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Todas las clulas contienen la informacin necesaria para realizar distintas reacciones
qumicas mediante las cuales las clulas crecen, obtienen energa y sintetizan sus
componentes. Est informacin est almacenada en el material gentico, el cual puede
copiarse con exactitud para transmitir dicha informacin a las clulas hijas. Sin embargo
estas instrucciones pueden ser modificadas levemente, es por eso que hay variaciones
individuales y un individuo no es exactamente igual a otro de su misma especie (distinto
color de ojos, piel, etc.). De este modo, podemos decir que el material gentico es lo
suficientemente maleable como para hacer posible la evolucin.
La informacin gentica o genoma, est contenida en unas molculas llamadas cidos
nucleicos. Existen dos tipos de cidos nucleicos: ADN y ARN. El ADN guarda la
informacin gentica en todos los organismos celulares, el ARN es necesario para que
se exprese la informacin contenida en el ADN; en los virus podemos encontrar tanto
ADN como ARN conteniendo la informacin (uno u otro nunca ambos).
OBJETIVOS
cidos nucleicos
Definicin
Los cidos nucleicos son polinucletidos, es decir, polmeros lineales resultantes de la unin mediante
enlace fosfodister de un nmero variable de unidades monomricas bsicas, denominadas
nucletidos. Un nucletido est formado por tres componentes; una pentosa (la ribosa o la
desoxirribosa), un compuesto heterocclico nitrogenado (base nitrogenada purina o pirimidina) que
junto con la pentosa forma un nuclesido, y una molcula de cido fosfrico. Los nucletidos tienen
papeles muy variados dentro del metabolismo celular. Son la moneda energtica en el metabolismo
(ej. ATP), son mensajeros qumicos secundarios en la respuesta celular a los estmulos inducidos por
hormonas o agentes externos (ej.: AMPc), constituyen una serie de importantes cofactores
enzimticos y, por supuesto, son los constituyentes de los cidos nucleicos: ribonucleicos (ARN) y
Desoxirribonucleicos (ADN). Los cidos nucleicos son macromolculas polimricas formadas por
subunidades llamadas nucletidos.
Composicin
Los cidos nucleicos estn formados por la condensacin de unidades bsicas estructurales llamadas:
NUCLEOTIDOS
Unidos por enlace fosfodiester. Un nucletido est constituido por :
Bases pirimidnicas, derivadas de la pirimidinas. Son la citosina (C), que se encuentra tanto en el
ADN como en el ARN; la timina (T), que se presenta slo en el ADN; y el uracilo (U), componente
del ARN.
Bases pricas, derivadas de la purina. Las ms importantes
la guanina (G). Las dos en ambos tipos de cidos nucleicos.
son
la adenina (A) y
Nuclesido
La unin de una pentosa con una base nitrogenada forma un nuclesido. El enlace se
forma entre el carbono anomrico del azcar y uno de los nitrgenos de la base
nitrogenada. En la unin se forma una molcula de agua. Este enlace recibe el nombre de
enlace N-glucosdico. Si la pentosa es una ribosa, tenemos un ribonuclesido. Estos tienen
como bases nitrogenadas la adenina, guanina, citosina y uracilo. Si la pentosa es un
desoxirribosa, tenemos un desoxirribonuclesido. Estos tienen como bases nitrogenadas la
adenina, citosina, guanina y timina. Se nombra aadiendo la terminacin -osina, si derivan
de una base prica, o -idina, se sta es pirimidnica, al nombre de la base que lo forma:
adenosina, guanosina, citidina, timidina, etc. Si la pentosa es la desoxirribosa se antepone
el prefijo desoxi-; por ejemplo, desoxiaguanosina, desoxicitidina, etc.
Los nucletidos se forma por la unin de un nuclesido con el cido fosfrico, esta se
produce mediante la esterificacin del azcar por el cido fosfrico. Es una
unin fosfoster entre un OH del cido fosfrico y el OH situado en el carbono 5 del azcar,
con formacin de una molcula de agua. Segn el azcar sea la ribosa o la desoxirribosa,
tendremos ribonucletidos odesoxirribonucletidos.
La nomenclatura de los nucletidos es compleja. Los nucletidos se nombran como el
nuclesido del que proceden eliminando la a final y aadiendo la terminacin monofosfato, por
ejemplo, adenosin monofosfato (AMP). Llevan el prefijo desoxi-, en el caso de estar formadas por la
pentosa desoxirribosa. (dAMP)
N de repeticiones
N de nucletidos
A (SU)
5.700
B (SU)
7.530
C (SBNC)
3.720
D (SBNC)
4.350
E (SR)
200
500
F (SAR)
10.000
300
G (SAR)
1.000.000
200
Complejidad
22.300
Si imaginamos un organismo eucarionte con los tipos de secuencias indicados en la tabla anterior, su
complejidad sera la suma del nmero de nucletidos de cada tipo de secuencia (22.300) sin tener en
cuenta el nmero de veces que est repetida cada una de ellas.
No es difcil imaginar que la velocidad de renaturalizacin del ADN (paso de dos hlices sencillas a
una doble hlice) este relacionada con el nmero de veces que esta repetida una determinada
secuencia.
