M.

Zawari

Departamento de Qumica, Ciencia e Investigacin, Universidad Islmica Azad, Tehern, Irn.

DOI: http://dx.doi.org/10.13005/ojc/310103

RESUMEN:

En este estudio investigamos Adenina, Guanina, Citosina y Timina moleculesadsorption de nitruro

de boro por la teora de densidad funcional (DFT). Para este propsito se calcula la energa de
adsorcin (Ead), homo- brecha de energa LUMO (Eg), diferencia de voltaje (? V) y (q) de
adenina, las molculas de guanina, citosina y timina en diferentes distancias de adsorcin en la
capa de nitruro de boro y compararlas.

PALABRAS CLAVE:

Nitruro de boro; La adsorcin; estudios DFT

Copie el siguiente citar este artculo:

Hoja de nitruro de boro Zawari M. como una superficie nueva para la adsorcin mdica y la sntesis
de frmacos. Orient J Chem 2015; 31 (1).

Copie el siguiente citar esta URL:

Hoja de nitruro de boro Zawari M. como una superficie nueva para la adsorcin mdica y la sntesis
de frmacos. Orient J Chem 2015; 31 (1). Disponible en: http://www.orientjchem.org/?p=7300

Introduccin

El nitruro de boro es un material sinttico, que aunque descubierto en el siglo 19 no fue

desarrollado como un material comercial hasta la segunda mitad del siglo 20. El boro y el nitrgeno
son vecinos de carbono en la tabla peridica - boro en combinacin y nitrgeno tener el mismo
nmero de electrones de la capa externa - los radios atmicos de boro y el nitrgeno son similares
a la del carbono. No es sorprendente, por tanto, que el nitruro de boro y exhiben similitud de
carbono en su estructura cristalina (1-5) .En la misma manera que existe de carbono como el
grafito y el diamante, nitruro de boro pueden ser sintetizados en formas hexagonales y cbicos.
Nitruro de boro hexagonal (h-BN) es el equivalente en la estructura de grafito. Al igual que su placa
de grafito como microestructura y la estructura reticular en capas le dan buenas propiedades
lubricantes. h-BN es resistente a la sinterizacin y por lo general est formada por prensado en
caliente (6-10). BN es un muy buen aislante elctrico. Ofrece muy alta conductividad trmica y
buena resistencia al choque trmico.

A diferencia de grafeno, una lmina h-BN es una amplia aislante hueco, como es mayor h-BN, y es
un material prometedor para las tecnologas opto-electrnicos, dispositivos de tnel y transistores
de efecto de campo. Usando una combinacin de exfoliacin mecnica y grabado por iones
reactivos, monocapa y multicapa suspendidos hojas h-BN puede ser preparado. La brecha de
banda de nanocintas de nitruro de boro puede ser alterada por pasivacin borde con diferentes
tipos de tomos. Una combinacin de un nmero impar de capas h-BN es un cristal inico no
centrosymmetric que es piezoelctrico debido a D3h simetra. Las ondulaciones en las h-BN
resultados de hoja en una fuerte polarizacin en el plano de la hoja que depende no
analticamente en el vector de onda de las ondulaciones. hoja de h-BN tiene una deformacin
elstica no lineal hasta una resistencia a la rotura seguido por una cepa de ablandamiento al
fracaso. Por otra parte, la banda prohibida de los nanotubos de nitruro de boro se puede reducir
por un campo elctrico transversal debido a una mezcla de estados dentro del orbital molecular
ocupado ms alto y el ms bajo orbital molecular desocupado. La reduccin de la brecha de banda
debido a los resultados de deformacin uniaxial en relacin magnetorresistencia de tnel que
aumenta linealmente con la tensin aplicada (11-15).

El nitruro de boro (BN) es un compuesto hecho por el hombre moderno que es paralelo a la
perfeccin de la estructura cristalina y propiedades de origen natural de carbono elemental. En
realidad nitruro de boro hexagonal hBN (o grafito blanco) es un lubricante de alto rendimiento
similar al grafito natural, mientras que el nitruro de boro cbico cBN (o borazone) es segundo en la
dureza despus del diamante, ambas sustancias se clasifican como las mejores superabrasivos. An
ms, existe una analoga cristalogrfica perfecto entre los polimorfos de nitruro de boro y los
altropos de carbono: hBN (nitruro de boro hexagonal) tiene la misma red cristalina como grafito,
RBN (nitruro de boro rombodrico) tiene la misma red cristalina como grafito rombodrico, cBN
(cbico nitruro de boro) tiene la misma red cristalina como el diamante, WBN (nitruro de boro
wurtzitic) tiene la misma red cristalina como lonsdaleta (una variedad wurtzitic de diamante). Para
el nitruro de boro, as como para el carbono la misma distincin se puede hacer entre los
polimorfos de baja densidad -Baja dureza y alta densidad - polimorfos de dureza elevada (16).

