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Las micrografas electrnicas del ADN antiparalelo de doble hebra en replicacin sugieren que el proceso
se lleva a cabo en un (o dos) horquillas de replicacin. Se saba que la ADN polimerasa slo puede
extender las hlices en direccin 5 3 Entonces cmo se replica la cadena?
En 1968, Reiji Okazaki realiz el siguiente experimento:
Coloc clulas de Escherichia coli durante 30 segundos en un medio que contena 3H Timina;
posteriormente, centrifug las clulas en un medio bsico y obtuvo fragmentos de cidos nucleicos de 7 y
11S (Svedvergs, unidades de densidad), lo que significaba que contenan entre 1X10 3 y 2X103 nucletidos.
Despus verifico el efecto del tiempo en la incubacin y encontr que el tamao de los fragmentos era
proporcional al tiempo, a estos fragmentos se les denomina fragmentos de Okazaki.
Okazaki interpret la presencia de estos fragmentos en trminos de la replicacin semidiscontinua:
del
La ADN polimerasa III es incapaz de iniciar la sntesis por s sola, para esto necesita un cebador (ARN) que es
sintetizado por una ARN polimerasa (=primasa). Este cebador es eliminado posteriormente.
3 etapa: correccin de errores.
El enzima principal que acta como comadrona (R. Shapiro) es la ADN polimerasa III, que corrige todos los errores
cometidos en la replicacin o duplicacin. Intervienen otros enzimas como:
* Endonucleasas que cortan el segmento errneo.
* ADN polimerasas I que rellenan correctamente el hueco.
* ADN ligasas que unen los extremos corregidos
Intervienen enzimas similares a los que actuan en las clulas procariontes y otros enzimas que han de duplicar las
histonas que forman parte de los nucleosomas. Los nucleosomas viejos permanecen en la hebra conductora.
LA REPLICACIN
Replicacin semiconservativa
.
FUNCIONES QUE DEBE CUMPLIR EL CROMOSOMA: SIGNIFICADO GENTICO DE LA
REPLICACIN
Las principales funciones que debe cumplir un cromosoma son la de replicarse (producir copias de si
mismo), la de transmitirse de una clula a otra y de una generacin a la siguiente y la de expresar la
informacin que contiene.
Bacteria
Bacteria dividindose
Bacterias descendientes
Conservativo
Dispersivo
fuente de Nitrgeno N15. Durante estas 14 generaciones el ADN de las bacterias las bacterias se haba
sintetizado con bases nitrogenadas con Nitrgeno pesado (N15). Posteriormente, comprobaron que podan
distinguir el ADN del las bacterias que crecan en un medio normal (con N14) del ADN de las bacterias que
haban crecido durante 14 generaciones en N15. Para ello extrajeron el ADN de ambos tipos de bacterias y
lo centrifugaron en un gradiente de densidad de CsCl. El resultado fue que la densidad del ADN de las
bacterias que haban crecido en presencia de N15 era mayor que el ADN de las bacterias que haban
crecido con N14. Una vez comprobado que eran capaces de distinguir el ADN de ambos tipos de bacterias,
continuaron el experimento de la siguiente forma: Las bacterias que haban estado creciendo en Nitrgeno
pesado (N15) las pasaron a un medio de cultivo que contena N14 (Nitrgeno normal) y a distintos tiempos,
media generacin, una generacin, dos generaciones, tres generaciones de replicacin, tomaban una
muestra del cultivo bacteriano, extraan el ADN y centrifugaban en gradiente de densidad de CsCl.
correspondiente al ADN N14 y otra de densidad intermedia (N14-15) entre la del ADN N14 y el ADN N15. La
cantidad de ADN que contena la banda correspondiente al ADN N14 era tres veces mayor que la
encontrada en la banda de densidad intermedia (N14-15), proporcin (3:1).
Los resultados obtenidos por Meselson y Stahl (1958) se ajustaban a un modelo de replicacin
semiconservativo. Para asegurarse, aislaron la banda de ADN de densidad intermedia (N14-15) obtenida a
partir de las bacterias que llevaban una generacin en N14, desnaturalizaron el ADN de la banda mediante
calor para separar sus dos hlices y, mantenindolas desnaturalizadas, centrifugaron en CsCl. Si la
replicacin de E. coli se ajustaba al modelo semiconservativo, una de las hlices debera estar construida
con N15 (la vieja) y la otra hlice con N14 (la nueva) y, al centrifugar en gradiente de densidad esperaramos
obtener dos bandas una ms densa correspondiente a la hlice construida con N15 y otra menos densa
sintetizada con N14. El resultado obtenido por Meselson y Stahl (1958) fue precisamente el esperado para
una replicacin semiconservativa.
