Para responder a este Documento, favor citar este número: 8022-1-2862

Bogotá D.C.,

Doctora
EDNA XIMENA AGUADO G.
AUDITORA MÉDICA
SIN DIRECCIÓN. PARA PUBLICAR EN PÁGINA WEB

Referencia: Auditoría de cuentas

Respetada Dra. Edna Ximena:

Me refiero a su consulta de la referencia. Sobre el particular esta Oficina efectúa el siguiente

análisis:

1.- CONSULTA

Documentos soporte que se deben presentar para el pago de las cuentas por prestación de
los servicios de salud.

2.- MARCO LEGAL

El trámite para el pago de la prestación de los servicios básicamente se encuentra resumido

en la siguiente normatividad.

- LEY 100 DE 1993

ARTÍCULO 156. Características básicas del Sistema General de Seguridad Social en Salud. El
Sistema General de Seguridad Social en Salud tendrá las siguientes características:...

e) Las entidades promotoras de salud tendrán a cargo la afiliación de los usuarios y la

administración de la prestación de los servicios de las instituciones prestadoras. Ellas están
en la obligación de suministrar, dentro de los límites establecidos en el numeral 5o del
artículo 180, a cualquier persona que desee afiliarse y pague la cotización o tenga el subsidio
correspondiente, el plan obligatorio de salud en los términos que reglamente el gobierno.
i) Las Instituciones Prestadoras de Salud son entidades oficiales, mixtas, privadas,
comunitarias y solidarias, organizadas para la prestación de los servicios de salud a los
afiliados del Sistema General de Seguridad Social en Salud, dentro de las Entidades
Promotoras de Salud o fuera de ellas. El Estado podrá establecer mecanismos para el
fomento de estas organizaciones y abrir líneas de crédito para la organización de grupos de
práctica profesional y para las Instituciones Prestadoras de Servicios de tipo comunitario y
Solidario; ...

ARTÍCULO 177. Definición. Las Entidades Promotoras de Salud son las entidades
responsables de la afiliación, y el registro de los afiliados y del recaudo de sus cotizaciones,
por delegación del Fondo de Solidaridad y Garantía. Su función básica será organizar y
garantizar, directa o indirectamente, la prestación del Plan de Salud Obligatorio a los afiliados
y girar, dentro de los términos previstos en la presente Ley, la diferencia entre los ingresos
por cotizaciones de sus afiliados y el valor de las correspondientes Unidades de Pago por
Capitación al Fondo de Solidaridad y Garantía, de que trata el título III de la presente Ley.
ARTÍCULO 179. Campo de acción de las entidades promotoras de salud. Para garantizar el
Plan de Salud Obligatorio a sus afiliados, las Entidades Promotoras de Salud prestarán
directamente o contratarán los servicios de salud con las Instituciones Prestadoras y los
profesionales. Para racionalizar la demanda por servicios, las Entidades Promotoras de Salud
podrán adoptar modalidades de contratación y pago tales como capitación, protocolos o
presupuestos globales fijos, de tal manera que incentiven las actividades de promoción y
prevención y el control de costos. Cada Entidad Promotora deberá ofrecer a sus afiliados
varias alternativas de Instituciones Prestadoras de Salud, salvo cuando la restricción de
oferta lo impida, de conformidad con el reglamento que para el efecto expida el Consejo
Nacional de Seguridad Social en Salud.

PARÁGRAFO. Las Entidades Promotoras de Salud buscarán mecanismos de agrupamiento de

riesgo entre sus afiliados, entre empresas, agremiaciones o asociaciones, o por
asentamientos geográficos, de acuerdo con la reglamentación que expida el gobierno
nacional. (Subrayado fuera de texto)
ARTÍCULO 185. Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud. Son funciones de las
Instituciones Prestadoras de Servicios de Salud prestar los servicios en su nivel de atención
correspondiente a los afiliados y beneficiarios dentro de los parámetros y principios
señalados en la presente Ley.