El nitruro de boro tiene un gran potencial en la nanotecnologa. Los estudios muestran que la BN
puede ser particularmente adecuada para el objetivo applications.The biolgica del presente
trabajo fue investigar el potencial de adsorcin de nitruro de boro (17-24).

Los dos pares de nucleobases, la adenina (A) con timina (T) y citosina (C) con guanina (G), han sido
considerados clave para la estabilidad del ADN, la replicacin, y la capacidad para el
almacenamiento de informacin, con los enlaces de hidrgeno entre ellas jugando un papel
integral. La adenina y guanina pertenecen a la clase de doble anillado de molculas llamadas
purinas. Citosina, timina y uracilo son todas las pirimidinas. El uracilo sustituye a la timina en el
ARN. Adenina, guanina, timina, citosina y uracilo son bases debido a la presencia de uno o ms de
los siguientes grupos: - NH2, - NH - y = N - grupos. Es importante destacar que, - NH2 y - NH -
grupos pueden reaccionar con cidos carboxlicos y cido fosfrico para formar amidas. Por lo
general son simplemente llamados bases de la gentica. Debido a que A, G, C, T y aparecen en el
ADN, estas molculas se denominan bases de ADN; A, G, C y T se denominan ARN-bases.
Formacin de pares de enlaces de hidrgeno compuestas de una purina y una pirimidina, tales
como guanina-citosina y adenina-timina.

Estos nucletidos son importantes para una serie de razones. La mayora de ellos, no slo ATP, son
las fuentes de energa que impulsan la mayora de nuestras reacciones. ATP es la fuente ms
comnmente utilizado, pero GTP se utiliza en la sntesis de protenas, as como algunas otras
reacciones. UTP es la fuente de energa para la activacin de glucosa y galactosa. CTP es una fuente
de energa en el metabolismo lipdico. AMP es parte de la estructura de algunos de los coenzimas
NAD como coenzima y A. Y, por supuesto, los nucletidos son parte de los cidos nucleicos. Ni las
bases ni los nucletidos se requieren componentes de la dieta.

El conocimiento de la interaccin entre las molculas biolgicamente activas, tales como protenas
o cidos nucleicos, y las superficies slidas es relevante para la preparacin de materiales y
biosensores compatibles bio. La adsorcin de molculas orgnicas pequeas, en particular,
aminocidos o bases de cido nucleico, en las superficies se estudia con ello para ayudar en la
comprensin de los procesos intermoleculares complejas, por ejemplo, en el origen de la vida de
investigacin (25).

La auto-organizacin de las molculas orgnicas aparece como uno de los enfoques ms

prometedores para la miniaturizacin de los dispositivos electrnicos. Debido a su
complementariedad de Watson-Crick, bases de ADN son candidatos prometedores para el diseo
de estructuras autoorganizadas funcionales. Estructuras bidimensionales de bases de ADN
autoensambladas sobre diversos sustratos, como Au (111) superficies de grafito o especialmente
altamente orientada, se han investigado tanto experimental y tericamente en gran medida. El
conocimiento profundo de la interaccin molcula de sustrato es esencial para la comprensin y la
prediccin exitosa de la interaccin intermolecular de molculas de superficie adsorbido. En este
contexto, investigamos aqu computacionalmente el mecanismo de adsorcin de adenina, guanina,
citosina y timina molculas individuales en la superficie de nitruro de boro (26).

Es de fundamental importancia para la comprensin de la funcin de la purina de ADN y las bases

de pirimidina para entender su adsorcin espontnea en las superficies. Por esta razn, el estudio
terico de los cidos nucleicos y su adsorcin en diferentes tipos de materiales de electrodo ha
sido recientemente de gran inters (27).

La adsorcin de pequeas biomolculas en superficies inertes acta como laboratorio de las

interacciones moleculares y es un excelente punto de partida para abordar los procesos de
reconocimiento y auto-organizacin molecular. Mediante el estudio de estos sistemas que
obtenemos informacin sobre el delicado equilibrio entre las fuerzas intermoleculares que
contribuyen a supramolecular de unin, por ejemplo, la identificacin nica de antgenos y sus
sitios de unin en nuestra bioqumica. Es natural para comenzar una investigacin de las
interacciones moleculares y organizacin, centrndose en elementos fundamentales, como los
cidos nucleicos o los aminocidos. Sistemas de biopolmero tridimensional, como la doble hlice
de ADN o protenas, plegamiento de permiso de una extrema complejidad que limita el acceso
directo a la mayor parte de la estructura, y experimental directa de sondeo de la organizacin a
escala atmica es difcil. Por lo tanto, la modelizacin terica deber trazar las interacciones y la
organizacin no slo entre la estructura orden primaria, sino tambin secundaria y superior en
ausencia de cualquier calibracin con experimentos. Por el contrario, atrapando bases ncleos en
superficies inertes no slo simplifica las posibilidades de reorganizaciones estructurales, pero
tambin hace que las interacciones moleculares accesibles a la caracterizacin directa a travs de
experimentos a escala atmica avanzadas (25-27).

