Cuaderno 123

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Sntesis de protenas
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Colgeno, insulina, hemoglobina, bilirrubina resultan nombres conocidos. Son protenas que forman parte de la vida cotidiana. De hecho, son uno de los componentes principales de las clulas y ms de la mitad de su peso seco. La cantidad de funciones diferentes que realizan las protenas es enorme: son parte de la estructura celular, regulan, transportan, defienden, aceleran reacciones, entre otras. Cmo se descubri la estructura de las protenas? Corra la dcada de 1940 y genetistas de la poca revelaban los primeros indicios de que los genes determinaban la estructura de protenas individuales. Sin embargo, no fue sino hasta principio de los aos 50 que el bioqumico britnico Frederick Sanger descubri, estudiando la insulina, cmo se formaban las protenas a partir de la unin de molculas ms pequeas. As como el descubrimiento de la estructura del ADN ejerci una gran influencia sobre el conocimiento de la base molecular de la herencia y de la gentica, la determinacin de la secuencia de la insulina constituy la clave para comprender la estructura y la funcin de las protenas. Era lgico pensar que si la insulina tena una secuencia definida y genticamente determinada, tambin la tuvieran las dems protenas. El mecanismo por el cual se fabrican o sintetizan las protenas es tan fascinante como complejo y su conocimiento proporciona una parte importe de las herramientas bsicas de la biologa molecular. Todo empieza en el ADN La informacin gentica est almacenada en molculas de ADN (ver cuadernos n 3, 32, 65). Esta informacin se transmite mediante un flujo unidireccional, que va del ADN hacia el ARN y de ste a las protenas. Este enunciado constituye el Dogma Central de la Biologa (ver cuadernos n 3, 32, 100) y fue expresado por el cientfico ingls Francis Crick, famoso adems por proponer junto a James Watson un modelo de estructura para el ADN y por ganar el Premio Nobel en 1962 por ese trabajo.
Figura 1: Dogma Central de la Biologa. El flujo de informacin gentica es unidireccional y va desde al ADN hacia las protenas. Fuente: ArgenBio
"El Cuaderno de Por Qu Biotecnologa" es una herramienta didctica creada y desarrollada por el equipo pedaggico del Programa Educativo Por Qu Biotecnologa. Su reproduccin est autorizada bajo la condicin de que se aclare la autora y propiedad de este recurso pedaggico por parte del Programa Educativo Por Qu Biotecnologa.
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protena especfica, la porcin de ADN que la codifica ser copiada en forma de ARN, mediante un proceso denominado transcripcin. Luego el ARN formado, que se denomina ARN mensajero, es utilizado como molde para la sntesis de protenas por un mecanismo llamado traduccin. Esta informacin finalmente llega de manera unidireccional a las protenas, y son ellas quienes llevan a cabo la mayor parte de las actividades celulares.
Utilizando un vocabulario informtico, se podra decir que el ADN representa el software (instrucciones que las clulas reciben de sus progenitores), mientras que las protenas constituyen el hardware (aparato fsico que ejecuta el programa almacenado en la memoria). Actualmente, y aunque se sigue respetando este dogma como una generalidad, se sabe que hay excepciones para este postulado (retrovirus, ARN con actividad cataltica, etc.; ver cuadernos n 3 y 115). La sntesis de protenas, paso a paso Denominamos, entonces, sntesis proteica al mecanismo por el cual la informacin contenida en el ADN (ver cuadernos n 3 y 32), se traduce en protenas. Es un proceso complejo, que se realiza en distintos compartimientos celulares, en el que intervienen variadas molculas y que se produce bsicamente en dos pasos: Paso 1: La transcripcin La transcripcin ocurre dentro del ncleo celular (en las clulas eucariotas), y en el citoplasma en las procariotas (ver Cuaderno n 80). En esta primera etapa los genes, que seran palabras escritas en el ADN mediante la combinacin de cuatro letras o nucletidos A, T, C y G, se copian o transcriben a otro lenguaje, el del ARN denominado ARN mensajero (ARNm). En este proceso, denominado transcripcin, la sntesis de una molcula de ARNm es catalizada por una enzima llamada ARN polimerasa (ARNpol). El proceso se inicia cuando dicha enzima reconoce un lugar especfico del ADN llamado promotor. Luego de unirse al promotor, la ARNpol desenrolla aproximadamente una vuelta completa de la hlice del ADN poniendo al descubierto un fragmento de una sola hebra. Esta hebra de ADN, llamada hebra codificante, sirve de molde para que la ARNpol vaya agregando nucletidos complementarios uno tras otro, a medida que se desplaza en una direccin especfica sobre el ADN (Figura 2). Los nucletidos que adiciona la ARNpol para formar el ARNm son ribonucletidos, es decir, nucletidos que poseen en su estructura el azcar ribosa (a diferencia de la desoxirribosa presente en los nucletidos del ADN). Adems, la complementariedad de nucletidos se realiza de la siguiente manera:
El dogma enuncia lo siguiente: cuando en una clula se requiere la sntesis de una
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si en el ADN hay: la ARNpol agrega: C (citosina) G G (guanina) C T (timina) A A (adenina) U (uracilo) Tabla 1: Apareamiento de nucletidos que realiza la ARNpol para sintetizar el ARNm a partir de la hebra molde del ADN. En la tabla se puede ver que en el ARNm no existen las bases Timina (T), y son reemplazadas por la base U o Uracilo (ver cuaderno n 32). La enzima seguir transcribiendo hasta que encuentre la seal de terminacin que le indica que all debe detenerse (ver figura 2). Tan pronto como se ha completado la copia de ARNm, la hlice original de ADN se pliega nuevamente, y la molcula de ARNm se separa.