Las curvas de renaturalizacin o curvas Cot, de organismos que carecen de secuencias repetidas
como virus y bacterias, tienen forma de S, tienen un slo punto de inflexin o punto medio de la
reaccin. Todas las secuencias son nicas y tienen la misma probabilidad de encontrar a su
complementaria para formar la doble hlice.
Las curvas Cot de organismos eucariontes con diferentes tipos de secuencias, poseen varios puntos
de inflexin. Cada uno de ellos correspondiente a un tipo de secuencias (nicas, moderadamente
repetidas, y altamente repetidas).
Como en el caso de las curvas de fusin, tambin se utiliza como medida el punto medio de la
reaccin de renaturalizacin, es decir, el Cot o tiempo al que se ha reasociado la mitad del ADN. El
Cot es directamente proporcional a la complejidad del ADN del organismo. Valores de Cot bajos
(10-4 a 10-1) corresponden a secuencias altamente repetidas, valores de Cot comprendidos entre 10
y 102 corresponden a secuencias moderadamente repetidas y las secuencias nicas o de bajo nmero
de copias dan lugar a valores de Cot altos (mayores de 10 3) .
Eco RI
Hae III
Dichas endonucleasas de restriccin fueron descubiertas por Werner Arber, Hamilton O. Smith y
Daniel Nathans en la bacteria E.coli , trabajos por los que recibieron el premio Nobel. Estas enzimas
forman parte del sistema de defensa (sistema de modificacin-restriccin) de las bacterias frente a la
entrada de ADN exgeno en su interior. Existen cientos de endonucleasas diferentes que reconocen
distintas secuencias cortas de tipo palndrmico. En la siguiente tabla se indican algunas de las
endonucleasas ms frecuentes:
Endonucleasa de
restriccin
Eco RI
Escherichia coli
Eco RII
Escherichia coli
Hae III
Haemophilus aegyptus
Hin dII
Haemophilus influenzae
Hin dIII
Haemophilus influenzae
Hpa I
Haemophilus parainfluenzae
Hpa II
Haemophilus parainfluenzae
Ava I
Anabaena variabilis
Del ARNm: Llevar la informacin gentica codificada (obtenida por transcripcin del ADN)
desde el ncleo hasta los ribosomas donde es traducida en una secuencia de AA.
Del ARNr: Asociado a protenas constituye los ribosomas y su funcin est relacionada con
la traslacin de stos a lolargo del ARNm durante la traduccin (sntesis de proteica).
Del ARNt: posee un triple papel:
-captar AA activados del citoplasma (forma los 'complejos de transferencia' AA-ARTt).
-transferir tales AA a los ribosomas en sntesis.
-colocarlos en el lugar que les corresponde en la protena de acuerdo con la informacin
codificada en el ARNm (por complementariedad entre el triplete anticodn del ARNt y el
triplete codn del ARNm)
Clasificacin
ADN
El ADN, cido desoxirribonucleico, o en ingls DNA, se define como un biopolmero (compuesto
qumico formado por unidades estructurales que se repiten) que constituye el material gentico de las
clulas. Est formado por unidades que estn ordenadas segn una secuencia y es ah donde se
encuentra la informacin para la sntesis de protenas. Es el responsable del cdigo gentico, que
determina en gran medida las caractersticas de los seres vivos al nacer.
La molcula de ADN est formada por dos cadenas formada por compuestos qumicos llamados
nucletidos. Existen cuatro tipos de nucletidos diferenciados por sus bases nitrogenadas; adenina,
timina, citosina y guanina. Las cadenas forman una especie de cadena retorcida, lo que permite que el
ADN se pueda desenrollar y hacer una lectura de ste. Cada nucletido posee una afinidad qumica
con aquel que se encuentra en paralelo en la otra cadena; adenina tiene afinidad con la timina, y la
citosina con la guanina. Esta afinidad qumica se ve empricamente con la unin de un enlace de
hidrgeno. Los nucletidos estn formados por un cido fosfrico, una desoxirribosa y una base
nitrogenada.
La estructura del ADN es tridimensional, por lo tanto posee tres niveles de distintas caractersticas:
Estructura primaria:
Cadena de nucletidos encadenados seguidos por una secuencia. Aqu se encuentra la
informacin gentica de la clula
Estructura secundaria:
Doble hlice. Mecanismo de duplicacin del ADN. Complementos en las bases nitrogenadas.
Estructura terciaria:
Almacenamiento del ADN en un volumen reducido. Esto vara dependiendo la clula si es
procarionte (disperso en el citoplasma) o eucarionte (almacenado complejamente en el ncleo).
