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CIDO DESOXIRRIBONUCLEICO.
Profesor:
Dr. Hctor C.
Bachiller:
Karelis Gonzlez.
Diciembre 2014.
cido Desoxirribonucleico.
El cido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un cido
nucleico que contiene instrucciones genticas usadas en el desarrollo y
funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus,
y es responsable de su transmisin hereditaria. La funcin principal de la
molcula de ADN es el almacenamiento a largo plazo de informacin.
Muchas veces, el ADN es comparado con un plano o una receta, o
un cdigo, ya que contiene las instrucciones necesarias para construir
otros componentes de las clulas, como las protenas y las molculas de
ARN. Los segmentos de ADN que llevan esta informacin gentica son
llamados genes, pero las otras secuencias de ADN tienen propsitos
estructurales o toman parte en la regulacin del uso de esta informacin
gentica.
Desde el punto de vista qumico, el ADN es un polmero de nucletidos,
es decir, un polinucletido. Un polmero es un compuesto formado por
muchas unidades simples conectadas entre s, como si fuera un
largo tren formado por vagones. En el ADN, cada vagn es
un nucletido, y cada nucletido, a su vez, est formado por un azcar
(la
desoxirribosa),
una base
nitrogenada (que
puede
ser adeninaA, timinaT, citosinaC o guaninaG) y un grupo
fosfato que acta como enganche de cada vagn con el siguiente. Lo
que distingue a un vagn (nucletido) de otro es, entonces, la base
nitrogenada, y por ello la secuencia del ADN se especifica nombrando
slo la secuencia de sus bases. La disposicin secuencial de estas
cuatro bases a lo largo de la cadena (el ordenamiento de los cuatro tipos
de vagones a lo largo de todo el tren) es la que codifica la informacin
gentica:
por
ejemplo,
una
secuencia
de
ADN
puede
ser ATGCTAGATCGC... En los organismos vivos, el ADN se presenta
como una doble cadena de nucletidos, en la que las dos hebras estn
unidas entre s por unas conexiones denominadas puentes de
hidrgeno.
Para que la informacin que contiene el ADN pueda ser utilizada por la
maquinaria celular, debe copiarse en primer lugar en unos trenes de
nucletidos, ms cortos y con unas unidades diferentes, llamados ARN.
Las molculas de ARN se copian exactamente del ADN mediante un
cido fosfrico:
Su frmula qumica es H3PO4. Cada nucletido puede contener uno
(monofosfato: AMP), dos (difosfato: ADP) o tres (trifosfato:ATP) grupos
de cido fosfrico, aunque como monmeros constituyentes de
los cidos nucleicos slo aparecen en forma de nuclesidos
monofosfato.
Desoxirribosa:
Es un monosacrido de 5 tomos de carbono (una pentosa) derivado de
la ribosa, que forma parte de la estructura de nucletidos del ADN. Su
frmula es C5H10O4. Una de las principales diferencias entre el ADN y
el ARN es el azcar, pues en el ARN la 2-desoxirribosa del ADN es
reemplazada por una pentosa alternativa, la ribosa.25
nucleicos.
Otra
de
sus
caractersticas
es
que
presentan tautomera o isomera de grupos funcionales, debido a que un
tomo de hidrgeno unido a otro tomo puede migrar a una posicin
vecina; en las bases nitrogenadas se dan dos tipos de tautomeras:
tautomera lactama-lactima, donde el hidrgeno migra del nitrgeno
al oxgeno del grupo oxo (forma lactama) y viceversa (forma lactima), y
tautomera imina-amina primaria, donde el hidrgeno puede estar
formando el grupo amina (forma amina primaria) o migrar al nitrgeno
adyacente (forma imina). La adenina slo puede presentar tautomera
amina-imina, la timina y el uracilo muestran tautomera doble lactamalactima, y la guanina y citosina pueden presentar ambas. Por otro lado, y
aunque se trate de molculas apolares, las bases nitrogenadas
presentan suficiente carcter polar como para establecer puentes de
hidrgeno, ya que tienen tomos muy electronegativos (nitrgeno y
oxgeno) que presentan carga parcial negativa, y tomos de hidrgeno
con carga parcial positiva, de manera que se forman dipolos que
permiten que se formen estos enlaces dbiles.
Se estima que el genoma humano haploide tiene alrededor de 3000
millones de pares de bases. Para indicar el tamao de las molculas de
ADN se indica el nmero de pares de bases, y como derivados hay dos
unidades de medida muy utilizadas, la kilobase (kb), que equivale a 1000
pares de bases, y la megabase (Mb), que equivale a un milln de pares
de bases.