- DECRETO 1485 DE 1994

ARTICULO 2o.- Responsabilidad de las Entidades Promotoras de Salud. Las Entidades
Promotoras de Salud serán responsables de ejercer las siguientes funciones:
(...)
d.- Organizar y garantizar la prestación de los servicios de salud previstos en el Plan
Obligatorio de Salud, con el fin de obtener el mejor estado de salud de sus afiliados con
cargo a las Unidades de Pago por Capitación correspondientes. Con este propósito
gestionarán y coordinarán la oferta de servicios de salud, directamente o a través de la
contratación con Instituciones Prestadoras y con Profesionales de la Salud; implementarán
sistemas de control de costos; informarán y educarán a los usuarios para el uso racional del
sistema; establecerán procedimientos de garantía de calidad para la atención integral,
eficiente y oportuna de los usuarios en las instituciones prestadoras de salud.
e.- Organizar la prestación del servicio de salud derivado del sistema de riesgos
profesionales, conforme a las disposiciones legales que rijan la materia.
f.- Organizar facultativamente la prestación de planes complementarios al Plan Obligatorio de
Salud, según lo prevea su propia naturaleza.

- DECRETO 3260 DE 2004.

ARTÍCULO 9o. REGLAS PARA EL PAGO EN LOS CONTRATOS POR CONJUNTO INTEGRAL DE
ATENCIÓN, PAGO POR EVENTO U OTRAS MODALIDADES DIFERENTES A LA CAPITACIÓN EN
REGÍMENES CONTRIBUTIVO Y SUBSIDIADO. En los contratos donde se pacte una modalidad
de pago diferente a la capitación, tanto en el régimen contributivo como en el régimen
subsidiado, las EPS o ARS y las IPS se sujetarán al siguiente procedimiento de trámite y pago
de las cuentas:

1. Las ARS y las EPS deberán recibir facturas de las instituciones prestadoras de servicios de
salud como mínimo durante los veinte (20) primeros días calendario del mes siguiente al que
se prestaron los servicios, incluido el mes de diciembre, de conformidad con la jornada
habitual de trabajo de sus oficinas administrativas en los días y horas hábiles. La
presentación de la factura no implica la aceptación de la misma.
Para la radicación y presentación de facturas, las ARS o EPS, no podrán imponer restricciones
que signifiquen requisitos adicionales a la existencia de autorización previa o contrato cuando
se requiera y la demostración efectiva de la prestación de los servicios en salud.
2. Las ARS o EPS contarán con treinta (30) días calendario contados a partir de la
presentación de la factura para adoptar uno de los siguientes comportamientos que
generarán los correspondientes efectos aquí descritos:
a) Aceptar integralmente la factura: En este evento se procederá al pago del ciento por
ciento (100%) de la factura dentro de los cinco (5) días calendario siguientes a los treinta
(30) días iniciales;

b) No efectuar pronunciamiento alguno sobre la factura: En este evento se efectuará el pago

del cincuenta (50%) del valor de la factura dentro de los cinco (5) días calendario siguientes
al vencimiento de los treinta (30) días iniciales. Si trascurrido el término de cuarenta (40)
días calendario a partir de la radicación de la factura, no efectúa pronunciamiento alguno,
deberá pagar el cincuenta por ciento (50%) restante dentro de los cinco (5) días calendario
siguientes al vencimiento de este término;
c) Formular glosas a la factura: En este evento se procederá al pago de la parte no glosada
dentro de los cinco (5) días calendario siguientes al vencimiento de los treinta (30) días
iniciales.

3. Cuando se formulen glosas a la factura la IPS contará con treinta (30) días calendario para
responderlas. Una vez respondidas las glosas la ARS o EPS contará con cinco (5) días
calendario para proceder al pago de los valores que acepta y dejar en firme las glosas que
considere como definitivas.
4. En aquellos eventos en que existan glosas definitivas por parte de la ARS o EPS las partes
acudirán a los mecanismos contractuales o legales previstos para la definición de las
controversias contractuales surgidas entre las partes.