La determinacin de la estructura de adsorbida adenina, guanina, citosina y timina en BN

superficies es importante para entender su unin y reactividad en los fenmenos de adsorcin y de
estas molculas en BN de catlisis y otra superficie puede ser capaz de producir cambios en las
interacciones entre el BN y capa de tomos extraos o molculas (28-31).

En la investigacin nanoestructura, la interaccin molecular con la superficie nanoestructura es un

campo sub de considerable inters debido a las aplicaciones potenciales, tales como el
almacenamiento, sensores qumicos, y dispositivos electrnicos. Doping o funcionalizacin
nanoestructuras travs qumica unin de tomos, molculas o grupos moleculares es visto como
un enfoque viable para la adaptacin de sus propiedades.

Se estudi la adsorcin de molculas de adenina, guanina, citosina y timina en la hoja de BN por

medio de la teora funcional de la densidad (DFT) calculations.Adsorption energa Ead (kcal /
mol), homo- brecha de energa LUMO Eg (eV), voltaje Se estudi la diferencia? V (UA) y q (e)
(32-35).

Mtodos Computacionales

Los clculos qumicos cunticos en el presente trabajo se llevaron a cabo con el paquete de
software de Gauss 2009. La adsorcin de las molculas de adenina, guanina, citosina y timina se
investig en prstina nitruro de boro usando clculos de la teora funcional de densidad.

La geometra del boro Nitrid y adenina, guanina, citosina y timina molculas han sido optimizados
por intercambio de tres parmetros hbrido de Becke funcional y la correlacin no local funcional
de Lee, Yang, y el mtodo Parr (B3LYP) con base 6-31G * conjunto de Barone usando ab initio
paquete de qumica cuntica Gaussian (36-38). La densidad B3LYP funcional se ha demostrado
previamente para reproducir propiedades experimentales y se ha utilizado comnmente para
nanoestructuras.

La optimizacin se realiza junto con un clculo de la frecuencia para verificar que la geometra era
un mnimo real sin cualquier frecuencia imaginario. En el presente estudio, hemos realizado
sistemticas primeros clculos principales en las nanoestructuras atmicas y electrnicas. La
descripcin de la energa intra-molecular de las molculas individuales, nitruro de boro y adenina,
guanina, citosina, timina es buscado dentro del sistema nano en comparacin con los clculos
realizados para las molculas separadas libres. En este enfoque, se puede determinar la energa de
interaccin mediante el clculo de la energa de la libre BN y adenina, guanina, citosina, timina
individualmente para cada disposicin geomtrica del sistema. La energa de adsorcin, brecha de
energa, la diferencia de tensin y q se han calculado a nivel de cndo pop = teora chelp.

Resulte y Discusin

En este estudio, se presenta la energa de adsorcin (kcal / mol), energas HOMO, energas LUMO y
brecha de energa homo LUMO (eV), clculos de diferencia de voltaje? V y q para la capa de
nitruro de boro que estn dopados por Adenina, Guanina , las molculas de citosina y timina en el
varias distancias.

El EAD energa de adsorcin de la adenina unido BN se calcul como sigue:

Ead = E (Adenina / BN) - [E (BN) + E (Adenina)]

Donde E (Adenina / BN) corresponde a la energa de la nitruro de boro, en el que la adenina se ha

adsorbido en la superficie, E (BN) es la energa de la hoja aislado, y E (adenina) es la energa de un
solo Adenina molcula. Calculamos otros valores de energa de adsorcin para guanina, citosina y
timina adjuntos BN de la misma manera.

La banda prohibida HOMO-LUMO una brecha entre el HOMO (el ms alto ocupado orbital
molecular) y LUMO (el ms bajo orbital molecular desocupado) (32). Con el fin de comprobar la
validez de esta descripcin sobre la estabilidad estructural de los sistemas de Adenina-BN,
Guanina-BN, Citosina-BN y Timina-BN, se han calculado los orbitales frontera HOMO-LUMO.
Recientemente, la banda prohibida HOMO-LUMO se ha sugerido es una medida de las
propiedades estructurales estabilidad y la semi-conductoras de. El intervalo de banda de estos
sistemas como las diferencias relativas en la energa del HOMO y el LUMO se informa en las Tablas
1-4. En Figura 1 se muestran los modelos de estado de adsorcin de molculas en el nitruro de
boro.aca va las imgenes

Figura 1: Las vistas de las molculas unidas BN. Adenina-BN (a),

guanina-BN (b), citosina-BN (c) y sistemas de Timina-BN (d).