Apareamiento de bases
La dble hlice de ADN se mantiene estable mediante la formacin
de puentes de hidrgeno entre las bases asociadas a cada una de las
dos hebras. Para la formacin de un enlace de hidrgeno una de las
bases debe presentar un "donador" de hidrgenos con un tomo de
hidrgeno con carga parcial positiva (-NH 2 o -NH) y la otra base debe
presentar un grupo "aceptor" de hidrgenos con un tomo
cargado electronegativamente (C=O o N). Los puentes de hidrgeno son
uniones ms dbiles que los tpicos enlaces qumicos covalentes, como
los que conectan los tomos en cada hebra de ADN, pero ms fuertes
que interacciones hidrfobas individuales, enlaces de Van der Waals,
etc. Como los puentes de hidrgeno no son enlaces covalentes, pueden
romperse y formarse de nuevo de forma relativamente sencilla. Por esta
razn, las dos hebras de la doble hlice pueden separarse como una
cremallera, bien por fuerza mecnica o por alta temperatura.28 La doble
hlice se estabiliza adems por el efecto hidrofbico y el apilamiento,
que no se ven influidos por la secuencia de bases del ADN. 29
Cada tipo de base en una hebra forma un enlace nicamente con un tipo
de base en la otra hebra, lo que se denomina complementariedad de las
bases. As, las purinas forman enlaces con las pirimidinas, de forma que
A se enlaza slo con T, y C slo con G. La organizacin de dos
nucletidos apareados a lo largo de la doble hlice se
denomina apareamiento de bases. Este emparejamiento corresponde a
la observacin ya realizada por Erwin Chargaff (1905-2002),30 que
mostr que la cantidad de adenina era muy similar a la cantidad de
timina, y que la cantidad de citosina era igual a la cantidad de guanina
en el ADN. Como resultado de esta complementariedad, toda la
informacin contenida en la secuencia de doble hebra de la hlice de
ADN est duplicada en cada hebra, lo cual es fundamental durante el
proceso de replicacin del ADN. En efecto, esta interaccin reversible y
especfica entre pares de bases complementarias es crtica para todas
las funciones del ADN en los organismos vivos.
Como se ha indicado anteriormente, los dos tipos de pares de bases
forman un nmero diferente de enlaces de hidrgeno: A=T forman dos
puentes de hidrgeno, y CG forman tres puentes de hidrgeno (ver
imgenes). El par de bases GC es por tanto ms fuerte que el par de
bases AT. Como consecuencia, tanto el porcentaje de pares de bases
GC como la longitud total de la doble hlice de ADN determinan la fuerza
de la asociacin entre las dos hebras de ADN. Las dobles hlices largas
de ADN con alto contenido en GC tienen hebras que interaccionan ms
fuertemente que las dobles hlices cortas con alto contenido en AT.31 Por
esta razn, las zonas de la doble hlice de ADN que necesitan separarse
fcilmente tienden a tener un alto contenido en AT, como por ejemplo la
secuencia TATAAT de la caja de Pribnow de algunos promotores.32 En el
laboratorio, la fuerza de esta interaccin puede medirse buscando la
temperatura requerida para romper los puentes de hidrgeno,
la temperatura de fusin (tambin denominado valor Tm, del
ingls melting temperature). Cuando todas las pares de bases en una
doble hlice se funden, las hebras se separan en solucin en dos hebras
completamente independientes. Estas molculas de ADN de hebra
2.
Estructura primaria:
Secuencia de nucletidos encadenados. Es en estas
cadenas donde se encuentra la informacin gentica, y dado que el
esqueleto es el mismo para todos, la diferencia de la informacin
radica en la distinta secuencia de bases nitrogenadas. Esta
secuencia presenta un cdigo, que determina una informacin u
otra, segn el orden de las bases.
Estructura secundaria:
3.
La forma "A" es una espiral que gira hacia la derecha, ms amplia que la
"B", con una hendidura menor superficial y ms amplia, y una hendidura
mayor ms estrecha y profunda. La forma "A" ocurre en condiciones no
fisiolgicas en formas deshidratadas de ADN, mientras que en la clula
puede producirse en apareamientos hbridos de hebras ADN-ARN,
adems de en complejos enzima-ADN.38 39
Los segmentos de ADN en los que las bases han sido modificadas
por metilacin pueden sufrir cambios conformacionales mayores y
adoptar la forma "Z". En este caso, las hebras giran alrededor del eje de
la hlice en una espiral que gira a mano izquierda, lo opuesto a la forma
"B" ms frecuente.40 Estas estructuras poco frecuentes pueden ser
reconocidas por protenas especficas que se unen a ADN-Z y
posiblemente estn implicadas en la regulacin de la transcripcin.