Si la replicacin del ADN de E. coli se ajustar al modelo Conservativo al centrifugar el ADN de las
bacterias despus de un generacin en medio con N14, hubieran obtenido dos bandas una de densidad
correspondiente al N14 y otra de densidad correspondiente al N15. Nunca habran observado, en este caso,
una banda de ADN de densidad intermedia (N14-15).
Cairns (1963) interpret que el cromosoma de E. coli era circular, que se replicada de modo
semiconservativo, que exista un punto de inicio de la replicacin, un origen, y un punto de crecimiento
(PC). Sin embargo, esta interpretacin fue errnea, ya que en E. coli existe un solo punto de iniciacin de la
Replicacin (Ori C) pero existen dos puntos de crecimiento (PC), ya que la replicacin en E. coli, como
veremos ms adelante es bidireccional.
J. Cairns
Despus la citocinesis reparte el material citoplasmtico y aparecen dos clulas hijas idnticas. La
citocinesis en clulas vegetales se produce por coalescencia de vesculas del aparto de Golgi que dan
lugar al fragmoplasto figura en forma de tonel que adquiere el huso acromtico, al ser empujadas sus fibras
hacia fuera, el crecimiento de dicho tabique se produce del interior hacia el exterior de la clula. En las
clulas animales la citocinesis tiene lugar por estrangulamiento de fuera hacia dentro.
Fases del ciclo celular : meristemo radicular de cebolla
Interfase
Profase
Metafase
Anafase Temprana
Anafase Tarda
Telofase temprana
Telofase tarda
Dos clulas
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La explicacin que dieron a estos resultados fue que el cromatidio se comportaba como si fuera una doble
hlice de ADN y que se replicaba de forma semiconservativa. Para poder distinguir las clulas del
meristemo radicular de Vicia faba de la 1 Metafase mittica de las clulas de la 2 Metafase mittica,
trataron las raices con colchicina durante la primera divisin mittica. La colchicina inhibe la formacin de
las fibras del huso acromtico y, como consecuencia, se impide la anafase o separacin de los cromatidos
hermanos a polos opuestos apareciendo clulas con doble cantidad de cromosoma (poliploides). Por tanto,
las clulas de la 2 Metafase tenan doble nmero de cromosomas que las clulas de la 1 Metafase.
El siguiente esquema pone de manifiesto que si se supone que el cromatidio es una doble hlice de ADN
que se replica de forma semiconservativa, se obtienen los resultados observador por Taylor y
colaboradores, es decir, todos los cromosomas de la clula estn marcados en sus dos cromatidios en la 1
Metafase y todos los cromosomas de la clula estn marcados en un solo cromatidio en la 2 Metafase.
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Existen mtodos de tincin ms recientes que permiten comprobar sin necesidad de realizar un marcaje
radiactivo que la replicacin de los cromatidios se ajusta al modelo semiconservativo. Las clulas pasan por
dos periodos de sntesis sucesivos en presencia de bromodesoxiuridina (BUdR). Posteriormente se tien
los cromosomas con Giemsa y con un colorante fluorescente. La bromodesoxiuridina es un anlogo de la
Timina y la sustituye durante la replicacin. Los cromatidios constituidos por dos cadenas con BUdR se
tien de color ms claro que los cromatidios que tienen una hlice original y otra con BUdR que se tien de
color oscuro. Este tipo de tincin origina los que se denomina cromosomas en arlequn, y es especialmente
adecuado para distinguir intercambios entre cromtidas hermanas.
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El origen de replicacin en E. coli es una secuencia de 245 pb que contiene una secuencia de 13 pb
repetida tres veces en tndem. Adems esta regin contiene cuatro zonas de unin a la protena Dna A que
se encarga de separar las hlices para comenzar la replicacin.
