02/03/14

DC. CARLOS CORTS PENAGOS

Estructura de los cidos nucleicos

DNA y RNA como material gentico
Estructura del cromosoma

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Estructura de los cidos nucleicos

James Watson y Francis Crick publican en la revista

NATURE la elucidacin de la estructura molecular
de los cidos nucleicos, iniciando as, con la
denominada MOLECULARIZACION DE LA
BIOLOGIA.

Estructura de los cidos nucleicos

R N A a n d D N A a re p o l y m e r s o f
nucleotides. The backbone of the
polymer is a repeating chain of sugarphosphate-sugar-phosphate- etc.

http://www.dnalc.org/resources/3d/25-basepairing.html

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Estructura de los cidos nucleicos

NUCLEOSIDO

NUCLEOTIDO

Estructura de los cidos nucleicos

ADENINA

CITOSINA

GUANINA

URACILO

TIMINA

Cada cadena de DNA o RNA esta constituida de NUCLEOTIDOS. Estos son molculas
orgnicas compuestas por de un grupo fosfato, un monosacrido (ribosa o desoxiribosa) y
una de las bases nitrogenadas (A-T-G-C para el DNA y A-U-G-C para el RNA)

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Estructura de los cidos nucleicos

DNA

DNA

O
O

5'

Basen

3'

3'

O
O

O P O P O P
O

PPi

:B

O
O P O
O

O
5'

O
3'

dNTP

Base

5'

5'

Basen+1

Base

3'

HO

HO

En enlace que se forma entre dos nucleotidos ocurre a travs de uan reaccin de condensacin
donde el grupo 3OH de uno de ellos reacciona con el grupo fosfato ubicado en el C5 del
azucar. Este enlace covalente (fosfodiester) se denomina ENLACE NUCLEOTDICO.

Estructura de los cidos nucleicos

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

Los polmeros de nucleotido (POLINUCLETIDOS) tienen

una direccin determinada por los extremos 5 fosfato y
3OH (por convencin se escriben de 5 a 3).

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Estructura de los cidos nucleicos

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

1. Single stranded
2. Stem
3. Interior loop

4. Junction multiloop
5. Bulge loop
6. Hairpin loop

E. coli 16S rRNA

Estructura de los cidos nucleicos

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

La molcula de DNA presenta dos caractersticas

importantes: sus cadenas son COMPLEMENTARIAS
(interaccione entre las bases) y ANTIPARALELAS (posicin
de extremos 5 y 3).
http://www.dnalc.org/resources/3d/23-dna-unzip.html

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Estructura de los cidos nucleicos

La interaccin entre las dos cadenas que

conforman el DNA se da a travs de
enlaces por PUENTES DE HIDRGENOS
entre las bases (A-T y C-G).

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

Estructura de los cidos nucleicos

La molcula de DNA puede adquirir diferentes
estructuras, la mas comn es la doble hlice B.
Otras formas alternativa son: hlice A (11 pares de
bases en un giro completo) y hlice Z (12 pares de
bases en un giro completo y con direccin
izquierda)

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

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Estructura de los cidos nucleicos

Puentes de
Hidrgeno entre
las bases
complementarias

La estructura de hlice del DNA crea dos

surcos externos conocidos como SURCO
MAYOR y SURCO MENOR, ambos son sitios de
acceso a las las bases y son utilizados por
protenas asociadas con la replicacin y
transcripcin del DNA

MAJOR GROOVE

MINOR GROOVE

Estructura de los cidos nucleicos

PARTICULAS VIRALES

HUMANO

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Estructura de los cidos nucleicos

single stranded DNA

double stranded DNA

Bacteriofago T1

Estructura de los cidos nucleicos

positive single stranded RNA

double stranded RNA

negative single stranded RNA

Virus Mosaico del Tabaco

Virus Ebola

Rotavirus

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Estructura de los cidos nucleicos

Protena verde fluorescente

Aequorea victoria
TRANSFERENCIA DE MATERIAL GENETICO: ORGANISMOS TRANSGENICOS

Estructura de los cidos nucleicos

PRIMERA

CLULA

BACTERIANA

S I N T T I C A A U T O - R E P L I C A T I VA

Mycoplasma mycoides JCVI-syn1.0

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Genoma Humano

DECODIFICANDO LA MOLCULA DE DNA HUMANO

1.
2.
3.
4.
5.
6.

