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Los grupos fosfato están unidos a los carbonos 5' y 3' de cada azúcar de
la cadena de ADN. Un final de la cadena lleva un grupo fosfato libre
pegado al carbono 5'; a este se le llama extremo 5' de la molécula. El
otro final tiene un grupo hidroxilo libre (-OH) en el carbono 3' y se le llama
extremo 3' de la molécula.
Cuando dos cadenas de ADN se ensamblan en una doble hélice, las dos
cadenas están una enfrente de la otra, pero en direcciones opuestas; el
extremo 5' de una cadena está apareado con el extremo 3' de la otra
cadena.