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ENZIMAS
ENZIMAS
Las enzimas catalizadores de las reacciones
qumicas en los seres vivos. Sustancias que, sin
consumirse en una reaccin, aumentan notablemente
su velocidad.
Ello hace posible que en condiciones fisiolgicas
tengan lugar reacciones que sin catalizador
requeriran condiciones extremas de presin,
temperatura o pH.
Sin las enzimas los procesos biolgicos seran tan
lentos que la vida no podra existir
La Ea de la hidrlisis de la
urea baja de 30 a 11 kcal/mol
con la accin de las enzimas,
acelerando la reaccin 1014
E+S
E+P
Tiempo de la reaccin
El aumento de temperatura
necesario para producir la
reaccin no catalizada seria
de 529C
ENZIMAS
Enzima
Sitio activo
Sustrato
Enzima - Catalizador
Complementariedad
geomtrica
Complementariedad
de
cargas, uniones inicas
Modelos:
Llave cerradura.
Encaje inducido
Clasificacin y nomenclatura
Nombre sistemtico:
Grupo transferido
Aceptor
EC 2.7.1.1
Grupo
Enzimas
Subgrupo
Clasificacin y nomenclatura
Clasificacin de enzimas por Grupos
EC 1.x Oxidorreductasas
EC 2.x Transferasas
EC 3.x Hidrolasas
EC 4.x Liasas
EC 5.x Isomerasas
EC 6.x Ligasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin, en que tomos de
oxigeno hidrogeno son trasladados entre molculas:
Ared + Box
Aox + Bred
AH2 + B
A + BH2
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa
-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa
Dador
EC 1.1.3.4
Aceptor
Nombre comn:
Glucosa oxidasa
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x EC 1.2.x EC 1.3.x EC 1.4.x EC 1.5.x EC 1.6.x etc.
Deshidrogenasas
Oxidasas
Peroxidasas
Oxigenasas
Hidroxilasas
Reductasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de tomos
grupo de tomos entre molculas:
A-X + B
A + B-X
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrlisis y tambin su reverso.
A-B + H2O
A-OH + H-B
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular Pptido hidrolasas: clasificacin comn
(no sistemtica)
I. Segn la situacin del enlace atacado:
- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Segn el mecanismo cataltico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remocin de grupo de
tomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas):
A-B
Ejemplo
Nombre sistemtico:
Histidina amonio-liasa (EC
4.3.1.3)
Nombre comn:
Histidasa
A+ B
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerizacin moleculares
A
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC
5.3.1.5)
Clasificacin y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas
de la hidrlisis de un nucletido trifosfato (ATP, GTP, etc.).
A + B + ATP
Ejemplo: Glutationa sintasa (EC
6.2.2.3)
Nombre sistmico:
G-L-glutamilo-Lcisteina:glicina ligase
A-B + ADP + Pi
ORGANISMOS TERMFILOS
Coenzimas
Las
Sustrato
oxidado
CINTICA ENZIMTICA
1.
2.
3.
Complejo enzima-sustrato
E+S
E
k1
k2
ES
k3
P+
Baja
concentracin
de sustrato
ALTA
concentracin
de sustrato
SATURACION
E+S
k+1
k-1
ES
k+2
E+P
Vmax[S]
Km + [S]
0.24
Vmax
0.2
0.16
Vmax/2
0.12
0.08
0.04
0
0
1
Km
10
Vmax/2
Km
La Km es la concentracin de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Vmax
Vmax/2
Km
Significado de la constante Km
1.
Representacin Lineweaver-Burke
Representacin recproca doble
(Lineweaver - Burk)
0.04
1/v
1/Vmax
0.03
1
K m 1
1
v V mx s V mx
0.02
-1/Km
0.01
0.00
-0.4
-0.2
0.0
0.2
0.4
0.6
1/s
INHIBICION ENZIMATICA
Introduccin
Inhibidor:
Compuesto que hace disminuir la actividad enzimtica, a travs
de interacciones con el centro activo u otros centros especficos
(alostricos).
EI
ESI
Inhibicin reversible
(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,
impidiendo la fijacin del substrato: Inhibicin Competitiva
(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo
haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
fijacin del substrato a la enzima, pero s impide la accin
cataltica: Inhibicin No Competitiva
(c) El inhibidor se fija nicamente al complejo enzima-substrato
una vez formado, impidiendo la accin cataltica; este tipo
se conoce como Inhibicin Acompetitiva
Inhibicin Competitiva
Inhibidores Competitivos
Compiten con el sustrato por el sitio activo
de la enzima
Se une solo a la enzima libre
V mx no se altera y K M cambia
Inhibicin competitiva
S
ES
E
I
EI
E+P
[E] [I]
Ki =
[EI]
Caractersticas:
- Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente
exclusivas
- A muy altas concentraciones de substrato desaparece la
inhibicin
- Por lo general, el inhibidor competitivo es un anlogo qumico
del substrato.
