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PROTEINAS
Las protenas son macromolculas orgnicas, biopolmeros de aminocidos que cumplen diversas
funciones en los seres vivientes y en los alimentos, forman parte de los macronutrientes juntamente con
los carbohidratos y los lpidos, el trmino protena deriva del griego proteios, que significa primero.
Las protenas son las molculas mas abundantes en los animales, en los cuales cumplen diversas
funciones, por ejemplo forman parte estructural de los tejidos, actan como organismos de defensa en
los anticuerpos, son catalizadores biolgicos (enzimas), son constituyentes de la sangre, etc.
Los alimentos ricos en protenas (huevo, leche carne) son costosos, caros y escasos especialmente en
los pases pobres y subdesarrollados donde la poblacin no tiene fcil acceso a estos productos por el
elevado costo en el nivel de vida y acentuado por el elevado ndice de crecimiento de la poblacin, por
lo que se hace indispensable conocer las protenas, sus propiedades, materias primas, procesamiento,
etc. y los alimentos ricos en estos nutrientes para poder satisfacer las necesidades de la poblacin, en
especial los aspectos de produccin, manejo, transformacin, almacenamiento y transporte.
Las propiedades particulares de cada protena depende principalmente de la clase y frecuencia de los
aminocidos que la constituyen.
Aminocidos
Los aminocidos son compuestos orgnicos que tienen en su molcula un grupo carboxilo y un grupo
amino, de todos las posibles formas de aminocidos, solamente 20 clases diferentes se han encontrado
como constituyentes mas frecuentes de las protenas, con alguna excepciones; con caractersticas
particular adicionales, estos aminocidos son -aminocidos, es decir el grupo amino se halla
localizado en el carbono de la cadena carbonada y adems tienen configuracin L..
Clasificacin
Hay varias formas de clasificar a los aminocidos, los principales criterios son:
1. En base a la estructura y naturaleza del grupo R.
a. Aminocidos con cadena lateral aliftica: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina.
b. Aminocidos con cadena lateral aromtica: fenilalanina, triptfano, tirosina
c. Aminocidos con cadena lateral hidroxilada: Serina, treonina, 4-hidroxiprolina
d. Aminocidos con cadena lateral que contiene azufre: Cisteina, metionina
e. Aminocidos con cadena lateral que contiene grupo carboxilo: Acido Glutmico, Acido asprtico.
f. Aminocidos con cadena lateral que contiene Nitrgeno bsico: Arginina, Histidina, Lisina.
g. Aminocidos con cadena lateral iminico y amdico: Prolina, Glutamina, Asparragina.
2. En base a la polaridad del grupo R.
a. Apolares: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina, fenilalanina, triptfano, metionina.
b. Polares sin carga: Serina, treonina, cisteina, tirosina, asparragina, glutamina.
c. Polares con carga: Acido asprtico, cido glutmico, histidina, lisina, arginina
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La isoleucina, treonina y la 5-hidroxilisina tienen dos tomos quirales y presentan cuatro ismeros.
punto isoelctrico
los aminocidos son compuestos anfteros, ya que pueden actuar como cidos o como bases, aunque
muchas veces se suelen escribir sus frmulas como molculas neutras, su estructura real es inica
donde el grupo carboxilo est desprotonado con carga negativa (grupo carboxilato) es la parte bsica de
la molcula y el grupo amino protonado (grupo amonio) es la parte cida, esta estructura de doble in o
in dipolar se conoce como Zwitterion (del alemn doble in).
1. Esta estructura de doble in, es confirmada por las siguientes caractersticas particulares que
presentan los aminocidos:
2. Presentan puntos de fusin elevados (mayores a 200C), por ejemplo para la alanina su punto de
fusin es de 262C.
3. Los aminocidos tiene momentos dipolares elevados en comparacin con los cidos o aminas
simples, y son mas solubles en agua que en solventes orgnicos moderadamente polares como
diclorometano o eter dietlico (glicina =14 D; propilamina = 1,4 D; cido propinico = 1,7
D).
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4. Los aminocidos son menos cidos que la mayora de los cidos carboxlicos (son cidos dbiles,
el in amonio es un cido dbil); y menos bsicos que la mayora de la aminas (el grupo
carboxilato es una base dbil) los cidos carboxlicos presentan un pka 5, la aminas pkb 4; los
aminocidos pka 10, pkb 12.
Como los aminocidos se comportan tanto como cidos o como bases, en medio cido presentan una
carga neta positiva y en medio bsico presentan una carga neta negativa, la forma predominante del
aminocido depende del pH de la solucin, por ejemplo la alanina se halla en su forma aninica Ala - a
pH mayores que 9,6; (pka1 = 9,6) y en su forma catinica a pH menores que 2,3 (pka 2 = 2,3) Ala+ .
