Cmo los investigadores a descifrar la informacin en el ADN?
Virtualmente todos los materiales biolgicos, tales como esta muestra de sangre, contienen ADN. Incluso pequeas cantidades de fluidos biolgicos pueden producir trazas de ADN. Debido a que la secuencia de nucletidos en una molcula de ADN es una forma de informacin, la capacidad de leer e interpretar la secuencia hace que sea posible identificar un individuo o diagnosticar una enfermedad. Por ejemplo, el anlisis del ADN fetal en la circulacin materna puede revelar anomalas cromosmicas, as como la presencia de variantes de secuencia que pueden causar enfermedades. Sin embargo, las tcnicas para la lectura de las secuencias de ADN, que se describen en este captulo, tambin generan desafos en la recopilacin de grandes cantidades de datos y la comprensin de cmo las clulas se almacenan a si mismas y utilizar esa informacin.
Todos los componentes estructurales de las clulas y la maquinaria que llevan
a cabo las actividades de las clulas son especificados fundamentalmente por el material gentico de la clula-DNA. Por lo tanto, antes de examinar otros tipos de molculas biolgicas y sus transformaciones metablicas, debemos tener en cuenta la naturaleza del ADN, incluyendo su estructura qumica y cmo su informacin biolgica est organizada y expresada. La seccin de Herramientas y Tcnicas de este captulo incluye algunos de los mtodos utilizados para estudiar y manipular el ADN en el laboratorio.
3-1 El DNA es el material gentico
Conceptos claves
El ADN y el ARN son polmeros de nucletidos, cada uno de los
cuales consta de una base de purina o pirimidina, desoxirribosa o ribosa y fosfato. Una molcula de ADN contiene dos hebras antiparalelas que se enrollan alrededor de la otra para formar una doble hlice en la que las bases de A y T estn en hebras opuestas, y las bases de C y G estn en hebras opuestas, emparejndose a travs de enlaces de hidrgeno.
Los cidos nucleicos de doble hebra se desnaturalizan a
temperaturas elevadas; en temperaturas muy bajas, los polinucletidos complementarios unidos (Atravez de los puentes de hidrogeno, para formar una doble hebra).
Gregor Mendel ciertamente no fue el primero en darse cuenta de que
las caractersticas de un organismo (por ejemplo, color de la flor o la forma de las semillas en plantas de guisantes (arveja)) se pasaron a su descendencia, pero en 1865 l fue el primero en describir sus patrones predecibles de herencia. En 1903, los factores hereditarios de Mendel (ahora llamados genes) fueron reconocidos como pertenecientes a los cromosomas (una palabra que significa "cuerpos de color"), que son visibles al microscopio ptico (Fig. 3-1). Los cidos nucleicos han sido descubiertos en 1869 por Friedrich Miescher, quien aisl este material de las clulas blancas de la sangre en el pus de vendas quirrgicas. Sin embargo, cuando se hizo evidente que los cromosomas estaban compuestas de ambas protenas y nucleico cidos, los cidos nucleicos fueron descartados como posibles portadores de la informacin gentica, debido a su falta de complejidad: Ellos slo contena cuatro diferentes tipos de unidades estructurales, llamadas nucletidos. En contraste, las protenas contenan 20 tipos diferentes de aminocidos y mostro una gran diversidad en la composicin, el tamao y la forma-atributos que parecan ms apropiados para los portadores de la informacin gentica. Aos despus, los microbilogos mostraron que una sustancia de una cepa de un patgeno muerto (causante de la enfermedad) de la bacteria Streptococcus pneumoniae podra transformar las clulas de una cepa normal al tipo de patgenos. En 1944, Oswald Avery, Colin MacLeod y McCarty Maclyn demostraron que esta sustancia transformadora era el cido desoxirribonucleico (ADN), pero sus resultados no obtuvieron mucha atencin. Otros siete aos pasaron hasta que Alfred Hershey y Martha Chase demostraron que en bacterifagos (virus que infectan clulas bacterianas y que consisten solamente de protenas y ADN), el ADN, no la protena, fue el agente infeccioso (Fig. 3-2). Por este tiempo, el ADN se sabe que contienen cadenas de nucletidos polimerizados-
abreviado A, C, G y T-pero stos se pensaban que se produjera tan
simple repeticin de tetranucleotidos, por ejemplo, ACGT-ACGT-ACGT-ACGT
Figura 3-1 Los cromosomas humanos de la amniocentesis. En
esta imagen, los cromosomas han sido teidos con colorantes fluorescentes.
