Fungal Bioremediation MYCOREMEDIATION

KATA PENGANTAR
Ilmuwan mulai menggunakan jamur dan bakteri untuk degradasi xenobiotik
Senyawa organik menjelang pertengahan abad ke-20. Penggunaan
Bakteri menunjukkan hasil yang cepat dan menjanjikan, namun penelitian tentang evaluasi jamur
Telah tertinggal. Ini tidak berarti jamur itu tidak sesuai organisme
Atau fungsinya kurang memuaskan daripada bakteri dalam merendahkan senyawa tersebut.
Partisipasi jamur dalam bioremediasi sekarang sudah mapan
Di semua ekosistem.
Mycoremediation adalah salah satu area yang paling kompleks dalam remediasi terapan
teknik. Selama dua dekade terakhir, banyak ilmuwan jamur dan insinyur
Ingin mencoba menggunakan jamur dalam degradasi senyawa organik,
Dan bagi mereka yang mencoba menggunakannya, hasilnya bagus.
Penemuan nilai jamur putih membusuk dalam bioremediasi telah membawa
Kesuksesan yang lebih besar dan dengan demikian telah merangsang penelitian di seluruh dunia. Baru
Era dalam penggunaan teknologi jamur untuk degradasi senyawa organik
telah mulai. Dengan demikian, kebutuhan telah muncul untuk sebuah buku yang membahas tentang
Peran unik jamur dalam bioremediasi.
Keadaan sains yang digambarkan di sini merupakan karya perintis yang fokus
Di bidang baru dan menarik dari mikoremediasi. Buku itu berisi unsur
Dari semua disiplin ilmiah dan teknik yang dikenal secara global dan berbasis
Dasar yang kuat dalam subjek yang akan berfungsi untuk menghubungkan pengetahuan yang dikembangkan
Pada abad kedua puluh dan kedua puluh satu. Buku itu ensiklopedi
Dalam lingkup dan menyajikan berbagai jenis jamur dan jamur yang terkait
Proses yang digunakan untuk membersihkan limbah dan wastewaters di lingkungan yang terkontaminasi.
Buku ini mencakup aspek-aspek yang berkaitan dengan jamur degradatif, taksonomi, biokimia,
Enzim, rekayasa reaktor, rekayasa genetika, ekologi Biodegradasi, dan aplikasi praktis. Pengetahuan mengalir
dari
Mendasar untuk aspek praktis, sehingga berguna untuk belajar dan menerapkan bioremediasi
Secara holistik Buku ini tidak hanya berisi sintesis interwoven
Dan perspektif historis teknologi namun juga memberikan "slow release
Nutrisi "untuk penemuan dan batas baru untuk penelitian masa depan.
Jamur adalah salah satu organisme alami yang paling serbaguna dalam strukturnya,
Metabolisme, ekologi, dan genomik. Langkah pertama adalah memahami jamur
Morfologi, analisis dan pengukuran pertumbuhan, dan proses jamur
Biodegradasi (Bab 1). Tes imunologi dan molekuler dikoreksi
Sebagai alat baru untuk deteksi jamur degradatif. Bab 2 dan 3 penutup
Pengolahan berbagai macam limbah industri dan tempat pembuatan bir dan
Limbah penyulingan, fermentasi, bioreaktor, dan pemodelan bersamaan dengan
Kepentingan ekonomi. Selanjutnya, jalur metabolisme dan mekanisme
Mycotransformation dan mycodetoxifi kation dari minyak bumi hidrokarbon
(Bab 4), bifenil poliklorinat dan dioksin (Bab 5), dan pestisida
(Bab 6) dieksplorasi. Spektrum bioreaktor, mekanisme,
Dan faktor-faktor yang mempengaruhi mycotransformation, jalur metabolisme, dan metabolit
Fenol (Bab 7), hidrokarbon aromatik polisiklik (Bab 8),
Pulp dan serbuk kertas pabrik (Bab 9), dan pewarna (Bab 10) ditutupi
berikutnya. Peran enzim jamur dalam degradasi dan transformasi
Fenol, hidrokarbon aromatik polisiklik, lignin dan pabrik pulp dan kertas
Effl uents, dan pewarna dibahas secara rinci. Bab 11 berfokus pada properti,
Mekanisme yang terkait, dan aplikasi jamur hidup dan tidak hidup
Biomassa dalam biosorpsi logam. Peran jamur mikoriza dalam pengambilan
Logam beracun dan degradasi senyawa organik xenobiotik juga dibahas
(Bab 12). Metode untuk mengidentifikasi, memilih, dan menggunakan jamur dibahas
Secara holistik terkait dengan aplikasi mikoremediasi. Kemajuan terakhir
Dalam rekayasa genetik dan bioteknologi molekular yang akan berguna
Penciptaan jamur yang sesuai mampu mendetoksifikasi senyawa detoksifikasi lebih cepat
Juga dijelaskan. Namun, banyak masalah dan keterbatasan masih ada
Dan perlu diatasi.