El valor de pH en el caul el aminocido se halla con sus cargas positivas y negativas balanceadas, es
decir iguales, con carga neta igual a cero, se denomina pH isoelctrico o punto isoelctrico, es decir:
A pH > PI los aminocidos se hallan mayormente con carga negativa,
A pH < PI los aminocidos se hallan mayormente con carga positiva
A pH = PI los aminocido se hallan con carga positiva igual a la carga negativa, pero siempre tienen
carga elctrica.
Los valores de los puntos isoelctricos depende de la estructura de la cadena R del aminocido.
Los aminocidos cidos Acido asprtico (PI=2,8) y cido glutmico (PI=3,2) con grupos carboxilos en
sus cadenas laterales R, tiene pI cido, por que es necesario una solucin cida para evitar la
desprotonacin del segundo grupo carboxilo y mantener el aminocido como in dipolar y
elctricamente neutro.
Los aminocidos bsicos, Lisina (PI=9,7), Arginina (PI=10,8); Histidina (PI=7,6) tienen puntos
isoelctricos a pH bsicos y reflejan la basicidad de las cadenas laterales R, el grupo imidazol de la
histidina es dbilmente bsico, la basicidad intermedia del grupo amino de la lisina y la basicidad
fuerte del grupo guanidinio de la arginina. En cada caso se necesita una solucin bsica para evitar la
protonacin de los nitrgenos de las cadenas laterales R y mantener el aminocido en su punto
isoelctrico.
Los dems aminocidos son neutros o ligeramente cidos o ligeramente bsicos, sus puntos
isoelctricos son ligeramente cidos entre 5 y 6, por que la acidez del grupo NH 3+ es un poco mayor
que la basicidad del grupo COO-.
Los aminocidos en medio cido se hallan totalmente protonados (COOH / NH3+) esto es un cido
de Bronsted diprtico por lo tanto son posibles dos ionizaciones las que se describen por sus valores de
pka; para la mayora de los aminocidos el pka 1 del grupo carboxilo COOH tiene un valor
aproximado de 2, mientras que el pka 2 del grupo amino NH3+ tiene un valor de 9 a 10, esto se aprecia
mejor en las curvas de titulacin.
Las constantes de ionizacin de los grupos ionizables, grupos carboxilos pka 1, grupos amino pka2, y de
otros grupo de las cadenas laterales R pka 3, se indican en la tabla, por ejemplo el pka del grupo
carboxilo de la glicina es 2,34, a pH menores que 2,34 el grupo carboxilo de la glicina est protonado
COOH, y a pH mayores se halla como COO -. El pka del grupo amino de la glicina es de 9,78 lo que
indica que a pH menores que 9,78 el grupo amino se halla protonado como NH 3+ y a pH mayores se
halla como grupo amino libre -NH2.
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El valor del pI de cualquier aminocido neutro se puede obtener calculando el promedio de los
valores de pka1 y pka2, de los aminocidos cidos calculando el promedio de pka 2 y pka3 o sea de los
pka(carboxilo) y pka(grupo polar de la cadena R) y de los aminocidos bsicos calculando el promedio de pka2 y
pka3 o sea de los pka(amonio) y pka(grupo polar de la cadena R).
El valor de pH para el cual solo existen como iones dipolares o sea en el punto isoeltrico se alcanza
cuando las cargas netas positivas y negativas son iguales, es decir Aa + = Aa -.
Por ejemplo:
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Propiedades Fsicas
Los aminocidos son slidos cristalinos incoloros, funden a elevadas temperaturas con
descomposicin, algunos subliman.
Algunos aminocidos son solubles en agua como la prolina (162g /100g H 2O, 25C), la glicina (25g /
100g H2O, 25C) y alanina (16g /100g H 2O, 25C), los dems aminoacidos son poco solubles, la
cistina y tirosina son muy poco solubles, la solubilidad aumenta con la adicin de cido o lcalis, en
general los aminocidos son poco solubles en solventes orgnicos por el carcter polar, en ter son
insolubles todos los aminocidos, en etanol son solubles la prolina y la cistena, la isoleucina es
relativamente soluble en alcohol caliente.
Propiedades sensoriales y nutricionales
Los aminocidos tienen sabor dulce o amargo y algunos son inspidos, el sabor dulce es
principalmente de los aminocidos de la serie D y de sabor amargo los de la serie L, la intensidad
gustativa depende de la hidrofobicidad de las cadenas laterales.
El cido glutmico en soluciones concentradas tiene sabor a carne, por lo que la sal sdica del cido
glutmico (glutamato monosdico) se utiliza como realzante del sabor a carne. La metionina tiene
sabor a azufre.
El cuerpo humano tiene la capacidad de sintetizar aproximadamente la mitad de los aminocidos que
necesita para fabricar sus protenas y estructurar sus tejidos, por lo que debe consumir obligatoriamente
en la dieta los diez aminocidos esenciales, las protenas que aportan los 10 aminocidos esenciales
para la nutricin humana se llaman protenas completas (carne, leche, pescado, huevos), los adulto
requiere aproximadamente de 50g/da de protena completa.