PARÁGRAFO 1o. Las IPS no tendrán derecho a la aplicación del literal b) del presente
artículo, cuando la EPS o ARS haya formulado glosas que en el promedio de los últimos seis
(6) meses superen el cincuenta por ciento (50%) del valor de las facturas o cuentas de cobro
radicadas.

PARÁGRAFO 2o. Las EPS y ARS podrán pactar plazos inferiores a los establecidos en el
presente artículo.
ARTÍCULO 11. PAGOS POR CAPITACIÓN EN LOS REGÍMENES CONTRIBUTIVO Y
SUBSIDIADO. Cuando se trate de contratos de prestación de servicios por capitación tanto
en el régimen contributivo como en el régimen subsidiado, las EPS y ARS pagarán dentro de
los diez (10) primeros días hábiles de cada mes a las instituciones prestadoras de servicios
de salud, el valor mensual correspondiente, sin perjuicio de los ajustes posteriores por
concepto de novedades, los cuales se harán en el siguiente pago o a más tardar en el
momento de la liquidación de los respectivos contratos.

3.- CONSIDERACIONES

3.1. Trámite de cuentas por concepto de prestación de servicios de salud.

Las Entidades Promotoras de Salud y las Instituciones Prestadoras de Servicios podrán

celebrar sus contratos para la prestación del servicio, a través del pago por capitación o por
evento.

Como se trata de un acuerdo de voluntades, dichas formas de contratación no se podrán

imponer unilateralmente por parte de las empresas promotoras de salud. Estas no pueden
prevalecerse de quienes manejan los recursos y las afiliaciones para imponer su criterio y
forzar a las IPS a asumir cláusulas y condiciones gravosas que atentan contra su viabilidad.
Uno de los riesgos que se deriva del manejo financiero establecido en la Ley 100 genera una
posición dominante.

Esto tiene plena consistencia con la circunstancia de que la seguridad social dejó de ser, en
virtud de la norma constitucional, una configuración normativa abstracta y alejada del
padecimiento real de la población para convertirse en un derecho concreto, con una
concepción amplia, fundada en los principios de eficiencia, universalidad y solidaridad.

Del mismo modo y para hacer viable el incremento de la cobertura de la seguridad social,
con sujeción a los principios enunciados, el constituyente de 1991 estableció que el Estado,
con la participación de los particulares, podía ampliar progresivamente la prestación de los
servicios en la forma que determine la ley, con la posibilidad de que el legislador pudiese
hacerla efectiva a través de entidades públicas o privadas.
Así mismo y respecto a la atención de la salud, como servicio público a cargo del Estado y
con base en los mismos principios, el artículo 49 constitucional determinó que al Estado le
corresponde "establecer las políticas para la prestación de los servicios de salud, por
entidades privadas y ejercer su vigilancia y control".
Los preceptos anteriores fueron desarrollados por la Ley 100 de 1993, a través de la cual se
reguló lo relacionado con el Sistema General de Seguridad Social en Salud. En cuanto hace a
la prestación del mencionado servicio, el artículo 156 ibídem establece las características del
mismo, dentro de las cuales caben destacar las siguientes:

"(...) i. Las IPS son entidades oficiales, mixtas, privadas, comunitarias y solidarias,
organizadas para la prestación de los servicios de salud a los afiliados del Sistema General de
Seguridad Social en Salud, dentro de las EPS o fuera de ellas (...).

