Microbiologa General I

Asesor: Q.F.B. Yolanda Flores Cabrera

RUTAS METABLICAS
- Gluclisis
Es la va metablica encargada de
oxidar la glucosa con la finalidad de
obtener energa para la clula.
Consiste en 10 reacciones
enzimticas consecutivas que
convierten a la glucosa en
dos molculas de piruvato, el cual es
capaz de seguir otras vas
metablicas y as continuar
entregando energa al organismo.
Los productos ms comunes de la
fermentacin de la glucosa son el
lactato o el etanol y el dixido de
carbono. Las enzimas que
catabolizan estas reacciones se
encuentran en el citosol.
La glucolisis ocurre en dos fases o etapas, en la primera se forman 2 molculas
de gliceraldehido3-fosfato, ambas molculas pasan por la fase de beneficios.
Durante esta etapa se utiliza ATP para la fosforilacin de los azcares.
Durante la segunda fase o etapa se obtienen dos molculas de pruvato y dos
ATP, esta incluye las reacciones de xido-reduccin y aquellas de fosforilacion
en las que se genera ATP. El piruvato puede actuar como precursor de alanina o
fermentacin, ya sea lctica, alcohlica o actica esto en un proceso de
respiracin anaerobia.

*Puntos importantes en la regulacin de la gluclisis

1.-La glucosa se fosforila a glucosa-6-fostato por ATP y hexoquinasa
2.-Reaccion catalizada por la fosfofructoquinasa
3.-Reaccion catalizada por la piruvato quinasa que es activada por la fructosa
1,6 -bifostato y AMP.

- Va de Enthner-Duodorf

Elaboro: Cuautle Osorio Guadalupe

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La ruta de Entner-Doudorof es una ruta metablica alternativa que cataboliza

glucosa a piruvato usando una serie de enzimas distintas a la gluclisis y a la
ruta de la pentosa fosfato
*Primera fase
1) La glucosa es fosforilada por la enzima Hexocinasa, con gasto de ATP,
obteniendo glucosa-6-fosfato.
2.- La glucosa 6-fosfato se izomeriza a 6-fosfogluconato, por medio de la
enzima deshidrogenasa.
3.- El 6-fosfogluconato se deshidrata por la enzima gluconatodehidratasa
obteniendo 2-ceto-3-desoxi-6-fosfolguconato, con la liberacin de agua.
4.- El 2-ceto-desoxi-6-fosfogluconato puede desdoblarse en piruvato y
Gliceraldehido-3-fosfato, por medio de la enzima aldolasa.
*Segunda fase
Pasos del 6 al 10 de la gluclisis.
6. Oxidacin del gliceraldehido 3 fosfato a 1-3 bisfosfoglicerato: este paso es
catalizado por la gliceraldehido 3 fosfato deshidrogenasa y se gana una
molcula de NADH
7. Transferencia de un grupo fosfato del 1-3 bisfosfoglicerato al ADP: la enzima
fosfoglicerato cinasa transfiere un grupo fosfato del 1-3 bifosfoglicerato al ADP
formando ATP y 3 fosfoglicerato. Es la primera fosforilacin a nivel de sustrato
8. Conversin del 3 fosfoglicerato en 2 fosfoglicerato: la enzima fosfoglicerato
mutasa transfiere el grupo fosfato del carbono 3 al carbono 2
9. Deshidratacin del 2 fosfoglicerato a fosfoenolpiruvato: esta reaccin es
llevada a cabo por la enzima enolasa
10. Transferencia del grupo fosfato del fosfoenol piruvato al ADP: la piruvato
cinasa cataliza la reaccin que da lugar a la segunda fosforilacin a nivel de
sustrato, en esta fosforilacin el piruvato aparece primero en su forma enol y
despus pasa automticamente a su forma ceto sin ayuda de alguna enzima.

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- Ciclo de Krebs
El ciclo tiene como funciones primordiales, el ser la ruta final de la oxidacin de
las molculas combustibles y el de proporcionar molculas precursoras para
rutas biosintticas. Cuando acta con ese ltimo objetivo requiere de
reacciones denominadas anapletoricas que le proporcionan metabolitos y
evitan que deje de funcionar.
Estimula la respiracin celular por los cidos dicarboxilicos (succinico, fumarico
y malico)
Est constituido por una seria de reacciones que oxidan al grupo acetilo del
acetil-CoA a dos molculas de CO2, conserva la energa, libre producida en la
sntesis de ATP.

