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El cuerpo humano normalmente alberga varios cientos de especies bacterianas y un nmero ms pequeo de
virus, hongos y protozoos. La mayora de ellos son comensales, ya que viven con nosotros sin causar dao.
Su nmero, as como la variedad de especies, cambia permanentemente. En cada momento cada uno de
nosotros posee un espectro particular e individualizado de microorganismos. El trmino "flora" se debe a que
la gran mayora de los microorganismos aislados de nuestro cuerpo son bacterias y estas pertenecen al reino
vegetal El dilema del microbilogo clnico es decidir cul de los microorganismos aislados de una muestra
clnica son causantes de la enfermedad. Para el clnico, por otra parte, el conocimiento de los
microorganismos de la flora normal es indispensable en la interpretacin de los hallazgos de los exmenes
microbiolgicos.
Localizacin de la flora
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Los microorganismos se encuentran en aquellas partes del cuerpo expuestas al medio ambiente
o que comunican con l como piel, nariz y boca, intestino y tracto urogenital. Los rganos y
tejidos internos son habitualmente estriles. Las reas colonizadas con el mayor nmero de
microorganismos se muestran en la Tabla 1.
Tabla 1
AREAS MAS COLOIZADAS DEL ORGAISMO
Ubicacin
Piel
Tracto respiratorio
Tracto digestivo
Tracto genitourinario
Las bacterias, y en menor escala los hongos y protozoos, residen y proliferan activamente en
estos sitios. Las otras partes del cuerpo humano, como el resto del tracto respiratorio y del
tracto digestivo, la vejiga y el tero, tienen microorganismos en menor nmero y slo estn de
paso El hallazgo de microorganismos patgenos en estos sitios es altamente sugerente de
enfermedad, pero no lo certifica. Por otra parte, existen otros tejidos y rganos en que no
existen microorganismos, son territorios estriles. La presencia de microorganismos en estos
lugares es generalmente considerada de significado diagnstico. Incluidos entre stos estn la
sangre, el lquido cefalorraqudeo, los lquidos articulares (sinovial) y los tejidos profundos en
general. La densidad de la poblacin bacteriana oscila de un sitio a otro como se puede apreciar
en la Tabla 2.
Tabla 2.
UMERO DE BACTERIAS POR SITIO AATOMICO
Y RELACIO ETRE BACTERIAS AEROBIAS Y
AAEROBIAS
Sitio anatmico
mero
bacterias/ml
Relacin
aerobios/anaerobios
Cisura gingival
1011 - 1012
1/1.000
Estmago
102 - 105
1/1
Colon
1011 - 1012
1/1000
Piel superficie
104 - 105
1/100
Piel intrafolicular
105 - 106
1/100
Importancia de la Flora
La flora habitual juega un importante papel tanto en la salud como en la enfermedad. La
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letales, llamadas bacteriocinas. Cuando la flora habitual es barrida por el uso masivo de
antibiticos, se est dando la oportunidad de una colonizacin con bacterias diferentes a las
habituales, o bien la chance de que los microorganismos exgenos o endgenos produzcan
enfermedad. Los pacientes tratados con antibiticos de amplio espectro tienen ms
oportunidades de desarrollar diarrea asociada a antibiticos, incluyendo una forma ms grave de
patologa del intestino grueso, la "colitis pseudomembranosa". El antibitico en este caso barre la
flora intestinal y deja que el Clostridium difficile, que estaba en muy baja concentracin, se
desarrolle, produciendo la citotoxina responsable del cuadro.