k) Las EPS podrán prestar servicios directos a sus afiliados por medio de sus propias IPS, o
contratar con Instituciones Prestadoras y profesionales independientes o con grupos de
práctica profesional, debidamente constituidos"
Por su parte, el artículo 179 de la Ley 100 dispuso que, para garantizar el Plan de Salud
Obligatorio a sus afiliados, las EPS prestarán directamente o contratarán los servicios de
salud con las Instituciones Prestadoras y los profesionales. Para racionalizar la demanda por
servicios, las EPS podrán adoptar modalidades de contratación y pago, tales como
“capitación, protocolos o presupuestos globales fijos”, de tal manera que incentiven las
actividades de promoción y prevención y el control de costos.
Ahora bien, a diferencia de otras modalidades de contratación, como puede ser la de evento
(modalidad de contratación mediante la cual un asegurador paga a una IPS, una tarifa
diferenciada para la atención de actividades o procedimientos específicos de salud), los
contratos por capitación no están sujetos para su pago a la atención integral, o a la
actividad, pues en estos la obligación surge con independencia de la ocurrencia de tales
hecho. Así, entonces, en los contratos por capitación se pacta un valor mensual cuyo pago
deberá hacerse por parte de la entidad de aseguramiento en los términos convenidos o, en
su defecto, en el plazo establecido en el artículo 11 del Decreto 3260 de 2004, esto es,
dentro de los diez (10) primeros días hábiles de cada mes. En consecuencia, el mismo no
puede estar condicionado al mes siguiente a la prestación del servicio, pues no corresponde
esta modalidad de pago a los contratos de prestación de servicios por capitación.

El contrato por capitación (aquel mediante el cual la atención de servicios se presta a un

grupo de afiliados y se cobra con un valor único por persona durante un tiempo
determinado, sea que la persona utilice o no los servicios ofrecidos), protocolos o
presupuestos globales fijos, son propios de la contratación suscrita entre las instituciones
prestadoras de servicios de salud y las ARS o EPS para la prestación de los servicios de
salud, lo que hace que los mismos se puedan dar a nivel municipal o departamental
dependiendo de la IPS con la que se contrate y que, de conformidad con lo señalado en el
numeral 6 del artículo 194 de la Ley 100 de 1993, se rijan por el derecho privado, pudiendo
utilizar cláusulas exorbitantes previstas en el Estatuto General de la Contratación
Administrativa. Esto siempre y cuando en la contratación de la prestación de servicios de
salud una de las partes sea una Empresa Social del Estado, toda vez que, tratándose de
partes cuya naturaleza jurídica sea privada, es claro que la contratación se rige plenamente
por el derecho privado.
Según se indicó, las entidades promotoras de salud y las instituciones prestadoras de salud
podrán pactar libremente las condiciones que regirán los contratos para la prestación de
los servicios de salud; no obstante, en el caso de los contratos por capitación, las EPS y
ARS pagan dentro de los diez (10) primeros días hábiles de cada mes a las instituciones
prestadoras de servicios de salud, el valor mensual correspondiente teniendo en cuenta las
novedades presentadas.

Tratándose de glosas, las administradoras del régimen subsidiado y las entidades promotoras
de salud, deberán adelantar una revisión íntegra de la cuenta, antes de proceder a sus
glosas.

Cuando en el trámite de las cuentas por prestación de servicios de salud se presenten glosas,
se procederá de conformidad con lo señalado en el Decreto 3260 de 2004, es decir, en
primer lugar se efectuará el pago de lo no glosado. Si las glosas no son resueltas por parte
de la institución prestadora de servicios de salud, IPS, en los términos establecidos en la
citada norma, se debe acudir a los mecanismos contractuales o legales previstos para definir
las controversias contractuales.

Del análisis de la normatividad antes mencionada se establece, claramente, el procedimiento

a seguir para la formulación y pago de las glosas u objeciones, que hace la ARS o EPS a la
facturación presentada por la IPS, correspondiente a la prestación de los servicios en salud,
para lo cual debe tenerse en cuenta que:
1.- La ARS o EPS reciben la facturación de la IPS durante los 20 primeros días calendario del
mes siguiente a la prestación del servicio de salud.