Buku ini ditujukan untuk menjangkau khalayak luas, termasuk para manajer dan
Pemimpin dalam penelitian dan praktik mikoremediasi dan harus sangat
Berguna sebagai alat referensi untuk berlatih insinyur, ilmuwan, pengelola lokasi limbah,
Dan ahli regulasi. Ini juga akan memberikan informasi yang berguna bagi para ahli
Di bidang sekutu, seperti botani, mikologi, geologi, ekologi, biokimia jamur,
Genetika, enzim, teknik metabolik, mikrobiologi lingkungan,
Dan bioteknologi. Ini harus menjadi sumber terkemuka untuk lulusan dan
Mahasiswa sarjana tertarik untuk memahami kapasitas dan prosesnya
Biodegradasi jamur. Mahasiswa pascasarjana dapat melakukan eksperimen
Atau penelitian di laboratorium atau menerapkan jamur dalam bioremediasi pada saat terkontaminasi
Situs tanpa mencari panduan khusus. Pekerjaan juga akan berfungsi sebagai
Buku pegangan untuk pembuatan desain dan komponen baru untuk mikoremediasi
Proses. Instruktur akan menemukan bahwa mereka dapat mengajar kursus atau courserelated
Topik langsung dari buku, dan ceramah dapat dipersiapkan dalam a
Berbagai program studi, mulai dari latar belakang mendasar hingga studi kasus.
Referensi hampir 2000 dapat berfungsi sebagai template untuk subjek tertentu
Daerah yang terkait dengan mikoremediasi. Buku ini akan merangsang pemikiran dan lebih besar
Penelitian dalam konteks proses mikoremediasi yang lebih luas di masa datang
Dekade. Limbah berbahaya dan wastewaters merupakan masalah modern
Peradaban yang tidak akan hilang selama berabad-abad. Limbah dan wastewaters baru
Sedang dihasilkan setiap tahun dengan industrialisasi kita yang terus berkembang. Sehari akan
Datanglah saat jamur akan memainkan peran lebih besar dalam transformasi dan detoksifikasi
Limbah berbahaya dan air limbah dari pada saat ini.
Saya sangat berterima kasih kepada Dr. Steven C. McCutcheon atas bimbingannya yang berharga
Dan saran selama persiapan buku. Kredit khusus diberikan kepada saya
Istri, Dr. Julu Bhatnagar, yang memberikan wawasan tentang bioteknologi dan molekuler
Dan teknik imunologi untuk deteksi jamur degradatif sebagai
Serta berkontribusi pada disain sampulnya. Akhirnya, saya ingin mengungkapkan
Terima kasih yang tulus kepada Pak Nathan Wilson karena telah mengizinkan saya untuk menggunakan
fotonya
Dari Trametes versicolor (dari situs Web http://mushroomobserver.org) di
Sampul buku.
Penolakan
Buku ini ditulis oleh Harbhajan Singh dalam kapasitas pribadinya. Tidak ada yang istimewa
Dukungan atau pengesahan oleh Badan Perlindungan Lingkungan A.S. atau apapun
Badan pemerintah federal lainnya memang dimaksudkan atau harus disimpulkan.
Atlanta, Georgia Harbhajan Singh

PENGANTAR
Jamur adalah kelompok organisme yang beragam dan ada di mana-mana di lingkungan.
Mereka telah banyak berkontribusi terhadap pembentukan kesejahteraan manusia sejak
Awal peradaban. Kontribusi mereka berkisar dari alam hingga industri
menggunakan. Mereka bisa eksis dan bertahan di hampir setiap habitat. Jamur memainkan peran penting
Di semua ekosistem dan mampu mengatur aliran nutrisi dan
Energi melalui jaringan miselia mereka. Mereka mempengaruhi lingkungan di
Macroscale, meskipun dampaknya tetap tersembunyi dari dunia.
Jaringan miselium mereka mungkin mencakup beberapa hektar lapisan hutan, dan dengan demikian
Jamur dianggap sebagai insinyur ekosistem alami dan sejati (Lawton dan
Jones, 1995). Namun, kontribusi jamur seringkali terbengkalai
Profesional, insinyur, ilmuwan, dan masyarakat umum.
