Instituto Tecnológico de Veracruz

Unidad de Investigación y desarrollo en alimentos

Materia
Ingeniería bioquímica

Dr. Mario Ramirez Lepe

Tarea: Árbol filogenético.

Presenta:
Muñoz Castillo Lucía Yazmín

10 de Septiembre del 2016

 UNIDAD DE INVESTIGACIÓN Y DESARROLLO EN ALIMENTOS

Árbol filogenético

Pasos a realizar:

Paso 1: Abrir el programa Mega 7.0 y dar click en MEGA links en la parte inferior y después en show
MEGA web brower
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Paso 2: El programa nos redireccionará a la página virtual del NCBI, en donde se selecciona
el apartado de proteínas y después colocaras el nombre de la proteína que deseas analizar,
en mi caso es colágeno tipo 1.

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Paso 3: Una vez ingresado el nombre de la proteína, procedemos a buscar entre las opciones
y darle click.

Paso 4: Posteriormente nos direccionará a la información de la proteína y damos clic en Add

to alignment que se encuentra en la parte superior derecha.

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Paso 5: Al hacer clic en Add to alignment automáticamente el programa guardara la secuencia

de la proteína de interés y regresará a la página del NCBI, en donde podremos buscar las
demás proteínas para completar el árbol filogenético, para guardar más proteínas, seguiremos
los pasos 3 y 4 hasta terminar con todas las proteínas a procesar.

Paso 6: Una vez elegidas todas las proteínas, procedemos a guardar el archivo, seleccionando la
opción de guardar que se encuentra en la parte superior izquierda de la pantalla.

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Paso 7: Cuando se halla guardado el archivo, regresamos al menú principal de MEGA 7.0 y
damos clic en la opción Phylogeny que se encuentra en la parte superior del menú y después
seleccionamos cosntruct/Test Neighbor –joining Tree. Una vez que abramos el archivo,
aparecerá una nueva ventana en donde modificaremos el apartado de Test of phylogeny y
colocaremos la opción de Bootstrap method y después presionamos Compute para que el
programa realice el árbol Filogenético.
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Paso 8: se abrirá una nueva ventana con nuestro árbol terminado.

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