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Son molculas muy complejas que producen todas las clulas vivas y los virus.
Reciben este nombre porque fueron aisladas del ncleo de clulas vivas. Los cidos
nucleicos son las sustancias fundamentales de los seres vivos, y se cree que aparecieron
hace unos 3.000 millones de aos, cuando surgieron en la Tierra las formas de vida ms
elementales. Los investigadores han aceptado que el origen del cdigo gentico que
portan estas molculas es muy cercano en el tiempo al origen de la vida en la Tierra . Los
bioqumicos han conseguido descifrarlo, es decir, determinar la forma en que la secuencia
de los cidos nucleicos dicta la estructura de las protenas.
Las dos clases de cidos nucleicos son el cido desoxirribonucleico (ADN) y el cido
ribonucleico (ARN). Tanto la molcula de ARN como la molcula de ADN tienen una
estructura de forma helicoidal. Su peso molecular es del orden de millones.
La investigacin pionera que revel la estructura general del ADN fue llevada a cabo
por los biofsicos britnicos Francis Crick, Maurice Wilkins y Rosalind Franklin, y por el
bioqumico estadounidense James Watson. Utilizando una fotografa de una difraccin de
rayos X de la molcula de ADN obtenida por Wilkins en 1951, Watson y Crick elaboraron
un modelo de la molcula de ADN, que fue completado en 1953. La estructura del ARN
fue descrita por el cientfico espaol Severo Ochoa y por el bioqumico estadounidense
Arthur Kornberg. Ambos sintetizaron ADN a partir de distintas sustancias. Este ADN tena
una estructura similar a la del ADN natural, pero no era biolgicamente activo.
La funcin biolgica de los cidos nucleicos es la de ser responsables del
almacenamiento y transmisin gentica y en unin con las enzimas son:
a) La direccin de la biosntesis de todas las protenas celulares.
b) La constancia de la replicacin de las clulas para dar clulas hijas idnticas
c) La propiedad de las clulas para adaptarse a las demandas fisiolgicas o a
cambios del medio ambiente.
d) Las mutaciones naturales e inducidas en la constitucin gentica de un organismo.
e) La inmensa variedad de organismos individuales dentro de una especie.
Tanto el RNA como el DNA estn compuestos de unidades monomricas denominadas
nucletidos. En consecuencia un cido se llama tambin polinucletido.
Cada nucletido tiene tres partes: 1) una aldopentosa - monosacrido de 5 carbonos
aldosa, 2) Una base nitrogenada cclica y 3) un grupo fosfato.
Azcar + Base Nitrogenada = Nuclesido
Nuclesido + Fosfato = Nucletido
Los dos cidos nucleicos son: ADN - cido desoxirribonucleico (el monosacrido de
sus nucletidos es 2-desoxirribosa) y ARN - cido ribonucleico (el monosacrido de sus
nucletidos es ribosa). Por sus siglas en ingls son DNA y RNA, respectivamente.
Otra diferencia entre DNA y RNA radica en la identidad de una de las cuatro bases
nitrogenadas; Adenina, Guanina y Citosina estn presentes, tanto en el DNA como en el
RNA; Timina est presente solo en las molculas de DNA y Uracilo solamente en RNA.
AZUCAR
PURINAS
PIRIMIDINAS
RNA D- Ribosa
Adenina
Guanina
Citosina
Uracilo
DNA D- Desoxirribosa
Adenina
Guanina
Citosina
Timina
UNA HEBRA
Cada hebra esta hecha de un azcar unido covalentemente a un fosfato que a su vez
se une a otro azcar y as sucesivamente. Cada hebra de ADN puede contener miles o
millones de estas uniones azcar-fosfato.
Cada azcar tiene tambin, una purina o pirimidina unida a l covalentemente.
Enlace fosfodistes
P - S - P - S - P - S - P - S - P
NB
NB
NB
NB
NUCLETIDOS
A) Ribosa y Desoxirribosa. Los azcares que diferencian los nucletidos del RNA y
DNA son las pentosas D-ribosa y la D-desoxirribosa cada uno contiene 5 tomos
de carbono y un grupo funcional OH. La desoxirribosa contiene un grupo OH
menos especficamente en la posicin del carbono 2. Los nombres sistemticos de
los azcares contienen el sufijo furanosa debido a la similitud estructural del
furano, que es una molcula de 5 miembros que contiene oxgeno.