Tracto respiratorio
Areas que generalmente albergan microorganismos. Diferentes micrococos pigmentados,
Staphylococcus epidermidis taphylococcus aureusPeptostreptococcus spp. son abundantes en la
saliva y en la superficie de los dientes. Los Streptococcus pyogenes estn presentes en un
porcentaje del 5 al 10% de los sujetos sanos. Los streptococcus pneumoniae pueden
encontrarse hasta en un 25% de los individuos normales. Las Neisseria spp.pigmentadas,
Branhamella catarrhalis, Veillonella spp. y Corynebacterium spp. son comunes en la saliva y en
las encas La familia de las enterobacterias est bien representada, siendo Escherichia coli,
Klebsiella spp. y Enterobacter spp.los ms comunes en la saliva y sobre la superficie de los
dientes. La distribucin de los microorganismos en el tracto respiratorio se puede ver en la Tabla
3.
Tabla 3
MICROORGAISMOS DEL TRACTO RESPIRATORIO
Microorganismo
Ubicacin
Enfermedad
Acinetobacter spp.
Nasofrinx
Meningitis, neumona
bacteriana
Actinomyces spp.
Boca, amgdalas
Actinomicosis, clculos
salivales
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Arachnia propionica
Boca
Actinomicosis
Bacterionema
matruchotii
No determinada
Bacteroides spp.
Boca, amgdalas
Absceso pulmonar
grangrena pulmonar
Bifidobacterium spp.
Boca
Actinomicosis.
Campylobacter
sputorum
Nasofrinx, encas,
superficie dentaria,
saliva
No determinada
Candida albicans
Boca, faringe
Algorra, neumonitis
Corynebacterium spp.
Boca, nariz
Endocarditis bacteriana
subaguda, absceso
pulmonar
Enterobacteriaceae
Boca, faringe
Neumona, absceso
pulmonar
Enterococcus
Bacteremia, meningitis,
neumona, endocarditis
Eubacterium spp.
Boca
No determinada
Fusobacterium spp.
Boca, amgdalas
Angina de Vincent?,
Absceso pulmonar
Haemophilus spp
Boca , nasofrinx
Laringotraqueobronquitis,
meningitis, neumonitis,
bacteremia, conjuntivitis.
Lactobacillus spp.
Boca, saliva
Endocarditis bacteriana
(muy rara)
Leptotrichia buccalis
Boca, sup.dentaria
No determinada
Micrococcus spp.
Boca, amgadalas
No determinada
Moraxella spp.
Nasofrinx
Conjuntivitis
eisseria spp.
Boca, nasofrinx
Meningitis
Acn, endocarditis
Rothia dentocariosa
Boca
Absceso
Selenomonas sputigena
Nasofrinx
No determinada
Staphylococcus aureus
Staphylococcus
epidermis
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Streptococcus
pneumoniae
Neumona, conjuntivitis,
meningitis, otitis
Torulopsis glabrata
Boca
Treponema denticola
Boca
No determinada
Treponema refringens
Boca
Angina de Vincent?
Veillonella spp.
Boca, amgdalas
Endocarditis bacteriana
Vibrio sputorum
Boca
No determinada
Streptococcus grupo
viridans
Boca, faringe
Endocarditis bacteriana
subaguda
Areas generalmente estriles. La laringe, la trquea, los bronquios, los bronquolos, los
alvolos y los senos accesorios de la cara son habitualmente estriles. La contaminacin por
algn microorganismo es ocasional, pero los mecanismos de defensa se encargan de eliminarlos
eficientemente.
Tracto gastrointestinal
Areas que generalmente albergan microorganismos. La parte del tuvo digestivo que
invariablemente alberga microorganismos es el intestino grueso, aunque ocasionalmente tambin
pueden recuperarse de leon bajo en sujetos normales, como se muestra en la Tabla 4.
Tabla 4
MICROORGAISMOS DEL TRACTO GASTROITESTIAL
Microorganismo
Ubicacin
Enfermedad
Achromobacter spp.
Infecciones post-operatorias,
post-traumticas
Acidaminococcus
frementans
Intestino grueso
No determinada
Acinetobacter
calcoaceticus
Infecciones post-operatorias
Aeromonas spp.
Alcaligenes faecalis
Gastroenteritis (rara),
bacteremia
Bacillus spp.