El ADN posee diversas propiedades y funciones de las cuales destaca: El control de la actividad
celular. Lleva la informacin gentica de la clula la que determina las caractersticas de sta y que
puedan ser transmitidas en el proceso de divisin celular. Puede duplicarse en la divisin celular,
ESTRUCTURA
Existen cuatro bases: dos pricas denominadas adenina (A) y guanina (G) y dos pirimidnicas
denominadas citosina (C) y timina (T). Para formar el ADN, se unen largas cadenas de estas bases
mediante molculas de fosfato y azcar. La estructura de doble hlice (ver figura) del ADN no fue
descubierta hasta 1953 por James Watson y Francis Crick (el artculo A Structure for Deoxyribose
Nucleic Acid fue publicado el 25 de abril, 1953) en Nature), que dejaba claro el modo en que el ADN
se poda "desenrollar" para que fuera posible su lectura o copia. Una larga hebra de cido
nucleico est enrollada alrededor de otra hebra formando un par entrelazado.Dicha hlice mide 3,4 nm
de paso de rosca y 2,37 nm de dimetro, y est formada , en cada vuelta, por 10,4 pares de
nucletidos enfrentados entre si por sus bases nitrogenadas. El rasgo fundamental es que las bases
de nucletidos de una hebra "casan" con la especie de nucletidos de la otra, en el sentido de que la
adenina siempre casa con la timina (lo que se denomina A....T) y la guanina siempre casa con la
citosina (G...C). Este emparejamiento corresponde a la observacin ya realizada por Chargaff (19052002) de que en todas las muestras la cantidad de adenina es siempre la misma que la timina, como
ocurre con la guanina y la citosina, as se aseguran cantidades iguales. Asi una pequea purina
(adenina y guanina) est siempre emparejada con una mayor pirimidina (timina y citosina), siendo de
este modo uniforme la doble hlice (no hay "bultos" ni "pellizcos"). La cantidad de purina (A+G) es
siempre igual a la cantidad de primidina (T+C). Se estima que el genoma humano tiene alrededor de
3.000 millones de pares de bases.Dos unidades de medida muy utilizdas son la kilobase (kb) que
equivale a 1.000 pares de bases, y la megabase (Mb) que equivale a un milln de pares de bases
El modelo de doble hlice permite explicar las propiedades que se esperan del ADN:
Enlace de hidrgeno
La adhesin de las dos hebras de cido nuclico se debe a un tipo especial de unin qumica
conocido como puente de hidrgeno. Los puentes de hidrgeno son uniones ms dbiles que los
tpicos enlaces qumicos, esto significa que las dos hebras de la hlice pueden separarse con
facilidad, quedando intactas.
A--T
C---G
Papel de la secuencia
En un gen, la secuencia de los nucletidos a lo largo de la cadena de ADN define una protena que un
organismo es capaz de sintetizar o "expresar" en uno o varios momentos de su vida, usando la
informacin de dicha secuencia. La relacin entre la secuencia de nucletidos y la secuencia
de aminocidos de la protena es determinada por un mecanismo celular de transcripcin, conocido de
forma general como cdigo gentico.
En muchas especies de organismos, slo una pequea fraccin del total de la secuencia
del genoma codifica protenas. La funcin del resto es especulativa.
La secuencia tambin determina la susceptibilidad del ADN para ser cortado por restriccin
enzimtica, la quintaesencia de la ingeniera gentica. La posicin en la que es secuenciada en un
genoma individual determina la huella de ADN. (por completar)
EL ADN como almacn de informacin
En realidad se puede considerar as, como un almacn de informacin (mensaje) que se trasmite de
generacin en generacin, conteniendo toda la informacin necesaria para construir y sostener el
organismo en el que habita.Se puede considerar que las obreras de este mecanismo son
las protenas. Estas pueden ser estructurales como las protenas de los msculos, cartlagos, pelo,
etc., o bienfuncionales como las de la hemoglobina o las innumerables enzimas del organismo. La
funcin principal de la herencia es la especificacin de las protenas, siendo el ADN una especie
de plano o receta para nuestras protenas. Unas veces la modificacin del ADN que provoca
disfuncin protica lo llamamos enfermedad, otras veces, en sentido beneficioso, dar lugar a lo que
conocemos como evolucin.
Las alrededor de treinta mil protenas diferentes en el cuerpo humano estn hechas de veinte
aminocidos diferentes, y una molcula de ADN debe especificar la secuencia en que se unan dichos
aminocidos,
El ADN en el genoma de un organismo podra dividirse conceptualmente en dos, el que codifica las
protenas y el que no codifica. En el proceso de elaborar una protena, el ADN de un gen se lee y se
transcribe a ARN. Este ARN sirve como mensajero entre el ADN y la maquinaria que elaborar las
protenas y por eso recibe el nombre de ARN mensajero. El ARN mensajero instruye a la maquinaria
que elabora las protenas, para que ensamble los aminocidos en el orden preciso para armar la
protena.
El dogma central de la gentica es que el flujo de actividad y de informacin es:
ADN ARN protena
Slo muy raras veces la informacin fluye del ARN al ADN.
ADN LIGASA
ADN ligasa es una enzima que forma enlaces covalentes entre el extremo 5 de una cadena
polinucleotdica y el extremo 3 de otra cadena polinucleotdica. Tambin se denomina enzima de
unin de polinucletidos.
La reparacin por escisin puede ser realizada por 3 enzimas: la correndonucleasa U.V., iniciadora del
proceso, la ADN polimerasa I, que elimina y reconstruye el fragmento de ADN, y la ADN ligasa, que
realzia la unin de los fragmentos nuevos y antiguos.