NUCLEOTIDOS
POLIMERO DE NUCLEOTIDOS DNA
GENES
CROMOSOMA
NUCLEO CELULAR CELULA
ORGANISMO HUMANO

Genoma Humano

DECODIFICANDO LA INFORMACION CONTENIDA EN EL DNA

T T T TG G A C C C T G A C A C T T G A A A C T C C C C T G A C A C T T G A C A T

10

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Genoma Humano

DECODIFICANDO LA INFORMACION CONTENIDA EN EL DNA

Enero 1990. Inicia el proyecto como un
esfuerzo conjunto del U.S. Department of
Energy y el National Institutes of Health.
Junio 2000. Se termina el primer borrador
del genoma humano.
Febrero 2001. Se publica el primer
anlisis del genoma humano (SCIENCE
NATURE)
Abril 2003. El HGP es declarado
terminado con la liberacin de la
secuancia completa

Genoma Humano

DECODIFICANDO LA INFORMACION CONTENIDA EN EL DNA

T T T TG G A C C C T G A C A C T T G A A
ACTCCCCTGACACTTGACAT
C C C C T G A TG G A C C C T G A C A C
C T G A C A T T T TG G A C G A C A T G A
CATGACACTTGACATCCCCT
G A TG G A C C C T G A C A C C T C C C
CTGCCCCTGCCCCTGGACG
El Genoma Humano contiene 3000 millones de
pares de bases.

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Genoma Humano

Colicorto gris o domstico

(Monodelphis domestica)

Li et al., 2011

Genoma Humano

La comparacin de secuencias genmicas o

genomas completos, permite establecer con
mayor precisin las RELACIONES FILOGENTICAS
entre organismos.
Eukaryota

Bacteria

Archaea

Haeckel 1874

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Genoma Humano

La molcula de DNA contenida en el ncleo de las clulas eucariotas es el MATERIAL

HEREDADO y representa la fuente de INFORMACIN que determina las funciones celulares.

Genoma Humano

El GENOMA es la suma de todo el DNA contenido en una clula. Las clulas somticas al
ser diploides contienen un genoma condensado en 23 pares de cromosomas.

13

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Genoma Humano

Genoma Humano

Genoma Humano

DNA
cadena molde

La INFORMACIN en el genoma
est determinada por la
posicin de los 4 diferentes
nucletidos en la cadena de
DNA. Parte de esta informacin
puedes ser interpretada por el
CODIGO GENETICO

TRANSCRIPCIN

RNAm
TRADUCCIN

Protena

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Genoma Humano

TRANSCRIPCION

CTGACACTTGAAACTCCCCTGA
CACCTTGAGAGAGACCCTGAC
TTGACAACTCCTCTGACCTGAG
ACCTCGATGATGATGATCTCGAC
TGACATGATGACAAAACTCTGC
CTACTGGATAGATAGATAGATAAC
TCCTGCCTGATAGACACATATATA
ACTCTGACCTGAGACCTGATGA
CCGATACGATACGATACGATAC
CTTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG

TRADUCCION
El 25% de la secuencia del DNA humano esta
relacionada con genes. Secuencias que
codifican para la sntesis de una PROTEINA. En
humanos se han identificado 25,000 genes
aproximadamente.

Genoma Humano

TRANSCRIPCION

CTGACACTTGAAACTCCCCTGA
CACCTTGAGAGAGACCCTGAC
TTGACAACTCCTCTGACCTGAG
ACCTCGATGATGATGATCTCGAC
TGACATGATGACAAAACTCTGC
CTACTGGATAGATAGATAGATAAC
TCCTGCCTGATAGACACATATATA
ACTCTGACCTGAGACCTGATGA
CCGATACGATACGATACGATAC
CTTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG

TRADUCCION
Los GENES en organismo EUCARIOTES se
encuentran interrumpidos por secuencias de
DNA no codificante denominadas INTRONES.
Las regiones codificantes de un gen se
denominan EXONES.

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Genoma Humano

DNA

Exon 2

Exon 1

Exon 3

Exon 4

Exon 5

RNA
Alternative Splicing
1

4 5

mRNA
Translation

Translation

Protein A

Protein B

Translation

Protein C

A schematic representation of alternative splicing. ALTERNATIVE SPLICING

refers to the process by which a given gene is spliced into more than
one type of mRNA molecule.