Jamur diyakini bertahan selama sekitar 5300 tahun (Haselwandter
Dan Ebner, 1994). Armillaria bulbosa dianggap sebagai yang terbesar dan
Organisme hidup terpanjang di dunia (Smith et al., 1992). Jamur bersifat mikroskopis
Organisme eukariotik yang menunjukkan pertumbuhan pada berbagai substrat dan
Mampu melanjutkan fungsinya hampir indefi nitely. Organisme ini,
Termasuk jamur, ragi, dan jamur ringan, adalah mikroorganisme yang unik
Yang bisa digunakan dalam remediasi limbah dan wastewaters.
Insinyur lingkungan hidup di seluruh dunia harus memecahkan masalah limbah
Dan wastewaters, dan jamur saprophytic famented lainnya dapat menurunkan senyawa
Mengalir dengan air limbah untuk menerima air dan dengan demikian berkontribusi
Pembersihan mereka Beberapa jamur, ragi, dan jamur sangat toleran terhadap ekstrem
Konsentrasi ion hidrogen di substrat dan dapat ditemukan dengan sangat

Asam atau sangat basa lingkungan. Jamur sangat plastik dan paling banyak
Sel jamur adalah totipoten, sehingga seluruh organisme dapat diregenerasi tidak hanya
Dari spora tapi juga dari fragmen hama.
1.1 BIODEGRADASI DAN BIODETERIORASI FUNGAL
Jamur diketahui mendegradasi, atau menyebabkan memburuk, berbagai macam bahan
Dan senyawa, proses yang dikenal sebagai mycodegradation dan mycodeterioration.
Aktivitas degradasi jamur telah dikenal di berbagai bidang
Situasi dimana mereka menghancurkan berbagai jenis kayu, kertas bekas, tekstil,
Plastik, kulit, dan elektroinsulasi dan berbagai bahan pembungkus (Tabel
1.1). Polyethylene, dengan berat molekul 4000 sampai 28.000, terdegradasi oleh
Budidaya Penicillium simplicissimum YK (Yamada-Onodera et al.,
2001), dan bioremediasi polietilena mungkin dilakukan di masa depan.
Enzim Mucor rouxii NRRL 1835 dan Aspergillus fleve telah diproduksi
Perubahan sifat mekanik dan berat polietilen sekali pakai
Tas (El-Shafei et al., 1998). Jamur putih membusuk juga efisien dalam polietilen
Degradasi (Iiyoshi et al., 1997). Aspergillus flvus dijajah dan
Jenis polimetil metakrilat chitosan-graft terdegradasi sebesar 45% selama 25 hari
Budidaya aerobik dalam penelitian oleh Harish Prashanth dkk. (2005). Phanerochaete
Chrysosporium menempel pada serat poliamida-6 dan mengurangi 50% dari
Massa molar polimer setelah 3 bulan (Klun et al., 2003). Dari 15 jenis
Jamur putih dan coklat, Resinicium bicolor terbukti paling banyak
Jamur efektif untuk detoksifikasi bahan karet ban bekas limbah
Sebelum devulcanisasi (Bredberg et al., 2002).
Jamur juga membantu dalam memburuknya beton. Spesies Fusarium
Berkontribusi terhadap hilangnya kalsium dan berat pada beton selama pemaparan (Gu
Et al., 1998). Peningkatan porositas semen dan kehilangan kekuatan lentur dengan
Pencucian kalsium rendah telah dikaitkan dengan asam yang diproduksi oleh Aspergillus
Niger dan Mycelia sterilia (Perfettini et al., 1991). Kontak langsung jamur
Miselia dengan permukaan semen tidak perlu. Jamur hitam seperti Phoma
Dan Alternaria berinteraksi dengan permukaan marmer dan menyebabkan fisik, kimiawi,
Dan kerusakan estetika (Diakumaku et al., 1995). Aureobasidium pullulans
Berkoloni pada polivinil klorida plasticized (pPVC) dalam waktu 25 sampai 40 minggu
Paparan (Webb et al., 2000). Tarik aureobasidium tumbuh utuh
Formulasi pPVC sebagai satu-satunya sumber karbon, mengeluarkan ekstraseluler
Esterase, dan menyebabkan penurunan berat lapisan bawah. Selain itu, konstruksi baru
Bahan yang dihasilkan dari bagian tanaman yang hancur sangat terancam oleh
Cetakannya
Keanekaragaman hayati jamur dari berbagai jenis bahan pustaka menjadi masalah
Di seluruh dunia. Pada periode 1919-1977, jamur berkepala milik 234
Spesies dari 84 genera diisolasi dari berbagai jenis bahan pustaka
(Zyska, 1997). Dua puluh lima tahun penelitian menyelidiki noda di atas kertas
Dibuat oleh jamur, dikenal sebagai foxing, telah dijelaskan (Arai, 2000). Sebuah budaya
Dari Rhizopus oryzae mengubah kertas limbah ke l (+) - asam laktat (Park et
Al., 2004). Jamur juga menyebabkan kerusakan pada lukisan dinding dan kemunduran
Artefak kayu Ada banyak literatur tentang pembusukan kayu dengan warna putih - dan
Jamur coklat-membusuk. Jamur juga telah diketahui menyerang kuno dan abad pertengahan
Permukaan kaca Trichophyton simii dan A. niger telah terbukti menyebabkan
Degradasi wol dalam media kultur cair (Shrivastava et al., 1996).
