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RESUMEN
La mayora de las clulas eucariotas contienen mitocondrias que son vestigios de un suceso
endosimbionte ancestral que tuvo lugar hace aproximadamente 1.500-2.000 millones de aos,
cuando una bacteria con capacidad de utilizar oxgeno coloniz una clula protoeucaritica
husped. Las comparaciones de secuencias sugieren que los parientes ms cercanos de la
protomitocondria son las -proteobacterias, bacterias gram-negativas que pueden existir como
bacterias libres, aunque la mayora de los miembros de este grupo viven como simbiontes o
parsitos de plantas y animales. En particular, se considera que las eubacterias ms cercanas a la
mitocondria son miembros de la subdivisin rickettsia de las -proteobacterias. Los anlisis
filogenticos realizados hasta este momento sugieren que todos los genomas mitocondriales
descienden de un ancestro comn, lo que implica un origen monofiltico de la mitocondria, es
decir, que la mitocondria se origin una sola vez en la evolucin. El primer genoma mitocondrial
que se secuenci en su totalidad fue el de Homo sapiens, en el ao 1981. Este genoma presenta
caractersticas nicas que le hacen particularmente interesante para ser utilizado en estudios de
evolucin humana. As, su anlisis en poblaciones obtenidas de todo el mundo ha corroborado la
hiptesis, inicialmente propuesta de acuerdo con evidencias fsiles, de un origen africano del
humano moderno (Homo sapiens).
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INTRODUCCIN
La mitocondria desempea numerosas funciones metablicas y reguladoras en las
clulas eucariticas, y es el orgnulo donde se genera la mayor parte del ATP mediante el
sistema de fosforilacin oxidativa. Hace aproximadamente 2.000 millones de aos, la
tensin de oxgeno ambiental de la atmsfera en la tierra aument muy rpidamente, lo que
sugera que el origen de la mitocondria como orgnulo en los eucariotas primitivos estaba
asociado con este suceso medioambiental (1). Sin embargo, durante los miles de millones de
aos anteriores a este incremento global de oxgeno, la atmsfera terrestre probablemente
no fue la atmsfera fuertemente reductora sugerida por Oparin en 1957 (2). Durante la
historia de la biosfera, el oxgeno era accesible en la atmsfera a bajos niveles y muy
probablemente a niveles ms altos localmente. Esta presencia continua de oxgeno es
coherente con el origen ancestral de las oxidasas terminales caractersticas de la
mitocondria. Las reconstrucciones filogenticas basadas en las secuencias de citocromo c
oxidasa y citocromo b estn de acuerdo con la divergencia de las proto-mitocondrias a partir
de las bacterias hace 1.500-2.000 millones de aos. En consecuencia, el sistema respiratorio
oxidativo, que se introdujo en los eucariotas mediante la mitocondria primitiva, ya fue un
sistema enzimtico ancestral.
La teora endosimbionte del origen de la mitocondria se origin en el siglo
diecinueve y fue Margulis quin en los aos 70 la hizo resurgir cuando los mtodos
moleculares permitieron comprobar algunas de sus predicciones (3). Ms tarde, el
descubrimiento de los genomas mitocondriales y los resultados de reconstruccin
filogentica empleando secuencias de rARN y de algunas protenas mitocondriales
reforzaron esta teora segn la cual las mitocondrias son descendientes de las bacterias
aerbicas que, de alguna forma, sobrevivieron a la endocitosis y se incorporaron en el
citoplasma (4).
En este captulo, se resumen los avances ms recientes que se han publicado en el
campo de la evolucin de la mitocondria y su genoma. Aunque el origen de la mitocondria
a partir de la endosimbiosis de una proteobacteria es algo muy aceptado en la actualidad, la
naturaleza de la clula husped, la complejidad metablica del endosimbionte y la
evolucin posterior de la proto-mitocondria a la mitocondria actual son todava objeto de
debate y discusin. Asimismo, hasta hace unos aos la informacin de la organizacin del
genoma mitocondrial era escasa. El nmero de secuencias mitocondriales completas
disponibles as como el intervalo filogentico comprendido por estos mtADNs era bastante
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limitado, con un fuerte sesgo hacia los animales y particularmente hacia los vertebrados.
