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Metabolismo de
Ácidos Nucleicos
Generalidades
Bases nitrogenadas, nucleósidos, nucleótidos
Síntesis y degradación de nucleótidos
Generalidades
• Los ribonucleósidos, desoxirribonucleósidos, y los
derivados de los mismos, unidos al ácido fosfórico, son los
nucleótidos, compuestos esenciales en la célula.
• Sin ellos no existirían ADN, ARN ni tampoco la síntesis
proteica.
• Los nucleótidos por si solos, son componentes de muchas
vías metabólicas, en las que sirven como coenzimas
• Las bases púricas y pirimidínicas, pueden reusarse o
sintetizarse de novo.
Estructura de un nucleótido...
Nucleótido
• Los nucleótidos
están formados por
una base Ac.fosfórico Nucleósido
nitrogenada, una
pentosa y uno, dos
Base nitrogenada Pentosa
o tres grupos
fosfato.
• La base nitrogenada Purina Pirimidina
puede ser púrica o
pirimidínica.
Las purinas y pirimidinas
• Tanto el ADN como el ARN contienen las
mismas purinas: Adenina(A) y Guanina(G)
• Tanto el ADN como el ARN contienen la
pirimidina Citosina(C) pero difieren en la
otra pirimidina.
• El ADN contiene Timina (T) y el ARN
Uracilo(U)
Purinas...
NH2 O
N N
N HN
N NH2 N
N H N H
Adenina(A) Guanina(G)
Pirimidinas......
O NH2 O
CH3
HN N HN
O N O N O N
H H H
Timina(T) Citosina(C) Uracilo(U)
Los nucleósidos...
HOH2C O
• La unión de una base nitrogenada
y un azúcar (pentosa), genera un
nucleósido. OH
• Los nucleósidos de las bases
A,G,T,C y U son: adenosina, OH OH
guanosina, timidina, citidina y ribosa
uridina.
• El azúcar puede ser ribosa HOH2C O
(ribonucleósido) y 2-desoxirribosa
(desoxirribonucleósido)
OH
OH H
Desoxirribosa
Los nucleótidos...
• El nucleósido adenosina, se
une al ácido fosfórico para OH
formar:
– Nucleótido monofosfato: AMP Nucleótido monofosfato
– Nucleótido difosfato: ADP
Nucleótido difosfato
– Nucleótido trifosfato: ATP
Nucleótido trifosfato
Síntesis de nucleótidos de las
purinas
CO2 Glicina
• El proceso genera AMP y
GMP.
aspartato
• Los diversos carbonos del C N
nucleo purina derivan de
N C
distintos aminoácidos, del CO2
y del tetrahidrofolato. C
• El proceso tiene tres etapas: C C
– Síntesis de fosforribosil amina
N N
– Síntesis de inosina monofosfato
– Síntesis de AMP y GMP Formil
tetrahidrofolato
Glutamina
Síntesis de 5´fosforribosil amina
• En primer término se sintetiza fosforribosil pirofosfato: a partir de la ribosa
5´fosfato
• Mediante la actividad de la ribosa fosfato fosfoquinasa en presencia de ATP y de
Mg
• Se activa por el Fosfato inorgánico y se inactiva por la presencia de nucleósidos
purínicos
• En la segunda etapa la 5 fosforribosil pirofosfato, en presencia de la
Glutamina:fosforribosil pirofosfato amidotransferasa, de glutamina agua y
magnesio se transforma en fosforribosil amina
POH2C O Pirofosfo
quinasa POH2C O Amidotransferasa POH2C O NH2
Mg Mg
OH
O~P~P
ATP AMP Glutamina Glutamato
Fosforribosil + H2O +PPi Foforribosil
Ribosa 5 fosfato
1-pirofosfato amina
Síntesis de Inosina Monofosfato
• Las siguientes nueve etapas para formar IMP requieren
de cuatro moléculas de ATP y la presencia de los
donantes de N y C correspondientes.
