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Glucosdic
Bases Nitrogenadas
4
3
3
2
5
6
7
9
NH2
CH3
pirimidina
imidazol
NH2
NH2
Azcar
Radical Fosfato
Base nitrogenada
Azcar
Nuclesido
Nuclesido
Radical fosfato
Nucletido
Nucletido
Nucletido
Nucletido
Nucletido
... = AN
ADN
Desoxirribosa
Adenina, guanina, citosina, timina
Radical fosfato
ARN
Ribosa
Adenina, guanina, citosina, uracilo
Radical fosfato
Base Nitrogenada
Adenina
Guanina
Citosina
Timina
Uracilo
Nuclesido
Adenosina
Guanidina
Citidina
Timidina
Uridina
Nucletido
cido Adenlico
cido Guanlico
cido Citidlico
cido Timidlico
cido Uridlico
b) Rotacin en torno al
enlace glucosdico
En nucletidos las dos
conformaciones se
interconvierten. La rotacin
en torno al enlace
glucosdico (entre la
pentosa y la base)
determina dos
corformaciones:
-Sin: la base sobre la
pentosa. Lo puede tener G
-Anti: La base hacia fuera.
Ambos se interconvierten
en nucletidos de purina. La
forma anti predomina en
nucletidos de pirimidina y
en los cidos nucleicos.
secuencia
esqueleto
El dinucletido
formado es 3 5
fosfodister. Se
pueden seguir
aadiendo ms
nucletidos,
establecindose
un esqueleto:
azcar fosfato
azcar, con una
base unida a cada
azcar en su
posicin 1.
La informacin
codificada radica
en la secuencia de
las BN
pApA
ApAp
OH
La presencia de un grupo
OH en posicin 2 de la
ribosa, hace que el
polinuceltido sea menos
estable: el OH se encuentra
adecuadamente situado para
atacar el P en presencia de
iones OH - , causando la
rotura de la unin
fosfodister y formar un
enlace cclico 2, 3
Fosfonucletido 5
Fosfonucletido 3
Estructura Secundaria
Modelo propuesto por Watson y
Crick en 1953.
Son dos hebras antiparalelas, en
forma de hlice, que se mantienen
unidas por el apareamiento
complementario de las bases:
A T y C- G
2
Forman un puente
Espectro de difraccin de
rayos X: Wilkins y Atsbury
Amnico: A
Amnico Cetnico: C, G
L.Pauling
(Caltech)
M.Wilkins y R.E.Franklin
(Londres)
J.D.Watson y F.H.C.Crick
(Cambridge)
Periodicidad a 0,34 nm
Periodicidad
a 3,4 nm
Estructura helicoidal
(forma en X)
Regla de la Equivalencia
El modelo secundario descrito requiere cantidades
equivalentes de A y T y de C y G.
= 1
A/G
C/T
= 1
A
28,2
G
21,5
C
21,2
T
27,8
5-Me-C
1,3
Esperma de bovino
28,7
22,2
20,7
27,3
1,3
Germen de trigo
27,3
22,7
16,8
27,1
6,0
Saccharomyces
31,3
18,7
17,1
32,9
Escherichia coli
26,0
24,9
25,2
23,9
Mycobacterium tuberculosis
15,1
34,9
35,4
14,6
X174
24,3
24,5
18,2
32,3
T3
23,7
26,2
27,7
23,5
T5
30,3
19,5
19,5
30,8
T7
Virus ARN
Mosaico del tabaco (TMV)
32,4
A
29,8
18,3
G
25,4
C
18,5
32,4
U
26,3
22,6
17,2
38,0
22,2
Poliomielitis
28,6
24,0
22,0
25,4
17,0
HMC
Organismo
Tejido
A+T/G+C
Escherichia coli
1,00
Diplococcus pneumoniae
Mycobacterium tuberculosis
Levadura
1,59
0,42
1,79
Esperma
1,85
Esperma
1,23
Mdula sea
1,33
Hombre
Hombre
Timo
Hgado
1,52
1,53
Hombre
Esperma
1,52
Orientacin de
las hebras
Una hebra se
orienta en
sentido 5 3
y la otra en
sentido 3 5,
es decir son
antiparalelas
Diapositiva 69
http://www.arrakis.es/~ibrabida/vigadn2.html
3
Tipos de ADN
TIPO DE ADN
GIRO DE HELICE
A
B
Z
Dextrgiro
Dextrgiro
Levgiro
n de nucleotidos
por vuelta
11
10
12
Modelo A
Las purinas
estn en
posicin sin
Modelo Z
T
A
A
T
G
C
C
G
A
T
C
G
G
C
T
A
G
C
C
G
T
A
A
T
A 3
T 5
C
G
T
A
A
T
A 3
T 5
5 T
3 A
T
A
A
T
G
C
C
G
A
T
C
G
G
C
T
A
G
C
Estructura Terciaria
Se refiere a como se almacena el
ADN en un volumen reducido.
Vara segn se trate de
organismos procariotes o
eucariotes:
1 vuelta 34 A
10000
24
10 pb
X
Bases nitrogenadas
Protenas
DNA
A260
= 1,8
A280
RNA
A260
= 2,0
A280
Tm de desnaturalizacin
f) Energa libre: (
G) Su relacin seala el grado de
estabilidad de la doble hebra. Es una constante termodinmica
que indica la cantidad de energa consumida (+) o liberada (-) en
una reaccin. Se mide Kcal/mol
Globalmente cuando se va a formar una estructura de bases
emparejadas, se libera energa y su estabilidad est en esa
capacidad para liberarla.
Se libera energa en cada par de bases que se forman
METODOS DE ESTUDIO
ELECTROFORESIS
Muestra DNA
Migracin DNA
EtBr
Fotografa
Bienvenidos al mundo
del ADN