Professional Documents
Culture Documents
Desde 1850, Pasteur reconoce que las fermentaciones en las levaduras son catalizadores
por fermentos. A fines del siglo 19, Buchner hizo fermentaciones de azucares a alcohol in
vitro, es decir en un sistema no viviente.
Las enzimas son catalizadores proteicos (salvo las ribozimas) que se distinguen por su
eficiencia y especificidad, stos son esenciales para la clula, no habra vida si no fuere por la
catlisis. Las enzimas aceleran la velocidad a la cual ocurre una reaccin determinada, esto no
debe confundirse con la espontaneidad de una reaccin, el hecho de que sea exergnica y por
ende espontanea, no tiene relacin con la velocidad a la cual ocurre esa reaccin. Muchas
enzimas para poder funcionar, requieren de un cofactor, ya sea un metal o alguna coenzima. Por
ejemplo, el Cu2+ es un cofactor para la enzima citocromo oxidasa, o el K+ es un cofactor para la
enzima piruvato quinasa. Se piensa que la necesidad de algn cofactor es un vestigio de la
catlisis primitiva durante los inicios de la vida, cuando las reacciones dependan de algn metal
para ser llevada a cabo. Los cofactores metlicos son mucho menos especficos que las
coenzimas (poseen grupos prostticos), stos derivan de las vitaminas, componentes esenciales
para la vida, que no pueden ser sintetizados por el humano por lo que son importantes en la dieta.
Por ejemplo hay algunas coenzimas que sirven como transportadores de ciertos grupos
funcionales o ciertos tomos como la biocitina, que transfiere el CO 2 con la enzima piruvato
carboxilasa para formar un oxalacetato.
E + S ES EP E + P
La enzima (E) reconoce su sustrato (S) formando un complejo (ES) donde lleva a cabo
una reaccin que transforma el sustrato en producto (P) para despus desasociarse de l y seguir
actuando en otros sustratos, esto caracteriza a los catalizadores su habilidad de poder ser
reutilizado, hay algunos casos especficos en donde la enzima no vuelve a ser utilizada en la
reaccin.
La figura a la izquierda
muestra la energa de la reaccin (G) a
medida que el S pasa a ser P, en este
caso como el nivel energtico del P es
menor que el del S, el G es negativo
y la reaccin es espontnea. La energa
de activacin es la energa requerida
para llevar el S al estado de transicin
() para que la reaccin tome lugar y
es esta energa que disminuye el
catalizador.
Anlogos del :
Las enzimas y los anticuerpos comparten la caracterstica de ser protenas que unen
compuestos en forma especfica. Se ha visto que cuando anlogos de supuestos estados de
transicin de reacciones enzimticas son incubados con anticuerpos, stos ltimos aceleran las
reacciones de descomposicin espontnea de los anlogos en varios rdenes de magnitud. Esto
da origen al concepto de anticuerpo cataltico (abzyme) que es de alto inters en las reas
biomdicas.
Modelo Enzimtico:
La interaccin de la enzima con el
sustrato no es el tpico llave-cerradura"
como lo propuso Emil Fisher a fines del
siglo 19, puesto que de ser as no ocurrira
ningn cambio en el sustrato. Ocurre ms
bien mediante un encaje inducido (la
enzima es complementaria el estado de
transicin) (Koshland 1958). Este modelo
establece que el sitio activo de la enzima
(regin de unin a sustrato) es una disposicin de la enzima que favorece al sustrato a alcanzar
su estado de transicin. Por ejemplo, con la enzima hexoquinasa este modelo se ejemplifica. Al
entrar la glucosa al sitio activo, el OH del C6 desplaza una molcula de agua que normalmente se
encuentra en esa posicin. Este OH del C6 es el que se fosforila con el P del ATP. La xilosa se
une tambin al sitio activo pero como no tiene C6, no desplaza al agua, en este caso, cuando se
agrega ATP, la enzima es engaada y fosforila el agua. La fosforilacin del agua no ocurre si
no se agrega xilosa, lo que demuestra que sta (y por ende la glucosa) provoca un cambio
conformacional que activa a la enzima para que catalice la ruptura del enlace fosfoanhidrido
entre los P y P del ATP.
La energa de unin alcanza para vencer una serie de obstculos como los factores
entrpicos cuando corresponda, ya que la enzima puede disminuir al unirse uno o ms sustratos a
la enzima, tambin la ruptura de interacciones sustrato-solvente (solvatacin), la distorsin que
hay que introducir en el S para pasarlo a P y lo ms importante, la ruptura de los enlaces. Pero
adems de la energa de unin, hay otros factores que permiten bajar la energa de activacin y
alcanzar el estado de transicin:
c) Catlisis Covalente: Hacer intermediarios covalente con el sustrato, esto no sucede con
todas las protenas. Ej: Descarboxilacin de acetoacetato.
El protonado de un C de la lisina
acta como imn de electrones.