RIBOSA
PURINAS
ADENINA
GUANINA
PIRIMIDINAS
CITOSINA
TIMINA
Unin mono-districa
Unin mono dianhdrico
Ambas uniones, ster y anhdrido.
URACILO
Unin monoster
Ester anhidrido
Anhidrido mixto
Unin diester
LA
CELULA
Wilkins era un cristalgrafo de rayos X esto es, estudiaba los ordenamientos de los
atomos en los cristales, bombardeando el crsital con el rayo X. La forma en que los rayos
X eran dispersado por los tomos en el cristal (pauta de difraccin) proporciona
informacin sobre el ordenamiento espacial de los tomos que forman el cristal.
(Similarmente, la manera en que los rayos X se esparcen por nuestro huesos, msculos y
piel, proporciona informacin sobre la densidad de estos tejidos y el ordenamiento de los
tomos dentro de ello) Wilkins examino los cristales de DNA purificado mediante este
mtodo y encontr que haba tres ordenamientos espaciales (periodicidades) en los
cristales de DNA; estos eran de 3.4A, 20A, y 34A Por qu la pauta de difraccin simpre
indica este espaciamineto repetitivo? Ordenar estos fragmentos de informacin para que
tengan sentido, es un rompecabezas.
Watson y Crick lo resolviern elegantemente. Conscientes de la estructura molecular
de las bases nitrogenadas y de su organizacin en el nuclotido Watson y Crick
construyern modelos a escala del DNA, utilizando la estructura y el tamao de las purina
y pirimidinas y las dimensiones del cristal de DNA. Ordenarn los nucleotidos en una
secuencia lineal en la que el eje de la cadena estaba formado por secuencias repetitivas
de azcar-fosfato-azucar-fosfato; ms aun, propusiern que la molecula del DNA
constaba de dos largas cadenas, cada una de ellas con un eje de azcar-fosfato. La
posicin de las bases result algo problemtica, pero de pronto qued claro que la
adenamina slo poda enlazarse con la timina (mediante dos puentes de hidrogeno) y que
la guanina slo podia enlazarse con la citosina (mediante tres puentes de hidrogeno)
Semejante apareamineto especifico de una purina con una pirinidina explicaba las
cantidades identicas de adenina-timina y citosina-guanina. Adems, cuando las bases
nitrogenadas se reunian como A-T o G-C la distancia a lo ancho era de 20A. Watson y
Crick propuesiern que los nucleotidos estaban ordenados longitudinalmente formando
dos largas cadenas; el eje de cada una consataba de dos grupos de azcar y fosfatos, y
ambas estaban enlazadas por bases en los puntos interiores (Fig 6.4).
Entonces se hizo obvio que las bases formaban los peldaos de una escalera y que
los ejes constaban de una secuencia ordenada en forma alterna de azcares y fosfatos;
la distancia entre bases sucesivas (peldaos) era de 3.4A. La periodicidad de 34A que
Wilkins haba encontrado en los crsitales de DNA es 10 veces 3.4A y Watson y Crick
propuesiern que la escalera estaba enrollada en forma de helice (semejante a uan
escalera en espiral) con un giro completo (360) cada dcima base. El modelo de
Watson-Crick para el DNA estaba completo lo llamarn la doble helice, puesto que estaba
hecho de dos cadenas de nucleotidos enrollada una alrededor de otra (Fig 6.4).
Una de las propiedades que el DNA debe tener para funcionar en la herencia es la
capacidad de duplicarse. El modelo de Watson-Crick incluye esto. Una cadena del DNA
es complemento de la otra, puesto que cuando la adenina se presenta en una cadena, la
timina lo hace en la opuesta y la guanina en una cadena frente a la citosina en la otra.
Las cadenas helicoidales pueden ser separadas por las bases apareadas; el abrirse es
el resultado de la reduccin de los hidrogenos que formaban puentes entre las bases,
esto permite que se forme una nueva cadena complementaria de nucletidos y otros
materiales presentes en la clula, bajo la direccin de una enzima especifica llamada
DNA polimerasa (Fig 5).