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Cuando las molculas de ADN circular se replican se observan lo que se denominan "ojos o burbujas" de
replicacin. La forma que adoptan los intermediarios de la replicacin se parece a de la letra griega .
Burbuja
Forma
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Para demostrar que la replicacin es bidireccional se pueden realizar experimentos que se denominan de
pulso y caza, en los que la clula es expuesta durante un breve periodo de tiempo en un medio con timidina
tritiada TH3 (pulso) y despus se pasa a un medio con timidina no radiactiva (fra) en exceso (caza).
Posteriormente se extiende el ADN se un portaobjetos y despus se realiza una autorradiografa.
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como molde ADN. Todos los fragmentos de Okazaki comienzan por un Cebador. Posteriormente, la
Holoenzima de ADN polimerasa III lleva a cabo la sntesis del fragmento de ADN correspondiente hasta
llegar al siguiente cebador. En ese momento, la ADN polimerasa I sustituye a la Holoenzima de ADN
polimerasa III. La ADN polimerasa I se encarga de retirar el ARN cebador mediante su actividad
exonuetdica 5'P - 3' OH y al mismo tiempo rellena el hueco sintetizando ADN.
Por ltimo, los dos fragmentos de Okazaki tienen que unirse, es necesario enlazar el extremo 3'OH de un
fragmento con el 5'P del siguiente fragmento. Dicha labor de sellado y unin de los sucesivos fragmentos la
realiza la Ligasa.
CRCULO RODADOR
Los mecanismos de replicacin en virus y bacterias dependen de la propia estructura del material
hereditario o cromosoma de la especie procarionte estudiada. Por tanto, el mecanismo de replicacin vara
segn se trata de molculas de ADN circulares doble hlice (E. coli, parvovirus), ADN circular de una hlice
(fX174), ADN doble hlice lineal con redundancia Terminal (fago T7) o ADN doble hlice lineal con extremos
cohesivos (fago l). El mecanismo de replicacin puede adoptar la forma q (E. coli, plasmidios), el modelo
del circulo rodador (fX174, Fago l) o el Lazo de desplazamiento o lazo D (ADN mitocondrial).
En el modelo del crculo rodador una endonucleasa corta una de las hlices (hlice externa en el esquema)
y el extremo 5' se fija a la membrana. El extremo 3'OH producido por el corte lo utiliza la ADN polimerasa
como cebador para ir aadiendo nucletidos y copiando la otra hlice (hlice interna en el esquema). Por el
otro extremo de la hlice cortada (el extremo 5') tambin se va sintetizando una nueva hebra. Lo que se
supone que sucede es que la hlice interna girara de forma continua en el sentido indicado haciendo que
cada vez saliera ms cantidad de la hlice inicialmente cortada por la endonucleasa. La hlice interna
seguira dando vueltas de forma que sera copiada varias veces al igual que la hlice que emerge por el
lado derecho, formndose una molcula ADN doble hlice muy larga que contienen varias copias sucesivas
del ADN del fago. Estas molculas reciben el nombre de multmeros o concatmeros. El caso del fago l,
posteriormente una endonucleasa denominada ter reconoce la secuencia de doce pares de bases de los
extremos cohesivos del fago y produce un corte asimtrico para liberar copias independientes del ADN
doble hlice lineal del fago.
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Circulo rodador
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Algunos virus resuelven este problema de una manera sencilla. Por ejemplo, el fago l cuyo material
hereditario es ADN doble hlice lineal con extremos cohesivos, lo primero que hace cuando infecta a E. coli
y va a replicar su ADN es convertirse en ADN doble hlice circular a travs de los extremos cohesivos. De
este manera, ya han desaparecido los problemas de replicacin de los extremos lineales.
Otros virus, como los Adenovirus resuelven el problema gracias a la existencia de una protena que se une
al extremo 5' y que contiene un residuo de serina unido a un nucletido CTP que suministra el extremo 3'
necesario para que la ADN polimerasa pueda cebarse y copiar el extremo. La protena que forma un
complejo con la ADN polimerasa tiene 80 Kd, sin embargo, la protena que aparece en el interior de las
partculas virales maduras tiene solamente 55 Kd. Por tanto, durante la maduracin del virus debe ser
procesada y pasar de 80 Kd a 55 Kd. El virus f29 tambin tiene protenas unidas al extremo 5' implicadas
en la replicacin y algunos virus ARN como el virus de la polio poseen protenas de bajo peso molecular
(Vpg) con solo 22 aminocidos estn unidas al extremo 5' .
