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Resumen
Tibetano es una valiosa raza ovina del Himalaya clasificada como en peligro de extincin.
El conocimiento del nivel y la distribucin de la diversidad gentica en el ganado ovino
tibetano son importante para el diseo de estrategias de conservacin para su
supervivencia sostenible y preservar su potencial evolutivo. Por lo tanto, por primera vez,
Trece loci microsatlites mostr significativa salidas (P 0,05 b) a partir de las proporciones
de Hardy-Weinberg en la poblacin. La estimacin de deficiencia de heterocigotos variado
de -0.443 (OarCP20) a 0.668 (OarFCB128) con un valor positivo media de 0,302 0,057.
Un normal "L 'distribucin en forma de prueba de modo de desplazamiento y el exceso de
heterocigotos no significativo sobre la base de diferentes modelos sugiere ausencia de
reciente cuello de botella en la poblacin tibetana existente. En vista de la disminucin de
la poblacin de ovejas tibetano (menos de 250) en el tracto cra, necesidad de la hora es
la gestin cientfica inmediata de la poblacin con el fin de aumentar la parte de la
poblacin de la mano con la retencin de los alelos fundadores en la medida de lo posible.
Introduccin
Biodiversidad ovejas en la India se caracteriza por un alto grado de endemismo como las
variaciones en las condiciones agro climticas han llevado al desarrollo de ms de 40
razas (Acharya, 1982). Esta vasta biodiversidad ovina se est erosionando rpidamente
con ms del 50% de las especies ovinas actualmente bajo amenaza (Bhatia y Arora,
2005). Ovejas proporciona empleo e ingresos a los sectores social y econmicamente
desventajosas de la sociedad siendo criados por los trabajadores sin tierra y los
agricultores marginales. Razas autctonas deben ser consideradas como reservorios
importantes de recursos no explotados debido a la presencia de la variacin gentica
potencialmente beneficioso no reconocido. Por otra parte, las razas autctonas son los
bienes culturales debido a su papel en las formas de tenencia de la agricultura y en la vida
social de las poblaciones rurales. Ovejas tibetano es una de esas castas importantes de la
regin del Himalaya del norte de la India templada. Las ovejas emigraron a la India con
los comerciantes tibetanos que los utilizaron como animales de carga para el transporte
de mercancas diversas, adems de lana (Gobierno de Bengala, 1864). La independencia
de la India en 1947 dio lugar a cambios polticos y econmicos con el cese concomitante
de su migracin en el pas.
animales tibetanos son de tamao mediano, todo blanco con la cara de color negro o
marrn y manchas marrones y blancos en el cuerpo. El velln es relativamente fino y est
entre los mejores obtenidos a partir de las razas ovinas autctonas de subcontinente indio
(Banerjee, 2009). Los animales son nicos de la adaptacin al clima templado duro y
terreno difcil del Himalaya y sobrevivir incluso en el sistema de alojamiento abierta.
Tibetano es considerado como una de las mayora de las razas de ovejas rstico que
prospera en condiciones de extrema dureza y privaciones mientras que proporciona la
carne y abajo para el pueblo. Ellos son la nica fuente de sustento en la zona desde la
agricultura no es adecuado debido a las caractersticas geo-climticas. Sin embargo, la
poblacin de ovejas tibetano ha disminuido drsticamente en un pasado reciente
(Banerjee, 2009) debido a la falta de mercado regulado, la vinculacin de transporte, la
contraccin de los pastizales, el aumento de la endogamia y la aparicin de
enfermedades. La poblacin ha bajado de 30.000 (Acharya, 1982) a menos de 250 en
Sikkim (Ganadera de censo de 2012; Kumar, 2015). Por lo tanto, se requieren medidas
especficas de gestin y conservacin urgentes no slo para la restauracin de la
poblacin natural empobrecido debido a la situacin de peligro, sino tambin por su
importancia biolgica y econmica e importancia ecolgica. El conocimiento de la
variabilidad gentica es muy importante para establecer un programa de conservacin y
manejo. El uso de marcadores genticos moleculares altamente variables, tales como los
microsatlites, es uno de los ms ful de energa significa para el estudio de la diversidad
gentica debido a su alto grado de polimorfismo, la abundancia, la distribucin al azar en
todo el genoma, co-dominante de herencia y la neutralidad con respecto a las seleccin
(Barcaccia et al, 2013;. Putman y Carbone, 2014). Estos se utilizan para estimar la
diversidad de las especies ovinas autctonas en todo el mundo (Ghazyl et al, 2013;.
Ceccobelli et al, 2015). Incluyendo la India (Bhatia y Arora, 2005; Sharma et al., 2010).
Por desgracia, ningn estudio ha sido llevado a cabo hasta ahora para investigar las
caractersticas genticas de las ovejas tibetano utilizando tcnicas de biologa molecular.
Esto es fundamental, ya que se requieren esfuerzos de conservacin urgentes para
conservar y utilizar los recursos genticos ovejas tibetano.
Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue en primer lugar para estimar la
variabilidad intra-raza gentica de ovejas tibetano utilizando 25 marcadores de
microsatlites y en segundo lugar para detectar cuello de botella de la poblacin, si los
hay.