Kedua jamur tersebut menyebabkan penurunan berat badan pada wol dan pelepasan protein.
Beberapa
Spesies jamur juga diketahui menyerbu resin yang digunakan untuk merekatkan lensa bersama
Mikroskop dan instrumen optik lainnya. Fusarium moniliforme adalah
Mampu merendahkan asam deoksiribonukleat (DNA) ke dasar nukleat atau
Derivatif (Kruszewska et al., 2004).
1.2 BAGAIMANA BUNGA MENGHASILKAN AIR UNTUK TUMBUH DI AIR
Jamur filamen dapat menjajah substrat lembab seperti kayu dan lobang
Antarmuka air untuk tumbuh ke udara (Wosten et al., 1999). Schizophyllum
Komune mengurangi tegangan permukaan air sebelum keluar dari air
Fase untuk membentuk hifa udara atau badan buah. Tegangan permukaan hasil dari
Sekresi sejumlah besar hidrofobin ke dalam lingkungan berair
Yang membentuk protein amphipathic yang stabil di antarmuka air-udara. Di sebuah
Aliran kontinu medium cair, hifa jamur miselium, terutama
A. niger, mengarahkan kembali arahan mereka untuk tumbuh di hulu (Oh et al., 1997).
1.3 MUGFOLOGI FUNGAL, ANALISIS,
DAN PENGUKURAN PERTUMBUHAN
1.3.1 Morfologi jamur
Kerajaan jamur mewakili sekelompok organisme dengan berbagai macam
Struktur. Mayoritas jamur terdiri dari struktur vegetatif
Disebut miselia yang tumbuh dari tip mereka sebagai pohon bercabang biner (Viniegra-
Gonzalez et al., 1993). Mycelia adalah struktur unik seperti struktur tabung
Membentuk sistem bercabang dan anastomulan yang luas. Setiap miselium seperti a
Hutan, dimana pohon individu dikenal sebagai hypha. Hifa paling banyak
Jamur septate, namun kehadiran pori-pori melalui septa memungkinkan massa

Gerakan sitoplasma dan organel dan migrasi nukleus melalui

Miselium ke bagian yang jauh. Setiap hypha dimulai dari spora pada saat perkecambahan
Menghasilkan satu atau beberapa hasil yang disebut tabung germinal, di mana
Bahan diangkut menuju puncak pertumbuhan. Hifa dibatasi oleh
Dinding matriks heteropolimer kaku yang disebut chitin, yang terdiri dari
glukosamin. Sebuah miselium mengandung dua jenis vesikula di sitoplasma itu
Memainkan peran penting dalam pertumbuhan apikal (Bartnicki-Garcia, 1990). Ini vesikula
Memiliki ukuran yang berbeda, melakukan fungsi yang berbeda, dan dikenali sebagai
Macrovesicles dan microvesicles. Macrovesicles mengeluarkan polimer dan
Enzim yang terdiri dari fase amorf dinding, dan mikrovesikel
Komponen merupakan kerangka chitin dinding. Komponen macrovesicles
Disintesis secara internal, sedangkan komponen microvesicles
Terakumulasi pada atau di dekat antarmuka membran dinding. Ragi adalah uniseluler
Organisme dengan dinding sel dan satu nukleus per sel. Secara umum ada
Banyak variasi dalam bentuk sel ragi, namun ada dua tipe dasar:
Ragi pemula dan ragi.
Jamur filamentosa menunjukkan beberapa morfologi berbeda dalam kultur terendam.
Mycelia bebas terdispersi atau diaglomerasi dalam media.
Agregat hyphal longgar disebut sebagai rumpun; Lebih padat, sering berbentuk bulat
Agregat disebut pelet. Hyphae bisa berkisar dari rattery linear sampai
Struktur bercabang. Rumpun dan pelet bervariasi dalam ukuran, kepadatan, dan permukaan
Struktur, bahkan di jamur yang sama. Karena sifatnya yang kental, yang terdispersi
Suspensi miselia berperilaku non-Newtonian. Suspensi jamur pellet
Kurang kental dan dengan demikian memberi pengaruh lebih sedikit pada sifat fl ow
Dari media cairan curah. Rheologi fluida fermentasi dipengaruhi oleh
Dua faktor utama: konsentrasi biomassa dan morfologi sel jamur.
