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PRÁCTICA 4: BARRERAS ROTACIONALES

GENERALIDADES

En una aproximación bastante simple, podemos decir que los enlaces entre átomos tienen simetría
cilíndrica y permiten la rotación de los grupos que unen (Figura 1). Una conformación es el arreglo
espacial de los átomos responsable de la distinción entre estereoisómeros. Estos pueden ser
interconvertidos por rotaciones alrededor de enlaces simples. Un conjunto de estereoisómeros,
cada uno de los cuales está caracterizado por una conformación correspondiente a un punto
estacionario en la superficie de energía potencial de la molécula se conoce como confórmero [1].

Figura 1. Libre rotación alrededor del enlace C-C.

La rotación del enlace Carbono-Carbono en el etano da lugar a dos conformaciones extremas que
pueden analizarse mediante las proyecciones de Newman (Figura 2): (a) la conformación alternada
y (b) la conformación eclipsada. Es claro que el paso de la conformación alternada a la eclipsada o
viceversa se realiza por un giro de 60°. Obsérvese que en un giro continuo de 360° existen infinitas
conformaciones posibles.

Figura 2. Proyecciones de Newman para la molécula de etano.

Una gráfica de la rotación completa se muestra en la Figura 3. La energía necesaria para pasar de la
conformación eclipsada a la alternada es 2.875 kcal/mol (12.029 kJ/mol), determinada
experimentalmente [2].
Figura 3. Perfil energético para la rotación del etano alrededor del enlace C-C [3].

Un caso interesante de analizar es la molécula de n-butano. La rotación alrededor del enlace simple
Carbono(2)–Carbono(3) en la molécula de butano genera cuatro conformaciones (Figura 4). La
conformación que tiene los Carbonos 1 y 4 en lados opuestos se llama Anti. La conformación que
deja dichos Carbonos a 60°, respecto al Anti, recibe el nombre de Eclipsada. La conformación que
tiene los Carbonos 1 y 4 enfrentados se llama Sin. La conformación que deja dichos Carbonos a 60°,
respecto al Sin, recibe el nombre de Gauche.

Figura 4. Confórmeros de n-butano.

La curva de energía potencial para la rotación completa se muestra en la Figura 5. La barrera


energética del confórmero sin al confórmero gauche es de 5.17 kcal/mol (21.6 kJ/mol), mientras
que la barrera del gauche al anti es 0.89 kcal/mol (3.723 kJ/mol) [3,4].
Figura 5. Conformación energética para la molécula de n-butano [3].

OBJETIVOS

1.- Calcular la barrera de energía rotacional del etano y la barrera sin-anti para el n-butano
a partir del análisis del perfil de energía de sus diferentes conformaciones.
2.- Reproducir los datos reportados en un artículo de investigación para la molécula de
butano [4].

METODOLOGÍA

ETANO:

a) Construir el archivo de entrada para la estructura del etano en GV5.

b) Realizar el cálculo de optimización con el método Hartree-Fock. Adicionalmente al cálculo


se le agrega que no considere la conectividad (en la pestaña “General”) ni las coordenadas
cartesianas: hf/6-31G(d) opt=z-matrix

c) En “Additional Keywords” se le agrega la opción de z-matrix (Figura 6).


Figura 6. Construcción del archivo de entrada

d) Para las coordenadas cartesianas, al momento de guardar el archivo de entrada aparece la


indicación de “Write Cartesians” (Figura 7), se descartan las coordenadas cartesianas.

Figura 7. Selección de coordenadas cartesianas.

e) Una vez guardado, se edita el archivo de entrada desde G09W; para agregar la función de
Scan al archivo de entrada, como se muestra a continuación:
%chk=etano.chk
# hf/6-31g(d) opt=z-matrix

Barrera Rotacional Etano

0 1
C1
H2 1 B1
H3 1 B1 2A1
H4 1 B1 3A1 2D1 0
C5 1 B2 4A1 3D2 0
H6 5 B1 1A1 4D3 0
H7 5 B1 1A1 4D4 0
H8 5 B1 1A1 4D5 0

B1 1.07
B2 1.54
A1 109.47
D1 -120.00
D2 120.00
D3 -60.00
D4 60.00
D5 180.00 S 18 20.0

NOTA: La S indica que para el diedro D5 (que conecta los átomos H8, C5, C1, H4) se realice un
barrido de 18 pasos de 20° cada uno en el enlace C5–C1.
f) Correr el archivo y guardar.

BUTANO:

a) Construir el archivo de entrada para la estructura del anti-butano en GV5.

b) Realizar el cálculo de optimización con el método Hartree-Fock (hf). Adicionalmente al


cálculo se le agrega que no considere la conectividad (en la pestaña “General”) ni las
coordenadas cartesianas:
a. HF/6-31G(d) opt=z-matrix

c) En “Additional Keywords” se le agrega la opción de z-matrix (Figura 6).

d) Para las coordenadas cartesianas, al momento de guardar el archivo de entrada aparece la


indicación de “Write Cartesians” (Figura 7), se descartan las coordenadas cartesianas.

e) Una vez guardado, se edita el archivo de entrada desde G09W, para agregar la función de
Scan al archivo de entrada, como se muestra a continuación:
%chk=butano.chk
# hf/6-31g(d) opt=z-matrix