- El inhibidor es tan especfico como el substrato
Sin inhibidor
Con inhibidor
El inhibidor competitivo
aumenta la Km
Km
Km
Sin
con
inhibidor inhibidor
1/v
0.07
0.06
0.05
0.04
1/Vmax
0.03
0.02
-1/Km
0.01
1/s
0.00
-0.3
-0.2
-0.1
0.0
-1/(Km
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
Inhibidor No Competitivo
Se une a un lugar diferente del sitio activo
la enzima
Se une a la enzima libre y tambin al
complejo enzima-sustrato
Por accin del inhibidor disminuye la Vmx
pero el valor de Km no se altera
Inhibicin NO competitiva
Inhibicin acompetitiva
Inhibidor Acompetitivo
Se une a un lugar diferente del sitio activo
de la enzima
Se une slo al complejo enzima-sustrato
Los efectos que tiene: disminuye el valor
de Km y tambin el de Vmx
Inhibidor Acompetitivo
El inhibidor Acompetitivo se une a la enzima en un sitio
diferente del sitio activo
Inhibicin Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
qumico de la enzima, modificndola covalentemente
- Su accin no se describe por una constante de equilibrio Ki,
sino por una constante de velocidad ki:
E+I
Inhibidores Irreversibles
Producen inactivacin permanente de la
actividad enzimtica
Se interfiere con el normal desarrollo de
una reaccin o va metablica
Efecto
Km, V mx descienden
Enzimas alostricas
Las
enzimas
alostricas
presentan
estructura
cuaternaria.
Tienen
diferentes
sitios
activos, unen mas de una
molcula de sustrato
la curva de velocidad presenta
una forma sigmoidal
* ALOSTERISMO
MODIFICACIONES
SOBRE LA ENZIMA
EXISTENTE
*REGULACIN COVALENTE
a) FOSFORILACIN
b) PROTELISIS
ISOENZIMAS
a) EXPRESIN DEL GENE
MODIFICACIONES
PARA CAMBIAR LA
CANTIDAD DE
ENZIMA
* SNTESIS
* DEGRADACIN
b) SNTESIS DE LA PROTENA
EN EL RIBOSOMA
DIFERENTES MECANISMOS
ENZIMA ALOSTRICA
SUSTRATO
SITIO CATALITICO
ENZIMA
SITIO REGULADOR
SITIO CATALITICO
SUSTRATO
ENZIMA
Sitio Regulador
Ligando o
Regulador o Efector
alostrico
(especfico)
Sitio alostrico
(es especfico)
Actividad enzimtica
Sitio alostrico
(es especfico)
Actividad enzimtica
VELOCIDAD
LA TRANSICIN DE T a R
POR LA UNIN DE SU
SUSTRATO, TAMBIN
AUMENTA LA ACTIVIDAD
SUSTRATO
Unin a la enzima
(Sitio alostrico)
Induccin de
Cambio conformacional
Transmisin a travs
De la enzima hasta
El Sitio cataltico
Expresin de
La actividad de la
enzima (catlisis)
MODIFICACIN + Cambio en la
DE LA AFINIDAD POR EL Estructura del sitio
PRODUCTO, CAM- BIO cataltico.
REACTIVIDADES
De residuos crticos en la
catlisis.
REGULACIN ENZIMTICA
SUSTRATO
INHIBIDOR
COMPETITIVO
INHIBIDOR
NO
COMPETITIVO
INHIBIDOR
ALOSTRICO
SITIO CATALITICO
SUSTRATO
ENZIMA
ENZIMA
ENZIMA
ENZIMA
Sitio Regulador
A+ B
Enz A
Sustrato A
Sustrato B
Enz B
Sustrato C
Enz C
Sustrato D
Enz D
Sustrato E
ENZIMA
DEFOSFORILADA
FORMA ACTIVA
Pi (FOSFATASA)
FOSFOENZIMA O
ENZIMA
FOSFORILADA
MODIFICACIN
Fosforilacin
Acetilacin
Miristilacin
ADP-ribosilacin
Farnesilacin
-Carboxilacin
Sulfatacin
Ubiquitinacin
EJEMPLO DE
PROTENA
MODIFICADA
Piruvato cinasa
Histonas
Src
RNA polimerasa
Ras Trombina
Fibringeno
Ciclina
ADP+ Pi
CINASA o
ENZIMA
DEFOSFORILA
DA
ACTIVA
FOSFORILAS
A Pi
Pi
Sitio de
fosforilacin
ENZIMA FOSFORILADA
Pi
FOSFATA
SA
INACTIVA
REGULACIN COVALENTE
PROTELISIS (REGULACIN IRREVERSIBLE)
NH2
COOPROCESAMIENTO
PRECURSOR
(INACTIVO) O
PROTENA INMADURA
ZIMGENO
COOH
NH2
COOH
FORMA MADURA
(ACTIVA)
ISOFORMAS O ISOENZIMAS
O ISOZIMAS
Regulacin enzimtica
Control gentico: Sntesis de enzimas como
respuesta a las variaciones de las
necesidades metablicas, permite a las
clulas responder de forma eficaz a las
variaciones del ambiente.
Ejemplo E. coli puede metabolizar lactosa
en ausencia de glucosa en el medio.
Transformacin
de Alimentos
Fermentaciones
Quesos
Vinos
Agricultura
Rhyzobium
Medicina
Transaminasas
Industria
Farmacutica
Penicilina
RESUMEN
Las
RESUMEN
La