Materiales y mtodos
El tracto cra de ovejas tibetano est confinada a la zona alpina seca, Distrito Norte del
estado de Sikkim en la India (Fig. 1). La poblacin est confinada en slo seis manadas
que se encuentran en el valle Phalung (4697 m, latitud 27 56 'de longitud 88 35'). Las
muestras de sangre fueron adquiridas de veinte ovejas tibetano (aproximadamente el 10%
de la poblacin existente) de la regin de cultivo (Fig. 1) siguiendo las directrices del
MoDAD (medicin de la Diversidad de los Animales Domsticos) programa (FAO, 2004).
La oveja nativa fueron evaluados por sus caractersticas de la raza fenotpica de acuerdo
con el descriptor de la raza y los individuos de cada lote fueron muestreados. Los
propietarios fueron interrogados en detalle para minimizar el muestreo de individuos
estrechamente relacionados. Se recogieron muestras de sangre (5-6 ml) en vacutainer
que contiene cido actico de etileno diamina tetra (0,5 mM, pH 8,0). ADN genmico fue
extrado de la sangre entera usando el protocolo forma phenolchloro (Sambrook et al.,
1989).
Parmetros genticos bsicos como las frecuencias de alelos observados (n) y nmero
efectivo de alelos (Ne), observada (Ho) y la heterocigosidad esperada (He) y dficit de
heterocigotos (FIS) en el conjunto de la poblacin se calcularon mediante el anlisis de
los datos genticos con GenAlEx 6.2 software (Peakall y Smouse, 2008). Anlisis of
Hardy-Weinberg y Ewens-Watterson neutralidad se aplicaron usando POPGENE versin
1.31 (Yeh et al., 1999). eventos de cuello de botella en la poblacin fueron probados por
tres mtodos. El primer mtodo consiste en tres pruebas de heterocigosidad exceso
desarrollados por Cornuet y Luikart (1996): (i) prueba de los signos, (ii) las diferencias de
las pruebas estandarizadas, y (iii) una prueba de inicio de sesin de rangos de Wilcoxon.
La distribucin de probabilidad se estableci utilizando simulaciones 1000 menores de
tres aos modelo modelos infinita alelo (IAM), el modelo gradual de mutacin (SMM) y el
modelo de dos fases de la mutacin (TPM). El segundo mtodo es la representacin
grfica del indicador de modo de cambio propuesto originalmente por Luikart et al. (1998).
La prdida de alelos raros en poblaciones congestiones se detecta cuando una o ms de
las clases de alelos comunes tienen un mayor nmero de alelos que la clase alelo raro
(Luikart et al., 1998). Estos dos mtodos se aplicaron usando cuello de botella v1.2.02
(http://www.ensam.inra.fr/URLB).
Resultado y discusin
Todos los marcadores fueron polimrficos y se detectaron un total de 148 alelos en los 25
loci. Una prueba exacta de vinculacin desequilibrio genotpico no produjo los valores P
significativos en toda la poblacin, y se asumi surtido, por tanto, independiente de todos
los loci. Cantidad razonable de polimorfismo en la raza ovina tibetano era evidente a partir
de los datos de frecuencia de alelo (disponibles bajo peticin) con el nmero medio de
alelos (MNA) de 5,920 0,387 (Tabla 2). BM6526 mostr el mayor nmero de alelos
observados por locus (11), mientras que BM8125, OarVH72 y BM6506 mostraron la ms
baja (3). Nmero esperado de alelos variaron de 1.490 (BM8125) a 8.667 (BM6526) con
la media de 3,70 (Tabla 2). Por lo tanto la seleccin de los microsatlites con una gama de
polimorfismo redujo el riesgo de sobreestimar la variabilidad gentica, lo que podra
ocurrir con el uso selectivo de loci altamente polimrficos. Un microsatlite
preferiblemente debe tener al menos 4 alelos para ser til para la evaluacin de la
diversidad gentica como por la seleccin estndar de microsatlites loci (Barker, 1994).
Sin embargo, 3 alelos por locus tambin se han utilizado para evaluar la diversidad
gentica (Li et al., 2010). Por lo tanto todos los 25 microsatlites se conservaron para su
posterior anlisis. La diversidad allica (nmero medio de alelos observados por locus)
por encima de la observada en el ganado ovino tibetano se ha informado en algunas de
las razas de ovinos de la India (Arora et al, 2008;.. Kumarasamy et al, 2009; Radha et al.,
2011; Sharma et al., 2010). Sin embargo, MNA en raza tibetano es mayor que la
observada en varias otras razas de ovinos indio a saber. 4,94 en Madras ovejas Roja
(Prema et al., 2008), 5,0 en Nilagiri (Girish et al., 2007), 5,04 en Muzaffarnagari (Arora y
Bhatia, 2004), 5,3 en Kheri (Bhatia y Arora, 2008), 5,6 en Shahbad (Pandey et al.,
2009), en 5,7 Magra (Arora y Bhatia, 2006) y 5,88 en Vembur (Pramod et al., 2009) .As,
se puede concluir que existe suficiente variabilidad gentica en el ganado ovino tibetano a
pesar de su disminucin de la poblacin tendencia.
Conclusin