Toda la informacin necesaria para ordenar estas bases en una secuencia lineal con
el fin de complementar las cadenas originales del DNA est proporcionado por este
mecanismo de apareamiento complementario de bases.
Por ejemplo, si la cadena del DNA contiene adenina, un nucletido que contenga
timina se aparear con ste; y si la base siguiente en la cadena de DNA es guanina el
nucletido que har par con l debe contener citosina; y as sucesivamente en esta forma
las nuevas cadenas complementarias; la nueva cadena es una copia complementaria del
original. La formacin de dos nuevas cadenas identicas a las dos originales se efectan
as, pero adems y esto es lo ms importante, la secuencia exacta de los pares de
bases nitrogenadas en las cadenas originales se habr reproducido exactamente (Fig 6.5)
Este proceso de duplicacin de DNA se llama replicacin.
B
a
C
b
D
c
pigmento castao
d
necesita. Se ha establecido que el codigo genetico es un codigo por tripletes; esto es,
consta de secuencia de tres bases nitrogenadas. La naturaleza de las palabras del codigo
por tripletes ha sido descifrada completamente. Estos se muestra en la Fig 6.8. Como
puede observarse, hay alguna redundancia en el codigo, puesto que algunas
combinaciones significan el mismo aminoacido; por ejemplo, las palabras del codigo DNA
que especifica la alanina son CGA, CGG, CGT, Y CGC. Tenemos una situacin similar en
el lenguaje espaol, donde varias palabras diferentes pueden utuilizarse para especificar
el mismo objeto: casa, hogar, morada, residencia. Los codigos en los que varias
palabras diferentes del codigo describen la misma cosa se llaman
cdigos
degenerados; el codigo genetico es un codigo degenerado.
S
e
ha descubierto que el cdigo gentico es universal, esto es, se da el mismo triplete para el
mismo aminocido en todos los organismos desde virus hasta los seres humanos. Esto
sugiere que el cdigo gentico probablemente evoluciona solo una vez. Las diferencias
entre virus, bacterias, seres humanos y los dems organismos vivos no se deben a
diferencias en las clases de bases nitrogenadas en su DNA, sino a variaciones en la
secuencia de estas bases. Es muy parecido a usar las letras del alfabeto para formar
palabras diferentes. Las letras utilizadas son siempre las mismas, sin embargo su
significado (mensaje) pueden diferir segn la manera en que se hayan ordenado la letras.
Similarmente, el orden diferente de los tripletes (letras) a lo largo de la cadena de DNA,
originara una secuencia variable de aminocidos (palabras) en una protena (enunciado)
es posible producir un numero casi infinito de ordenamiento de tripletes en el DNA y asi es
posible tener una variedad ilimitada de secuencias de aminocidos en las protenas. La
especificidad de la especie tiene como bases las diferentes secuencias de aminocidos
en una protena (esto es, la hemoglobina del perro difiere de la humana en el numero de
aminocidos), pero debe hacerse hincapie en que este es ,en ultimo trmino un reflejo del
orden especifico de las palabras de tres letras de la clave gentica el DNA (cuadro 6B).
Al igual que con el DNA, estos grupos constitutivos juntos forman un nucletido o ms
especficamente un ribonucletido (Fig 6-9) Aunque el RNA, como el DNA contienen
cuatro bases nitrogenadas diferentes solo tres de estas son las mismas del DNA. El RNA
contiene las bases adenina, guanina, citosina y uracilo. El uracilo es una pirimidina
idntica a la timina, y en el RNA, el uracilo reemplaza la timina del DNA.
Figura 6-9- estrcuctura general de un ribonucletido.
se expone (Fig 6-10): solo una de las cadenas expuestas del DNA sirve como gua para
la sntesis de una cadena complementaria del RNAm. Utilizando el mecanismo del
apareamiento complementario de bases, los nucletidos del RNAm incipiente, libres en el
ncleo se alinean y forman pares con los nucletidos de DNA: el RNAm uracilo con el
DNA-adenina, el RNAm-citosina con DNA-guanina y el RNAm-adenina con el DNA-timina.
El mecanismo de apareamiento de las bases, a segura que la secuencia de los
nucletidos en la cadena de DNA es seguida exactamente por la secuencia en la que los
nucletidos del RNAm incipiente estn alineados. Una vez alineados los nucletidos se
enlazan con la ayuda de la enzima RNA polimerasa, para formar una cadena de RNAm.