Haga clic aqu para ver figura

Click here to View figure

 Tabla 1: Calculado energa de adsorcin (kcal / mol),
energas HOMO, energas LUMO, HOMO-LUMO brecha de
energa (eV), diferencia de voltaje (au) y q (e) para el
sistema de Adenina-BN en varias distancias

Click here to View table

Table2: Calculado energa de adsorcin (kcal / mol), energas

HOMO, energas LUMO, HOMO-LUMO brecha de energa (eV),
diferencia de voltaje (au) y q (e) para el sistema de Guanina-
BN en varias distancias

Click here to View table

Tabla 3: Calculado energa de adsorcin (kcal / mol),

energas HOMO, energas LUMO, HOMO-LUMO brecha de
energa (eV), diferencia de voltaje (au) y q (e) para el
sistema de Citosina-BN en varias distancias
Click here to View table

Tabla4: Calculado energa de adsorcin (kcal / mol),

energas HOMO, energas LUMO, HOMO-LUMO brecha de
energa (eV), diferencia de voltaje (au) y q (e) para el
sistema de Timina-BN en varias distancias
Click here to View table

Los valores esperados de la adsorcin Ead energtica (kcal / mol), homo LUMO brecha energtica Eg (eV),
diferencia de voltaje? V (au), y q (e) de la Adenina-BN, Guanina-BN, Citosina sistemas -BN y Timina-BN se
muestran en las Figuras 2-5 y tambin estos valores calculados se comparan en las Tablas 1
 Figura 2: Los grficos de la energa de adsorcin
calculada (kcal / mol) para Adenina-BN (a), guanina-BN
(b), BN timina (d) sistemas de Citosina-BN (c) y.
Click here to View figure

Figura 3: Las grficas de HOMO-LUMO brecha de energa

(eV) para Adenina-BN (a), guanina-BN (b), citosina-BN
(c) y sistemas de Timina-BN (d).

Click here to View figure

Figure4: Las grficas de las diferencias de tensin (UA)

para Adenina-BN (a), guanina-BN (b), citosina-BN (c) y
sistemas de Timina-BN (d).

Click here to View figure

Figura5: Las grficas de q (e) para Adenina-BN (a),

guanina-BN (b), BN timina (d) sistemas de Citosina-BN
(c) y.

Click here to View figure

La funcin de Lennard-Jones es una muy famosa funcin emprica de la dinmica molecular. El

potencial de Lennard-Jones es un potencial efectivo que describe la interaccin entre dos
molculas no cargadas o tomos. El potencial de Lennard-Jones es medianamente atractivo como
dos molculas sin carga o tomos se acercan el uno al otro desde la distancia, pero fuertemente
repulsiva cuando se acercan demasiado. Como tal, es un modelo para todos los pares potenciales
interatmicas. Su sencillez y precisin hacen que sea muy adecuado para simulaciones de dinmica
molecular. La forma de la funcin (V (r)) est dada por:

En la que R es la separacin interatmica, epsilon es la constante de energa (o bien profundidad) y

sigma es efectivamente el dimetro de uno de los tomos.

En corto alcance (pequeo r) la energa potencial es grande y positivo, revelando que esta es una
disposicin muy desfavorable de los tomos (que indica que los dos tomos estn fuertemente
superponen). A larga distancia la energa potencial es pequeo y negativo. Esto indica que en este
rango el par de tomos experimenta una influencia estabilizadora. (De hecho, esta corresponde a
la energa de dispersin de London, causada por una forma sutil de atraccin elctrica conocida
como la interaccin dipolo-dipolo instantneo). En una separacin ligeramente mayor que sigma,
la energa est en un mnimo. Aqu es donde la pareja tomo es estable, y se contentar con
permanecer en esta posicin hasta que alguna influencia externa les perturba. La forma bsica de
esta curva es comn a casi todos los potenciales empricos y capta lo esencial de (enlazantes)
fuerzas interatmicas.

Podemos utilizar la funcin de energa potencial para el clculo de la fuerza entre los tomos.
Matemticamente esto se da por la negativa de la primera derivada de la funcin - en otras
palabras, el negativo de la pendiente de la grfica en todos los puntos. Una derivacin Tal muestra
que cuando los tomos estn cerca de la fuerza de repulsin es, a larga distancia es atractivo, y en
el mnimo de energa, la fuerza es cero - como se esperaba! La forma matemtica de la fuerza es el
siguiente:

Tenga en cuenta que la fuerza F es un vector, con componentes en tres direcciones: X, Y, Z. Esto es
bastante diferente de la funcin potencial, que es un escalar y slo tiene un valor para cada
distancia r. Esta es una razn por qu es ms conveniente trabajar con funciones potenciales en
lugar de las leyes de la fuerza.