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Q.F.

Juan Salazar Snchez

Nucletidos
Son steres de fosfato de pentosas en las cuales una base nitrogenada est
unida al C1 de una azcar.
En los ribonucletidos la pentosa es la D-ribosa, en los
desoxiribonucletidos (DNA, desoxinucletidos), el azcar es 2-desoxi-Dribosa (los nmeros primos sealan posiciones de tomos del azcar, los no
primos corresponden a la base nitrogenada).
El fosfato puede estar en posicin 3 5. Si no hay fosfato en la molcula, el
compuesto es un nuclesido.
En general estos compuestos son cidos moderadamente fuertes.
Las bases nitrogenadas son molculas planas, aromticas y heterocclicas
que son derivados de la purina o pirimidina

Funciones metablicas de los nucletidos


Todos los tipos de clulas contienen una gran variedad de nucletidos y
derivados. Sus principales funciones son las siguientes:
a) Participacin en el metabolismo energtico. El ATP (trifosfato de adenosina)
se genera en las clulas mediante fosforilacin, oxidativa y a nivel de sustrato.
Se utiliza para activar las reacciones metablicas, y est implicado en procesos
tales como: contraccin muscular, transporte activo y mantenimiento de la
integridad de las membranas celulares. El ATP es un dador de fosfato para la
generacin de otros nuclesidos 5-trifosfatos .

b) Presencia en unidades monomricas de cidos nucleicos. ADN y ARN,


estn compuestos por unidades de nucletidos. En reacciones de sntesis de
cidos nucleicos, los nuclesidos 5-trifosfatos son sustratos que se unen al
polmero por enlaces fosfodister 3-5, liberando pirofosfato

c) Mediadores fisiolgicos de procesos metablicos clave. AMPc (monofosfato


de adenina cclico) acta como segundo mensajero en el control de los
procesos glucgenolisis y glucognesis, mediados por adrenalina y glucagn.
d) Componentes de coenzimas. NAD (dinuclotido de nicotinamida y
adenina), FAD (dinucletido de adenina y flavina) y CoA (Coenzima A) son
constituyentes metablicos implicados en gran nmero de rutas metablicas.
e) Intermediarios activados, necesarios para diversas reacciones. UDPglucosa es un intermediario clave en la sntesis de glucgeno y de
glucoprotenas. GDP-manosa, GDP-fucosa, UDP-galactosa y CMP-cido
silico son intermediarios clave de reacciones en las que azcares son
transferidos para la sntesis de glucoprotenas. CTP se utiliza para generar
CDP-colina, CDP-etanolamina y CDP-diacilgliceroles, compuestos que
intervienen en metabolismo de fosfolpidos.
f) Efectores alostricos. Las concentraciones intracelulares de nucletidos
controlan los pasos regulados en las vas metablicas.

Estructura Qumica de los Nucletidos


Los nucletidos que se encuentran en las clulas son derivados
de los compuestos heterocclicos altamente bsicos, purina y
pirimidina.

Purina

Pirimidina

Es el aspecto bsico de los nucletidos que les ha dado el trmino comn de


"bases" cuando estn asociados con los nucletidos presentes en el ADN y
ARN. Existen 5 clases principales de bases que se encuentran en las clulas.
Los derivados de la purina se llaman adenina y guanina, y los derivados de la
pirimidina se llaman timidita, citosina y uracilo. Las abreviaciones comunes
que se utilizan para estas cinco bases son A, G, T, C, y U.

Metabolismo de los Nucletidos

Biosntesis y Degradacin de Nucletidos


Los nucletidos son substituyentes ubicuos en la naturaleza que participan
casi en todos los procesos bioqumicos.

1.- Forman las unidades monomricas de los cidos nucleicos, que son
sintetizados directamente de nuclesidos trifosfatados, la forma activada
de los nucletidos.
2.- De los nuclesidos trifosfatados el que participa como donador de
energa qumica en un mayor nmero de procesos, es el adenosn
trifosfato (ATP) que adems es el producto final de la gran mayora de los
procesos metablicos. Muchos intermediarios activados como la UDPglucosa en la sntesis de glucgeno, contienen nucletidos.

3.- Muchas vas metablicas estn reguladas al menos en parte por los
niveles de ATP, ADP o AMP.
De manera semejante, muchas seales hormonales como aquellas que
controlan al metabolismo del glucgeno, son mediadas intracelularmente
por las molculas cclicas del AMP o GMP (cAMP o cGMP).
4.- Los nucletidos de adenina son componentes de las coenzimas
NAD+, NADP+, FMN, FAD y CoA.

Representacin de una cadena de nucletidos

Clasificacin de las Bases Nitrogenadas


Las pirimidinas que tienen un anillo de seis miembros

Las purinas que tienen un anillo de 5 miembros


fusionado a uno de 6:

Cada cido nucleico contiene 4 tipos de bases.