Estructuras en cudruplex
En los extremos de los cromosomas lineales existen regiones
especializadas de ADN denominadas telmeros. La funcin principal de
estas regiones es permitir a la clula replicar los extremos cromosmicos
utilizando la enzima telomerasa, puesto que las enzimas que replican el
resto del ADN no pueden copiar los extremos 3' de los
cromosomas.43 Estas terminaciones cromosmicas especializadas
tambin protegen los extremos del ADN, y evitan que los sistemas de
reparacin del ADN en la clula los procesen como ADN daado que
debe ser corregido.44 En las clulas humanas, los telmeros son largas
zonas de ADN de hebra sencilla que contienen algunos miles de
repeticiones de una nica secuencia TTAGGG. 45
Estas secuencias ricas en guanina pueden estabilizar los extremos
cromosmicos mediante la formacin de estructuras de juegos apilados
de unidades de cuatro bases, en lugar de los pares de bases
encontrados normalmente en otras estructuras de ADN. En este caso,
cuatro bases guanina forman unidades con superficie plana que se
apilan una sobre otra, para formar una estructura cudruple-G
estable.46 Estas estructuras se estabilizan formando puentes de
hidrgeno entre los extremos de las bases y la quelatacin de un metal
inico en el centro de cada unidad de cuatro bases. 47 Tambin se
pueden formar otras estructuras, con el juego central de cuatro bases
producir
la
Desde este punto de vista, las obreras de este mecanismo son las
protenas. Estas pueden ser estructurales, como las protenas de
los msculos, cartlagos,
pelo,
etc.,
o funcionales,
como
la hemoglobina o las innumerables enzimas del organismo. La funcin
principal de la herencia es la especificacin de las protenas, siendo el
ADN una especie de plano o receta para producirlas. La mayor parte de
las veces la modificacin del ADN provocar una disfuncin proteica que
dar lugar a la aparicin de alguna enfermedad. Pero en determinadas
ocasiones, las modificaciones podrn provocar cambios beneficiosos
que darn lugar a individuos mejor adaptados a su entorno.
Las aproximadamente treinta mil protenas diferentes en el cuerpo
humano estn constituidas por veinte aminocidos diferentes, y una
molcula de ADN debe especificar la secuencia en que se unen dichos
aminocidos.
En el proceso de elaborar una protena, el ADN de un gen se lee y se
transcribe a ARN. Este ARN sirve como mensajero entre el ADN y
la maquinaria que elaborar las protenas y por eso recibe el nombre
de ARN mensajero o ARNm. El ARN mensajero sirve de molde a la
maquinaria que elabora las protenas, para que ensamble los
aminocidos en el orden preciso para armar la protena.
El dogma central de la biologa molecular estableca que el flujo de
actividad y de informacin era: ADN ARN protena. No obstante, en
la actualidad ha quedado demostrado que este "dogma" debe ser
ampliado, pues se han encontrado otros flujos de informacin: en
algunos organismos (virus de ARN) la informacin fluye de ARN a ADN;
este proceso se conoce como "transcripcin inversa o reversa", tambin
llamada "retrotranscripcin". Adems, se sabe que existen secuencias
de ADN que se transcriben a ARN y son funcionales como tales, sin
llegar a traducirse nunca a protena: son los ARN no codificantes, como
es el caso de los ARN interferentes.34 35
El ADN no codificante
El ADN del genoma de un organismo puede dividirse conceptualmente
en dos: el que codifica las protenas (los genes) y el que no codifica. En
muchas especies, slo una pequea fraccin del genoma codifica
protenas. Por ejemplo, slo alrededor del 1,5% del genoma humano
Como los ADN diana pueden encontrarse por todo el genoma del
organismo, los cambios en la actividad de un tipo de factor de
transcripcin pueden afectar a miles de genes. 96 En consecuencia, estas
protenas son frecuentemente las dianas de los procesos
de transduccin de seales que controlan las respuestas a cambios
ambientales o diferenciacin y desarrollo celular.
CONCLUSIONES
El ADN contiene la informacin gentica que permite a la mayora de los
organismos vivientes funcionar, crecer y reproducirse. Sin embargo, no
est claro durante cunto tiempo ha ejercido esta funcin en los ~3000
millones de aos de la historia de la vida, ya que se ha propuesto que
las formas de vida ms tempranas podran haber utilizado ARN como
material gentico. El ARN podra haber funcionado como la parte central
de un metabolismo primigenio, ya que puede transmitir informacin
gentica y simultneamente actuar como catalizador formando parte de
las ribozimas. Este antiguo Mundo de ARN donde los cidos nucleicos
funcionaran como catalizadores y como almacenes de informacin
gentica podra haber influido en la evolucin del cdigo gentico actual,
basado en cuatro nucletidos. Esto se debera a que el nmero de bases
nicas en un organismo es un compromiso entre un nmero pequeo de
bases (lo que aumentara la precisin de la replicacin) y un nmero
grande de bases (que a su vez aumentara la eficiencia cataltica de las
ribozimas).
La
investigacin
sobre
el ADN
tiene
un
impacto
significativo,
bioqumica
hacen
uso
intensivo
de