Figura 2: Proceso de transcripcin. A partir del ADN doble cadena, la enzima ARN polimerasa sintetiza un ARN mensajero simple cadena. Fuente: http://www.geosfera.es/monograficos/DNA/Adn/14-25.jpg Una vez finalizada la transcripcin, el ARNm est casi listo para la siguiente etapa. Pero an esta inmaduro y para madurar debe ser protegido de manera de evitar que pueda degradarse en su viaje al citoplasma. Para ello, unas enzimas especficas se encargan de ponerle una caperuza o CAP en uno de sus extremos y una cadena corta de adeninas (colita de poliA) en el otro. Una vez completada la maduracin (que involucra otros procesos que aqu no mencionamos), el ARNm parte hacia el citoplasma a travs de los poros de la membrana nuclear en las clulas eucariotas.
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Paso 2: La traduccin Una vez en el citoplasma, la secuencia del ARNm debe ser decodificada a protena. Este es el proceso de traduccin y puede dividirse en tres fases: iniciacin, elongacin y terminacin (Figura 3)
Figura 3: Proceso de traduccin. A partir del ARN mensajero y mediante un complejo mecanismo, se sintetizan las protenas Fuente: http://www.monografias.com/trabajos/sinteproteinas/Image172.gif -Iniciacin: en este punto es importante destacar que la forma en que el ARNm es ledo es diferente a lo sucedido en la transcripcin, ya que en la traduccin los nucletidos del ARNm son ledos de a tres, es decir que un triplete de nucletidos, tambin llamado codn, codifica para un aminocido determinado. Es decir que cada codn determina qu aminocido se agregar a la futura protena. La traduccin se inicia cuando el ARNm se une a una organela celular compleja denominada ribosoma. Los ribosomas estn formados por dos subunidades, una mayor
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y otra menor, y es esta ltima la que reconoce y se une en primer lugar al ARN mensajero (ver figura 3). Los codones de ARNm no reconocen directamente a los aminocidos, sino que la traduccin utiliza molculas adaptadoras que unen el aminocido con su correspondiente triplete o codn. Estos adaptadores son un grupo de pequeas molculas de ARN, conocidas como ARN de transferencia (ARNt), cada una de las cuales tiene solo entre 70 y 90 nucletidos de longitud. Esta molcula tiene una conformacin tridimensional caracterstica, denominada hoja de trbol, que le permite llevar a cabo su funcin de adaptador (Figura 4).
Figura 4: Estructura del ARN de transferencia. Conformacin tridimensional del ARNt, conocida como hoja de trbol. Fuente: http://img.tfd.com/dorland/thumbs/RNA_transfer-RNA.jpg En la estructura del ARNt existen dos zonas de gran importancia para el proceso de sntesis proteica: un triplete de secuencia variable llamado anticodn, cuyas bases son complementarias al codn de la molcula de ARNm; el otro triplete est ubicado al otro extremo, y unido covalentemente a un aminocido especfico (ver figura 4). Esta unin del aminocido especfico con el ARNt la cataliza una enzima llamada aminoacil-tRNA sintetasa. Una vez que la subunidad pequea del ribosoma se encuentra en posicin, un ARNt llamado iniciador (que porta el aminocido metionina), reconoce el primer codn (AUG) en el ARNm y se carga sobre la subunidad pequea, para luego unirse la subunidad mayor del ribosoma. De esta manera se forma un ribosoma funcional completo, que as ensamblado posee dos sitios de unin diferentes para molculas de ARNt: el sitio P y el sitio A (ver figura 3). -Elongacin: una vez que el ARNt de iniciacin unido a metionina se ubica en el sitio A, otro ARNt con su correspondiente aminocido debe ubicarse en el sitio P,
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adyacente al sitio A. Con los dos ARNt en su sitio, comienza el proceso de alargamiento o elongacin de la cadena polipeptdica: existen 20 aminocidos esenciales diferentes, todos con una estructura bsica comn, constituida por un carbono central al que se le unen un grupo qumico carboxilo, uno amino y otro grupo qumico que es particular para cada aminocido y que se conoce como cadena lateral o R (Figura 5).