1. Sintetasa+Glicina + ATP
2. Formil transferasa + Formil tetrahidrofolato
3. Sintetasa + Glutamina + ATP + H2O
4. Sintetasa + ATP
5. Carboxilasa + CO2
6. Sintetasa + Aspartato + ATP
7. Adenilo succinato liasa + H2O
8. Formiltransferasa + Formil tetrahidrofolato
9. Ciclohidrolasa
Síntesis de IMP (I) CH2-NH2
POH2C O NH2
CH2-NH
O=C CHO
POH2C O NH O=C
Glicina POH2C O NH
ADP
+ ATP Formil tetra
5fosforribosil Hidro folato Tetrahidrofolato
amina 5fosforribosil
glicinamida 5fosforribosil
formilglicinamida
N
CH2-NH
CHO
H2N HN=C
POH2C 0 N
POH2C O NH
5fosforribosil 5fosforribosil
5aminoimidazol I
n
formilglicinamidina
o
Síntesis de IMP (II) N
COOH
HOOC N
N H2N
HC-NH-C
POH2C O N
CH2 H2 N
ATP POH2C O N CO2
H2N Aspartato
HOOC N
O
Fosforribosil 5fosforribosil
SuccinocarboxamidaRibosa 5fosfato Aminoimidazol 5fosforribosil
aminoimidazol carboxilato 5aminoimidazol
H2O
Fumarato
CO
N
NH2-CO N CO HN
N
H2N
Formiltetra Ciclohidrolasa N N
H2N hidrofolato O
N
O HC-NH N
O
Ribosa 5fosfato
Ribosa 5fosfato O Ribosa 5fosfato Inosina 5
Fosforribosil monofosfato(IMP)
Fosforribosil
Carboxamida
Carboxamida
aminoimidazol
formamidoimidazol
Síntesis de AMP y GMP
HOOC-CH2-CH-COOH
CO Xantosina
NH GTP+Aspartico CO N monofosfato
N N IMP dehidrogenasa HN
HN HN
OC
N
Adenil N
O N Sintetasa N
O N NAD + H2O ON
succinato
Ribosa 5fosfato
Ribosa 5fosfato Ribosa 5fosfato
NH2 CO Guanosina
N N Monofosfato
HN HN
(GMP)
NH2
N
ON N
ON
Ribosa 5fosfato Ribosa 5fosfato
Adenosina
Monofosfato
Transformación de nucleótidos
monofosfato en di y tri fosfato
• Los nucleósidos di fosfato son sintetizados a partir de los monofosfato
mediante nucleósido monofosfato quinasas. Igual si se trata de ribo o
desoxirribo nucleósidos. El ATP es la fuente de fosfato
Nucleósido difosfato
GDP ATP GTP ADP
quinasa
CDP ATP CTP ADP
Degradación de Purinas
• Deficiencia en adenosina deaminasa:
inmunodeficiencia; células T y B
• Deficiencia en purina nucleósido fosforilasa:
daño en la función de las células T. Menor
formación de ác.úrico
• Gota: hiperuricemia;artritis aguda por depósito
de cristales de ácido úrico.
– Primaria:mayor producción de ác.úrico
– Secundaria: cáncer insuficiencia renal
Adenosina
deaminasa
AMP Adenosina Inosina Pi
5 nucleotidasa
Purina nucleósido
H2O NH3
H2O Pi fosforilasa
Ribosa 1-
Guanosina
GMP Hipoxantina fosfato
O2+H2O
Pi
PurinaHnucleósido
Xantino oxidasa
fosforilasa
2
Ribosa 1- O
fosfato 2 H2O2
Aminohidrolasa
Guanina
Xantina
O2+H2O
H2O NH3
Xantino oxidasa
H2O2
Ácido Urico
Síntesis de nucleótidos de las
pirimidinas
• A diferencia de los nucleótidos de las purinas,
donde las bases se sintetizan ya unidas a la
pentosa, en el caso de las pirimidinas primero se
sintetizan las bases y luego se unen a la pentosa.
• Las fuentes de carbono y nitrógeno de las
pirimidinas son la glutamina, el CO2 y el ácido
aspártico.
• El paso inicial es la síntesis de carbamil fosfato
Síntesis de carbamil fosfato
• La glutamina y el CO2 en presencia de la carbamil fosfato sintetasa II
y dos moléculas de ATP produce carbamil fosfato. Esta enzima no
requiere biotina como otras carboxilantes.
• El proceso es semejante al que da inicio a la síntesis de urea, catalizado
por la carbamil fosfato sintetasa I .