Esto ha dificultado mucho predecir cul fue el genoma mitocondrial ancestral (genoma
protomitocondrial) y, en particular, decidir que mtADNs contemporneos se parecen ms al
estado ancestral. Sin embargo, con los avances en el campo de la investigacin genmica
mitocondrial, entre los que se incluye la introduccin de la tecnologa de secuenciacin de
alto rendimiento, el nmero de genomas mitocondriales secuenciados completamente ha
aumentado considerablemente. La investigacin del mtADN presente en taxones
ancestrales e intermedios as como de organismos actuales ayudar a refinar las rutas y
modos de evolucin del mtADN.
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Figura 2.- Cdigo gentico estndar (dentro de la caja) y variaciones en el cdigo gentico
mitocondrial (fuera)
AAA (Asn en platelmintos y equinodermos)
AUA (Met en la mayora de los metazoos con excepcin de equinodermos, planarias y celentreos)
UGA (Trp en todos los animales)
AGA/AGG (Ser en la mayora de los invertebrados; Gly en los procordados; Stop en vertebrados)
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eliminados del genoma del parsito dado que tales funciones pueden ser dispensables o
complementadas por funciones del husped (codificadas en el ncleo).
La comparacin de los genomas mitocondriales de R. prowazekii (el ms
mitocondrial) y R. americana (el ms bacteriano) ha permitido identificar genes
adicionales en Rickettsia (834 frente a 62 genes) que se han perdido durante la evolucin del
genoma mitocondrial. Entre los genes de Rickettsia que no estn en el mtADN actual se
encuentran aquellos que se definen como operacionales (genes implicados en biosntesis de
cofactores, metabolismo de cidos grasos y fosfolpidos, metabolismo energtico, divisin
celular, etc.) y genes que codifican factores de replicacin, transcripcin y traduccin del
mtADN. En la mayora de los casos, esta informacin gentica perdida se encuentra
depositada y expresada en la actualidad en el genoma nuclear.
El contenido gnico relativamente bajo del mtADN comparado con los genomas
eubacterianos conocidos, incluso los ms pequeos, parece implicar una prdida
relativamente rpida y extensa o una transferencia de informacin gentica en un estadio
temprano en la evolucin del genoma protomitocondrial. Las diferencias en el contenido
gnico entre los mtADNs existentes se explican mejor asumiendo una prdida gnica
diferencial posterior a la divergencia del genoma protomitocondrial. De hecho, existen
casos bien documentados en plantas de una transferencia relativamente reciente de
informacin gentica del genoma mitocondrial al nuclear, que incluye genes que codifican
protenas estructurales de la cadena respiratoria y genes que codifican protenas
ribosomales. La eliminacin de genes del mtADN no es slo un proceso evolutivo en curso
sino que ciertos genes se han perdido en ms de una ocasin. Por ejemplo, los genes que
codifican protenas ribosomales estn ausentes en los genomas mitocondriales de
Plasmodium y otros apicomplexa, Chlamidomonas y algas verdes relacionadas, animales y la
mayora de los hongos, pero se infiere que han estado presentes en los mtADNs de los
ancestros evolutivos intermediarios de estos linajes.
Existen diferentes mecanismos moleculares que median la modificacin reductora de
genomas: uno es el mecanismo de disminucin en el cual se eliminan grupos cortos de
nucletidos, una manera lenta pero segura de eliminar secuencias de ADN. De hecho se
han observado evidencias de este mecanismo en el genoma de Rickettsia: casi una cuarta
parte del genoma de Rickettsia prowazekii es secuencia no codificante (6). El espectro
mutacional de secuencias no codificantes de distintas especies de Rickettsia sugiere que el
modo de evolucin dominante son deleciones cortas (19). As, las secuencias no
codificantes no esenciales pueden salir del genoma debido a pequeas deleciones. Un
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I
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fase inicial que se caracteriza por la incorporacin de los aminocidos prebiticos (Gly, Ala,
Ser, Asp, Glu, Val, Leu, Ile, Pro y Thr). Un paso intermedio que implica la incorporacin
de 7 aminocidos adicionales derivados de los prebiticos por biosntesis: Phe, Tyr, Arg,
His, Trp, Lys, y Met y una fase final donde se incorporaron al cdigo gentico los cinco
aminocidos cuya sntesis es dependiente de tARN o es mediada por rutas biosintticas no
cannicas (Asn, Gln, Cys, selenocistena (Sec) y pirrolisina (Pyl)).