Morfologi sel jamur diinduksi oleh intensitas agitasi, kultur CO2,
PH, tingkat pertumbuhan spesifik, dan O2.
1.3.2 Analisis Morfologi Jamur
Analisis morfologi jamur tergantung pada pengukuran akurat hyphal
Panjang dan frekuensi bercabang. Berbagai metode diakui untuk
Analisis morfologi jamur (Tabel 1.2). Analisis gambar adalah salah satunya
Metode. Unit pertumbuhan hibrid (G) telah diusulkan (Caldwell dan Trinci,
1973) untuk menentukan total panjang hafal (hifa utama ditambah cabang) dibagi

Dengan jumlah tip, situs ekstensi hyphal. Studi autoradiografi

Telah menunjukkan ketidakpercayaan persentase signifikan dari tip hyphal di
Trichoderma itu tidak berkontribusi terhadap pertumbuhan (Pitt dan Bull, 1982). Itu
Nilai akun G untuk jumlah tip yang layak. G dihitung berdasarkan volume
Dasar (Gvol) jika variasi dalam diameter hyphal individu juga dicatat
(Robinson dan Smith, 1979). Estimasi nilai Gvol yang tepat membutuhkan
Penggunaan dua kation magnifi untuk mengukur lebar hafar (Cox et al., 1998).
Program dan protokol analisis citra otomatis telah dikembangkan
Untuk identifikasi dan pencacahan sel hidup versus mati Aureobasidium
Pullulat pada slide mikroskopis dan permukaan daun (Nelson et al., 2000).
Sel hidup mengambil CellTracker Blue dan Nonviable DEAD Red, dan
Perangkat lunak optimal digunakan untuk membedakan sel yang layak dan mati. Otomatis
Metode pembuatan gambar digital jamur digunakan untuk mengevaluasi warnanya
Distribusi, dimensi koloni, dan pengukuran tekstur dari tujuh isolat
Penicillium (Dorge et al., 2000). Aplikasi Windows bisa menemukan
Posisi dan ukuran hingga tiga koloni dalam sebuah gambar. Analisis citra otomatis
Dan pewarnaan fluoresen juga telah digunakan untuk menentukan jamur
Biomassa di tanah dan permukaan inert (Morgan et al, 1991).
Beberapa pengukuran digunakan untuk miselium agregat lepas (gumpalan) di
Keadaan terdispersi. Penggunaan yang umum digunakan adalah pengukuran area yang
diproyeksikan, dimana a
Area tiga dimensi dari rumpun bisa ditangkap dengan ukuran yang masuk akal. Di
Aspergillus niger, rasio perimeter rumpun ke perimeter inti miliki
Telah digunakan untuk mengukur bentuk rumpun (Papagianni et al., 1999). Yang diproyeksikan
Daerah rumpun berkorelasi baik dengan reologi kaldu untuk Penicillium chrysogenum
(Cox et al., 1998). Proyeksi pengukuran area juga digunakan untuk
Analisis citra pelet jamur, ukuran pelet, dan bentuk dan dimensi
Daerah hifa yang menonjol. Namun, pengukuran berhubungan dengan semua morfologi
Bentuk dalam fermentasi jamur belum dikembangkan. Sangat mengerikan
Jamur, analisis fraktal telah digunakan dengan beberapa keberhasilan untuk mempelajari
pertumbuhan koloni
(Jones et al., 1993; Matsuura dan Miyazima, 1993). Metode standar untuk
Mengukur dimensi fraktal (D) tidak diketahui, dan nilai D yang diperoleh adalah
Tergantung metode (Soddell dan Seviour, 1994).
1.3.3 Formasi dan Struktur Pelet
Proses pembentukan pelet pada jamur belum sepenuhnya dipahami,
Tetapi dua mekanisme yang berbeda, pengetatan dan penguraian yang tidak koagulasi,
telah dilamar. Pembentukan pelet koagulasi adalah dua langkah
Proses: agregasi spora, dan agregasi selanjutnya dari perkecambahan
Aglomerat spora. Pelet nonkoagulasi dihasilkan dari perkecambahan a
Spora tunggal Phanerochaete chrysosporium nampaknya melibatkan polisakarida permukaan
Menjembatani selama langkah awal agregasi, tapi tidak jelas
Apakah mekanisme ini berlaku untuk semua jamur (Gerin et al., 1993). Pelet
Juga dapat dihasilkan dari aglomerasi agregat dan fragmen hara
Dari pelet yang sebelumnya rusak. Faktor-faktor yang mempengaruhi pembentukan pelet adalah
Strain specifi c, dan struktur pelet biasanya tergantung pada budidaya
Kondisi yang digunakan selama proses berlangsung. Struktur pelet mycelial bervariasi
Dan dapat berkisar dari agregat yang longgar dan tidak beraturan hingga bola yang rapat dan
kompak.
