que se encarga del estudio de
la rapidez de reaccin, cmo cambia la rapidez de reaccin bajo condiciones
variables y qu eventos moleculares se efectan mediante la reaccin general
(Difusin, ciencia de superficies,catlisis). La cintica qumica es un estudio
puramente emprico y experimental; el rea qumica que permite indagar en
las mecnicas de reaccin se conoce como dinmica qumica.
Rapidez o velocidad de las reacciones:
La rapidez (o velocidad) de reaccin est conformada por la rapidez de formacin
y la rapidez de descomposicin. Esta rapidez no es constante y depende de varios
factores, como la concentracin de los reactivos, la presencia de un catalizador, la
temperatura de reaccin y el estado fsico de los reactivos.
Uno de los factores ms importantes es la concentracin de los reactivos. Cuanto
ms partculas existan en un volumen, ms colisiones hay entre las partculas por
unidad de tiempo. Al principio, cuando la concentracin de reactivos es mayor,
tambin es mayor la probabilidad de que se den colisiones entre las molculas, y
la rapidez es mayor. A medida que la reaccin avanza, al ir disminuyendo la
concentracin de los reactivos, disminuye la probabilidad de colisin y con ella la
rapidez de la reaccin. La medida de la rapidez de reaccin implica la medida de
la concentracin de uno de los reactivos o productos a lo largo del tiempo, esto es,
para medir la rapidez de una reaccin necesitamos medir, bien la cantidad de
reactivo que desaparece por unidad de tiempo, o bien la cantidad de producto que
aparece por unidad de tiempo. La rapidez de reaccin se mide en unidades de
concentracin/tiempo, esto es, en (mol/l)/s, es decir, moles/(ls).
Para una reaccin de la forma:

la ley de la rapidez de formacin es la siguiente:

es la rapidez de la reaccin, la disminucin de la
concentracin del reactivo A en el tiempo . Esta rapidez es la rapidez
media de la reaccin, pues todas las molculas necesitan tiempos distintos
para reaccionar.
La rapidez de aparicin del producto es igual a la rapidez de desaparicin
del reactivo. De este modo, la ley de la rapidez se puede escribir de la
siguiente forma:

Este modelo necesita otras simplificaciones con respecto a:
la actividad qumica, es decir, la "concentracin efectiva"
la cantidad de los reactivos en proporcin a la cantidad de los
productos y del disolvente
la temperatura
la energa de colisin
presencia de catalizadores
la presin parcial de gases



Orden de reaccin:
Para cada reaccin se puede formular una ecuacin, la cual describe cuantas partculas
del reactivo reaccionan entre ellas, para formar una cantidad de partculas del producto.
Para una reaccin de la forma:

esto significa, que dos partculas A colisionan con una partcula B, una partcula C y una
partcula D para formar el producto E.
Sin embargo, la probabilidad de que cinco partculas colisionen al mismo tiempo y con
energa suficiente, es escasa.
Ms probable es que dos o tres partculas colisionen y formen un producto intermedio,
este producto intermedio colisiona con las dems partculas y forma otros productos
intermedios hasta formar el producto E, aqu un ejemplo:



La descomposicin de la reaccin principal en llamadas reacciones elementales y el
anlisis de estas nos muestra exactamente como ocurre esta reaccin.
Por medio de mtodos experimentales o por premisas se puede determinar la
dependencia de la rapidez de las reacciones elementales con las concentraciones de
los componentes A, B, C y D.
El orden de reaccin est definido como la suma de los exponentes de las
concentraciones en la ley de la rapidez de la reaccin. Este es tambin llamado orden
total de reaccin, pues el orden depende del reactivo que se analice. El orden de la
reacciones se determina experimentalmente.


Ejemplo :
Suponiendo que la velocidad de reaccin de la primera reaccin elemental tiene una
dependencia cuadrtica con la concentracin del reactivo A, esto significa que esta
reaccin es de segundo orden con respecto al reactivo A. El orden total de esta
reaccin es tambin segundo, pues no hay otros reactivos.
Suponiendo que la velocidad de reaccin de la segunda reaccin elemental tenga una
dependencia lineal con la concentracin del reactivo A
2
, lineal con la concentracin del
reactivo B y ninguna dependencia con C. Entonces es la reaccin de primer orden en
relacin a A
2
, de primer orden en relacin a B y de cero orden en relacin al
componente C. El orden total es segundo.
Suponiendo que la velocidad de reaccin de la tercera reaccin
elemental tenga una dependencia lineal con la concentracin de A
2
BC, pero ninguna
con la concentracin de D, entonces es la reaccin de primer orden en relacin a A
2
BC
y de orden cero en relacin a D. El orden total de la reaccin es primero.
Para una reaccin hipottica de la forma:

la velocidad de reaccin se define como la siguiente expresin en caso de que sea una
reaccin simple molecular, como la del caso anterior:
v=k[A]

[B]

(las concentraciones de reactivos estn elevados a su correspondiente coeficiente
cintico slo en el caso en el que la reaccin sea elemental). Donde los corchetes
denotan la concentracin de cada una de las especies; "v" denota la rapidez de
reaccin y "k" es la constante cintica. La velocidad de las reacciones qumicas abarca
escalas de tiempo muy amplias. Por ejemplo, una explosin puede ocurrir en menos de
un segundo; la coccin de un alimento puede tardar minutos u horas.