ADN POLIMERASA
ADN polimerasa es una enzima que cataliza la sntesis de ADN a partir de desoxirribonucletidos y de
una molcula de ADN plantilla o molde.
Tras la accin de la ADN polimerasa I y una vez que se han eliminado y aadido alrededor de unas
10 bases, interviene la enzima ADN ligasa que une los extremos libres del fragmento recin formado
con el resto de la cadena, recuperando as el ADN su estructura normal
ADN FSIL
El estudio del ADN fsil, se usa en paleogentica, utiliza la reaccin en cadena de la polimerasa PCR,
permitiendo estudiar registros moleculares de ADN que sean lo suficientemente antiguos, pudiendo
realizar secuenciaciones y estudiar su composicin. Los restos de ADN del fsil ms antiguo que se
conoce (que han podido ser recuperados y ledos) pertenecen a losneanderthales no sobrepasando
los 50.000 aos.
Uno de sus usos ha sido los anlisis comparativos de ADN que concluyen que en nuestro genoma no
hay herencia neandertal
ADN GIRASA
Una de las ADN topoisomerasas que acta durante la replicacin del ADN para reducir la tensin
molecular causada por el superenrollamiento. La ADN girasa produce cortes de doble cadena y
despus los une.
La ADN girasa, como topoisomerasa, juega un papel muy importante en la modulacin del estado
topolgico del ADN, regulando la estructura superhelicoidal del mismo.
ADN MITOCONDRIAL
En las clulas eucariotas la mayor parte del cdigo gentico est dentro del ncleo celular, pero
tambin hay orgnulos dentro del citoplasma que contienen ADN, que es llamado mADN o ADN
mitocondrial para diferenciarlo del ADN nuclear.
El cdigo con el que las mitocondrias representan las protenas es parecido al nuclear, pero no es
igual, hay algunas diferencias.
ADN RECOMBINANTE
ADN recombinante : variedad de tcnicas que los bilogos moleculares utilizan para manipular las
molculas de ADN. El proceso consiste en tomar una molcula de ADN de un organismo, sea
un virus, planta o una bacteria y llevarla al laboratorio para manipularla y ponerla de nuevo dentro de
otro organismo. Esto se puede hacer para estudiar la expresin de ungen e incluso en algunos casos,
para tratar una enfermedad gentica humana.
Las ADN polimerasas tambin realizan otras funciones durante el proceso de replicacin. Adems de
participar en la elongacin, desempean una funcin correctora y reparadora gracias a su actividad
exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de degradar el ADN partiendo de un extremo de ste.
Es importante que existan estos mecanismos de correccin ya que de lo contrario los errores
producidos durante la copia del ADN daran lugar a mutaciones.
Punto de origen
Un origen de replicacin es el lugar del cromosoma donde se inicia la replicacin de la cadena de
ADN. Se trata, por lo tanto, de una determinada secuencia de nucletidos a partir de la cual se
desarrolla una horquilla de replicacin que dar lugar a las dos cadenas idnticas de ADN resultantes.
En los organismos procariotas suele encontrarse un nico origen de replicacin en su ADN, mientras
que en los eucariotas se encuentran normalmente mltiples orgenes en cada cromosoma, lo que
permite una velocidad razonable de replicacin de las largas cadenas de ADN de estos organismos.
Esta multiplicidad de orgenes en una cadena conforma las denominadas burbujas de replicacin.
Caractersticas generales
En cada una de las molculas hijas se conserva una de las cadenas originales, y por eso se dice
que la replicacin del ADN es semiconservadora. Hasta que finalmente se pudo demostrar que la
replicacin es semiconservadora, se consideraron tres posibles modelos para el mecanismo de la
replicacin
Semiconservadora (modelo correcto). En cada una de las molculas hijas se conserva una de
las cadenas originales.
Etapas de la transcripcin
Pre iniciacin
Al contrario de la replicacin de ADN, durante el inicio de la transcripcin no se requiere la presencia
de un cebador para sintetizar la nueva cadena, de ARN en este caso. Antes del inicio de la
transcripcin se necesitan toda una serie de factores de transcripcin que ejercen de factores de
iniciacin, que se unen a secuencias especficas de ADN para reconocer el sitio donde la transcripcin
ha de comenzar y se sintetice el ARN cebador. Esta secuencia de ADN en la que se ensamblan los
complejos de transcripcin se llama promotor. Los promotores se localizan en los extremos 5'terminales de los genes, antes del comienzo del gen, y a ellos se unen los factores de transcripcin
mediante fuerzas de Van der Waals y enlaces de hidrgeno. Los promotores tienen secuencias
reguladoras definidas, muy conservadas en cada especie, donde las ms conocidas son la caja TATA
(situada sobre la regin -10), con la secuencia consenso TATA(A/T)A(A/T); y la caja TTGACA (situada
en el punto -35). La formacin del complejo de transcripcin se realiza sobre el promotor TATA, all se
forma el ncleo del complejo de iniciacin. Sobre la caja TATA se fija una protena de unin (TBP)
junto con el factor de transcripcin TF II D (TF proviene del ingls: transcription factor). Despus, a ellos
se unen otros factores de transcripcin especficos: TF II A, que estabiliza el complejo TFII D-ADN; los
factores TFII B y TFII E se unen al ADN y el TF II F (una helicasa dependiente de ATP) y al final la ARN
polimerasa. Todo ello forma un complejo que se llama complejo de preiniciacin cerrado. Cuando la
estructura se abre por mediacin del factor de transcripcin TF II H, da comienzo la iniciacin.