Secara umum, suspensi pellet dari sel jamur tidak kental dan menyimpang
Dari perilaku Newton pada konsentrasi biomassa tinggi.
Beberapa faktor diketahui mempengaruhi pembentukan dan struktur
Pelet dalam jamur ringan (Gibbs et al., 2000): konsentrasi inokulum dan
Persiapan, intensitas agitasi, komposisi media, dan lain-lain.
Komposisi sedang meliputi pH kultur, kadar karbon, konsentrasi fosfor,
Agen permukaan-aktif, dan sebagainya. Beberapa jamur tidak membentuk pelet;
Jamur lainnya dalam bentuk pelleted menunjukkan penurunan produksi metabolit
Disebabkan oleh keterbatasan transfer hara dalam sel pelet. Kompatibel ketat
Pelet adalah defi cient dalam aliran bebas dari difusi molekul dan berongga masuk
Pusatnya, karena autolisisis miselium. Dalam Penicillium chrysogenum,
Pelet dengan diameter kurang dari 400 M mengandung semua sel aktif. Lebih besar
Pelet menunjukkan empat zona yang berbeda: lapisan luar sel yang tumbuh secara aktif,
Dua lapisan sel yang kurang aktif, dan pusat berongga. Hanya di luar 100 sampai
Lapisan 200 pM pelet chrysosporium Phanerochaete mengasimilasi glukosa
(Cronenberg et al., 1994). Hubungan yang mungkin terjadi antara jamur
Morfologi dan produksi metabolit jamur berperforma tinggi.
1.3.4 Pengukuran Pertumbuhan
Pertumbuhan adalah proses yang kompleks dengan banyak proses komponen yang berbeda.
Peraturan
Pertumbuhan dikendalikan oleh banyak faktor. Jamur membutuhkan karbon dan
Nitrogen untuk pertumbuhan, dan beberapa aspek nutrisi telah diperiksa oleh
Singh (1978). Berbagai media telah didirikan untuk deteksi dan
Pencacahan ragi dan jamur (Beuchat, 1992). Teknik lempeng-lempar
Lebih disukai daripada teknik pour-plate. Metode yang ada untuk pengukuran
Pertumbuhan jamur (Tabel 1.3). Pengukuran kitin digunakan untuk memperkirakan jamur
Biomassa dalam fermentasi solid-state (Roche et al., 1993). Ergosterol juga
Dianggap sebagai indikator biomassa jamur. Sebagai ergosterol tunduk
Degradasi fotokimia yang signifikan, pengujian ini harus dipekerjakan dengan hati-hati
Sebagai biomarker untuk jamur hidup (Mille-Lindblom et al., 2004). Sebuah analisis sederhana
Teknik telah dikembangkan yang memungkinkan penentuan kuantitatif
Pertumbuhan jamur dan kemampuan decolorizing pada media padat jamur putih-busuk

(Yonni et al., 2004). Teknik ini digunakan pada berbagai media padat yang mengandung
Kandungan nitrogen rendah atau tinggi dan pada pewarna.
Secara umum, pertumbuhan jamur dalam kultur cair diukur dari segi kering
Berat dalam budaya stasioner atau kocok dalam 500 ml Erlenmeyer fl ask. SEBUAH
Metode cepat dan effisien telah dikembangkan untuk pengukuran pertumbuhan
Jamur yang tidak rata (Langvad, 1999). Pertumbuhan bisa diukur sangat effi -
Dengan mudah pada piring microtiter 96-well dan pembaca microplate. Pencacahan
Propagul jamur oleh unit pembentuk koloni (CFU) dipekerjakan secara rutin
Kation kuantisasi jamur (Bridge and Spooner, 2001).
Metode elektrokimia yang didasarkan pada voltametri siklik menunjukkan keempatnya
Fase pertumbuhan Fusarium solani (Subrahmanyam et al., 2000). Pertumbuhan
Kurva yang diperoleh cocok dengan metode pengukuran kering yang biasa
berat. Eksperimen juga menegaskan bahwa puncak anodik disebabkan oleh metabolit,
Bukan biomassa jamur. Perilaku sel hidup Saccharomyces
Cerevisiae dalam sistem voltametri dengan elektroda grafit menunjukkan
Hubungan antara arus puncak dan kurva pertumbuhan selama keseluruhan
Periode fermentasi (Ci et al., 1997). Tahap awal pertumbuhan, dari
Perkecambahan melalui pengembangan hyphal jamur ringan seperti Penicillium,
Phoma, dan Trichoderma, dapat dianalisis dengan flow cytometry
(Bradner dan Nevalainen, 2003).