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Dado que las protenas nucleares se sintetizan en el citoplasma usando el cdigo gentico
estndar y se transportan a la mitocondria utilizando un sistema de traslocacin mediado
por un pptido seal, su sntesis se escapa de la interrupcin causada por la reasignacin de
codones mitocondriales. Esto est de acuerdo con la hiptesis de minimizacin del genoma
que postula que la velocidad de replicacin impone una fuerte presin negativa en el
genoma mitocondrial que conduce a una seleccin de los genomas de tamao pequeo.
En resumen, los datos disponibles en la actualidad indican que el bajo uso y la no
asignacin de codones, la presin del genoma G+C, la minimizacin del genoma, el
pequeo tamao del proteoma y la desaparicin de tARNs juegan un papel crtico en la
evolucin del cdigo gentico. Curiosamente, las mitocondrias de plantas escapan de
alguna manera a los efectos de la evolucin y mantienen el cdigo gentico estndar (22,
26).
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2) Herencia Materna
El mtADN tiene un patrn de herencia materna, lo que ha facilitado a los
investigadores estudiar los diferentes linajes a lo largo del tiempo destacando el ancestro
materno de una poblacin sin los efectos de la herencia biparental y recombinacin
inherentes al ADN nuclear. Sin embargo, existe un caso descrito en la bibliografa de un
hombre con una intolerancia al ejercicio severa que presentaba un mtADN muscular de
origen predominantemente paterno (28). Desde hace varios aos se sabe que las
mitocondrias de los espermatozoides son destruidas selectivamente en el oocito y se ha
demostrado que el mtADN paterno es marcado para su destruccin en el oocito por
ubiquitinacin (29, 30). Esto indica que el caso de herencia paterna descrito podra ser
consecuencia de un fallo en el reconocimiento y eliminacin de las molculas paternas de
mtADN y que por tanto podra ser un fenmeno extremadamente raro. Este hecho ha sido
corroborado dado que investigaciones posteriores en ms pacientes no han revelado ningn
caso ms de herencia paterna (31, 32, 33). Por lo tanto, hasta este momento se considera
que el mtADN se hereda por va materna lo que resulta muy interesante para estudios de
evolucin humana.
3) Ausencia de Recombinacin
Otro principio de antropologa molecular que se ha considerado un dogma desde
hace aos es la ausencia de recombinacin en el mtADN. Sin embargo, desde el ao 1999
existen varios estudios, basados en anlisis estadsticos y filogenticos de secuencias de
mtADN, que tratan de demostrar, sin xito, la presencia de recombinacin en el mtADN
humano. Recientemente, se ha publicado un caso de recombinacin del mtADN en el nico
paciente conocido que presentaba mtADN materno y paterno (31). Aqu, la recombinacin
ocurra en aproximadamente 0,7% del mtADN total presente en el tejido muscular del
paciente. Este hecho indica que la recombinacin en el mtADN es posible porque las
mitocondrias poseen una recombinasa funcional, aunque no est claro en qu medida las
mitocondrias presentes en una clula son capaces de fusionarse e intercambiar ADN.
4) Tasa Mutacional
La tasa de mutacin del mtADN es varios rdenes de magnitud superior que la de
los genes nucleares, con una frecuencia estimada de 0,017 x 10-6 sustituciones por sitio y ao
para el genoma completo (excluyendo la regin de control donde la tasa mutacional es
mayor). Sin embargo, existen discrepancias entre las estimaciones de la tasa mutacional del
mtADN basadas en comparaciones filogenticas o en pedigrs. Debido a que un nmero
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AGRADECIMIENTOS
M.E.G. es postdoctoral senior del Centro de Investigacin Biomdica en Red
(CIBERER). La investigacin de nuestro laboratorio est financiada por el Instituto de
Salud Carlos III (PI070167 PI10/00703), el Ministerio de Ciencia e Innovacin (PLE20090144) y la Comunidad de Madrid (GEN-0269/2006).
ABREVIATURAS
ADN
mtADN
rARN
tARN
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cido desoxirribonucleico
ADN mitocondrial
ARN ribosmico
ARN de transferencia
SSU rARN
RFLP
pb
OXPHOS
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