La molcula de RNAm se separa de la cadena del DNA y abandona el lugar de sintesis en
el ncleo: las cadenas de DNA ahora se cierran (Fig 6-10) As las secuencias de los
nucletidos del DNA, que corresponden a os genes, son copiadas en la secuencia
nucletidos del RNAm; el cdigo gentico ha sido reescrito o copiado por el RNAm sin
ningn cambio en las palabras; el proceso se llama trascripcin.
Co
o
ya
hemos visto, el lenguaje del cdigo gentico contenido en la molcula del DNA esta
escrito con palabras de tres letras, utilizando un alfabeto de cuatro letras. El RNAm
utilizando un alfabeto de cuatro letras, una sola de las cuales es diferente del alfabeto del
DNA, copia fidedignamente estas palabras de tres letras del cdigo. Las cuatro letras del
alfabeto de DNA pueden formar 64 palabras diferentes del cdigo de tres letras o
tripletes y es fcil ver que en el RNAm el cdigo de cuatro letras puede formar tambin 64
palabras de tres letras; las 64 palabras del cdigo del RNAm se llama codones (Fig 6-8)
El problema de sacar la informacin gentica del ncleo sin liberar DNA, se ha resuelto
mediante la produccin de una cadena de RNAm. El RNA mensajero tiene un nombre
apropiado, porque no slo copia el cdigo gentico, sin que sale del ncleo donde fue
sintetizado y entra en el citoplasma. En el citoplasma el RNAm se une a un partcula, el
ribosoma, que contiene protena y una clase especial de RNA llamado RNA ribosomal
(RNAr) El ribosoma es el lugar, en la clula donde se sintetizan las protenas.
Cmo se traslada a la protena el mensaje codificado del RNAm? Es claro que antes
de poder sintetizar una protena , es necesario poner en posicin los aminocidos
constituyentes, ordenarlos en la secuencia apropiada y forjar las uniones peptdicas entre
los aminocidos adyacentes, de modo que se produzca una protena. Los aminocidos
no pueden efectuar esto por s mismos, puesto que no se enlazaran completamente con
el RNAm; el proceso depende de la molcula de un tipo adaptador que recoger un
aminocido individual y lo transferir al RNAm; este adaptador se llama RNA de
transferencia (RNAt) EL RNA de transferencia es una molcula de RNA torcida, de tal
manera que adquiere la forma de una hoja de trbol (Fig 6-11). Hay, por lo menos 20
clases de RNAt en el citoplasma y cada uno se liga a un aminocido especifico en su
extremo (Fig 6-11) En el doblez de la molcula de RNAt en forma de hoja de trbol, hay
triplete especfico de nucletidos, complementario de un triplete particular (codn) de
RNAm, denominado articodn.
Hemos presentado a todos los participantes en la sntesis de protenas; veamos ahora
como funcionan. Cada aminocido libre en el citoplasma, es activado por el ATP una
enzima; este aminocido activado es transferido a uno de los extremos de RNAt en forma
de hoja de trbol, especifico para ese aminocido particular. El RNAt lleva el aminocido
activado al ribosoma, compuesto de dos regiones globulares, una ms grande que otra
((Fig 6-12) .
La sntesis de la protena realmente comienza cuando una sola cadena de RNAm se une
a la regin de triple complementaria del UNAM (codn) (Fig 6-13).
El RNAt que lleva un aminocido, es puesto en posicin sobre la porcin ms grande del ribosoma;
en esta forma, el ribosoma activa como anzuelo o tornillo que conserva el RNAm en posicin y gua
el anticodn del RNAt. El siguiente paso implica el movimiento de un segundo RNAt con su
aminocido hasta el ribosoma y el acoplamiento especifico de su regin anticodn con el siguiente
codn del RNAm. As, cuando los dos codnes adyacentes del RNAm son ledos hay RNAt en el
ribosoma, alineados adecuadamente y unidos al RNAm, llevando cada uno un aminocido
activado. Con la ayuda de dos enzimas y de una molcula de GTP rica en energa (similar al ATP,
pero que contiene guanosina en vez de adenosina) se forma un enlace peptdico entre los
aminocidos adyacentes y el enlace del primer RNAt con el RNAm debilitndose el aminocido
(Fig 6-13b) Entonces, el ribosoma se mueve a lo largo de la cadena de RNAm cuando se lee el
tercer codn y el primer RNAt, ahora sin su aminocido descargado del RNAm (Fig 6-13c) Un
nuevo RNAt que lleva un aminocido activado, puede ahora unirse al tercer codn del RNAm el
movimiento del ribosoma a lo largo de la cadena del RNAm produce una lectura secuencial de
codn tras codn. Con cada lectura ocurre lo siguiente:
1.