1.4 TRANSFER MASSA, KINETIKA PERTUMBUHAN,
DAN BIOREAKTOR
Cendawan filamen adalah mikroorganisme terpenting untuk pengolahannya
Substrat padat Hal ini bisa disebabkan karena beragam kemampuan
Dan mode pertumbuhan hyphal. Perbedaan terbatas adalah model pertama yang bisa diprediksi
Perubahan panjang hyphal, percabangan, dan septa, berdasarkan mekanisme seluler
Diamati (Prosser dan Trinci, 1979). Sejak itu, beberapa model punya
Telah diusulkan untuk menjelaskan pertumbuhan hifa dengan pembesaran apikal dan bercabang.
Model ini telah dibagi menjadi dua kategori dan dijelaskan oleh
Nielsen (1992). Secara umum, model sel didasarkan pada mekanisme seluler
Diamati, dan model populasi mempertimbangkan sejumlah komponen intraselular
Dan reaksi. Berbagai pendekatan pemodelan diterapkan pada vegetatif
Pertumbuhan jamur. Ini termasuk empiris, mekanistik, deterministik, dan
Model stokastik
Bartnicki-Garcia dkk. (1989) mengusulkan sebuah model empiris untuk dideskripsikan
Pertumbuhan apikal dan hyphal morfogenesis secara kualitatif. Dua parameter utama
Digunakan: tingkat kenaikan luas sama dengan jumlah vesikula yang dilepaskan
Oleh pusat vesikel yang dipasok (VSC) per satuan waktu, dan laju linier
Perpindahan dari VSC. Georgiou dan Shuler (1986) menganggap difusi
Dari substrat dan biomassa di koloni dalam hal vegetatif, kompeten,
Conidiophore, dan spesies conidial. Model simulasi menyarankan proliferasi
Struktur pembeda karena keterbatasan perpindahan massa. Aynsley

Et al. (1990) mengembangkan model kinetik untuk pertumbuhan jamur miselium pada a
Budaya terendam. Nutrisi diserap secara merata, ditransformasikan menjadi dinding
Prekursor, dan diangkut ke ujung pertumbuhan, di mana mereka digunakan dalam
Proses perpanjangan Tidak ada pembatasan transfer massa yang diasumsikan di sini dan
Prekursor ditransformasikan pada tingkat konstan melalui kinetika Michaelis-Menten.
Mitchell dkk. (1991) mengusulkan model semimechanistik untuk pertumbuhan
Rhizopus oligosporus, sekresi glukoamilase pada media padat di mana ia berada
Berdifusi selama hidrolisis pati dan pelepasan glukosa. Glukosa
Diserap oleh miselium ditransformasikan menjadi biomassa melalui kinetika Monod.
Model matematis telah dikembangkan untuk pertumbuhan apikal, septasi, dan
Percabangan jamur miselium (Yang et al., 1992). Model ini didasarkan pada
Difusi dan produksi prekursor dinding untuk menggambarkan pertumbuhan tip dan septasi
(Deterministik) dan untuk proses percabangan (stochastic). Secara morfologi
Perkembangan miselia hingga pembentukan pelet berkorelasi dengan baik
Temuan eksperimental
Model mekanistik telah diturunkan yang mempertimbangkan perpindahan massa dan
Pertumbuhan hara pada jamur yang tidak beraturan sebelum bercabang (Lopez-Isunza et al.,
1997). Model ini mempertimbangkan difusi substrat dalam medium padat, serapan,
Dan pelepasan substrat di dinding oleh pembawa, dan pembentukan prekursor dinding
Untuk transportasi massal dengan difusi dan konveksi di dalam hifa. Baik
Korelasi kualitatif telah ditunjukkan antara simulasi model untuk a
Kisaran konsentrasi substrat dengan data eksperimen bila diukur
Nilai diameter hyphal dan panjang tabung kuman maksimum dipertimbangkan.