• La síntesis de urea se produce en la mitocondria y las de las
pirimidinas en el citosol. La fuente de nitrógeno en el primer caso es el
amonio mientras que en el segundo es la glutamina
Carbamil fosfato sintetasa II
2
2 ATP CO2 Gluta min a NH 2 CO O PO3
Carbamil fosfato
Síntesis de Uridina 5´monofosfato
O
OH O
NH2 Aspartato C
transcarbamilasa H2N CH2 Dihidroorotasa C
C=O HN CH2
Deshidrogenasa
NADH+H
O O
C C O
HN CH HN CH PRPP
PPi
C
O=C CO2 O=C HN CH
C C
N N COOH
O=C C
Ribosa 5´fosfato Ribosa 5 fosfato N COOH
Orotidina 5´monofosfato H
Uridina 5´monofosfato Orotato
Síntesis de CTP
• La Citidina trifosfato se forma a partir de la Uridina
trifosfato, por aminación de esta última por la enzima CTP
sintetasa y como donante de nitrógeno la glutamina.
Glutamina Glutamato
UTP CTP
ATP ADP+Pi
Ácidos nucleicos
• Ribonucleasas y desnaturalizados
desoxirribonucleasasdel jugo
Nucleasas
pancreático hidrolizan ARN y
ADN. oligonucleótidos
• Los oligonucleótidos son
hidrolizados por las
mononucleótidos
fosfodiesterasas pancreáticas Fosfodiesterasas
• Nucleotidasas y
nucleosidasas liberan purinas Nucleósidos
Nucleotidasas
y pirimidinas que son
degradadas en la célula Nucleosidasas
intestinal y excretadas por la Ácido Bases
orina, como en el caso del Úrico nitrogenadas
ác.úrico.
Orina
ADN
Estructura y Síntesis
ADN: generalidades
• Los ácidos nucleicos (ADN y ARN)
son estructuras químicas ADN
fundamentales para el
almacenamiento y la expresión de ADN
la información genética. ADN
• El ADN está presente tanto en los
cromosomas de los núcleos de las
células eucariotes, como en las Replicación
mitocondrias y cloroplastos de las
plantas. ADN
• En las células procariotes, que no
tienen núcleo, tienen un único
cromosoma o pueden contener
ADN no cromosomal como Transcripción
plásmidos.
• El ADN se replica durante la
división celular y se expresa por
transcripción al ARN.
ARN
Estructura de ADN
• El ADN es un Adenina
polidesoxirribonucleótido
con muchos
desoxirribonucleótidos
unidos por enlaces Citosina
fosfodiester 3,5
• Existe como una molécula
formada por un par de Guanina
cadenas (salvo en algunos
virus) entorchadas una
sobre otra, en una doble
hélice. Timina
• En las células eucariotes el
ADN está asociado a varios
tipos de proteínas en una
estructura llamada
nucleoproteína
El enlace 3,5 fosfodiester...
• Este enlace une el grupo 5´ Terminal 5´
hidroxilo de la desoxirribosa de P
un nucleótido con el grupo 3´
hidroxilo de otro. 5´ 3´ T
• La cadena muestra polaridad en P
un terminal 5´ y en otros
5´ 3´ A
terminales 3´ que no están
unidos. P
• La secuencia se expresa del 5´ C
3´
terminal 5´ de la cadena al P
terminal 3´.
5´ G
• Los enlaces fosfodiester pueden 3´
ser rotos mediante endo (al P
medio) y exo (al extremo) 5´ G
desoxirribonucleasas 3´
OH Terminal 3´
La hélice doble
• En la hélice doble, las dos cadenas Terminal 3´ Terminal 5´
giran alrededor de un eje común.
• Están colocadas de forma
antiparalela, esto es, el terminal 5´
Ranura
ancha
• La forma A tiene 11 bases por
360°, gira a la derecha y las
bases están giradas 20° de la
delgada
Ranura
perpendicular.
• La forma Z tiene 12 pares por
360°, gira a la izquierda . Se
le encuentra en algunas
porciones del ADN. B-ADN Z-ADN
Síntesis de ADN en procariotes
• Cada una de las cadenas del
doble helice del ADN se separan
para generar cadenas
complementarias.