Genoma Humano

Bacteria

Segmento de
cromosoma

Levadura

Drosophila

Human

Note that prokaryotic bacteria lack introns. The human genome is about ten-fold larger than that of
Drosophila. However, humans do not have a substantially larger number of coding genes than
Drosophila: humans genes are more spread out in the chromosomes, and typically have a higher
proportion of introns.

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Genoma Humano

Genoma Humano

NUMERO DE CROMOSOMAS

NUMERO DE GENES

BASES NUCLEOTDICAS

23

26,185

3,079,843,747

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Genoma Humano

The figure provides a summary of the

different components of the human
genome. Less than 1.5% of the genome
consists of the suspected 20,00025,000
protein-coding sequences. By contrast, a
large majority is made up of non-coding
sequences such as introns (almost 26%)
and (mostly defunct) transposable
elements (nearly 45%).

http://www.dnalc.org/resources/3d/09-how-much-dna-codes-for-protein.html

Genoma Mitocondrial

Genoma Humano

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Genoma Mitocondrial

Nuclear DNA is inherited

from all ancestors

Mitochondrial DNA is inherited

from a single lineage
Human Sperm-Oocyte interaction

Because mitochondrial DNA is passed through the maternal line, from mother to child, it contains information
about a persons direct MATERNAL ANCESTORS (mother, mothers mother, etc.). Since it also passes from
generation to generation with very little change, mitochondrial DNA is a rich source of information for deep
ancestry, going back hundreds or thousands of years.

Genoma Mitocondrial

Con base en DNA mitocondrial heredado por la madre, los individuos pueden ser HOMOPLSMICOS si el DNA
mitocondrial de todas las clulas es idntico o HETEROPLSMICOS si hay mas de un tipo de DNA mitocondrial.
As la HERENCIA HETEROPLSMICA genera una dosis gnica que esta relacionada con defectos en el
funcionamiento de la mitocondria.

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Genoma Mitocondrial

Genoma Humano

Genoma Mitocondrial

La MITOCONDRIA es un organelo esencial para entender la

evolucin de las clulas eucariotas. Su origen ha sido
asociado con formas de vida procariota, lo que explicara la
presencia de una doble membrana y de material gentico en
forma de DNA circular.

Ancestral
photosynthetic
eukaryote

Ancestral
prokaryote
Ancestral
heterotrophic
eukaryote

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Genoma Mitocondrial

Caractersticas de mtDNA humano:

dsDNA
Circular/superenrrollado
No asociado a HISTONAS
Presente en multicopias
2 a 10 por mitocondria

1 clula humana contiene en promedio 1000 mitocondrias

Las mitocondrias representan el 40% del volumen de las
CLULAS DEL MSCULO CARDIACO

Genoma Mitocondrial

El genoma humano mitocondrial contiene 16,569 pares

de bases de DNA con informacin para
2 molculas de RNA ribosomal (rRNA)
22 RNA de transferencia (tRNA)
13 polipptidos
El mtDNA esta constituido de una cadena pesada (H)
rica en guanina y una cadena ligera (L) rica en
citosina. La cadena L contiene la informacin para 12
de los 13 polipptidos, 14 de los 22 tRNA y los dos rRNA.

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Genoma Mitocondrial

Esquema comparativo de los DNAs mitocondriales

de Humanos y Levaduras (S. cerevisiae)

Genoma Mitocondrial

Esquema comparativo de los DNAs mitocondriales

de Humanos y Levaduras (S. cerevisiae)

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Genoma Mitocondrial

Comparativo de la estructura del GENOMA

MITOCONDRIAL en diferentes organismos incluyendo al
Humano.

Genoma Mitocondrial

El mtDNA codifica para 7 subunidades del

complejo I, 1 subunidad del complejo III, 3
subunidades del complejo IV y dos
subunidades del complejo V. El complejo II
es codificado por el DNA nuclear.

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Genoma Mitocondrial

La nica regin no codificante dentro del mtDNA es un

segmento denominado D-loop que comprende
1121pb. Esta regin contiene el orgen de replicacin
para la cadena H y los promotores para ambas
cadenas (H y L).