Cui dkk. (1998) menyajikan model matematis pertumbuhan jamur dan morfologi
Dalam fermentasi terendam. Model ini menjelaskan transfer oksigen,
Intensitas agitasi, tegangan oksigen terlarut, formasi ukuran pelet
Miselia, pecahan miselia dalam total biomassa, sumber karbohidrat
Konsumsi, dan pertumbuhan biomassa. Perbandingan simulasi dengan eksperimen
Data menunjukkan bahwa model tersebut dapat menggambarkan dengan baik periode jamur
Pertumbuhan dan morfologi. Variasi kekuatan tarik hyphal dengan waktu miliki
Telah dianggap dapat menyebabkan perbaikan pada model morfologi (Li
Et al., 2002). Sebuah model matematis telah dikembangkan yang menghubungkan
Sifat miselium jamur pada tingkat mikroskopik terhadap pertumbuhan dan fungsi
Pada makroskop (Boswell et al., 2003). Model ini didasarkan pada pergerakan
Dari tip hyphal dan translokasi substrat internal. Persamaan model
Adalah jenis hiperbolik-parabolik campuran dan penting bahwa massa
Dilestarikan dan dipelihara. Model ini dikalibrasi untuk Fusarium solani
Tumbuh pada media garam glukosa-mineral dan dipecahkan secara homogen
Dan lingkungan heterogen.
Sebuah model telah dibangun untuk menjelaskan pola koloni dan kolektif
Pertumbuhan hyphal jamur fusi (Matsuura, 2002). Model
Mempertimbangkan dua parameter eksternal, seperti tingkat nutrisi awal dan
Panjang langkah dari random random random, dan satu parameter internal, seperti
Frekuensi serapan hara. Model koloni menunjukkan awalan yang tidak teratur
Kation ramifikasi pada tingkat hara rendah, dengan pengurangan serapan hara

Frekuensi di bawah kondisi diffuse. Selama pertumbuhan Aspergillus nidulans,

Tingkat ekstensi hyphal berkurang, karena efek populasi saat
Hifa menghasilkan koloni padat tiga dimensi. Pinggiran koloni
Menjadi kental, karena efek populasi sebagai efek difusi nutrisi
Meningkat pada tingkat gizi tinggi dengan tingkat pertumbuhan alu yang rendah. Pola
Koloni dan onset gangguan didorong oleh kombinasi nutrisi
Difusi dan laju pertumbuhan hifa.
Bioreaktor jamur tertentu telah digunakan untuk menghilangkan beberapa polutan
(Tabel 1.4). Bioreaktor jamur juga disebut mikobakteri. Mycoreactors
Terdiri dari dua jenis: (1) biofilm lm atau sistem amobil dan (2) ditangguhkan
pertumbuhan. Mycoreactors berdasarkan pertumbuhan terpasang meliputi trickling fi lters,
Memutar kontaktor biologis, reaktor upfl owed-fi lm, dan tempat tidur berventilasi
Reaktor, dan yang didasarkan pada pertumbuhan tersuspensi meliputi reaktor bubur, di antaranya
Lainnya Mikroskop yang berbeda dioperasikan di bawah kondisi aerobik atau anaerobik.
Dalam mikoraktor, operasi bisa batch, semibatch, sekuensing
Batch, atau kontinu. Tangki yang diaduk adalah mycoreaktor yang paling umum
Pertumbuhan terendam. Namun, dalam kondisi tertentu, jenis reaktor lainnya,
Seperti tempat tidur kemasan, kolom gelembung, dan loop menara pengangkut udara, juga
digunakan.
Beberapa jamur digunakan dalam bentuk immobilisasi di berbagai reaktor untuk memudahkan
Biodegradasi cepat Pembentuk pelet jamur dibudidayakan di aeratized fluida
Atau reaktor loop pengangkutan udara yang ditangguhkan. Beberapa fisik, kimiawi, dan biologis
Parameter yang mempengaruhi bioproses penting dalam pemantauan dan
Kontrol kinerja dan bioreaktor dan perbaikannya. Sebuah matematika
Pemodelan proses yang melibatkan berbagai asumsi dapat digunakan untuk
Memprediksi efisiensi pencabutan kontaminan dari bioreaktor. Metabolik
Dan keragaman genetik jamur dalam bioreaktor dapat dianalisis dengan memperolehnya
Polymerase chain reaction (PCR) amplifikasi kation DNA. Penggunaan
Filter berbasis lapangan ultrasonik telah dinilai untuk pemisahan yang disempurnakan
Dari jamur ringan dan penggunaannya dalam proses batch berulang (Crognale et al.,
2002). Kondisi operasi dioptimalkan, dan tiga proses batch
Mengungkapkan 88% dari efisiensi pemisahan sistem.
Selama dekade terakhir, sistem kontrol berbasis pengetahuan telah digunakan
Dalam proses bioteknologi. Bagian berbasis pengetahuan Biogenes
Sistem kontrol untuk pengendalian bioproses serasah Saccharomyces cerevisiae
Budidaya telah diuraikan (Hrncirip et al., 2002). Data proses