• Se forman entonces dos
moléculas hijas de ADN con
orientación antiparalela como
fue el ADN original.
• A esto se llama replicación
semiconservadora porque
aunque las cadenas madre se
separan (no se conservan) se
mantienen intactacta en las dos
moléculas hijas de ADN.
• Las enzimas involucradas son las
polimerasas que sintetizan la
secuencia complementaria de
cada cadena
Separación de bases
complementarias en procariotes origen
ADN helicasa
Proteinas unidas a la
Cadena única
ARN primer
Elongación de las cadenas...
• Las polimerasas de las células eucariotes y procariotes
elongan la nueva cadena de ADN, añadiendo
desoxirribonucleótidos al terminal 3´de la cadena.
• La secuencia depende de las bases del patrón original
con los cuales los nucleótidos de la nueva cadena van a
formar par.
– ADN polimerasa III: Cataliza la elongación del ADN.
E3´hidroxilo del RNA primer ingresa el primer ribonucleótido.
y elonga el ADN en dirección 5´3´ antiparalelo al patrón
original.
– Los nucleótidos están como moléculas trifosforiladas
(dATP,dGTP,dTTP, dCTP) y liberan pirofosfato al unirse.
– Además de la ADN polimerasa existe un detector de lectura
que prueba la secuencia en dirección opuesta.
ADN de célula Eucariote
• Una célula humana tiene 46 cromosomas. Su ADN total mide
aproximadamente 1 metro de longitud.
• Este ADN está asociado a proteínas llamadas Histonas, las cuales
sirven para ordenar el ADN en unidades estructurales llamadas
nucleosomas, con forma de esferas.
• Los nucleosomas conforman estructuras más complejas llamadas
nucleofilamentos que se unen constituyendo los cromosomas.
Histonas y nucleosomas
• Las Histonas son proteínas pequeñas, cargadas
positivamente por su contenido en lisina y arginina.
• Son de cinco clases H1, H2A, H2B, H3, H4.
• Forman puentes iónicos con el ADN, que es negativo.
• Dos moléculas de H2A, H2B, H3 y H4 forman el
núcleo de cada nucleosoma, envuelto por ADN.
• Nucleosomas unidos por una unión de ADN de
aproximadamente 50 nucleótidos forma un
nucleofilamento.
• La histona H1 no se encuentra en el nucleosoma, sino
entre dos nucleosomas.
Nucleosomas y
nucleofilamentos
(H2A,H2B,H3,H4)2
H1
Daños del ADN
• El ADN es constantemente sujeto de daño
provocado por sustancias químicas y
radiaciones.
• Los daños son generalmente pérdida de
nucleótidos. Si el daño no es reparado se
provoca una mutación permanente.
• La radiación genera la unión covalente de
dos timinas adyacentes formando un dímero
que detiene a la polimerasa del ADN.
Reparación del ADN
• Tiene dos etapas:
– Reconocimiento del
dímero por una
endonucleasa
endonucleasa
específica y ruptura de
la cadena dañada.
– Luego una exonucleasa
de ruptura, reconoce la
ADN polimerasa
incisión de la
exonucleasa
endonucleasa, y
asociada a la
polimerasa I restituye
la porción dañada.
ARN
Estructura y Síntesis
Generalidades
• Si bién es cierto, la herencia genética está contenida en
la secuencia de desoxirribonucleótidos del ADN, es a
través de las copias hechas en ARN, que esta herencia
se expresa.
• El proceso de copia de cada cadena de ADN se llama
transcripción. El mensaje de ARN es traducido en
secuencias de aminoácidos o cadenas polipeptídicas.
• Hay regiones del ADN que se transcriben, otras casi no,
para ello existen señales en el ADN que indican a la
polimerasa del ARN donde iniciar, cuán a menudo
hacerlo y dónde terminar el proceso.
transcripción
ADN
GPPP
AAA
mARN
rARN
tARN
Clases de ARN
• ARN ribosomal: ( rARN) se encentra como componente
de los ribosomas. En las células procariotes y en las mito-
condriales de los eucariotes se encuentran las clases 23S,
16S y 5S. En las células eucariotes están las clases 28S,
18S, 5,8S y 5S (S=coef. de sedimentación-svedbergs)
• ARN de transferencia: (tARN)es la más pequeña de las
moléculas de ARN (4S). Tiene entre 74 y 95 nucleótidos.