Figura 5: Estructura bsica de los aminocidos Todos los aminocidos poseen un carbono central, al cual se le unen un grupo carboxilo, un grupo amino y una cadena lateral (cadena R). Fuente:http://www.argenbio.org/adc/uploads/imagenes_doc/composicion_%20delas _%20celulas/aminoacido.JPG Para la elongacin de la cadena de polipeptdica, el extremo carboxilo del aminocido del sitio P se une mediante un enlace covalente al extremo amino del aminocido ubicado en el sitio A. Este enlace entre aminocidos se denomina unin peptdica y es catalizado por la peptidil-transferasa, una enzima firmemente unida al ribosoma. El ARNt del sitio A, ahora sin su aminocido, es liberado al citoplasma; seguidamente, el ribosoma se desplaza exactamente 3 nucletidos a lo largo de la molcula de ARNm translocacin ribosomal- y de esta manera quedar el sitio P ocupado por el ARNt que tiene unida la cadena de aminocidos en formacin, quedando el sitio A libre para recibir al siguiente ARNt con su correspondiente aminocido. Este proceso se repetir casi tantas veces como nmero de aminocidos intervengan en la sntesis de la cadena polipeptdica (ver figura 3). -Terminacin: de los 64 diferentes codones que existen (4 nucletidos agrupados de a tres = 4x4x4=64), hay 3 que no codifican para ningn aminocido, sino que son codones que indican la finalizacin de la cadena polipeptdica. Son los llamados codones stop (UAA, UAG, UGA) y a ellos se unen directamente factores de terminacin o de liberacin en el sitio A. Esta unin perturba la accin de la enzima peptidil-transferasa, haciendo que la traduccin termine y liberando el ribosoma y el polipptido completo (ver figura 3).
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Una vez finalizada la sntesis de la protena, el ARN mensajero queda libre y puede ser ledo de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice la sntesis de una protena ya est comenzando otra, con lo cual, una misma molcula de ARN mensajero, est siendo utilizada por varios ribosomas simultneamente. A este complejo de ARNm con mltiples ribosomas y sus respectivas cadenas polipeptdicas en crecimiento se lo denomina polisoma y es frecuente observarlo en las clulas activas. Finalmente, las protenas Con lo visto hasta ahora, se puede definir a las protenas como macromolculas (es decir, molculas grandes) formadas por polmeros de aminocidos, una cadena formada a partir de aminocidos. Sin embargo, las protenas poseen distintos niveles estructurales: el resultado inmediato de la sntesis proteica, es lo que se denomina estructura primaria, es decir, la secuencia lineal y ordenada de aminocidos (Figura 6a). A partir de esta secuencia bsica, las caractersticas fsico-qumicas de los grupos laterales (cadena R) de los aminocidos hacen que stos, aunque se encuentren alejados en el collar, puedan acercarse y adoptar mltiples conformaciones tridimensionales. Una de estas conformaciones es el plegamiento regular local entre residuos aminoacdicos cercanos de la cadena polipeptdica, gracias a la formacin de enlaces qumicos dbiles, que da como resultado la estructura secundaria. Los motivos ms comunes son la hlice alfa y la lmina plegada beta (Figura 6b). Luego, el modo en que la cadena polipeptdica se pliega en el espacio se denomina estructura terciaria (Figura 6c). Finalmente, y en algunos casos, varias cadenas proteicas plegadas (o subunidades) pueden unirse entre s por uniones no covalentes, constituyendo la estructura cuaternaria. (Figura 6d).
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Figura 6: Estructura proteica. Las protenas poseen una estructura 1ria (a, cadena lineal de aminocidos), y las estructuras tridimensionales: 2ria (b, lmina plegada beta y hlice alfa), 3ria (c, subunidad proteica) y 4ria (d, protena formada por ms de una subunidad) Fuente:http://4.bp.blogspot.com/_EdiSPJX1jg8/Sh23fpZSypI/AAAAAAAABzU/zA pnBrIJHUI/s400/estruc+1+prot.JPG
Cdigo gentico, universal y degenerado Uno de los desafos cientficos del siglo XX consisti en descifrar cul era la relacin entre la secuencia de bases en el ADN y la secuencia de aminocidos que forman las protenas. Como se dijo anteriormente, el ARNm es ledo cada tres nucletidos (o codn), que corresponden a un aminocido determinado. Este diccionario que permite traducir la informacin escrita en el lenguaje de los cidos nucleicos (nucletidos) al lenguaje de las protenas (aminocidos) se denomina cdigo gentico (ver cuaderno n 3 y Figura 7).