2.- La ARS o EPS cuenta con 30 días calendario a partir de la presentación de la factura,
para:

2.1. Aceptar la factura, caso en el cual procede al pago del 100%.

2.2. Guardar silencio sobre la factura, caso en el cual paga el 50% dentro de los cinco días
calendario siguientes al vencimiento inicial y si, pasados 40 días calendario, la IPS no efectúa
pronunciamiento alguno, procede a pagar el 50% restante dentro de los 5 días calendarios
siguientes. (Si efectúa pronunciamiento se seguirá con el punto 2.3 respecto del 50%
restante)
2.3. Efectuar las glosas. En este caso la IPS cuenta con 30 días calendario para responder las
glosas; una vez dada la respuesta la ARS o EPS tiene 5 días para el pago.

En el caso de las glosas definitivas por parte de la ARS o EPS las partes pueden acudir a los
mecanismos contractuales o legales previstos para la definición de controversias
contractuales surgidas entre las partes.

3.2. - Requisitos de una factura.

La factura comercial es un soporte contable que contiene, además de los datos generales de
los soportes de contabilidad, la descripción de los artículos comprados o vendidos, los fletes
e impuestos que se causen y las condiciones de pago, cuyos requisitos se hayan previstos
en los artículos 621 y 674 del C.Cio.

Desde el punto de vista del vendedor, se denomina factura de venta y del comprador,
factura de compra. Generalmente, el original se entrega al cliente y se elaboran dos copias,
una para el archivo consecutivo y otra para anexar al comprobante diario de la contabilidad.
Por su parte, el artículo 944 del código de comercio, estipula el derecho que todo comprador
tiene para exigir al vendedor, la entrega de una factura de las mercancías vendidas con
indicación del precio y su pago.

Comercialmente, la factura identifica la realización de un contrato de compraventa o

prestación de servicios, en el cual se discrimina en detalle el contenido del contrato, el monto
de la transacción, las condiciones de pago, la persona que interviene en la venta y, en
muchos casos, la persona que interviene en la compra. Mediante este documento se genera
el traslado de dominio del bien o servicio transado, sin que se haya perfeccionado en su
totalidad, ya que el pago se puede realizar con posterioridad a la facturación.

Para efectos tributarios, la expedición de la factura a que se refiere el artículo 617 del
Estatuto Tributario, consiste en entregar el original de la misma con el lleno de los siguientes
requisitos: (Art. 617 del Estatuto Tributario modificado por la Ley 223 de 1995 en su Art. 40).

a) Estar denominada expresamente como factura de venta;

b) Apellidos y nombre o razón y NIT del vendedor o de quien presta el servicio;
c) Apellidos y nombre o razón social del adquiriente de los bienes o servicios cuando éste
exija la discriminación del impuesto pagado, por tratarse de un responsable con derecho al
correspondiente descuento;
d) Llevar un número que corresponda a un sistema de numeración consecutiva de las
facturas de venta;
e) Fecha de su expedición;
f) Descripción específica o genérica de los artículos vendidos o servicios prestados;
g) Valor total de la operación;
h) El nombre o razón social y el NIT del impresor de la factura;
i) Indicar la calidad de retenedor del impuesto sobre las ventas;
j) Otros requisitos adicionales de control técnico, como son:

- Número y fecha (día/mes/año) de la resolución con la cual la DIAN otorga la autorización

de la facturación y el rango de numeración autorizada (prefijos y numeración), ya que esta
cuenta con una vigencia de dos años.
- Calidad de “Grandes Contribuyentes”.
- Tarifa correspondiente de Impuesto de Industria, Comercio y Avisos

Hasta aquí se ha descrito el trámite legal del cobro de la prestación de los servicios de salud
y los soportes que se adjuntan para su pago. En el asunto concreto, debe precisarse en todo
caso, que una IPS debe prestar únicamente los servicios de salud que tenga habilitados bajo
los preceptos, se reitera, que se acaban de señalar.
4.- Conclusión.