Intestino grueso
Intoxicacin alimentaria,
infeccin herida
Bacteroides spp.
Peritonitis, absceso,
colecistitis, enteritis
Diverticulitis, peritonitis
Butyriviberio
fibrosolvens
No determinada
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Intestino grueso
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Campylobacter spp.
Intestino grueso
Diarrea
Candida albicans
Complicaciones postoperatorias
Clostridium spp.
Intoxicacin alimentaria,
coledocistis, colecistitis,
enterocolitis
pseudomembranosa
No conocida
Enterobacteriaceae
Absceso, peritonitis,
bacteremia, diarrea, fiebres
entricas, fiebretifoidea
complicaciones postoperatorias y posttraumticas, meningitis,
endocarditis, intoxicacin
alimentaria
Enterococcus
Peritonitis, colecistitis,
complicaciones , postoperatorias
Eubacterium spp.
Intestino grueso
Diverticulitis, peritonitis
Meningitis, peritonitis
Fusobacterium spp.
Absceso, bacteremia
Lactobacillus spp,
No conocida
Mycobacteria spp.
Mycoplasma spp.
No determinada
Peptostreptococcus
spp.
Colecistitis, absceso,
peritonitis, mionecrosis
Propionibacterium
spp.
Intestino grueso
Endocarditis
Pseudomonas
aeruginosa
Gastroenteritis, meningitis,
bacteremia, complicaciones
postoperatorias
No determinada
Sarcina spp.
Intestino grueso
No determinada
Staphylococcus
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aureus
bajo
intoxicacin alimentaria,
complicaciones de
enterocolitis,
pseudomembranosa
Veillonella spp.
Intestino grueso
No determinada
Streptococcus grupo
viridans
No conocida
Vibrio spp.
Porcentaje
Microorganismo(s)
12.0
Bacteroides vulgatus
7.0
Fusobacterium prausnitzi
6.5
Bacteroides adolescentia
6.0
Ebacterium aerofaciens
4.5
Bacteroides thetaiotaomicron
3.6
Eubacterium eligens
3.2
Eubacteriumbioforme
11
2.3
Bacteroides distasonis
28
0.7
Bacteroides ovatus
29
0.6
Bacteroides fragilis
59 - 75
0.13
Enterococus faecalis
76 - 113
0.06
Tracto Genitourinario
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Ubicacin
Enfermedad
Uretritis, complicaciones de la
instrumentacin y de la ciruga
Bacteroides sp.
Complicaciones de la ciruga
(mujeres)
Genitales externos
No conocida
Candida albicans
Chlamydia spp.
Uretra, vagina
Clostridium sp.
Vagina
Complicaciones de la ciruga,
aborto
Corynebacterium
spp.
Vaginitis
Lactobacilus spp.
Vagina
Ninguna
Moraxella spp.
Vagina
Mycobacterium
spp.
Mycoplasma spp.
eisseria spp.
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Staphylococcus
aureus
Genitales externos(raro),
vagina, uretra anterior
Uretritis, furunculosis
Staphylococcus
No claramente establecida
S. saprophyticus
coagulasa negativa
Streptococcus
agalactiae
Vagina
Trichomonas
vaginalis
Vaginitis
Ninguna
Areas generalmente estriles. Como regla general, el resto de las estructuras del tracto
genitourinario se encuentran estriles.
Tabla 7
Microorganismos de la piel, odo y ojo
Microorganismo
Ubicacin
Enfermedad
Acinetobacter sup.
Piel
Complicaciones en pacientes
inmunocomprometidos
Bacillus spp
Piel
Candida albicans
Piel
Paroniquia (rara)
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Chlamydia trachomatis
Incierta
Corynebacterium spp
Epidermophyton
floccosum
Piel
Haemophilus aegyptius
Ojo
Haemophilus influenzae
Ojo
Micrococcus spp
Piel
No determinada
Moraxella spp
Ojo
Mycobacterium spp
Piel
Micobacteriosis (Piel)
eisseria spp
Ojo, piel
Peptostreptococcus spp
Piel
No conocida
Pityrosporum ovale
Piel
Caspa?