Coenzimas tpicas de este tipo de
catlisis son el piridoxal-P y la
tiamina-PP o TPP.
d) Catlisis por iones metlicos: aproximadamente 1/3 de las enzimas requieren un metal,
puede ser metaloenzimas (que en su estructura poseen metales como el Cu, Fe, Zn y Mn,
stas participan en procesos como el transporte de electrones en distintos procesos
metablicos) o pueden ser enzimas activadas por metales (en este caso, los metales son
factores, tales como K, Mg, Ca, etc) Tpicamente participan en reacciones de xido-
reduccin. Por ejemplo, la enolasa (una enzima que
participa en la glicolisis) lleva el 2-fosfoglicerato a
fosfoenolpiruvato, donde participa el Mg.
En esta reaccin la lisina-345 hace catlisis bsica
sacando un protn de la enzima que despus es
estabilizada (el intermediario) por 2 iones de Mg2+, y
facilitan la abstraccin del H+ del C2. El glutamato-211 facilita la eliminacin del OH por medio
de una catlisis cida general.
Cintica Enzimtica:
Es una herramienta til para estudiar mecanismos de accin enzimtica.
Pero, tambin, la velocidad mxima de la reaccin se dar cuando [ET] = [ES] (cuando la
enzima est saturada y todas las molculas estn participando en la reaccin), es decir:
Vm = K2[ET]
Por lo tanto:
Al graficar la ecuacin de Michaelis-Menten, da una hiprbola:
Por tal motivo, se suele usar la razn de Kcat/Km como una mejor referencia de la
eficiencia cataltica de una enzima o constante especifica. Tanto un valor alto de Kcat como una
baja Km (alta afinidad de E por S) contribuyen a aumentar el valor del K cat/Km.
Pero hay an algo ms, Kcat la hemos obtenido con una enzima saturada. Pero si
quisiramos medir la frecuencia con que la enzima transforma al S en P cada vez que interactua
con l, es mejor trabajar en una zona donde los encuentros de E con S sean ms ocasionales. Ello
ocurrir si [S] <<< Km (como ocurre en la clula). En estas condiciones:
El cuociente Ks/Km, o K1K2/(K-1 + K2), ser mximo cuando K2 >>> K-1 (el ES prefiere
ir a P que volverse a E + S), o sea cuando la formacin de P sea mucho ms rpido que la
disociacin de ES a E + S. En este caso, K2/Km = K1, que es la constante de velocidad de la
formacin de ES a partir de E + S (de segundo orden: M -1seg-1). La velocidad de la reaccin va
depender de que tan rpido difunda el sustrato por el medio hasta llegar a su sitio activo.
Tambin se analizan con criterios de Michaelis-Menten, donde pueden suceder dos cosas:
Para poder distinguir entre cual de las reacciones est tomando lugar, se realiza a travs de
cintica enzimtica (Lineweaver-Burk) dejando un sustrato S1 constante en exceso y variando el
otro sustrato S2, donde se obtienen rectas que van disminuyendo al aumentar S2, si las rectas
intersectan, hay ES1S2, y si son paralelas, es ping-pong.
Inhibicin Enzimtica:
1) Competitiva
2) Acompetitiva
3) Mixta o no-competitiva
Competitiva: Sucede cuando el inhibidor (I) se une reversiblemente al sitio del S, por lo que hay
que aumentar [S] para alcanzar la Vm. O sea, no se altera Vm pero si Km. El hecho de estar
aumentando S desplaza a I.
= 1 + [I]/Ki
Ki = [E][I]/[EI]
Acompetitiva:El I no se une a la enzima, sino que se une a la enzima una vez que este unido a su
sustrato (se une a un sitio diferente del sitio activo), por lo tanto, al aumentar la concentracin de
S, no se llega a Vmax.
= 1 + [I]/Ki
Ki = [ES][I]/[ESI]
En este caso la cintica enzimtica si muestra que se altera el Vmax dado que las rectas
intersectan en distintos puntos al eje y cuando se altera la concentracin de I. Adems se altera la
Km.
Mixta o no-competitiva: En este caso, el I se une a un sitio distinto del sitio activo y lo hace
tanto a la E como al ES.
En este caso se altera tanto el Vmax como el Km. Puesto a que se une tanto a E como a ES,
podemos determinar una Ki y una Ki.
Tabla Resumen:
Una manera de explicar el efecto heterotrpico postivo (activador alostrico) es que este
produce un cambio conformacional en su subunidad regulatoria que es transmitida a la
subunidad cataltica, la que adopta una forma ms afn al sustrato.
Las localizaciones de estas enzimas son distintas al igual que la funcin que posean, dado
que los distintos tejidos tienen funciones diferentes. En el infarto del miocardio, aumenta
principalmente la cantidad de LDH1 srica, una situacin que se mantiene hasta 24 horas
despus del infarto. Por otra parte, se observa un aumento de LDH5 en diversas patologas
hepticas como la cirrosis, hepatitis y otras enfermedades.