Iniciacin
Primero, una Helicasa separa las hebras de ADN en estas denominadas cajas TATA, ya que la
adenina y timina poseen un doble enlace, mientras que la citocina y guanina poseen uno triple.
Posteriormente se unen las proteinas de transcripcin (TBP, TF2D, TF2B) permitiendo, de esta
manera, el acceso de la ARN polimerasa al molde de ADN de cadena simple, siendo esta la ultima en
posicionarse. Aunque la bsqueda del promotor por la ARN polimerasa es muy rpida, la formacin de
la burbuja de transcripcin o apertura del ADN y la sntesis del cebador es muy lenta. La burbuja de
transcripcin es una apertura de ADN desnaturalizado de 18 pares de bases, donde empieza a
sintetizarse el ARN cebador a partir del nucletido nmero 10 del ADN molde de la burbuja de
transcripcin. La burbuja de transcripcin se llama complejo abierto. La ARN polimerasa es una
enzima formada por 5 subunidades: 2 subunidades , 1 subunidad , 1 subunidad ' y 1 subunidad
que tiene como funcin la unin de ribonucletidos trifosfato. Cuando se forma el complejo abierto, la
ARN polimerasa comienza a unir ribonucletidos mediante enlaces fosfodister, y una vez que se
forma el primer enlace fosfodister, acaba la etapa de iniciacin.y comienza asi comienza la siguiente
etapa.
Disgregacin del promotor
Una vez sintetizado el primer enlace fosfodister, se debe deshacer el complejo del promotor para que
quede limpio para volver a funcionar de nuevo. Durante esta fase hay una tendencia a desprenderse
el transcrito inicial de ARN y producir transcritos truncados, dando lugar a una iniciacin abortada,
comn tanto en procariontes como eucariontes. Una vez que la cadena transcrita alcanza una longitud
de unos 23 nucletidos, el complejo ya no se desliza y da lugar a la siguiente fase, la elongacin.
La disgregacin del promotor coincide con una fosforilacin de la serina 5 del dominio carboxilo
terminal de la ARN polimerasa, que es fosforilado por el TF II H (que es una protena quinasa
dependiente de ATP)
Elongacin
La ARN polimerasa cataliza la elongacin de cadena del ARN. Una cadena de ARN se une por
apareamiento de bases a la cadena de ADN, y para que se formen correctamente los enlaces de
hidrgeno que determina el siguiente nucletido del molde de ADN, el centro activo de la ARN
polimerasa reconoce a los ribonucletidos trifosfato entrantes. Cuando el nucletido entrante forma los
enlaces de hidrgeno idneos, entonces la ARN polimerasa cataliza la formacin del enlace
fosfodister que corresponde. A esto se le llama elongacin, la segunda etapa de la transcripcin del
ARN.
Terminacin
Al finalizar la sntesis de ARNm, esta molcula ya se ha separado completamente del ADN (que
recupera su forma original) y tambin de la ARN polimerasa, terminando la transcripcin. La
terminacin es otra etapa distinta de la transcripcin, porque justo cuando el complejo de transcripcin
se ha ensamblado activamente debe desensamblarse una vez que la elongacin se ha completado.
La terminacin est sealizada por la informacin contenida en sitios de la secuencia del ADN que se
est transcribiendo, por lo que la ARN polimerasa se detiene al transcribir algunas secuencias
especiales del ADN. Estas secuencias son ricas en guanina y citosina, situadas en el extremo de los
genes, seguidas de secuencias ricas en timina, formando secuencias palindrmicas, que cuando se
transcriben el ARN recin sintetizado adopta una estructura en horquilla que desestabiliza el complejo
ARN-ADN, obligando a separarse de la ARN polimerasa, renaturalizndose la burbuja de
transcripcin. Algunas secuencias de ADN carecen de la secuencia de terminacin, sino que poseen
otra secuencia a la que se unen una serie de protenas reguladoras especficas de la terminacin de la
transcripcin como rho .
ARN
El ARN es un polmero de ribonucletidosde uracilo, citosina, guanina y adenina, organizado en una
banda simple, como la mitad de una escalera con la misma estructura del ADN: los laterales estn
formados por los grupos fosfatos y azcares de los cuales parte una base nitrogenada.
Para traducir de un idioma a otro se necesitan un diccionario y unas reglas gramaticales; igualmente,
para traducir el ADN a las protenas se necesita una clave o cdigo gentico de equivalencia, que se
denomina Cdigo Gentico.
No todos los genes que existen en una clula se expresan todo el tiempo. A lo largo del desarrollo y
dependiendo de las necesidades celulares, una veces se expresan unos genes y otras veces otros del
cual se origina.