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Reaccin 1: Citrato sintasa (De oxalacetato a citrato)

El sitio activo de la enzima, activa el acetil-CoA para hacerlo afn a un centro

carbonoso del oxalacetato. Como consecuencia de la unin entre las dos
molculas, el grupo tioster (CoA) se hidroliza, formando as la molcula de
citrato.

La reaccin es sumamente exoergnica (G'=-31.4 kJ/mol), motivo por el cual

este paso es irreversible. El citrato producido por la enzima, adems, es capaz
de inhibir competitivamente la actividad de la enzima.

Incluso estando la reaccin muy favorecida (porque es exoergnica), la citrato

sintasa puede ser perfectamente regulada. Este aspecto tiene una notable
importancia biolgica, puesto que permite una completa regulacin del ciclo de
Krebs completo, convirtiendo a la enzima en una especie de marcapasos del
ciclo.

Reaccin 2: Aconitasa (De citrato a isocitrato)

La aconitasa cataliza la isomerizacin del citrato a isocitrato, por la formacin

de cis-aconitato. La enzima cataliza tambin la reaccin inversa, pero en el
ciclo de Krebs tal reaccin es unidireccional a causa de la ley de accin de
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masa: las concentraciones (en condiciones estndar) de citrato (91%), del

intermediario cis-aconitato (3%) y de isocitrato (6%), empujan decididamente
la reaccin hacia la produccin de isocitrato.
En el sitio activo de la enzima est presente un clster hierro-azufre que, junto
a algunos residuos de aminocidos polares, liga el sustrato. En concreto, la
unin al sustrato se asegura por la presencia de un resto de serina, de arginina,
de histidina y de aspartato, que permiten slo la unin estereospecifica del
citrato 1R,2S, rechazando la forma opuesta.

Reaccin 3: Isocitrato deshidrogenasa (De isocitrato a oxoglutarato)

La isocitrato deshidrogenasa mitocondrial es una enzima dependiente de la

presencia de NAD+ y de Mn2+ o Mg2+. Inicialmente, la enzima cataliza la
oxidacin del isocitrato a oxalsuccinato, lo que genera una molcula de NADH a
partir de NAD+. Sucesivamente, la presencia de un in bivalente, que forma un
complejo con los oxgenos del grupo carboxilo en posicin alfa, aumenta la
electronegatividad de esa regin molecular. Esto genera una reorganizacin de
los electrones en la molcula, con la consiguiente rotura de la unin entre el
carbono en posicin gamma y el grupo carboxilo adyacente. De este modo se
tiene una descarboxilacin, es decir, la salida de una molcula de CO 2, que
conduce a la formacin de -cetoglutarato, caracterizado por dos carboxilos en
las extremidades y una cetona en posicin alfa con respecto de uno de los dos
grupos carboxilo.

Reaccin 4: -cetoglutarato deshidrogenasa (De oxoglutarato a Succinil-CoA)

Despus de la conversin del isocitrato en -cetoglutarato se produce una

segunda reaccin de descarboxilacin oxidativa, que lleva a la formacin de
succinil CoA. La descarboxilacin oxidativa del -chetoglutarato es muy
parecida a la del piruvato, otro -cetocido.

Ambas reacciones incluyen la descarboxilacin de un -cetocido y la

consiguiente produccin de una unin tioster a alta energa con la coenzima
A. Los complejos que catalizan tales reacciones son parecidos entre ellos.

La -cetoglutarato deshidrogenasa (o, ms correctamente, oxoglutarato

deshidrogenasa), est compuesta de tres enzimas diferentes:
* Subunidad E1: las dos cetoglutarato deshidrogenasas.
* Subunidad E2: la transuccinilasa.
(La subunidad E1 y E2 presentan una gran homologa con las de la piruvato
deshidrogenasa.)
* Subunidad E3: la dihidrolipoamida deshidrogenasa, que es el mismo
polipptido presente en el otro complejo enzimtico.

Reaccin 5: Succinil-CoA sintetasa (De Succinil-CoA a succinato)

El succinil-CoA es un tioster a alta energa (su G de hidrlisis est en unos

-33.5 kJ mol-1, parecido al del ATP que es de -30.5 kJ mol-1). La citrato sintasa
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se sirve de un intermediario con tal unin a alta energa para llevar a cabo la
fusin entre una molcula con dos tomos de carbono (acetil-CoA) y una con
cuatro (oxalacetato). La enzima succinil-CoA sintetasa se sirve de tal energa
para fosforilar un nuclesido difosfato purinico como el GDP.