Hay un tipo específico de ARN por cada aminoácido.
Corresponde al 15% del ARN celular.
• ARN mensajero: (mARN). Es el 5% del ARN celular.
Trae la información genética del ADN al citosol. Incluye
una larga secuencia de nucleótidos de la adenina (cola poli
A) en el terminal 3´, y una 7 metil guanosina en el terminal
5´.
Transcripción de genes en procariotes
• La ARN polimerasa sintetiza todos los ARN, salvo el
inicial o primer, que es sintetizado por una primasa.
• La ARN polimerasa es una enzima que reconoce la se-
cuencia de nucleótidos al inicio del ADN que debe ser
transcrito, hace una copia complementaria del ADN,
luego reconoce el final de la secuencia que debe ser
transcrita.
• El ARN es sintetizado del terminal 5´a 3´, en forma
antiparalela al patrón de ADN. El producto es llamado
transcripción primaria.
Síntesis de ARN en procariotes
5´ 3´
3´ 5´
Factor sigma
3´
5´
Factor Rho
Secuencia de consenso
Secuencia -35
Etapas en la síntesis de ARN en procariotes
• Elongación: Una vez reconocida la región
promotora, la ARN polimerasa inicia la
transcripción. La ARN polimerasa no
requiere primer, ni tampoco tiene actividad
endo-exonucleasa por lo que no repara las
secuencias dañadas.
• La ARN polimerasa utiliza ribonucleósidos
trifosfato y libera pirofosfato cada vez que
se une un nucleótido.
Etapas en la síntesis de ARN en procariotes
ADN
• Terminación.- El pro-ceso 3´~ACACGACTGNNNNNCAGTCGTAAAAT~5´
de elongación de la cadena 5´~TGTGCTGACNNNNNGTCAGCATTTTA~3
de ARN continúa hasta Transcripción
que una señal de término
se alcanza. ARN
• En unos casos encuentra 5´~UGUGCUGACNNNNNGUCAGCAUUUUA~3´
una proteína llamada factor
N
Rho con actividad ATPasa. N N
• En otros casos la trans- N N
C= G
cripción debe poder formar A= U
un giro que lentifica a la G= C
ARN polimerasa y U= A
C= G
provoca una pausa. 5´~UGU G= C AUUUUA~3´
Transcripción de genes en eucariotes
• La transcripción de genes en eucariotes es
algo más complicada que en procariotes.
• Además de la ARN polimerasa reconocien-
do la región promotora e iniciando la
síntesis de ARN, un número de factores
complementarios de transcripción se unen a
distintos sitios del ADN dentro y fuera de la
región promotora, esto determina qué genes
deben ser transcritos.
Clases de ARN polimerasas, en células
eucariotes
• Hay tres tipos de ARN polimerasas en las células eucariotes:
– ARN polimerasa I: sintetiza los precursores de las ARN ribosomales
(28S,18S y 5,8S)
– ARN polimerasa II: sintetiza precursores del ARN mensajero y también
sintetiza el pequeño ARN nuclear.
• Promotores de genes clase II: una secuencia de ADN nucleótidos casi idéntica a
la de la secuencia de consenso se encuentra a 25 bases del inicio de transcripción
para la molécula de ARN mensajero; se le llama caja TATA o caja Hogness. A
70 u 80 nucleótidos del inicio de transcripción se encuentra una segunda
secuencia de consenso llamada caja CAAT . Una de estas secuencias sirve de
señal para el inicio de transcripción en las células eucariotes.
• Estimulantes de la regulación genética: Son secuencias de ADN que
incrementan la velocidad de iniciación de la transcripción por la ARN polimerasa
II.
– ARN polimerasa III produce pequeños ARN, tipo 5S.
SECUENCIAS RECONOCIDAS POR ARN POLIMERASA II
INICIO
40 bases 25 bases
CAAT TATA
Secuencia de consenso
Caja CAAT
Caja TATA o Caja Hogness
ARN polimerasa I
45S PrerARN
28S 5,8S 18S
ARNasas
Remción
de
28S 5,8S 18S Intrones