Professional Documents
Culture Documents
Tutorial 2
B.
Add Feature,
b. Pada Feature Type pilih Misc. Feature, pada Feature Name tulis MCS, posisinya klik
simple format From 653 to 760, klik Known Endpoint, OK.
c. Perhatikan di Graphic Pane, muncul tanda panah besar pada daerah cloning site
dengan nama MCS. Di Text Pane, pada Feature Map menjadi terisi dengan Misc.
Feature, yakni MCS. Jika ingin menghapus fitur tersebut, klik kanan pada MCS pilih
Delete Feature From FMap.
d. MCS seharus tidak dalam bentuk panah karena arah diperlukan, sehingga gambar MCS
tersebut bisa kita ubah menjadi kotak dengan cara aktifkan Edit Picture
, klik MCS,
klik kanan, Misc. Feature Display Setup, pada klik Show Label, More, pada
Subsitution pilih @N sinyal/enzyme/motif/molecule name, ; @F Fragment length,
pada Show simbol, klik Long , pilih kotak panjang, pada Style bisa dipilih warna dan
bentuk garis.
e. Kemudian tambahkan fitur lac promoter (p Lac) seperti pada langkah 2.b di atas namun
Feature Type-nya adalah Promoter Prokaryotic, hasilnya adalah p Lac mengarah ke
bawah (Gambar kiri) sehingga tidak sesuai dengan grafik pBluesript II pada lampiran,
fitur tersebut bisa diedit dengan klik p Lac, Feature Properties, Complementary,
OK (Gambar kanan).
f.
Dengan cara yang sama buatlah fitur yang dicantumkan dalam tabel di atas.
Perhatikan Feature Type-nya:
1. LacZ dan AmpR adalah coding sequence (CDS), perhatikan arahnya, klik
complementary.
2. pUC Ori adalah Replication Origin
3. f1 (+) origin of ss-DNA replication (f1 (+) ori) adalah replication origin
b. Perhatikan pada fitur pBluescript II terdapat restriction sites Apal I yang berada diluar
MCS dan informasinya tidak diperlukan. Untuk menghilangkannya adalah klik Apal I,
klik remove, OK.
c. Untuk menampilkan REN pada daerah tertentu saja misal MCS, maka isi Ignore RENs
cutting outside region dengan posisi MCS.
4. Mengedit Fitur molekul pBluescript II
a. Grafik fitur pBluescript II KS (+) yang didapat menampakan fitur MCS berada diluar
lingkaran molekul. Gabungkan fitur tersebut dengan cara mengaktifkan Edit Picture
, klik kotak MCS, lalu seret (drag) ke lingkaran molekul (Gambar Kiri).
b. Edit grafik fitur molekul tersebut sebagai mana tutorial sebelumnya, sehingga pola
warna dan garisnya semirip mungkin dengan grafik molekul pBluescript II KS (+) pada
lampiran (Gambar Kanan).
c. Save As di subset latihan : pBluescript II KS (+) Latihan1
D.
LAMPIRAN