La energa procedente del tioster viene convertida en energa ligada a una

unin fosfato. El primer paso de la reaccin genera un nuevo intermediario a
alta energa, conocido como succinil fosfato. Sucesivamente, una histidina
presente en el sitio cataltico remueve el fosfato de la molcula glucdica,
generando el producto succinato y una molcula de fosfohistidina, que dona
velozmente el fosfato a un nuclesido difosfato, recargndolo a trifosfato. Se
trata del nico paso del ciclo de Krebs en el que se produce una fosforilacin a
nivel de sustrato.

El GTP est implicado principalmente en las rutas de transduccin de seales,

pero su papel en un proceso energtico como el ciclo de Krebs es, en cambio,
esencialmente trasladar grupos fosfato hacia el ATP, en una reaccin catalizada
por la enzima nuclesido difosfoquinasa.

Reaccin 6: Succinato deshidrogenasa (De succinato a fumarato)

La parte final del ciclo consiste en la reorganizacin de molculas a cuatro

tomos de carbono hasta la regeneracin del oxalacetato. Para que eso sea
posible, el grupo metilo presente en el succinato tiene que convertirse en un
carbonilo. Como ocurre en otras rutas, por ejemplo en la beta oxidacin de
los cidos grasos, tal conversin ocurre mediante tres pasos: una primera
oxidacin, una hidratacin y una segunda oxidacin. Estos tres pasos, adems
de regenerar oxalacetato, permiten la extraccin ulterior de energa mediante
la formacin de FADH2 y NADH.

La primera reaccin de oxidacin es catalizada por el complejo enzimtico de la

succinato deshidrogenasa, la nica enzima del ciclo que tiene como aceptor de
hidrgeno al FAD en vez de al NAD +. El FAD es enlazado de modo covalente a la
enzima por un residuo de histidina. La enzima se vale del FAD ya que la energa
asociada a la reaccin no es suficiente para reducir el NAD +.

El complejo enzimtico tambin es el nico del ciclo que pasa dentro de la

membrana mitocondrial. Tal posicin se debe a la implicacin de la enzima en
la cadena de transporte de los electrones. Los electrones pasados sobre el FAD
se introducen directamente en la cadena gracias a la unin estable entre la
enzima y el cofactor mismo.

Reaccin 7: Fumarasa (De fumarato a L-malato)

La fumarasa cataliza la adicin en trans de un protn y un grupo

OH- procedentes de una molcula de agua. La hidratacin del fumarato
produce L-malato.

Reaccin 8: Malato deshidrogenasa (De L-malato a oxalacetato)

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La ltima reaccin del ciclo de Krebs consiste en la oxidacin del malato a

oxalacetato. La reaccin, catalizada por la malato deshidrogenasa, utiliza otra
molcula de NAD+ como aceptor de hidrgeno, produciendo NADH.

La energa libre de Gibbs asociada con esta ltima reaccin es decididamente

positiva, a diferencia de las otras del ciclo. La actividad de la enzima es
remolcada por el consumo de oxalacetato por parte de la citrato sintasa, y de
NADH por parte de la cadena de transporte de electrones.

- Ruta de las pentosas fosfato

La ruta de las pentosas fosfato es una ruta alternativa a la glucolitica cuyas
funciones son obtener poder reductor para las reacciones de biosntesis y D-
ribosa para la sntesis de nucleosidos. La ruta consiste en dos etapas de
naturaleza qumica diferente, la primera implica reacciones de xido-reduccin
y la segunda, reacciones en equilibrio de isomerizacin y reagrupamiento
molecular. La primera etapa regula el flujo del metabolismo a travs de la ruta.
Permite la oxidacin de la glucosa no genera ATP, reduce el NADH + a NADPH
formado exclusivamente en esta via.