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Las protenas que les falta uno o mas aminocidos esenciales se denomina protena incompleta, por lo
general las protenas proveniente de vegetales son incompletas, el valor biolgico o nutricional de una
protena (g de protena asimilada/100 g de protena consumida), viene determinado por el contenido
absoluto de aminocidos esenciales y por la relacin ponderal de los aminocidos esenciales entre s y
con los aminocidos no esenciales, en general el valor biolgico viene limitado por:
Deficiencia en lisina:
protenas de cereales (maz, arroz) y otras protenas vegetales
Deficiencia en metionina: Leche de vaca, protenas de la carne, protenas de la soya.
Deficiencia en Treonina: Protenas del trigo, arroz y centeno
Deficiencia en Triptfano: Casena del queso, protenas del maz y arroz.
Los vegetarianos pueden lograr un suministro adecuado de aminocidos esenciales consumiendo gran
cantidad y diversidad de productos vegetales, una alternativa mas eficiente es completar la dieta
vegetariana con una fuente rica en protenas completas con aminocidos esenciales como la leche o
huevos.
Recientemente se est investigando otras fuentes alternativas de protenas con alto contenido de
aminocidos esenciales, como la produccin biotecnolgica de ciertas variedades de levadura (ej.
Torula), o protenas de cierta variedad de lombrices de tierra son ricas en lisina.
Teniendo en cuenta que muchas partes del mundo, se carece de protenas en cantidad y calidad
(especialmente en regiones en las que la base alimenticia es de cereales y tubrculos), se hace de
mucha importancia mejorarlas con aminocidos esenciales, por ejemplo en Japn, Tailandia y Tunicia
se fortifica el arroz con L-Lisina y L-treonina; en el Japn se fortifica el pan con L-Lisina y la protena
de soja y man con metionina.
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La fuente directa inmediata de obtencin de aminocidos es las protenas, de la cual se pueden obtener
aminocidos por hidrlisis cida o por hidrlisis enzimtica con proteasas, un ejemplo especfico es la
produccin de cistena por hidrlisis de plumas de aves, la glicina y prolina a partir de hidrolizados del
colgeno.
Actualmente se obtienen grandes cantidades de aminocidos y otros metabolitos mediante procesos
biotecnolgicos, por ejemplo se obtiene L-lisisna mediante un proceso de fermentacin con
Brevibacterium Flavum, Brevibacterium lactofermentum y micrococcus glutamicus usando como
sustrato acetato de amonio y otros; El cido L-glutmico se obtiene por fermentacin con
Brevibacterium foavum, Brevibacterium roseum y con Brevibacterium saccharolyticum, otros
aminoacidos que se obtienen industrialmente por procesos biotecnolgicos son el triptfano y la
treonina.
La sntesis a partir de precursores es tambin muy utilizada en la produccin comercial, por ejemplo el
cido L-asprtico se obtiene a partir de cido fumrico y con ayuda de la enzima aspartasa en
hidrxido de amonio con un rendimiento del 90%, el L-triptfano se obtiene a partir del indol y serina
con ayuda de la enzima triptofanosintetasa.
La sntesis qumica es la forma mas directa de obtener aminocidos en laboratorio, se obtiene como
mezcla racmica que se pueden separar en sus ismeros tratando los derivados N-acetilados con
acilasa, los principales mtodos generales para la obtencin de aminocidos son:
1. Aminacin reductiva
Tratando un -cetoacido con amoniaco se forma una imina, esta imina se puede reducir a amina por
hidrogenacin cataltica con catalizador de paladio, la sntesis se logra en un solo paso tratando el cetoacido con amoniaco e hidrgeno en presencia de un catalizador de paladio y se obtiene una mezcla
racmica del -aminocido, por ejemplo para la sntesis de fenilalanina:
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2. Aminacin de un -halocido
Tratando un cido carboxlico con bromo en tribromuro de fsforo se obtiene un -bromoacilo, que al
hacer reaccionar este con agua se hidroliza dando un -bromocido (reaccin de Hell Volhard-Zelinsky
HVZ). Al reaccionar este -bromocido con amoniaco en exceso se convierte por aminacin directa
en -aminocido.
3. Sntesis de Strecker
Haciendo reaccionar un aldehdo adecuado con amoniaco acuoso y cianuro de hidrgeno, se obtiene un
-aminonitrilo y por hidrlisis cida de este se obtiene un -aminocido racmico. La reaccin se
inicia cuando el aldehdo reacciona con el amoniaco dando una imina electroflica que se protona con
el H del cianuro de hidrgeno, que luego es atacada por el in cianuro dando el -aminonitrilo.