Las mismas dos purinas, adenina (A) y guanina (G) estn
presentes en el ADN y en el ARN.
Las dos pirimidinas, en el ADN son citosina (C) y timina (T), en
el ARN, la timina se cambia por el uracilo (U).
La nica diferencia entre el uracilo y la timina es la presencia
de un substituyente metil en la posicin C5.
De tal manera que en el ADN solo existen A,G,C y T, mientras
que en el ARN contiene A,G,C y U.

En los cidos nucleicos, se encuentran dos tipos de


pentosas. Esta caracterstica diferencia al ADN del ARN
y les da el nombre a los dos tipos de cidos nucleicos:

En el ADN, la pentosa es la 2desoxiribosa y en el ARN es la


ribosa. La diferencia la hace la
presencia o ausencia de un grupo
hidroxilo en la posicin 2 del
anillo.

Diferencias entre un ribonucletido y un desoxirribonucletido

La base nitrogenada esta unida a la posicin 1 del anillo de


la pentosa por medio de un enlace glucosdico a la posicin
N1 de las pirimidinas o a la N9 de las purinas.
Para evitar ambigedades entre la numeracin de los
heterociclos y el anillo del azcar, las posiciones de la
pentosa se numeran como primos ().
Una base unida a una azcar se denomina nuclesido,
cuando se une un fosfato, la base-azcar-fosfato se
denomina nucleotido:

Los diferentes arreglos de los nucletidos.

Los nucletidos son los bloques de construccin a partir de los cuales se


construyen los cidos nucleicos.
Los nucletidos estn unidos en una cadena polinucleotdica con un
esqueleto que consiste de series alternadas de residuos de azcar y fosfato.
La posicin 5 de un anillo de pentosa est conectada a la posicin 3 de la
siguiente pentosa va un grupo fosfato . Por lo tanto, se dice que el esqueleto
de azcar-fosfato consiste de un enlace fosfodiester en posicin 5-3. Las
bases nitrogenadas estn por fuera del esqueleto.
El nucletido terminal en uno de los extremos de la cadena tiene el grupo 5
libre; y al otro lado de la cadena tiene un grupo 3 libre.
Es una convencin escribir las secuencias de cidos nucleicos en la
direccin 5-3, de tal forma que el extremo 5 est a la izquierda y el 3 a la
derecha.

Cuando el ADN o el ARN son rotos en sus nucletidos constituyentes, la


ruptura puede llevarse a cabo en cualquiera de los lados de los
enlaces fosfodiester.
Dependiendo de las circunstancias, los nucletidos tienen su grupo fosfato
unido a cualquiera de las posiciones 5 3 de la pentosa:

Posibilidades del acomodo de los grupos fosfato en las ribosas de los nucletidos.

Todos los nucletidos pueden existir en una forma en la cual hay ms de


un grupo fosfato unido a la posicin 5 por ejemplo:

Todos los enlaces (a, b y g) son ricos en


energa, la cual se utiliza como fuente para
mltiples actividades celulares. Los
nucletidos 5trifosfatados son los
precursores de la sntesis de los cidos
nucleicos.

Diferentes estados de fosforilacin de un nucletido

Sntesis de Ribonucletidos de Purinas


Las primeras evidencias de las sntesis de novo de estos
compuestos se hallaron al alimentar palomas con una variedad
de compuestos isotpicamente marcados.
Se determin qumicamente las posiciones de los tomos
marcados en el producto de excrecin, el cido rico (una
purina).
Se utiliz aves porque excretan el nitrgeno casi enteramente
como cido rico, substancia insoluble, fcilmente de aislar.
Los C4, C5 y N7 provienen de la glicina, mientras que cada uno
de los otros tomos, derivan de un precursor independiente.
El formato proviene del tetrahidrofolato, en el metabolismo de
unidades de un carbono.
El procedimiento consta de 11 reacciones

Tetrahidrofolato
Tetrahidrofolato

Origen de los tomos de una purina

Va de salvamento de las Purinas


Muchas clulas tienen un recambio activo de muchos de sus cidos nucleicos
(particularmente de algunos tipos de ARNs). A partir de este proceso, se liberan adenina,
guanina e hipoxantina (que a diferencia de la guanina, carece del grupo amino en posicin
C2).

Representacin de las molculas de guanina e hipoxantina.

Estas purinas libres, son recuperadas para formar sus nucletidos


correspondientes a travs de vas de salvamento. A diferencia de la sntesis
de novo que es prcticamente idntica en todas las clulas, las vas de
salvamento, son diversas. En los mamferos, las purinas son salvadas
principalmente por medio de dos enzimas, la adenina fosforibosiltransferasa
(APRT), forma AMP a travs de la transferencia de adenina al fosforibosil
pirofosfato con la liberacin de PPi:
Adenina + PRPP

AMP + PPi

Y la hipoxantina-guanina fosforibosiltransferasa (HGPRT), que cataliza una reaccin


anloga tanto para hipoxantina como para guanina:

Hipoxantina
o
+ PRPP
Guanina

IMP + PPi

GMP + PPi

Sntesis de Ribonucletidos de Pirimidinas


El proceso de la biosntesis de los ribonucletidos de pirimidina,
es ms sencilla que la de purinas. Experimentos con molculas
marcadas radiactivamente muestran que los tomos N1, C4,5 y
6, provienen de aspartato, C2 del HCO3- y N3 de la glutamina

Origen de los tomos de una Pirimidina

Organizacin gentica del ADN


.