El gen o los genes que se van a expresar se copian primero mediante un proceso que se denomina
transcripcin, y que consiste en que la secuencia de nucletidos correspondiente al gen en cuestin
se transcribe a una molcula de ARN mensajero (ARNm), que se separa del ADN y viaja desde el
ncleo al citoplasma (si se trata de una clula eucariota). Es como si de toda la informacin que existe
en una norme biblioteca (el ncleo con su inmensa cantidad de ADN) y se sacara una fotocopia de
una sola pgina o de unas pocas pginas, de un libro.
Por lo tanto la funcin del ARNm es sealar la secuencia de acuerdo con la cual los aminocidos son
incorporados del ADN a los ribosomas para dirigir la sntesis de protena.
El ARNm posee una sola banda, es lineal complementaria a la del ADN del cual se origina.
Es metablicamente muy activo; en la clula existen tantos ARN como genes deben ser transcrito el
mensaje escrito en nucletidos tiene que traducirse en aminocidos.
Biosntesis
Estructura
ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ARN
Al igual que el ADN, se refiere a la secuencia de las bases nitrogenadas que constituyen sus
nucletidos.
Tipos de ARN
El ARN mensajero (ARNm) es el tipo de ARN que lleva la informacin del ADN a los ribosomas, el
lugar de la sntesis de protenas. La secuencia de nucletidos del ARNm determina la secuencia de
aminocidos de la protena.21 Por ello, el ARNm es denominado ARN codificante.
Ribosoma 50S mostrando el ARNr (amarillo), las protenas (azul) y el centro activo, la adenina 2486
(rojo).
ARN mensajero. El ARN mensajero (ARNm o RNAm) lleva la informacin sobre la secuencia de
aminocidos de la protena desde el ADN, lugar en que est inscrita, hasta el ribosoma, lugar
en que se sintetizan las protenas de la clula. Es, por tanto, una molcula intermediaria entre
el ADN y la protena y el apelativo de "mensajero" es del todo descriptivo. En eucariotas, el
ARNm se sintetiza en el nucleoplasma del ncleo celular y de all accede al citosol, donde se
hallan los ribosomas, a travs de los poros de la envoltura nuclear.
ARN de transferencia. Los ARN de transferencia (ARNt o tRNA) son cortos polmeros de unos
80 nucletidos que transfiere un aminocido especfico al polipptido en crecimiento; se unen a
lugares especficos del ribosoma durante la traduccin. Tienen un sitio especfico para la
fijacin del aminocido (extremo 3') y un anticodn formado por un triplete de nucletidos que
se une al codn complementario del ARNm mediante puentes de hidrgeno.22
ARN ribosmico. El ARN ribosmico (ARNr o RNAr) se halla combinado con protenas para
formar los ribosomas, donde representa unas 2/3 partes de los mismos. En procariotas, la
subunidad mayor del ribosoma contiene dos molculas de ARNr y la subunidad menor, una. En
los eucariotas, la subunidad mayor contiene tres molculas de ARNr y la menor, una. En ambos
casos, sobre el armazn constituido por los ARNr se asocian protenas especficas. El ARNr es
muy abundante y representa el 80% del ARN hallado en el citoplasma de las clulas
eucariotas.25 Los ARN ribosmicos son el componente cataltico de los ribosomas; se
encargan de crear los enlaces peptdicos entre los aminocidos del polipptido en formacin
durante la sntesis de protenas; actan, pues, como ribozimas.
ARN reguladores
Muchos tipos de ARN regulan la expresin gnica gracias a que son complementarios de regiones
especficas del ARNm o de genes del ADN. .
ARN de interferencia. Los ARN interferentes (ARNi o iRNA) son molculas de ARN que
suprimen la expresin de genes especficos mediante mecanismos conocidos globalmente
como ribointerferencia o interferencia por ARN. Los ARN interferentes son molculas pequeas
(de 20 a 25 nuclotidos) que se generan por fragmentacin de precursores ms largos. Se
pueden clasificar en tres grandes grupos:26
Micro ARN. Los micro ARN (miARN o RNAmi) son cadenas cortas de 21 22 nucletidos hallados en
clulas eucariotas que se generan a partir de precursores especficos codificados en el genoma. Al
transcribirse, se pliegan en horquillas intramoleculares y luego se unen a enzimas formando un
complejo efector que puede bloquear la traduccin del ARNm o acelerar su degradacin comenzando
por la eliminacin enzimtica de la cola poli A.27 28
ARN interferente pequeo. Los ARN interferentes pequeo (ARNip o siARN), formados por 2025 nucletidos, se producen con frecuencia por rotura de ARN virales, pero pueden ser tambin
de origen endgeno.29 30 Tras la transcripcin se ensambla en un complejo proteico
denominado RISC (RNA-inducedsilencingcomplex) que identifica el ARNm complementario que
es cortado en dos mitades que son degradadas por la maquinaria celular, bloquean as la
expresin del gen.31 32 33
ARN asociados a Piwi.34 Los ARN asociados a Piwi son cadenas de 29-30 nucletidos, propias
de animales; se generan a partir de precursores largos monocatenarios, en un proceso que es
independiente de Drosha y Dicer. Estos ARN pequeos se asocian con una subfamilia de las
protenas "Argonauta" denominada protenas Piwi. Son activos las clulas de la lnea germinal;
se cree que son un sistema defensivo contra los transposones y que juegan algn papel en la
gametognesis.35 36
ARN antisentido. Un ARN antisentido es la hebra complementaria (no codificadora) de un hebra
ARNm (codificadora). La mayora inhiben genes, pero unos pocos activan la transcripcin.37 El
ARN antisentido se aparea con su ARNm complementario formando una molcula de doble
hebra que no puede traducirse y es degradada enzimticamente.38 La introduccin de un
transgen codificante para un ARNmantisentido es una tcnica usada para bloquear la expresin
de un gen de inters. Un mARNantisentido marcado radioactivamente puede usarse para
mostrar el nivel de transcripcin de genes en varios tipos de clulas. Algunos tipos estructurales
antisentidos son experimentales, ya que se usan como terapia antisentido.