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3. El ester N-ftalimidodietilmalnico se alquila haciendo reaccionar con una base como el etxido de
sodio dando la sal sdica del ster N-ftalimidodietilmalnico y etanol (el hidrgeno es cido),
luego haciendo reaccionar con un halogenuro de alquilo adecuado.
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Los aminocido N-acetilados se utilizan como suplemento en las protenas vegetales para elevar su
valor nutricional especialmente en alimentos que deben ser procesado trmicamente, ya que los
aminocidos son muy reactivos y pueden degradarse o formar productos con aromas indeseables,
adems el cuerpo humano utiliza por ejemplo la N-acetilmetionina
Los N-acilderivados de los aminocidos se transforman en oxazolinonas (azalactonas) con eliminacin
de agua, estos productos son muy reactivos y se utilizan en la sntesis de otros aminocidos.
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La reaccin directa de los aminocidos con un reactivo metilante como yoduro de metilo o sulfato de
dimetilo conduce a la obtencin derivados N-trimetilados denominados betanas, estos comnpuestos
existen en forma natural en tejidos animales y vegetales.
4. Carbamoilacin
Los aminocidos reaccionan con los isocianatos para dar carbamoilderivados que calentados en medio
cido se ciclan dando 2,5-dioxoimidazolidinas (Hidantoinas).
Mediante una reaccin semejante con fenilisotiocianato es posible conseguir una degradacin gradual
de los pptidos (degradacin de Edman) que se utiliza mucho en el anlisis secuencial de los residuos
de pptidos y protenas.
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estable, los seis tomos que conforman el enlace peptdico (C, O, H, N, R 1 y R2) son coplanares, de
ordenacin rgida, estabilizado por resonancia y tautomera.
Los pptidos son polmeros de aminocidos unidos por enlaces peptdicos, cada unidad de aminocido
se llama residuo, as un dipptido est formado por dos residuoas, un tripptido por tres, etc. Los
oligopptidos son pptidos que tienen de 4 a 10 residuos de aminocidos, un polipptido es un pptido
que tiene muchos residuos, las proteinas son polipptidos gigantes con miles de residuoscuyos pesos
moleculares llegan hasta 40 millones.
Los pptidos tienen un extremo N-terminal con el grupo amino libre (H 3N+) y el otro extremo
C-terminal con el grupo carboxilato libre (COO-), normalmente el extremo N-terminal se escribe a la
derecha y el extremo C-terminal a la izquierda, los pptidos se nombra empezando por el extremo
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N-terminal con la terminacin il a cada residuo excepto el extremo C-terminal, por ejemplo la
bradicidina es una hormona humana y es un nonapptido cuyo nombre y estructura es:
Arginil prolil prolil glicil fenilalanil seril prolil fenilalanil arginina
Bradicidina humana: Arg-Pro-Pro-Gli-Phe-Ser-Pro-Phe-Arg
La oxitocina bovina es una hormona peptdica que regula la produccin de leche en las vacas,
estructuralmente es un nonapprido con dos residuos de cistena en las posiciones 1 y 6 que unen parte
de la molcula en un gran anillo y el extremo C-terminal de glicina est en forma de amida.
La insulina bovina es una hormona peptdica mas compleja que regula el metabolismo de la glucosa,
la insulina se compone de dos cadenas polipeptdicas, la cadena A tiene 21 residuos de aminocidos,
con cistenas en posiciones 6, 7, 11 y 20, la cisteinas de posicin 6 y 11 forman un anillo interno por
puentes disulfuro, la cadena B tiene 30 residuos de aminocidos con cistena en las posicin 7 y 19 que
forman enlace de puente disulfuro con las cistenas de posicin 7 y 19 de la cadena A.
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Oxitocina bovina
Pptidos
Hay muchos pptidos naturales en las tejidos animales y vegetales, muchos de ellos tienen acciones
biolgicas especficas como hormonas peptdicas, antibiticos, toxinas, transmisores de seal qumica,
etc. Aqu sealamos los mas importantes en la qumica de los alimentos, adems de los ya citados:
Pptidos naturales: Glutatin
El glutatin, -L-glutamil L-cicteinil glicina se halla en tejidos animales, vegetales y microorganismos,
este pptido es coenzima de la enzima Glioxalasa, participa en el transporte activo de loa aminocidos,
interviene en muchas reacciones redox, modifica mediante transformaciones tiol-disulfuro de las
protenas del gluten, las propiedades reolgicas de la masa del pan, en condiciones elevadas de
glutatin reducido en la harina condiciona la adherencia y pegajosidad de la masa por reduccin de los
puentes disulfuro.
