ADN Recombinante Hasta las postrimeras de 1970, el ADN era una molcula que presentaba amplias dificultades para

su anlisis bioqumico. Su gran longitud y monotona hacan que la secuencia de nucletidos pudiese slo ser estudiada mediante mecanismos indirectos. Para esto se recurra a la determinacin de la secuencia de las protenas o del ARN. Hoy la situacin ha cambiado por completo y el ADN ha pasado a ser una de las molculas ms fciles de estudiar. Mediante las tcnicas que desarrollaremos en este captulo, veremos que es factible separar regiones determinadas del ADN, obtenerlas en grandes cantidades y determinar su secuencia de nucletidos a una velocidad de varios cientos de nucletidos al da. Tambin se nos hace posible alterar un gen (sometido a ingeniera) y transferirlo a clulas en cultivo o a la lnea germinal de animales, donde el gen modificado se incorpora como parte funcional y permanente del genoma. La tecnologa del ADN recombinante constituye una suma de tcnicas siendo las ms importantes: La rotura especfica del ADN mediante nucleasas de restriccin, que facilita el aislamiento y la manipulacin de los genes individuales. La secuenciacin rpida de todos los nucletidos de un fragmento purificado de ADN, que posibilita determinar los lmites de un gen y la secuencia de aminocidos que codifica. La hibridacin de los cidos nucleicos que hace posible localizar secuencias determinadas de ADN o ARN, utilizando la capacidad que tienen estas molculas de unirse a secuencias complementarias de otros cidos nucleicos. La clonacin del ADN, mediante la cual se puede conseguir que un fragmento de ADN se integre en un elemento gnico autorreplicante (plsmido o virus) que habita en una bacteria, de tal manera que una molcula simple de ADN puede ser producida generando muchos miles de millones de copias idnticas. La ingeniera gentica mediante la cual se pueden alterar secuencias de ADN produciendo versiones modificadas de los genes, los cuales se pueden insertar a clulas u organismos.

Fragmentacin, separacin y secuenciacin de molculas de ADN A diferencia de las protenas, los genes no existen en unidades independientes, sino que confieren regiones de una molcula de ADN de gran tamao. Aunque es posible fragmentar el ADN al azar, es muy difcil que estas porciones contengan un determinado gen. As, el purificar un determinado gen constituy un verdadero problema hasta la aparicin de las endonucleasas de restriccin. Estas enzimas, que pueden aislarse de bacterias, cortan el ADN de doble cadena en lugares discretos, definidos por la secuencia de nucletidos, produciendo fragmentos de ADN de tamao definido. Distintas especies de bacterias fabrican diferentes endonucleasas de restriccin y cada una de ellas posee especificidades de secuencia, siendo relativamente fcil encontrar una endonucleasa de restriccin que libere un fragmento de ADN que incluya un determinado gen. El tamao del fragmento liberado puede utilizarse para purificar el gen de una mezcla. Una vez purificado, puede amplificarse el fragmento de ADN Biologa mediante clonacin y determinarse la secuencia de nucletidos que se encuentran en la molcula mediante la secuenciacin. Las endonucleasas de restriccin son producidas por un amplio nmero de bacterias, a las que las protegen degradando molculas de ADN que han sido transportadas al interior de las mismas por medio de virus. As, una bacteria puede eliminar una porcin de cido nucleico viral que ha ingresado a su genoma. Cada enzima reconoce una secuencia especfica de ADN de entre cuatro y ocho nucletidos. Cuando estas secuencias son propias del genoma bacteriano estn protegidas del corte por medio de la metilacin; cuando estas secuencias se presentan en un ADN extrao, no se hallan metiladas por lo cual resultan como blanco del ataque de las endonucleasas. Se han aislado y purificado muchas nucleasas de restriccin de diferentes especies bacterianas y actualmente existen ms de cien de estas enzimas en el mercado. Algunas de las endonucleasas de restriccin cortan el ADN generando secuencias cortas de ADN de cadena sencilla en los extremos del fragmento. A este tipo de extremos se los conoce como adhesivos o cohesivos, pues es complementario de otra secuencia que genera la misma endonucleasa en otro fragmento. Los extremos cohesivos permiten unir fcilmente fragmentos de ADN obtenidos con la misma enzima. Las molculas de ADN producidas mediante la unin de dos o ms fragmentos de ADN se denominan Molculas de ADN Recombinantes.

Una determinada endonucleasa de restriccin cortar cualquier doble hlice de ADN de una determinada clula, generando una serie de fragmentos de ADN conocidos como Fragmentos de Restriccin. Si se combinan diferentes enzimas de restriccin, se pueden comparar los fragmentos obtenidos construyendo as un mapa de restriccin que muestre la localizacin de cada punto de corte en relacin con los puntos de restriccin vecinos. Un mapa de restriccin refleja la disposicin de secuencias de nucletidos especficas en la regin elegida para el corte. Esto significa que es posible realizar la comparacin de diferentes regiones de ADN, sin tener que determinar sus secuencias de nucletidos. Se pueden comparar as los mapas de restriccin de ADN humano y de varios primates en un grupo de genes que codifican para una misma protena. Si esto se realiza en aquellos genes que codifican para la hemoglobina, se podr observar que en el hombre, el orangutn y el chimpanc, las regiones codificantes han permanecido constantes durante los 5 a 10 millones de aos que los separan en el camino evolutivo. Los mapas de restriccin son tambin importantes para la clonacin de ADN y para la ingeniera gentica, permitiendo localizar un gen de inters en un fragmento determinado, facilitando as su aislamiento. Secuenciacin de los fragmentos de ADN Existen dos mtodos especficos para determinar la secuencia de nucletidos de cualquier fragmento de ADN purificado: el mtodo qumico y el enzimtico. El mtodo qumico de secuenciacin se inicia con la obtencin de un conjunto de molculas de ADN de doble cadena marcadas en un extremo 5 mediante la accin de la polinucletido quinasa y ATP marcado con 32 P. Luego, las cadenas de la doble hlice de ADN se disocian y se someten a un tratamiento suave con un agente qumico que destruye una de las cuatro bases nitrogenadas. Debido a la suavidad del tratamiento, slo se rompe, al azar, una base por molcula. Este tratamiento genera una suma de Las molculas de ADN producidas mediante la unin de dos o ms fragmentos de ADN se denominan Molculas de ADN Recombinantes. fragmentos de ADN de diferentes longitudes, que reflejan los lugares donde se encontraban las bases que fueron eliminadas. Los fragmentos son separados mediante la utilizacin de un gel y se detectan por autorradiografa. Es necesario mencionar que slo los fragmentos que poseen un extremo 5 terminal P aparecen en el gel y su tamao indica la distancia desde el extremo marcado hasta la base nitrogenada previamente destruida.