ARN largo no codificante. Muchos ARN largos no codificantes (ARNnc largo o longncARN)
regulan la expresin gnica en eucariotas;39 uno de ellos es el Xist que recubre uno de los dos
cromosomas X en las hembras de los mamferos inactivndolo (corpsculo de Barr).40
Riboswitch. Un riboswitch es una parte del ARNm (cido ribonucleico mensajero) al cual
pueden unirse pequeas molculas que afectan la actividad del gen.41 42 43 Por tanto, un
ARNm que contenga un riboswitch est directamente implicado en la regulacin de su propia
actividad que depende de la presencia o ausencia de la molcula sealizadora. Tales
riboswitchs se hallan en la regin no traducida 5' (5'-UTR), situada antes del codn de inicio
(AUG), y/o en la regin no traducida 3' (3'-UTR), tambin llamada secuancia de arrastre,14
situada entre el codn de terminacin (UAG, UAA o UGA) y la cola poli A
ARN con actividad cataltica
Ribozimas. El ARN puede actuar como biocatalizador. Ciertos ARN se asocian a protenas
formando ribonucleoprotenas y se ha comprobado que es la subunidad de ARN la que lleva a
cabo las reacciones catalticas; estos ARN realizan las reacciones in vitro en ausencia de
protena. Se conocen cinco tipos de ribozimas; tres de ellos llevan a cabo reacciones de
automodificacin, como eliminacin de intrones o autocorte, mientras que los otros
(ribonucleasa P y ARN ribosmico) actan sobre substratos distintos.14 As, la ribonucleasa P
corta un ARN precursor en molculas de ARNt,44 mientras que el ARN ribosmico realiza el
enlace peptdico durante la sntesis proteica ribosomal.
Espliceosoma. Los intrones son separados del pre-ARNm durante el proceso conocido como
splicing por los espliceosomas, que contienen numerosos ARN pequeos nucleares (ARNpn o
snRNA).45 En otros casos, los propios intrones actan como ribozimas y se separan a si
mismos de los exones.46
ARN pequeo nucleolar. Los ARN pequeos nucleolares (ARNpno o snoRNA), hallados en el
nuclolo y en los cuerpos de Cajal, dirigen la modificacin de nucletidos de otros ARN;22 el
proceso consiste en transformar alguna de las cuatro bases nitrogenadas tpicas (A, C, U, G)
en otras. Los ARNpno se asocian con enzimas y los guan aparendose con secuencias
especficas del ARN al que modificarn. Los ARNr y los ARNt contienen muchos nucletidos
modificados.
ARN mitocondrial
La mitocondrias tienen su propio aparato de sntesis proteica, que incluye ARNr (en los ribosomas),
ARNt y ARNm. Los ARN mitocondriales (ARNmt o mtARN) representan el 4% del ARN celular total.
Son transcritos por una ARN polimerasa mitocondrial especfica
- SINTESIS Y LOCALIZACIN DE LOS ARN
En la clula eucarionte los ARN se sintetizan gracias a tres tipos de enzimas:
- ARN polimerasa I, localizada en el nucleolo y se encarga de la sinteisde los ARNr 18 S, 5,8 S y 28 S.
- ARN polimerasa II, localizada en el nucleoplasma y se encarga de la sntesis de los ARNhn, es decir
de los precursores de los ARNm
- ARN polimerasa III, localizada en el nucleoplasma y se encarga de sintetizar los ARNr 5 S y los
ARNm
funcion del ARN:
ARN mensajero
El ARN mensajero es el cido ribonucleico que contiene la informacin gentica procedente del ADN
para utilizarse en la sntesis de protenas, es decir, determina el orden en que se unirn los
aminocidos.
El ARN mensajero es un cido nucleico monocatenario, al contrario que el ADN que es bicatenario.
