Terdapat banyak hambatan dalam terapi komplementer ini antara lain; adanya perbedaan

agama antara pasien dengan tenaga kesehatan yang sedang bertugas sehingga terapi ini tidak
dapat dilakukan. Hambatan lainnya yaitu tidak tersedianya sarana dan prasarana yang memadai
di lingkungan pasien untuk terlaksananya terapi ini, misalnya tidak tersedianya Al-Qur’an, music
murotal dan sebagainya. Selain itu, masih sedikitnya masyarakat yang mengetahui tentang terapi
ini membuat terapi ini masih sangat jarang digunakan dalam menurunkan ansietas pasien anak
pre-sirkumsisi. Maka dari itu dibutuhkan kesinambungan antara pasien, keluarga pasien, tenaga
kesehatan, sarana dan prasarana yang baik dalam terlaksananya terapi komplementer ini.