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Aproximadamente el 90% de los compuestos no proteicos que contienen SH en los tejidos de los
animales est formado por glutatin, por lo que se considera como almacenamiento de cistena que
puede actuar como agente reductor al interconvertirse de la forma reducida G-SH a la forma oxidada
G-S-S-G in vivo, estas reacciones estn relacionadas con dos funciones: la funcin protectora y la
funcin reguladora o regeneradora. Cumple su funcin protectora cuando reacciona con agentes
extraos oxidantes txicos para los tejidos como el radical aninico superxido O 2-, el perxido de
Hidrgeno H2O2, el radical OH- regulando el pH del medio, etc.
La funcin regeneradora se verifica al reponer los enlaces de puente disulfuro de algunas enzimas y
protenas que durante su reaccn se oxidan formando puentes disulfuro, entonces interviene la
glutationa a travs de la enzima transhidrogenasa de la glutationa para reducir los puentes disulfuro
de la protenas oxidadas a la forma reducida SH.
Carnosina, Anserina, Balenina
Son un grupo de pptidos de estructura similar formados por -alanina y L-histidina sustituida,
existen en forma natural en el msculo de los vertebrados, en la carne de vaca predomina la carnosina,
en la carne de gallina la anserina y la balenina es caracterstico de la carne de ballena, estos pptidos
participan en la excitabilidad y contractibilidad del msculo.
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La Vasopresina es otra hormona peptdica que tiene efectos antidiurticos al estimular la reabsorcin
de agua en el rin, tambin provoca la contraccin del msculo liso sobre todo de los vasos
sanguneos contribuyendo al control de la presin arterial.
Comparando las estructuras de estas dos hormonas peptdicas se puede observar que tiene muy
similares estructuras a excepcin de los residuos 3 y 8 que le dan caractersticas y propiedades muy
especiales
La somatostatina es otra hormona peptdica que inhibe la produccin de otra hormona, la HGH
(Human Growth Hormone) u hormona del crecimiento humano que se produce en la hipfisis, tambin
regula la produccin de otras hormonas como la insulina y el glucagn.
Pptidos neurotransmisore: encefalina, endorfinas, Los neurotransmisores son sustancias que regulan
la transmisin de impulsos mediante las clulas nerviosas (neuronas), uno de los neurotransmisores
mas estudiados es la acetilcolina (ver fosfolpidos), otros neurotransmisores de naturales peptdica son
las encefalinas y endorfinas, descubiertos en 1975, presentan funciones similares a la morfina por lo
que se los conoce tambin como pptidos opiaceos.
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El Boc-aminocido se hidroliza con facilidad al tratarlo brevemente con cido trifluoroactico anhidro
CH3-COOH, que seguido de un calentamiento para descarboxilacin se produce isobutileno, el
aminocido libre y CO2.
Paso II. Fijacin del pptido al soporte slido, El siguiente paso es fijar el aminocido C-terminal al
soporte slido. El soporte slido es una perla de poliestireno especial en la que los anillos aromticos
tienen grupos p-clorometilo, este polmero que se llama resina de Merrifeld en honor a su inventor, este
polmero se fabrica copolimerizando estireno con bajos porcentajes de p-clorometilestireno.
El grupo carboxilato del aminocido protegido en N, desplaza al cloruro del polmero formando un
ster del aminocido.
Paso III, construccin del pptido, adicin de aminocidos, Una vez el aminocido protegido en N,
se ha fijado al soporte polimrico, la cadena se construye en direccin del grupo amino (de adelante
hacia atrs), Para la formacin del enlace peptdico se emplea N,N-diciclohexilcarbodiimida (DCC)
acoplando el grupo carboxilato del nuevo aminocido protegido en N con el grupo amino del
aminocido anterior de la cadena creciente desprotegido en N, en esta reaccin se forma una amida
(enlace peptdico) y N,N-diciclohexil urea (DCU).
Liberacin del soporte y el grupo protector, Al finalizar la sntesis se rompe el ster con el polmero
con HF anhidro que tambin elimina al grupo protector Boc.
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Ejemplo de sntesis de pptidos en fase slida, escribir las reacciones de sntesis en fase slida del
pptido Ala Val Phe
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Protenas
Las protenas son polmeros de aminocidos unidos mediante enlaces peptdicos, desde el punto de
vista funcional, estructural y fsiolgico de los seres vivientes, las protenas constituyen uno de los
compuestos mas importantes, pues regulan, controlan y sostienen gran cantidad de funciones vitales
esenciales para la existencia de la vida tanto animal como vegetal.
Las molculas proteicas van desde las largas fibras insolubles que forman el tejido conectivo y el pelo
hasta los glbulos compactos solubles, capaces de atravesar la membrana celular y desencadenar
reacciones metablicas. Son molculas grandes, de peso molecular comprendido entre unos miles de
unidades y ms de millones, son especficas de cada especie y de cada uno de los rganos de cada
especie. Se estima que el ser humano tiene unas 30.000 protenas distintas, de las que slo un 2% se
han descrito en profundidad. Las protenas de la dieta sirven sobre todo para construir y mantener las
clulas, aunque su descomposicin qumica tambin proporciona energa, con un rendimiento de 4
caloras por gramo.