Propionibacterium spp
Piel
Sarcina spp
Piel
Complicaciones pacientes
inmunodeprimidos
Staphylococcus aureus
Staphylococcus
epidermidis
Heridas y Quemaduras
La flora de las heridas depende del sitio anatmico, del modo en que se produjo (traumtica o
quirrgica), del ambiente donde se produjo y del grado de contaminacin de las reas
adyacentes que fueron lesionadas al producirse la herida. Las heridas traumticas generalmente
se infectan con microorganismos aerbicos nativos, especialmente Staphylococcus aureus,
Streptococcus grupo A, Enterococcus Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Proteus spp.
Flavobacterium spp. y Acinetobacter spp. Entre las bacterias anaerbicas que con mayor
frecuencia infectan las heridas traumticas se encuentran los Clostridium spp., siendo los ms
frecuentes los clostridios de la gangrena gaseosa, tales como Clostridium perfringens tipo A, ,
Clostridium septicum y Clostridium novyii, aunque pueden ser simples contaminantes de las
heridas, por lo que el diagnstico de la gangrena gaseosa es estrictamente clnico, apoyado por
los hallazgos de laboratorio.
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Las infecciones que complican las heridas quirrgicas pueden ser producidas de dos formas. La
infeccin quirrgica, generalmente es una complicacin de un procedimiento de ciruga limpia.
Estas heridas dan cultivos positivos para Staphylococcus aureus, Enterococcus o bacilos Gram
negativos. La segunda clase de infeccin ocurre cuando el cirujano interviene en un rea
contaminada. Generalmente las bacterias que complican este tipo de ciruga son Escherichia coli,
Pseudomonas aeruginosa, Proteus spp, Providencia spp., el grupo Klebsiella-EnterobacterSerratia, Flavobacterium, Acinetobacter spp.,Bacteroides spp,entre los anerobios.
Muestras de Autopsia
Las muestras de autopsia pueden dar informacin de inmenso valor, cuando son tomadas
tempranamente, en forma asptica, cuando los cultivos son sembrados de inmediato y se
acompaan de frotis para tincin. Rutinariamente las muestras de rin, bazo, hgado y pulmn
son negativas, a menos que existan lesiones claramente establecidas en estos rganos. Si han
transcurrido ms de 6 horas entre el deceso y la toma de muestra, los cultivos tanto de sangre
de rganos slo reflejan la contaminacin postmortem o perimortem producida por los
microorganismos del intestino grueso. Una inmensa variedad de microorganismos, incluso
algunos inesperados, pueden ser recuperados y subsecuentemente demostrarse en los cortes de
tejido. Estos varan desde los ms comunes, hasta otros como Brucella, Nocardia, Penicillium,
Aspergillus, Streptococcus pneumoniae, Streeptococcus grupo A, Zygomycetes, Clostridium,
Salmonella y Shigella, para nombrar algunos.
Referencias escogidas
1. Murray PR, EJ, MA, Tenover FC. Yonken RH (editores). Manual of Clinical Microbiology, 6a
edicin. American Society for Microbiology, Washington, DC 1995.
2. Mims CA, Playfair JHL, Roitt IM, Wakelin D, Williams R (editores). Microbiologa Mdica.
Mosby/Doyma Libros, Gran Bretaa, 1995
3. Shaechter M, Medoff G, Eisenstein BI (editores). Mechanisms of MicrobiaDisease. 2a edicin.
Williams & Wilkins, Baltimore, 1993.
4. Shulman ST, Phair JP, Sommers HM (editores). The Biology & Clinical Basis of Infectious Diseases.
4a edicin W.B. Saunders Company, Philadlphia, 1992.
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