Procesamiento del ARN mensajero en clulas eucariotas
Inicialmente el ARN se conoce como transcrito primario o ARN precursor (pre-ARN), que en la
mayora de los casos no se libera del complejo de transcripcin en forma totalmente activa, sino que
ha de sufrir modificaciones antes de ejercer su funcin (procesamiento o maduracin del ARN). Entre
esas modificaciones se encuentran la eliminacin de fragmentos (splicing), la adicin de otros no
codificados en el DNA y la modificacin covalente de ciertas bases nitrogenadas. Concretamente, el
procesamiento del ARN en eucariotas comprende diferentes fases:
Adicin al extremo 5' de la estructura denominada caperuza (o CAP, su nombre en ingls) que es un
nucletido modificado de guanina, la 7-metilguanosina, que se aade al extremo 5' de la cadena del
ARNm transcrito primario (ubicado an en el ncleo celular). Esta caperuza es necesaria para el
proceso normal de traduccin del ARN y para mantener su estabilidad; esto es crtico para el
reconocimiento y el acceso apropiado del ribosoma.
Poliadenilacin: es la adicin al extremo 3' de una cola poli-A, una secuencia larga de poliadenilato, es
decir, un tramo de RNA cuyas bases son todas adenina. Su adicin est mediada por una secuencia o
seal de poliadenilacin (AAUAAA), situada unos 20-30 nucletidos antes del extremo 3' original. Esta
cola protege al ARNm frente a la degradacin, aumentando su vida media en el citosol, de modo que
se puede sintetizar mayor cantidad de protena.
En la mayora de los casos, el ARN mensajero sufre la eliminacin de secuencias internas, no
codificantes, llamadas intrones. Esto no ocurre en clulas procariontes, ya que estas no poseen
intrones en su DNA. El proceso de retirada de los intrones y conexin o empalme de los exones se
llama ayuste, o corte y empalme (en ingls, splicing). A veces un mismo transcrito primario o preARNm se puede ayustar de diversas maneras, permitiendo que con un solo gen se obtengan varias
protenas diferentes; a este fenmeno se le llama ayuste alternativo. Ciertas enzimas parecen estar
involucrados en editar el RNA antes de su exportacin fuera del ncleo, intercambiando o eliminando
nucletidos errneos.
El ARN mensajero maduro es trasladado al citoplasma de la clula, en el caso de los seres
eucariontes, a travs de poros de la membrana nuclear.
Al ARN mensajero en el citoplasma se acoplan los ribosomas, que son la maquinaria encargada de la
sntesis proteica. En procariontes, la unin de los ribosomas ocurre mientras la cadena de ARNmesta
siendo sintetizada.
Despus de cierta cantidad de tiempo el ARNm se degrada en sus nucletidos componentes,
generalmente con la ayuda de ribonucleasas.
ARN mensajero en clulas procariotas
El proceso de transcripcin y el de traduccin se realizan de manera similar que en las clulas
eucariotas. La diferencia fundamental est en que, en las procariotas, el ARN mensajero no pasa por
un proceso de maduracin y, por lo tanto, no se le aade caperuza ni cola, ni se le quitan intrones.
Adems no tiene que salir del ncleo como en las eucariotas, porque en las clulas procariotas no hay
un nucleo definido.-
Hidrlisis bsica, catalizada por los iones OH- de una base fuerte
(hidrxido sdico, por ejemplo). Es importante sealar que la hidrlisis
bsica slo acta sobre la cadena del RNA, ya que el mecanismo de esta
reaccin requiere un OH en 2, tan slo presente en la ribosa de las
molculas de RNA. Esto permite utilizar este tipo de hidrlisis para
degradar especficamente el RNA en una mezcla con DNA sin que se afecte
este ltimo. Es una forma de eliminar el RNA contaminante de una
preparacin de DNA.
La rotura del enlace fosfoster libera mono-, di- u oligorribonucletidos;
su concentracin relativa es funcin de la severidad de la hidrlisis.
una o, generalmente, varias etapas en las que se hace uso de tcnicas bioqumicas
clsicas de separacin y purificacin. Estas tcnicas aprovechan generalmente el gran
tamao y la naturaleza cida y, por lo tanto, hidroflica de los cidos nucleicos para
lograr su separacin del resto de los componentes de esa mezcla. En su estado
natural, in vivo, las molculas de cidos nucleicos se encuentran asociadas a
protenas (en su mayora bsicas); este hecho, unido a la semejanza en cuanto a
tamao de ambos tipos de molculas(macromolculas) convierte a las protenas en
los contaminantes naturales de los cidos nucleicos. Un segundo acompaante
universal es el otro tipo de cido nucleico: ambos, DNA y RNA, presentan una
enorme semejanza estructural, lo que, en principio, hace difcil su separacin.
Algunas de las tcnicas bioqumicas empleadas son de uso muy general, como:
La sedimentacin; se utilizan distintas variantes de esta tcnica, aunque
destaca por la calidad de sus resultados la sedimentacin en gradientes de
sacarosa, glicerol o, sobre todo, de sales de cesio (cloruro, trifluoroacetato,
etc.); en este ltimo medio se pueden separar, en condiciones adecuadas, las
molculas de protenas, el RNA, el DNA circular plasmdico y el DNA lineal
cromosmico; en presencia de bromuro de etidio, las molculas de DNA
intercalan ese catin entre sus bases nitrogenadas, lo que puede afectar a su
topologa y a su densidad, permitiendo la separacin de las molculas
plasmdicas, circulares y covalentemente cerradas