2.
3.
4.
manifiesta con frecuencia actividad enzimtica parcial. Para visualizar la diferencia entre
estas situaciones consideremos el siguiente enunciado: sonmassinpanqueconpan.
Si semejante enunciado se lee en tripletes, el significado se vuelve claro; son ms con
pan que sin pan. Si hubiera una delecin o se insertara una letra, y de nuevo la
secuencia de letras se leyera por tripletes, la lectura se transtornara y se producira un
enunciado sin sentido:
Insercin: sonmssinbpanqueconpan son ms sin bpa nqu eco npa n.
Delecin: sonmassinpnqueconpan son mas sin pnq uec onp an.
Sin embargo, la sustitucin de una sola letra puede producir un resultado con sentido.
Sonmassinpanqueconpaz son mas con pan que sin paz.
Como se menciono el cdigo genetico es codigo degenerado, cada aminoacido
particular est codificado por ms de un triplete. La degeneracin ocurre con ms
frecuencia en la tercera letra del triplete; as la lisina est codificada tanto por AAG com o
por AAA. Si ocurriera una sustitucin de base, que convirtiera AAA en AAG no habria
sustitucin del aminoacido y se produciria una proteina normal.
Una de las
especulaciones sobre la causa de la degeneracin en el codigo genetico es que regula
contra alteraciones que pueden llevar a efectos poco favorables.
James Joyce en Ulysses escribi sin ninguna puntuacin y en tal relato el significado a
veces se toma ambiguo porque las oraciones se confunden Cmo sabe la maquinaria
de la clula cuando empezar a leer una secuencia de nucletidos y cuando detenerse?
Puesto que el DNA es una larga cadena de nucletidos , es difcil entender porque la
clula no produce una cadena polipeptdica gigante: una oracin molecular continua.
Cules son los signos de puntuacin que determina la longitud de la oracin y le dicen a
la clula donde esta el principio y el fin de un gen?
Ya se han encontrado los signos de puntuacin necesarios (equivalentes a un periodo
o a un espacio) entre las secuencias lineales de nucleotidos en el DNA. La
transcripcin de una parte de DNA implica la enzima RNA polimerasa que cataliza la
formacin de la cadena de RNAm. La RNA polimerasa es una protena compleja que
consta de cinco cadenas polipeptdicas separadas.
Uno de los polipptidos se lama o (la letra griega sigma o S en ingles) y su funcin es
reconocer las seales de iniciacin para transcribir el DNA. Aunque la seal de iniciacin
se identifica por o no se ha determinado se cree que consta de una timina o citosina.
As como hay seales de iniciacin tambin hay de terminacin que actan para
concluir la sntesis de RNAm en un lugar especifico en el DNA. La lectura de estos signos
o puntos de terminacin, se hace mediante una protena especifica llamada p (la letra
griega rho o R en ingles) Hasta ahora no esta completamente claro como funciona p;
se pueden unir a nucletidos especficos en el DNA o actuar para liberar la RNA
polimerasa. El resultado final de la actividad de p es la separacin del RNAm del DNA.
Una vez transcrito el DNA en una cadena de RNAm, este se dirige al ribosoma,
donde se sintetiza la protena. La iniciacin y terminacin de una cadena protenica son
codificados mediante codnes RNAm especiales. Casi todas las protenas pueden
producirse en el laboratorio utilizando las enzimas adecuadas y una serie de nucletidos
que determinan el codn de iniciacin que codifica para el aminocido metionina, pero en
la naturaleza no todas las protenas tiene este aminocido en su extremo inicial. Esto se
explica porque en la s celulas hay dos clases de moleculas de RNAt para metionina. Una
molcula de RNAt se acopla a la metionina normal, pero la otra se une a una metionian