La reaccin se lleva a cabo en el citoplasma en dos fases:

Fase I: fase oxidativa, genera NADPH y Ribosa 5-fosfato

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Fase II: fase no oxidativa: intervienen azucares fosforilados (no hay perdida de
carbonos), pasan de azcar a azcar fosforilado -- provee metabolitos
intermediarios metablicos.
*Fase I
La primera reaccin es la deshidrogenacion enzimtica de la glucosa 6-fosfato
deshidrogenasa para dar 6-fosfoglucolactona. En condiciones fisiolgicas esta
reaccin es reversible, pero el producto de la reaccin rpidamente se hidroliza
mediante la 6-fosfogluconolactonasa a 6-fosfogluconato con una variacin alta
de energa libre claramente hacia la derecha.
En la siguiente reaccin el 6-fosfoglucenato sufre una descarboxilacion
oxidativa por la 6-fosfogluconato deshidrogenasa que requiere de NADP para
dar ribulosa 5-fosfato y CO2.
*Etapa II
Esta etapa comprende una serie de condensaciones , isonomerizaciones y
reagrupamientos catalizados enzimticamente.
El producto final de lso procesos oxidativos de la etapa I, la ribulosa 5-fosfato
es convertida en ribosa 5-fosfato por accin de la ribulosa 5-fosfato epimerasa.
En esta reaccin el carbono 3 de la ribulosa es invertido para dar xilulosa 5-
fosfato. Alternativamente, la ribulosa 5-fosfato puede ser convertida en la
aldolasa correspondiente, la ribosa 5-fosfato por la ribosa 5-fosfatoisomerasa,
una reaccin similar a la conversin de la glucosa 6-fosfato en fructosa 6-
fosfato.
Posteriormente aparecen reacciones de reordenamiento de atomos mediantela
accon de dos clases de enzimas: transaldolasas y transectolasas en las cuales
se lleva a cabo la transferencia de unidades de 2 y 3 atomos de carbono.

- -oxidacin
Los cidos grasos almacenados en los tejidos son utilizados por la clula para
la produccin de energa. La utilizacin de esta energa, vara de tejido a tejido,
adems de estar directamente relacionada con el estado metablico del
organismo. El msculo cardiaco y el esqueltico son los que ms dependen de
los cidos grasos como fuente de energa.
La principal oxidacin de cidos grasos que se efecta en los tejidos, proviene
de los triacilglicridos almacenados en el tejido adiposo, los cuales son
liberados por la accin de la lipasa de triacilglicridos sensible a hormonas. Una
vez liberados de los adipocitos, los cidos grasos, son transportados por el
torrente sanguneo en el complejo albmina-cidos grasos hasta el citoplasma
de los hepatocitos, en donde son activados por la acil-CoA sintasa (tiocinasa),
reaccin dependiente de ATP. Una vez en la matriz mitocondrial, el acil-CoA se
degrada para obtener una molcula de 2 carbonos, el acetil-CoA.
La b-oxidacin de los acil-CoA, al igual que el transporte de los cidos grasos a
la matriz mitocondrial, ocurre en cuatro reacciones:

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1.- Formacin del doble enlace trans-a,b a travs de la deshidrogenacin

de la flavoenzima acil-CoA deshidrogenasa.

2.- Hidratacin del doble enlace por la enoil-CoA hidratasa para formar 3-
L-hidroxiacil-CoA.

3.- Deshidrogenacin NAD+-dependiente del b-hidroxiacil-acil-CoA por la 3-L-

hidroxiacil-CoA deshidrogenasa, para formar el b-cetoacil-CoA correspondiente.

4.- Ruptura del enlace Ca - Cb en una reaccin de tiolsis catalizada por

la b-cetoacil-CoA tiolasa (a menudo llamada solamente tiolasa) para
formar acetil-CoA y un nuevo acil-CoA con dos tomos de carbono menos que
el original.

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Las primeras tres reacciones, recuerdan qumicamente las reacciones del

ciclo de los cidos tricarboxlicos para convertir succinato en oxaloacetato

Figura: representacin de las tres primeras reacciones del ciclo de

Krebs.

Las mitocondrias contienen tres acil-CoA deshidrogenasas con

especificidades para cadenas largas, medianas y cortas de cidos grasos
(unidos a acil-CoA). La reaccin catalizadapor estas enzimas conlleva la
remocin de un protn del carbono a y la transferencia de un hidruro al
carbono b del FAD.

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La hidroquinona (FADH2) resultante de la oxidacin de los cidos grasos

es reoxidada por la cadena de transporte de electrones mitocondrial, a travs
de una serie de reacciones de transferencia de electrones intermedias.

La flavoprotena que transfiere electrones (ETF), transfiere un par de

electrones del FADH2 a la flavoprotena ETF: ubiquinona oxidorreductasa (que
contiene un centro fierro-azufre), la cual a su vez transfiere el par de electrones
a la cadena de transporte de electrones mitocondrial, reduciendo a la coenzima
Q (CoQ). La reduccin del oxgeno molecular a H 20 en este punto resulta en la
produccin de 2 ATPs por par de electrones transferido.