Barrera Rotacional Butano

0 1
C1
H2 1 B1
H3 1 B1 2 A1
H4 1 B1 3 A1 2D1 0
C5 1 B2 4 A1 3D2 0
H6 5 B1 1 A1 4D3 0
H7 5 B1 1 A1 4D4 0
C8 5 B2 1 A1 4D5 0
H9 8 B1 5 A1 1D6 0
H10 8 B1 5 A1 1D7 0
C11 8 B2 5 A1 1D8 0
H12 11 B1 8 A1 5D9 0
H13 11 B1 8 A1 5D10 0
H14 11 B1 8 A1 5D11 0

B1 1.07
B2 1.54
A1 109.47
D1 -120.00
D2 120.00
D3 -60.00
D4 60.00
D5 180.00
D6 60.00
D7 -60.00
D8 180.00 S 18 20.0
D9 60.00
D10 180.00
D11 -60.00

NOTA: La S indica que para el diedro D8 (que conecta los átomos C11, C8, C5, C1) se
realice un barrido de 18 pasos de 20° cada uno en el enlace de C8–C5.

f) Correr y guardar el archivo de salida.

RESULTADOS

1. Registre la energía que aparece en el final del archivo de salida como


función del ángulo E (θ). Buscar la cadena HF=…, las energías vienen
registradas en el mismo orden que el ángulo.

 ¿Cuál es la conformación de mínima energía? E (mínimo) =

 Calcular la energía relativa en kcal/mol: Erel = E (θ) – E (mínimo).


Tabla 1. Energías del etano como función de su ángulo en kcal/mol

θ (H8–C5–C1–H4) E (θ; Hartree) Erel (kcal/mol)

0° (anti) -79.2282 -49715.6955


20° -79.2268 -49714.8170
40° -79.2242 -49713.1855
60° (eclipsada) -79.223 -49712.4325
80° -79.2246 -49713.4365
100° -79.2271 -49715.0052
120° (gauche) -79.2282 -49715.6955
140° -79.2268 -49714.8170
160° -79.2242 -49713.1855
180° (sin) -79.223 -49712.4325
200° -79.2246 -49713.4365
220° -79.2271 -49715.0052
240° (gauche) -79.2282 -49715.6955
260° -79.2268 -49714.8170
280° -79.2242 -49713.1855
300° (eclipsada) -79.223 -49712.4325
320° -79.2246 -49713.4365
340° -79.2271 -49715.0052
360° (anti) -79.2282 -49715.6955
Tabla 2. Energías del butano como función de su ángulo en kcal/mol

E (θ;
θ (C11–C8–C5–C1) Erel kcal/mol)
Hartree)

0° (anti) -157.233 -98663.7075


20° -157.232 -98663.08
40° -157.229 -98661.1975
60° (eclipsada) -157.228 -98660.57
80° -157.229 -98661.1975
100° -157.231 -98662.4525
120° (gauche) -157.231 -98662.4525
140° -157.227 -98659.9425
160° -157.221 -98656.1775
180° (sin) -157.217 -98653.6675
200° -157.221 -98656.1775
220° -157.227 -98659.9425
240° (gauche) -157.231 -98662.4525
260° -157.231 -98662.4525
280° -157.229 -98661.1975
300° (eclipsada) -157.228 -98660.57
320° -157.229 -98661.1975
340° -157.232 -98663.08
360 (anti) -157.233 -98663.7075
DISCUSIÓN DE RESULTADOS

1. Realice las gráficas correspondientes para el etano y el butano, Erel = f (θ). Comparar los
resultados obtenidos con los resultados registrados en el artículo “RotationalBarriers.
Energies of Alkane Rotamers. An Examination of Gauche Interactions” [4]y calcular el%error
encontrado.
-49712.0000
0 50 100 150 200 250 300 350 400
-49712.5000

-49713.0000
Erel (kcal/mol)

-49713.5000

-49714.0000

-49714.5000

-49715.0000

-49715.5000

-49716.0000
θ (H8–C5–C1–H4)

-98652
0 50 100 150 200 250 300 350 400
-98654

-98656
Erel kcal/mol)

-98658

-98660

-98662

-98664

-98666
θ (C11–C8–C5–C1)

5
4.5
4
(kcal/mol)

3.5
3
2.5
rel
2

E
1.5
1
0.5
0
0 1 2 3 4 5 6 7
Ángulo θ

2. Mediante las energías, determine el confórmero más estable, justificar dicho resultado.
3. Ilustrar cada una de las estructuras correspondientes a su ángulo.

REFERENCIAS

[1] International Union of Pure and Applied Chemistry. (2014). IUPAC Gold Book. Febrero 8, 2016.Sitio web:
http://goldbook.iupac.org
[2] Mo, Y; Wu, W.; Song, L.; Lin, M.; Zhang, Q.; Gao, J. (2004). The magnitude of hyperconjugationin ethane: A
perspective from ab initio valence bond theory. Agnew. Chem. Int. Ed., 43, 1986-1990.
[3] Germán Fernández. (2013). Análisis conformacional de etano y butano. Febrero 8, 2016. Sitio web:
http://www.quimicaorganica.org.
[4] Wiberg, Kenneeth B.; Murcko, Mark A. (1998). Rotational Barriers. 2.Energies of AlkaneRotamers. An
Examination of Gauche Interactions. J. Am. Chem. Soc., 110, 8029–8038.
[5] Weininger, Stephen J.; Stermitz, Frank R. (1988). “Química Orgánica”. (1° Edición). Barcelona, España.
Reverté.
[6] Quijano-Quiñones, Ramiro F.; Quesadas-Rojas, Mariana; Cuevas, Gabriel; Mena-Rejón, Gonzalo J. (2012).
The Rotational Barrier in Ethane: A Molecular Orbital Study. Molecules, 17, 4661-4671.

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