4.1. Para efectos tributarios, la expedición de factura a que se refiere el artículo 615 consiste
en entregar el original de la misma, con el lleno de los requisitos. No obstante, se debe tener
en cuenta el contenido del artículo 7 del Decreto 422 de 1991, cuando la factura constituya
factura cambiaria de compraventa, se entenderá cumplida la exigencia prevista en el inciso
primero del artículo 617 del Estatuto Tributario con la entrega de la copia al comprador.

4.2.- El procedimiento para el trámite y pago de cuentas por concepto de prestación de

servicios de salud debe estar ajustado a lo dispuesto en el artículo 9 del Decreto 3260 de
2004, por lo que sus términos deben ser acatados a cabalidad

Así las cosas, el pago de la facturación por prestación de servicios se encuentra dado en el
Decreto 3260 de 2004, luego, ni las Entidades Promotoras de Salud ni las Administradoras de
los Recursos del Régimen Subsidiado pueden retener el pago de sus obligaciones
consagradas en una factura.

4.3. Adicionalmente, y teniendo en cuenta que contablemente la prestación del servicio de

salud es un hecho económico, cualquier irregularidad en su registro debe ser objeto de
investigaciones de tipo disciplinario sin perjuicio de la sanción penal en que pueda incurrir el
encargado del mismo, de conformidad con lo previsto en el Decreto 2349 de 1993 en
concordancia con lo dispuesto en el Código de Comercio y la Ley 43 de 1990. Los soportes
contables son los documentos que sirven de base para registrar las operaciones comerciales
de una empresa, es por ello que se debe tener especial cuidado en el momento de
elaborarlos. Ello significa que en manera alguna se deben exigir para el pago de la prestación
del servicio de salud, el resultado de los exámenes (laboratorios clínicos) del paciente, toda
vez que estos no son soportes contables. Esos datos obran únicamente en la historia clínica,
la cual ha sido definida por el artículo 34 de la Ley 23 de 1981 como: “ … el registro
obligatorio de las condiciones de salud de un paciente. Es un documento privado, sometido a
reserva, que únicamente puede ser conocido por terceros previa autorización del paciente o
en los casos previstos en la ley."

4.4. Todas las operaciones económicas que realizan las empresas deben ser registradas en
los libros de contabilidad, pero a su vez, para que cada uno de estos registros sean
justificables deben soportarse con los documentos pertinentes para cada una de ellas. La
compra venta de servicios de salud, por ser un hecho económico, como tal, debe ser
clasificado según el plan contable que registre el ente económico. En el plan contable se
debe incluir la totalidad de las cuentas de resumen y auxiliares en uso, con indicación de su
descripción, de su dinámica y de los códigos o series cifradas que los identifiquen.

4.5. No puede una IPS subcontratar los servicios de salud, pues ello significa una
intemediación, conducta prohibida. (al respecto ver concepto de esta Oficina, el cual se
anexa). Se entiende que hay intermediación cuando:

a. Contrata la prestación de servicios de salud que no tiene habilitados y no está en

capacidad de ofrecer.
b.- Subcontrata la prestación de servicios de salud de forma regular y permanente y no de
manera excepcional como lo señala el Decreto 050 de 2003.
c.- Asume responsabilidades que por ley le corresponden a las EPS, provocando una
intermediación entre la entidad promotora de salud y las subcontratadas.

Finalmente, el registro contable de las glosas por parte de las IPS y las ESE se encuentran
previsto en las Circulares Externas 11 y 12 de 2004 respectivamente, las cuales pueden ser
consultadas en la página web de Superintendencia: WWW.supersalud.gov.co

El presente concepto se expide de conformidad con el artículo 25 del Código Contencioso

Administrativo

Cordialmente

JUAN FERNANDO ROMERO TOBON

JEFE OFICINA JURIDICA (E)

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Observaciones: SIN OBSERVACIONES
No. Folios: 9
No. Anexos: 0
Redactó: NANCY VALENZUELA