Factores o caractersticas que diferencia el orden de reaccin:

Existen varios factores que afectan la rapidez de una reaccin qumica: la
concentracin de los reactivos, la temperatura, la existencia de catalizadores y la
superficie de contactos tanto de los reactivos como del catalizador. Los catalizadores
pueden aumentar o disminuir la velocidad de reaccin.
Temperatura
Por norma general, la rapidez de reaccin aumenta con la temperatura porque al
aumentarla incrementa la energa cinticade las molculas. Con mayor energa cintica,
las molculas se mueven ms rpido y chocan con ms frecuencia y con ms energa.
El comportamiento de la constante de rapidez o coeficiente cintico frente a la
temperatura = lnA (Ea / R)(1 / T2 1 / T1) esta ecuacin linealizada es muy til y
puede ser descrito a travs de la Ecuacin de Arrhenius donde K es
la constante de la rapidez, A es el factor de frecuencia, EA es la energa de activacin
necesaria y T es la temperatura, al linealizarla se tiene que el logaritmo neperiano de la
constante de rapidez es inversamente proporcional a la temperatura, como sigue: ln(k1
/ k2) la hora de calcular la energa de activacin experimentalmente, ya que la
pendiente de la recta obtenida al graficar la mencionada ley es: -EA/R, haciendo un
simple despeje se obtiene fcilmente esta energa de activacin, tomando en cuenta
que el valor de la constante universal de los gases es 1.987cal/K mol. Para un buen
nmero de reacciones qumicas la rapidez se duplica aproximadamente cada
diezgrados centgrados




Estado fsico de los reactivos
Si en una reaccin interactan reactivos en distintas fases, su rea de contacto es
menor y su rapidez tambin es menor. En cambio, si el rea de contacto es mayor, la
rapidez es mayor.
Al encontrarse los reactivos en distintas fases aparecen nuevos factores cinticos a
analizar. La parte de la reaccin qumica, es decir, hay que estudiar la rapidez de
transporte, pues en la mayora de los casos estas son mucho ms lentas que la rapidez
intrnseca de la reaccin y son las etapas de transporte las que determinan la cintica
del proceso.
No cabe duda de que un mayor rea de contacto reduce la resistencia al transporte,
pero tambin son muy importantes la difusividad del reactivo en el medio, y su
solubilidad, dado que este es el lmite de la concentracin del reactivo, y viene
determinada por el equilibrio entre las fases.

Presencia de un catalizador
Los catalizadores aumentan o disminuyen la rapidez de una reaccin sin transformarse.
Suelen empeorar la selectividad del proceso, aumentando la obtencin de productos no
deseados. La forma de accin de los mismos es modificando el mecanismo de
reaccin, empleando pasos elementales con mayor o menor energa de activacin.
Existen catalizadores homogneos, que se encuentran en la misma fase que los
reactivos (por ejemplo, el hierro III en la descomposicin del perxido de hidrgeno) y
catalizadores heterogneos, que se encuentran en distinta fase (por ejemplo la malla de
platino en las reacciones de hidrogenacin).
Los catalizadores tambin pueden retardar reacciones, no solo acelerarlas, en este
caso se suelen conocer como retardantes o inhibidores, los cuales impiden la
produccin.
Los catalizadores no modifican la entalpia, la entropia o la energia libre de Gibbs de los
reactivos. Ya que esto unicamente depende de los reactivos.
Concentracin de los reactivos
La mayora de las reacciones son ms rpidas en presencia de un catalizador y cuanto
ms concentrados se encuentren los reactivos, mayor frecuencia de colisin.
Si los reactivos estn en disolucin o son gases encerrados en un recipiente, cuanto
mayor sea su concentracin, ms alta ser la velocidad de la reaccin en la que
participen, ya que, al haber ms partculas en el mismo espacio, aumentar el nmero
de colisiones.
El ataque que los cidos realizan sobre algunos metales con desprendimiento de
hidrgeno es un buen ejemplo, ya que este ataque es mucho ms violento cuanto
mayor es la concentracin del cido.
La obtencin de una ecuacin que pueda emplearse para predecir la dependencia de la
rapidez de reaccin con las concentraciones de reactivos es uno de los objetivos
bsicos de la cintica qumica. Esa ecuacin, que es determinada de forma emprica,
recibe el nombre de ecuacin de rapidez.
De este modo, si consideramos de nuevo la reaccin hipottica la rapidez de reaccin
"r" puede expresarse como
Los trminos entre corchetes son las molaridades de los reactivos y los exponentes m y
n son coeficientes que, salvo en el caso de una etapa elemental no tienen por que estar
relacionados con el coeficiente estequiomtrico de cada uno de los reactivos. Los
valores de estos exponentes se conocen como orden de reaccin.
Hay casos en que la rapidez de reaccin no es funcin de la concentracin, en estos
casos la cintica de la reaccin est condicionada por otros factores del sistema como
por ejemplo la radiacin solar, o la superficie especfica disponible en una reaccin gas-
slido cataltica, donde el exceso de reactivo gas hace que siempre estn ocupados
todos los centros activos del catalizador.
Presin
En una reaccin qumica, si existe una mayor presin en el sistema, sta va a variar la
energa cintica de las molculas. Entonces, si existe una mayor presin, la energa
cintica de las partculas va a aumentar y la reaccin se va a volver ms rpida; al igual
que en los gases, que al aumentar su presin aumenta tambin el movimiento de sus
partculas y, por tanto, la rapidez de reaccin es mayor. Esto es vlido solamente en
aquellas reacciones qumicas cuyos reactantes sean afectados de manera importante
por la presin, como los gases. En reacciones cuyos reactantes sean slidos o lquidos,
los efectos de la presin son nfimos.
Luz
La luz es una forma de energa. Algunas reacciones, al ser iluminadas, se producen
ms rpidamente, como ocurre en el caso de la reaccin entre el cloro y el hidrgeno.
En general, la luz arranca electrones de algunos tomos formando iones, con lo que
aumenta considerablemente la velocidad de reaccin.