Figura 3-2 Un tipo de bacterifago T. El fago o bacterifago
consiste sobre todo en una cubierta proteica que rodea a una molcula de ADN. Alfred Hershey y Martha Chase identificaron el ADN como el agente infeccioso. Cuando Erwin Chargaff demostr en 1950 que los nucletidos en ADN no estaban todos presentes en igual nmero y que la composicin de nucletidos vari entre especies, se hizo evidente que el ADN podra ser lo suficientemente compleja para ser el material gentico despus de todo, y la carrera estaba en descifrar su estructura molecular. La estructura del ADN en ltima instancia aclarada por James Watson y Francis Crick en 1953 incorporando observaciones de Chargaff. Especficamente, Chargaff observ que la cantidad de A es igual a la cantidad de T, la cantidad de C es igual a la cantidad de G, y la cantidad total de A + G es igual a la cantidad total de C + T. Las "reglas" de Chargaff podran ser satisfechas por una molcula con dos cadenas de polinucletidos (polmeros de nucletidos) en la que A y C en un par hebra con T y G en el otra.
Los cidos nucleicos son polmeros de
nucletidos Cada nucletido de ADN incluye una base que contiene nitrgeno. El bases adenina (A) y guanina (G) son conocidas como purinas porque se asemejan a lo orgnico purina compuesto:
Las bases de citosina (C) y timina (T) son conocidas como pirimidinas porque se parecerse al compuesto orgnico de pirimidina:
El cido ribonucleico (RNA) contiene el uracilo de pirimidina (U) en
lugar de timina:
De modo que el ADN contiene las bases A, C, G y T, mientras que el
ARN contiene A, C, G y U. El tomo de vinculacin N9 en una purina o tomo N1 en una pirimidina para una azcar de cinco carbonos forma un nuclesido. En el ADN, el azcar es 2-desoxirribosa; en el ARN, el azcar es ribosa (los tomos de azcar estn numerados con nmeros primos para distinguirlos de los tomos de la bases unida).
Tabla 3-1
Los Nuclesidos y nucletidos que contienen 2-desoxirribosa en
lugar de ribosa pueden ser llamados desoxinuclesidos y desoxinucletidos. La abreviatura de nucletidos est entonces precedido por "d". La Timina se encuentra en el ADN, pero no en RNA. El uracilo se encuentra en el ARN pero no en el ADN.
Un nucletido es un nuclesido a la que est unido uno o ms grupos
fosfato, generalmente a C5 del azcar. Dependiendo de si hay uno, dos, o tres grupos fosfato, el nucletido es conocida como un nuclesido monofosfato, nuclesido de difosfato, o nuclesido de trifosfato y est representado por una abreviatura de tres letras, por ejemplo,
Los Desoxinucletidos se denominan de manera similar, y sus
abreviaturas estn precedidas por "d". Los homlogos desoxi de los
compuestos que se muestran arriba sera por lo tanto
desoxiadenosina monofosfato (dAMP), difosfato desoxiguanosina (dGDP) y trifosfato de desoxicitidina (dCTP). Los nombres y siglas de las bases comunes, nuclesidos y nucletidos se resumen en la Tabla 3-1.
Algunos nucletidos tienen otras funciones
Adems de servir como bloques de construccin de ADN y ARN, nucletidos realizan una variedad de funciones en la clula. Estn involucrados en la transduccin de la energa, la sealizacin intracelular y la regulacin de la actividad enzimtica. Algunos nucletidos derivados son actores esenciales en las vas metablicas que sintetizan biomolculas o degradarlos con el fin de "captar" la energa libre. Por ejemplo, la coenzima A (CoA; Fig. 3-3a) es un portador de otras molculas durante su sntesis y la degradacin. Dos nucletidos estn unidos en los compuestos de dinucletido adenina nicotinamida (NAD; Fig. 3-3b) y la flavina adenina dinucletido (FAD; 3-3c Fig.), que somete a oxidacin reversible y la reduccin durante una serie de reacciones metablicas. Curiosamente, una parte de las estructuras de cada una de estas molculas se deriva de una vitamina, un compuesto que se debe obtener de la dieta. Figura 3-3 Algunos derivados de nucletidos. El grupo de adenosina de cada uno de estos compuestos se muestra en rojo. Tenga en cuenta que cada uno tambin contiene un derivado de la vitamina. (a) la coenzima A (CoA) contiene un residuo de cido pantotnico (pantotenato), tambin conocido como vitamina B5. El grupo sulfhidrilo es el sitio de unin de otros grupos. (b) El grupo de la nicotinamida adenina dinucletido de nicotinamida (NAD) es un derivado de la vitamina niacina (tambin llamado cido nicotnico o vitamina B3; ver recuadro) y se somete a oxidacin y reduccin. El relacionado compuesto de nicotinamida adenina dinucletido fosfato (NADP) contiene un grupo fosforilo en la posicin C2 de adenosina. (c) La oxidacin y la reduccin de flavina adenina dinucletido (FAD) se produce en el grupo de riboflavina (tambin conocida como vitamina B2).