Las principales funciones de las protenas en los seres vivientes son:
1. Intervienen en el crecimiento y el mantenimiento de las clulas, la mayora del tejido blando de los
animales (a excepcin del tejido adiposo) son formado por protenas o complejos de protenas con
otros constituyentes, por ejemplo el msculo, tejido conectivo o tendones, nervios, cartlago,
sangre, pelos, cuernos, uas, pluma, lana, seda natural, crnea, etc. sus principal componente son
protenas.
2. Las protenas son responsables de la contraccin muscular, por lo tanto son la parte activa de la
locomocin, otras sustancias de naturaleza proteica interviene en la transmisin y amplificacin de
seales nerviosas como las endorfinas.
3. Las enzimas digestivas son protenas, participan en los procesos de transformacin metablica de
los alimentos, por ejemplo la tripsina, quimotripsina, catalizan la degradacin de los alimentos para
convertirlo en sustancias mas sencillas.
4. Hay muchas protenas que cumplen funcin hormonal, por ejemplo la insulina es una protena que
regula el metabolismo de los azcares, La tiroglobulina, segregada por la glndula tiroidea, regula
el metabolismo global; la calcitonina, tambin producida en el tiroides, reduce la concentracin de
calcio en sangre.
5. Otras protenas cumplen funciones de transporte como la hemoglobina transporta el oxgeno que
respiramos desde los pulmones a todas partes del cuerpo, en las membranas hay muchas prortenas
de transporte transmembrnico
6. Las protenas cromosmicas y ribosmicas estn asociadas al DNA cromosmico y RNA para
formar ribosomas, que son conjuntos plurimoleculares donde ocurre la biosntesis de las protenas.
7. Las protenas txicas o toxinas se encuentran en el veneno de reptiles, arcnidos y animales
ponzoosos y son la causa de toxicidad para el sistema nervios de los mamferos, algunas toxinas
producen enfermedades como la toxina del clera producida por bacterias patgenas.
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asociado grupos fosfatos dando lugar a las fosforpotenas, que tambin se hallan en la yema
del huevo.
Las nucleoprotenas tiene una fraccin no proteica asociada a cidos nucleicos, ya sea DNA,
RNA o protenas cromosmicas, que intervienen en l regulacin de los genes del cromosoma.
II. Por su forma, las protenas pueden ser globulares o fibrosas
Las protenas globulares, tiene forma de glbulo casi esfricas o elipsoideas, se debe al
doblamiento, curvamiento o torcimiento de la cadena polipeptdica, en general las protenas
globulares son protenas con alto grado de estructura tridimensional y actividad biolgica y
altamente sensibles a los cambios fisicoqumicos, tal como las enzimas, estas protenas son
tambin mas solubles que las fibrosas, las protenas globulares son muy solubles y
desempean una funcin dinmica en el metabolismo corporal, son ejemplos la albmina, la
globulina, la casena, la hemoglobina, todas las enzimas y las hormonas proteicas.
Albminas y globulinas son protenas solubles abundantes en las clulas animales, el suero
sanguneo, la leche y los huevos.
hemoglobina es una protena respiratoria que transporta oxgeno por el cuerpo; a ella se debe el
color rojo intenso de los eritrocitos. Se han descubierto ms de cien hemoglobinas humanas
distintas, entre ellas la hemoglobina S, causante de la anemia de clulas falciformes.
Las protenas fibrosas tienen formas alargadas en forma de hilos o filamentos, muchas veces
estn asociadas varias cadenas polipeptdicas formando un haz, generalmente son protenas
insolubles en agua y presentan diversos grados de elasticidad, por ejemplo el colgeno, la
queratina (protenas de las uas, pelos, plumas, cuernos, lana) el cartlago, el tejido conectivo,
etc.
III. por su funcin biolgica las protenas pueden ser: protenas estructurales, enzimas, hormonas,
toxinas, protenas de defensa o anticuerpos, protenas de transporte, protenas de la visin, etc.
Las protenas estructurales forman parte de la estructura de tejidos como los msculos,
tendones, como la actina, miosina, el colgeno, tejidos conectivos y protenas de las
membranas celulares, tambin se incluyen las queratinas.
Las enzimas son protenas biolgicamente activas, participan en la biosntesis de todos los
metabolitos, se hallan en gran cantidad en los jugos digestivos donde participan en la
degradacin de los alimentos, por ejemplo la pepsina, tripsina, renina, etc.
Las protenas de defensa forman parte de los anticuerpos que se encuentran en la fraccin
gamaglobulnica de la sangre y los interferones que actan protegiendo al cuerpo contra el
ataque o invasin de clulas extraas, parsito o virus extraos.