La funcin de la oxidacin de los cidos grasos es generar energa

metablica. Cada vuelta de la b oxidacin produce un NADH, un FADH y
un acetil-CoA. La oxidacin del acetil-CoA va el ciclo del cido ctrico
genera NADHs y FADHs adicionales que son reoxidados a travs de la
fosforilacin oxidativa para formar ATP.Por lo tanto la oxidacin completa de
una molcula de cido graso es un proceso altamente exergnico, produce un
nmero elevado de ATPs.

- Fosforilacion oxidativa
La fosforilacin oxidativa es un proceso metablico que utiliza energa
liberada por la oxidacin de nutrientes para producir adenosina trifosfato (ATP).
Se le llama as para distinguirla de otras rutas que producen ATP con menor
rendimiento, llamadas "a nivel de sustrato". Se calcula que hasta el 90% de la
energa celular en forma de ATP es producida de esta forma.

La fosforilacion oxidativa es un proceso bioqumico que ocurre en las clulas.

Es el proceso metablico final (catabolismo) de la respiracin celular, tras la
glucolisis y el ciclo del cido ctrico. De una molcula de glucosa se obtienen 38
molculas de ATP mediante la fosforilacion oxidativa.

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Dentro de las clulas, la fosforilacion oxidativa se produce en las membranas

biolgicas. En procariotas es la membrana plasmtica y en eucariotas es la
membrana interna de las dos de que consta la mitocondria. El NADH y FADH2,
molculas donadores de electrones que fueron cargadas durante el ciclo del
cido ctrico, se utilizan en un mecanismo intrincado (que implica a numerosas
enzimas como NADH-Q reductasa, la citocromo c oxidasa y la citocromo
reductasa), gracias a la bomba H+ que moviliza los protones contra un
gradiente de membrana.

- Fermentaciones
Fermentacin Lctica
Ruta metablica anaerobia que ocurre en la matriz del citoplasma de la clula
en el cual se oxida parcialmente la glucosa para obtener energa.
Es producida generalmente por bacterias en ausencia de aire.
Acta sobre azucares contenidos en plantas de frutos y semillas.

Existen dos tipos de fermentaciones:

1) Fermentacin homolactica: tiene como producto final cido lctico.
Transformacin de piruvato en lactato en una sola etapa.
2) Fermentacin heterolactica: se produce cido lctico y otros compuestos
como cido actico y frmico.
Las bacterias del genero Lactobacillus, Leuconostoc y Streptococcus son las
especies consideradas como lcticas. La mayora de ellas son homo-
fermentadoras.

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Fermentacin alcohlica
La fermentacin alcohlica es un proceso anaerbico realizado por las
levaduras y algunas clases de bacterias. Estos microorganismos transforman el
azcar en alcohol etlico y dixido de carbono. La fermentacin alcohlica,
comienza despus de que la glucosa entra en la celda. La glucosa se degrada
en un cido pirvico.
La fermentacin alcohlica es un proceso anaerbico exergnico (libera
energa) y molculas de ATP necesarias para el funcionamiento metablico de
las levaduras (seresunicelulares). Debido a las condiciones de ausencia de
oxgeno durante el bioproceso, la respiracin celular de la cadena del ADP en
ATP queda completamente bloqueada, siendo la nica fuente de energa para
las levaduras la gliclisis de la glucosa con la formacin de molculas de ATP
mediante la fosforilacin a nivel de sustrato. El balance a nivel molecular del
proceso se puede decir que genera 2 molculas de ATP por cada molcula de
glucosa. Si se compara este balance con el de la respiracin celular se ver que
se generan 38 molculas de ATP.

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Ferm

entacin actica

La fermentacin actica es la fermentacin bacteriana por Acetobacter,

un gnero de bacterias aerbicas, que transforma el alcohol etlico en cido
actico, la sustancia caracterstica del vinagre. 1 La fermentacin actica
del vino proporciona el vinagre debido a un exceso de oxgeno y es uno de
los fallos del vino, un proceso que degrada sus cualidades. La fermentacin
actica es un rea de estudio dentro de la cimologa.

Aunque es una fermentacin en el sentido original de la palabra, un proceso

que partiendo de un azcar produce cidos, gases o alcohol, se aparta de la
regla en que es un proceso aerobio, es decir, que requiere oxigeno.

Elaboro: Cuautle Osorio Guadalupe

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