El ADN es una molcula que se ha organizado de


manera eficiente que permite almacenar la
informacin gentica para que se pueda mantener a
travs del tiempo y ser traspasada de
generacin en generacin entre las especies.

Replicacion del ADN


El proceso de replicacin de ADN es el mecanismo que permite
al ADN duplicarse (es decir, sintetizar una copia idntica).
De esta manera de una molcula de ADN nica, se obtienen dos
o ms "clones" de la primera.
Esta duplicacin del material gentico se produce de acuerdo
con un mecanismo semiconservativo, lo que indica que las dos
cadenas complementarias del ADN original, al separarse, sirven
de molde cada una para la sntesis de una nueva cadena
complementaria de la cadena molde, de forma que cada nueva
doble hlice contiene una de las cadenas del ADN original.

Gracias a la complementacin entre las bases que forman la secuencia de


cada una de las cadenas, el ADN tiene la importante propiedad de
reproducirse idnticamente, lo que permite que la informacin gentica se
transmita de una clula madre a las clulas hijas y es la base de la herencia
del material gentico.
La molcula de ADN se abre como una cremallera por ruptura de los
puentes de hidrgeno entre las bases complementarias liberndose dos
hebras y la ADN polimerasa sintetiza la mitad complementaria aadiendo
nucletidos que se encuentran dispersos en el ncleo.
De esta forma, cada nueva molcula es idntica a la molcula de ADN
inicial.
La replicacin empieza en puntos determinados: los orgenes de replicacin

Replicacin y Transcripcin del ADN

Fragmentos de Okasaki
Fragmentos de Okazaki son fragmentos cortos de ADN recin
sintetizadas, que se forman en la cadena molde en retraso
durante la replicacin del ADN.
Ellos son complementarios a la cadena molde en retraso,
formando secciones de ADN de doble cadena cortos.
Fragmentos de Okazaki son entre 1.000 y 2.000 nucletidos
de longitud en Escherichia coli y estn entre 100 y 200
nucletidos de longitud en eucariotas.
Estn separados por cebadores de ARN 10-nucletidos y son
no ligado hasta que se eliminan los cebadores de ARN,
seguido de enzima ligasa conecta los dos fragmentos de
Okazaki en una cadena complementaria recin sintetizada
continua.

Fragmentos de Okasaki

Proceso de Transcripcin del ADN


La transcripcin es el proceso por el cual se sintetiza un ARN
usando como molde al ADN.
Muchos tipos de ARN pueden ser sintetizados as por la
enzima ARN polimerasa, el ARN ribosomal el de transferencia,
los pequeos ARN nucleares o citoplasmticos y por supuesto
los ARN mensajeros, que sern luego traducidos a una cadena
polipeptdica.
El proceso de la transcripcin de los mensajeros es diferente
en procariotas y eucariotas.
Esto es debido a las diferencias propias entre los genes de las
bacterias y los de las clulas de animales superiores.

Los genes eucariotas son complejos y discontinuos es decir que


poseen regiones codificantes (que formarn parte de la protena) y
otros que son no codificantes y se remueven rpidamente antes que el
ARN salga al citoplasma a ser traducido. Las regiones codificantes se
llaman EXONES y las no codificantes se llaman INTRONES.
La transcripcin comienza en el punto 0 (cero) muy cerca del promotor
y termina en las bacterias en una secuencia llamada terminadora. La
polimerasa al copiar esa regin de ADN, se enlentece y se desprende
del molde. En algunos casos hay una protena que ayuda en ese
proceso denominada Rho.
Un esquema del ARN transcripto de esa regin terminadora se pliega
en el espacio formando una horquilla ya que el ARN es de cadena
simple.

El proceso en el cual se eliminan los intrones y empalman


los exones se denomina SPLICING

Los genes eucariotas son complejos y discontinuos es decir que poseen


regiones codificantes (que formarn parte de la protena) y otros que no son
codificantes y se remueven rpidamente antes que el ARN salga al
citoplasma a ser traducido. Las regiones codificantes se llaman EXONES y
las no codificantes se llaman INTRONES.
La transcripcin comienza en el punto 0 (cero) muy cerca del promotor y
termina en las bacterias en una secuencia llamada terminadora. La
polimerasa al copiar esa regin de ADN, se enlentece y se desprende del
molde. En algunos casos hay una protena que ayuda en ese proceso
denominada Rho.
Un esquema del ARN trasncriptor de esa regin terminadora se pliega en el
espacio formando una horquilla ya que el ARN es de cadena simple.