Las protenas de transporte, son protenas encargadas de trasladar alguna sustancia usando
como vehculo la sangre, por ejemplo la hemoglobina se encarga del transporte de oxgeno, en
las membranas hay protenas de transporte transmembrnicos, hay otras protenas encargadas
de trasladar vitaminas, hormonas, etc.
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a) Una vez que se han roto y separados los puentes disulfuro y purificado las cadenas individuales de
los polipptidos se debe determinar la secuencia y cantidad de aminocidos, para conocer la
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Normalmente se usa una estrategia general de fraccionar la cadena polipeptdica de las protenas
grandes en fragmentos pequeos y luego analizar su secuencia, para ellos se usan endopeptidasas las
cuales tienen cierta tendencia a romper enlaces peptdicos especficos, por ejemplo la tripsina rompe
los enlaces peptdicos de aminocidos bsicos como la Lisina y arginina; la quimotripsina rompe los
enlaces peptdicos de aminocidos aromticos fenilalanina, tirosina y triptfano. Otra alternativa mas
bien complementaria utiliza un agente qumico, por ejemplo el bromuro de ciangeno (Br-CN) rompe
especficamente el enlace peptdico de la metionina, luego teniendo los diversos fragmentos se
compara la continuidad de la secuencia por recoleccin y comparacin de los fragmentos obteniendose
la informacin completa de la secuencia total del pptido.
Otra alternativa para la determinacin de los amniocidos del extremo N-terminal es el mtodo de
Sanger, donde el pptido se trata con 2,4-dinitrofluorobenceno (Reactivo de Sanger) y luego se
hidroliza con HCl 6M, el derivado del 2,4-dinitrofenilo y se detectan por cromatografa o
espectroscopa ya que absorben luz visible y tiene un intenso color amarillo.
Tambin se suele utilizar el cloruro de dnsilo (cloruro de 5-dimetilaminonaftalen-1-sulfnico), que
reacciona selectivamente con los grupos amino terminales y los grupos -aminos, los derivados
arilsulfnicos son muy estables a la hidrlisis cida y tiene fluorescencias a la luz ultravioleta, por lo
que su deteccin es muy sensible.
El empleo de la aminopeptidasa, que es una exopeptidasa natural especfica que hidroliza los enlaces
peptdicos de los aminocidos aminoterminales, es muy conveniente, sin embargo tiene la dificultad de
que despus de roto el primer aminocido N-terminal, continua hidrolizando el siguiente y as
sucesivamente, por lo que se prefieren los mtodos qumicos.
Por ejemplo en la determinacin de la secuencia del siguiente pptido:
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No hay un mtodo eficiente para el anlisis de la secuencia de aminocidos de un pptido a partir del
extremo C-terminal, sin embargo existen mtodos que emplean exopeptidasas como la cabopeptidas
que rompe el enlace peptdico en el extremo C, los productos son el aminocido libre y un pptido mas
corto, pero como la reaccin es continua no se puede detener y continua hasta la hidrlisis total.
Tambin se suele emplear hidracina para detectar el extremo terminal, ya que la hidracina con el
pptido reacciona con el grupo carbonilo de cada enlace peptdico que luego se rompe fromando
derivados acilados de la hidracina (hidracidas de acilo) excepto en aminocido C terminal que se
recupera como aminocido libre.
2. Estructura Secundaria
Las cadenas de polipeptdica de una protena no se halla estirada, presenta dobleces normales de
acuerdo al enlace entre elementos, tipo de orbitales empleados en el enlace, y adopcin de una
geometra espacial para disminuir la interaccin estrica entre grupos hidrofbicos o estableces
interaccin por atracciones de dipolos, puentes de hidrgeno, etc, y estabilizar la cadena.
En general el enlace peptdico es rgido y no permite rotacin, por el carcter doble enlace que tiene,
estabilizado por el fenmeno de resonancia y tautomera, la longitud el enlace peptdico CN es de
1,32, intermedio entre el simple C-N de 1,47 y el doble C=N 1,21; sin embargo los enlaces N-C
y presentes en el patrn normal de la cadena polipeptdica permiten rotacin para estabilizacin de la
cadena o permitir interaccin entre grupos con cargas elctricas.
En general se pueden observar los siguientes patrones regulares:
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1. Los cuatro tomos vecinos, alrededor del enlace peptdico se hallan sobre un mismo plano
2. Los dipolos de enlace C=O y NH, se hallan en direcciones opuestas, con relacin al enlace
peptdico, esta orientacin se llama alineamiento trans de los dipolos, adems las cadenas R y los
tomos de C en dos aminocidos adyacentes tambin tienen orientacin trans.
