Estructura primaria del los cidos nucleicos

Extremo 5 (fosforilado)
NH2 OO P O CH2 H H O O P O N CH2 H H
enlace 3-5 fosfodister

N ON O H H OH O N N

Adenina (A)

enlace 3-5 fosfodister

NH N

Guanina (G)
NH2

O H H OH NH2

O P O

Citosina (C)
O N

H2C H H O
enlace 3-5 fosfodister

O H H O OHN O O CH2 H H OH H O H H N H

Timina (T)

Extremo 3 (con -OH libre)

Estructura de una doble hebra de DNA

extremo 5
O P
-O

extremo 3
H2 N CH2 H O H N N N NH N O H H H O O H H2C O O NH N N H2 H2 N O O H O N NH N O N N H2 N N H2 N N H H H N O O O H H2C O P H H H O H H O H P O H

(T)

H O P
-O

(A)

O O

H H

O-

CH2 H O O P
-O

N O H N

(C)

(G)

H H

OO

O CH2 H H

(G)
H2C O P H H O H H OO

O P
-O

H H

(C)

O CH2 H H O H H H O N O N NH N N

H O

(A) (T)
O N H2 N H2C O P O O O-

extremo 3

extremo 5

Modelo de Watson y Crick

0.33 nm

surco menor

3.4 nm

surco mayor

36
H3C O H N

H N

N N

N N N

C1

C1

(T)

(A)
1.08 nm

H N H O N N N O H N H

N N

H N

C1

C1

(C)

(G)

1.08 nm 2.37 nm

A-DNA

B-DNA

Z-DNA

Comparacin entre los tipos de DNA

A-DNA giro pb por vuelta altura por pb (nm) diametro () enlace glicosdico Inclinacin de las bases rotacin por pb Surco mayor
dextrogiro 11 0,29 25,5 anti71

B-DNA
dextrogiro 10,4 0,34 23,7 anti89

Z-DNA
levogiro 12 0,35 G-C 0,41 C-G 18,4 anti- para C y T sin- para G 81

33

36

-51 G-C -8,5 C-G plano

estrecho y muy profundo

ancho y bastante profundo estrecho y bastante profundo

Surco menor

muy amplio y poco profundo

Muy estrecho y profundo

T54-m1A58
H3 C N O NH O

A14-U8
N O N O NH2 N

NH2
N

+
N N N CH3

N N

G15-C48

H2 N

H2 N

N N NH N N N O

+
H3 C

NH

NH2

H2 N

A23-U12-A9
N

N N

NH

N H2

m22G26-A44

G22-C13-m7G46

Punto de unin del aminocido

Punto de unin del aminocido

5-P

Extremo 5 fosforilado Lazo DHU Lazo TYC

UH2

mG

UH2 UH2 m2G Brazo adicional (variable) mI Lazo DHU

Lazo TyC

Extremo aceptor
Extremo aceptor

Lazo DHU

Lazo anticodn

Lazo anticodn

Reacciones de hidrlisis de compuestos fosforilados

G (kJ/mol)
-62 fosfoenolpiruvato piruvato + Pi -49 1,3 bifosfoglicerato glicerol 3-fosfato + Pi -43 creatinina fosfato creatinina + Pi -33 PPi 2 Pi -31 ATP ADP + Pi ATP AMP + PPi

-14 AMP adenosina + Pi -10 glicerol 1-fosfato glicerol + Pi

Conformacin C2 endo y C3 endo de la ribosa

Aceptores y dadores de hidrgeno en las bases nitrogenadas

O N H N N H N N N

N H

O H CH3 N N

H N O

Patrones de difraccin de rayos X del DNA

A-DNA cristalino

B-DNA semicristalino

DNA circular y superenrollado

DNA circular relajado

DNA circular superenrollado (supercoiled)

Procesamiento del precursor de rRNA en E. coli

rRNA 23S rRNA 16S

tRNA M23 M16 RNAsa III RNAsa III

M5 tRNA

rRNA 5S

Procesamiento del mRNA en eucariotas

intrn 1 intrn 2 intrn 3 intrn 4 intrn 5 intrn 6

gen
exn 1 exn 2 exn 3 exn 4 exn 5 exn 6 exn 7

transcripcin

ayuste (eliminacin de intrones)

Modificacin de los extremos del mRNA

CAP poli A

Nucletidos infrecuentes en los RNAs

NH2 H3 C N N HO CH2 O OH N H3 C N N O O N HN N N HO CH2 O OH O N

H2 N HO CH2

OH

OH

OH

OH

1-metiladenodina (m A, A )
O HN O HO CH2 O N CH3
1 m

1-metilguanosina (m G, G )
O HN O HO CH2 O HO CH2 NH
1 m

Inosina (I)
O HN O O N

OH

OH

OH

OH

OH

OH

5-metiluridina (ribotimidina, T)

pseudouridina (Y) 5-(1'-ribosil)uracilo

dihidrouridina (D, DHU, UH2 )

Formacin de dmeros de timina

O NH N O N O NH O

CH3 O NH N O

UV
O

CH3

NH N O

CH3

CH3