Un enzima denominado Telomerasa aade estas secuencias a los extremos cromosmicos. La Telomerasa
lleva una corta secuencia de ARN (por ejemplo AACCCC) que sirve de molde para sintetiza la secuencia
repetida de los extremos (TTGGGG). La telomerasa, es una transcriptasa inversa, ya que tomando como
molde ARN sintetiza ADN. La adicin de estas secuencias cortas que lleva a cabo la Telomerasa
contrarresta la tendencia al acortamiento de los telmeros durante la replicacin normal.
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Polimerizacin o sntesis del ADN: seleccin de los dNTPs complementarios a las de la cadena
molde y formacin del enlace fosfodister entre el extremo 3' del nucletido (dNTP) anteriormente
incorporado y el extremo 5'P del siguiente dNTP.
Las ADN Polimerasas de E. coli solamente saben sintetizar (polimerizar) ADN en la direccin 5'P - 3'OH.
Las principales caractersticas de las ADN Polimerasas de E.coli, se pueden resumir en la siguiente tabla:
ADN Pol I
ADN Pol II
109.000
90.000
900.000
Monmero
Monmero
Multmero asimtrico
400
Desconocido
10-20
SI
SI
SI
Exonucleasa 3'-5'/Correctora
SI
SI
SI
Exonucleasa 5'-3'/Reparacin
SI
NO
NO
Estructura
PM (dalton)
Constitucin
N Polimerasas/clula
Actividad/Funcin
La ADN Pol III y la ADN Pol I son las enzimas que intervienen directamente en la replicacin del ADN de E.
coli. La ADN Pol I tiene un papel reparador, retira los cebadores con su actividad exonucleasa 5'- 3' y
rellena el hueco con su actividad polimerasa 5'- 3'.
A la ADN Pol II se la asigna exclusivamente una funcin reparadora, pero la muchas de sus caractersticas
y el papel que juega en la replicacin del ADN, si es que juega alguno, son desconocidas.
La ADN Pol III es la enzima que realiza la mayora de la replicacin del ADN, el corazn cataltico del
enzima lo constituyen las subunidades a (encargada de la polimerizacin), e (realiza la funcin correctora
de pruebas) y q (ensamblaje de las subunidades?). Realmente, el complejo enzimtico que lleva a cabo la
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replicacin es un multmero denominado Holoenzima de ADN Pol III que posee muchas cadenas o
subunidades polipeptdicas. Este multmero es realmente un dmero asimtrico, una mitad del dmero se
encarga de sintetizar la hlice retardada y la otra mitad sintetiza la hlice conductora. La subunidad t
interviene en la unin del dmero, el complejo g-d produce la unin al ADN molde y la subunidad b sujeta el
enzima al ADN.
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En el siguiente esquema se indica como la subunidad e de la ADN Pol III retira la Adenina introducida de
forma incorrecta mediante la funcin exonucleasa 3' - 5'.
FUNCIN
ADN Pol
ADN Pol
ADN Pol
ADN Pol
ADN Pol
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mitocondrial es diferente a la del cromosoma de E. coli, existen dos orgenes de replicacin diferentes para
cada hlice y la replicacin es unidireccional.
ADN mitocondrial
Helicasas: son enzimas que rompen los puentes de hidrgeno que mantienen unidas las dos
cadenas de la doble hlice. Entre las helicasas de E. coli se encuentran las protenas Dna B y Rep.
La protena Rep parece ayudar a desenrollar la doble hlice por delante de la polimerasa.
La protena SSB: se une al ADN de hlice sencilla y lo estabiliza retrasando la regeneracin de la
doble hlice.
La accin de las Helicasas durante la replicacin genera retorcimientos que deben ser eliminados. El ADN
circular puede sufrir enrollamientos y retorcimientos, dichos superenrollamientos se generan y eliminan por
enzimas denominadas Topoisomerasas.
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Autor: Csar Benito Jimnez, Profesor Titular de Gentica, Departamento de Gentica, U.C.M.
Comit asesor de
publicaciones.
Facultad de
Medicina, UNAM
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