3. El enlace peptdico es rgido, no permite rotacin, los enlaces N-C y R-CC permiten rotacin
en direccin de la estabilizacin de la de la cadena, los ngulos de rotacin del enlace N-C se
designa como y la rotacin del enlace R-CC se designa como , los valores normales de
estas rotaciones y los ngulos de enlace alrededor del enlace peptdico se muestran en el
diagrama siguiente:
Las orientaciones regulares adoptadas por las cadenas polipeptdicas como resultado del patrn de
rotacin y en torno a los enlaces adyacentes al enlace peptdico, las orientaciones regulares
observadas son: la estructura helicoidal (-helice dextrogira), la estructura laminar (paralela y
antiparalela) y la conformacin aleatoria al azar.
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Estructura Helicoidal
Es un ordenamiento regular adoptado por los poli L-aminoicidos, que consiste en un enrollamiento
helicoidal dextrgiro el los cuales = -60 y = -57, este enrollamiento a lo largo de un eje conduce
a una conformacin muy estable con las siguientes caractersticas:
Cada vuelta de la hlice consta de 3,6 restos de aminocidos, con una pendiente ascendente de
26, la longitud o paso por vuelta es de 0,54 nm. (5,4 )
Las cadenas laterales R se hallan orientados hacia afuera de la hlice, perpendiculares al eje
central del helicoide.
Los dipolos de los grupos carbonilo C=O del aminocido n y el H polarizado del grupo amino
N-H del aminocido n+4, se orientan de tal modo que permiten la interaccin mxima mediante
establecimiento de enlaces de puente de hidrgeno intracatenarios, dando a la cadena
polipeptdica una gran estabilidad.
Como los dipolos de los grupos carbonilos y aminos se hallan estableciendo enlaces de puente
de hidrgeno interno, entonces solamente queda disponible los grupos polares de las cadenas R,
por lo tanto lo mas probable es que las protenas que tengan alto contenido de estructura
helicoidal sea hidrfoba, insoluble en agua.
Los aminocidos que promueven la formacin de -hlices son: los aminocidos con cadenas
R apolares o poco polares no ionizables como: alanina, valina, leucina, fenilalanina, triptfano,
tirosina, cisteina, metionina, histidina, asparragina, glutamina, sin embargo los aminocidos
que evitan e interrumpen la orientacin helicoidal son: la prolina cuya estructura cclica provoca
una doblez natural, la presencia de aminocidos con grupos polares con carga elctrica (+) de Lis
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o Arg, que establecen atracciones electrostticas con los grupos polares con carga (-) de cido
glutmico, cido asprtico, serina o treonina.
El porcentaje de hlices de las protenas globulares es variable desde 0% hasta 90%, las
protenas fibrosas pueden tener el 100% de estructura helicoidal, por ejemplo el colageno, la
fibrona, etc.
Estructuras laminares
Las cadenas polipeptdicas tambin pueden formar arreglos ordenados de puentes de hidrgeno entre
cadenas alinendose una al lado de la otra, en esta disposicin cada grupo carbonilo de una cadena
forma un enlace de puente de hidrgeno con el H del grupo imino de la otra cadena adyacente, este
arreglo puede comprender muchas cadenas de proteinas alineadas lado a lado, originando una hoja
bidimensional, en esta estructura llamada laminar los ngulos de rotacin de los enlaces en las
cadenas de los aminocidos son tales que la hoja est plegada o plisada y los grupos laterales R de los
aminocidos se hallan en lados alternos de la hoja.
Esta conformacin puede ser itracatenaria (sobre todo en proteinas globulares) o intercatenaria (en
proteinas fibrosas), en las estructuras intercatenarias si estn alineadas en la misma direccin se
llaman alineacin paralela o lmina paralela, en cuyo caso = -119 y = 113. Si su alineacin es
en sentido contrario entonces se llama alineacin antiparalela o lmina antiparalela = -140 y =
135, aunque las dos disposiciones son frecuentes, la alineacin antiparalela es mas estable por que los
dipolos de los grupos carbonilos e iminos estn orientados para una interaccin ptima.
Estructuras Aleatorias
Cuando la cadena polipeptdica carece de un arreglo o patrn geomtrico repetitivo se dice que su
conformacin es aleatoria al azar, es decir un segmento no helicoidal o no laminar de una protena se
considera aleatorio, y est condicionado por los siguientes factores:
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la asociacin de dos o mas cadenas polipeptdicas, iguales o diferentes, que interactan a travs de
enlaces no covalentes se refiere a la estructura cuaternaria de las protenas, no es una propiedad comn
de todas las protenas, esta estructura muestran algunas clases de protenas, por ejemplo las
hemoglobinas que estn formados por cuatro fracciones similares a la mioglobina (homotetramrica)
dos y dos ,. Cada una de ellas con un peso molecular aproximado de 16000 Daltons.
Las diferentes orientaciones en el espacio de las subunidades les confiere propiedades diferentes en
relacin con el oligmero y permite a las protenas multimricas desempear papeles peculiares en la
regin intracelular.
Algunas protenas globulares y sus caractersticas inmediatas se muestran en la tabla 3.5.
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