Genoma Mitocondrial

D-Loop
Control Region
Central
conserved
region

HVS 2

HVS 1

La regin D-Loop tiene una tasa de mutacin mas alta

que el resto del mtDNA. La secuencia HVS1 de 360pb
presenta 240 variantes que van de 0 a 20pb. La
secuencia HVS2 de 268pb tiene 117 variantes de 0 a
10pb. Un conjunto de estas variantes representan un
HAPLOGRUPO.

24

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Genoma Mitocondrial

Variaciones en la secuencia HVS1 y HVS2 en

combinacin con otros cambios en la secuencia del
mtDNA han permitido generar 18 HAPLOGRUPOS y
algunos subgrupos.

Genoma Mitocondrial

Evolutionary tree of Human mitochondrial DNA (mtDNA) haplogroups

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Genoma Mitocondrial

mtDNA analyses provided our first genetic window into the past, detailing the history of maternal lineages across
human populations. The oldest mtDNA haplogroups are found in Africa (L1, L2 and L3). The pan-African haplogroup
L3 radiated to form MACROHAPLOGROUPS M and N. Haplogroups H, I, J, N1b, T, U, V, W and X are mainly
derived from macrohaplogroup N and make up almost all of the mtDNA types found in Europe. In Asia,
macrohaplogroups N and M radiated to generate mtDNA lineages A, B, C, D, F and G. Native Americans are known
to have Asian ancestry because only five haplogroups (A, B, C, D and X) encompass all of the mtDNA variation in
the New World, four of which came from Asia.

Genoma Mitocondrial

Testing your mtDNA uncovers the deep

ancestral origin of your direct maternal line
(your mother, your mothers mother, etc.)
and connects you with genetic cousins.
Because your mtDNA has been passed on
to you generation after generation by your
direct maternal ancestors, it offers the most
exact information possible for this line.

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Genoma Mitocondrial

Genealoga de la Familia Romanov

Tsar
Nicholas II

Tsarina
Alexandra

16111T
16357C
263G
3151C

16126C
16169T
16294T
16296T
73G
263G
3151C

Genoma Mitocondrial

Genealoga de la Familia Romanov

Tsar
Nicholas II

16357C

Tsarina
Alexandra

16111T
Anna Anderson supuesta
Anastasia Romanov

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Variaciones del Genoma

Genoma Humano

Variaciones del Genoma

El DNA de una clula humana contiene 3000

MILLONES DE NUCLETIDOS. La posicin de cada uno de
ellos es similar entre individuos en un 99.9%.

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Variaciones del Genoma

VARIACIONES DE NUCLEOTIDO UNICO SNP

CTGACACTTGAAACTCCCCTGA
CACCTTGACAACTCTGACCTGA
CTTGACAACTCCTCTGACCTGA
GACCTGATGACAACTCTGCTCT
GACCTGACATGATGACAAAACT
CTGCCTGATGACAACTCTGCTC
TGACACTCTGCCTGATGACAACT
CTGCTCACAACTCCTCTGACCT
GAGACCTGATGA C CAACTCCT
CTGTGCTCTGATCCTCTGATGATG

El genoma humano puede variar en secuencia debido a cambios en la posicin de los

nucletidos. Se estima que esta variacin de un solo nucletido es de 1:1000 pb. Los polimorfismos
de nucletido nico (SNPs) se consideran como tal cuando se encuentran presentes en al menos
el 1% de la poblacin.

Variaciones del Genoma

VARIACIONES DE NUCLEOTIDO UNICO SNP

CTGACACTTGAAACTCCCCTGA

CACCTTGACAACTCTGACCTGA

CTTGACAACTCCTCTGACCTGA
GACCTGATGACAACTCTGCTCT
GACCTGACATGATGACAAAACT
CTGCCTGATGACAACTCTGCTC
TGACACTCTGCCTGATGACAACT
CTGCTCACAACTCCTCTGACCT
GAGACCTGATGA C CAACTCCT
CTGTGCTCTGATCCTCTGATGATG

CTGACACTTGAAACTCCCCTGA
CACCTTGACAACTCTGACCTGA

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Variaciones del Genoma

THE HAPMAP PROJECT. Chart genetic variation within the human genome

Variaciones del Genoma

Haplotype: a set of closely linked genetic markers present on one

chromosome which tend to be inherited together

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Variaciones del Genoma

Variaciones del Genoma

EUR

AMI

AFR

AS

31