"El Cuaderno de Por Qu Biotecnologa" es una herramienta didctica creada y desarrollada por el 3ra. letra equipo pedaggico del Programa Educativo Por Qu Biotecnologa. Su reproduccin est autorizada bajo la condicin de que se aclare la autora y propiedad de este recurso pedaggico por parte del Programa Educativo Por Qu Biotecnologa.
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Figura 7: Cdigo Gentico. Es el diccionario que permite traducir el lenguaje de los cidos nucleicos al de las protenas. Fuente: http://perso.wanadoo.es/sancayetano2000/biologia/images/codigo.gif El cdigo gentico fue elucidado por Marshall Nirenberg y Heinrich Matthaei, diez aos despus de que Watson y Crick describieran la estructura de doble hlice del ADN. Descubrieron que el ARN, independientemente del organismo del cual era aislado, poda iniciar la sntesis de protenas cuando se lo incubaba junto a extractos celulares. Agregando un ARN sinttico formado slo por uracilos (poli-U), determinaron que el codn UUU (el nico posible en el ARN poli-U) codificaba para el aminocido fenilalanina, ya que el nico producto que apareca en el tubo era un polipptido que contena slo este aminocido. De la misma manera, un ARN artificial que consista en nucletidos A y C alternados originaba un polipptido formado por histidinas y treoninas. As, observando los productos formados luego de la incubacin con una serie de ARN sintticos, estos investigadores consiguieron descifrar completamente el cdigo gentico (ver cuadernos n 3, 20, 32). Una de las caractersticas ms significativas de este cdigo es su universalidad; esto significa que el mismo codn en diferentes especies codifica para el mismo aminocido. Efectivamente, los seres humanos, los monos, las cucarachas, las plantas, las bacterias, los hongos, etc. compartimos este cdigo, lo que lleva a meditar acerca de un origen comn y nico a todos los seres vivos. La mejor demostracin de que el cdigo gentico es universal es la posibilidad, mediante las tcnicas de ingeniera gentica (ver cuaderno n 4), de que al introducir el ADN de un organismo en otro, el organismo receptor sintetice las protenas del organismo donante del
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ADN. Por otro lado, de los 64 codones que existen, 61 corresponden a aminocidos (los otros 3 son codones de terminacin). Como slo existen 20 aminocidos, hay ms codones que aminocidos, de forma que un determinado aminocido puede estar codificado por ms de un triplete (por ejemplo, a la glicina le corresponden los codones GGU, GGC, GGA y GGG). Es por eso que se dice que la otra caracterstica del cdigo gentico es ser degenerado. Regulacin de la expresin gnica Todas las clulas de un organismo poseen la misma informacin gentica y sin embargo, las protenas expresadas en cada tipo celular no son las mismas. Muchas veces, ni siquiera en una misma clula se expresa el mismo tipo de protena, puesto que su sntesis depende de muchos factores, tanto internos como seales o factores externos. Es decir que la produccin de protenas a partir de los genes esta regulada, y este control es central para que una clula sea lo que es. En trminos generales, cul gen se expresa y cul no, est determinado por un control que se ejerce principalmente a nivel de la transcripcin. En ella, molculas proteicas especializadas son las encargadas de reprimir (regulacin negativa) o de activar (regulacin positiva) la expresin de determinado gen (ver cuaderno n 115). En la regulacin negativa, una protena denominada represor bloquea la regin de unin de la ARNpol al ADN. En el caso de la regulacin positiva, las protenas activadoras favorecen la unin de la ARNpol a zonas del ADN a las que normalmente la enzima no es muy afn. Otro punto de control muy importante que puede ocurrir tanto en la etapa de transcripcin como en la de traduccin, y tanto en el ncleo como en el citoplasma de la clula, es el silenciamiento gnico (ver cuaderno n 115): a nivel de transcripcin, el silenciamiento se produce por la modificacin del ADN mediante el agregado de un grupo qumico llamado metilo. La metilacin de bases impide el reconocimiento de los promotores por las polimerasas, y por lo tanto que se exprese ese gen. En cambio, en el silenciamiento gnico postranscripcional s hay transcripcin del gen silenciado. Lo que ocurre es que el ARN mensajero sintetizado es degradado de forma especfica, en funcin de su secuencia. En este caso tampoco habr sntesis proteica del gen que esta siendo silenciado (ver cuaderno n 115). Cada gen codifica para una protena? Hasta hace no mucho tiempo, la idea de que cada gen produce una protena especfica conocida como la hiptesis un gen, una protena fue un hito en el desarrollo de la biologa moderna. Sin embargo, y en base a estudios que se vienen realizando en el rea de la biologa molecular, ingeniera gentica y las micas (ver cuadernos n 4, 65, 114), este concepto fue cambiando. Cmo explicar la complejidad de la biologa humana con un nmero de genes no mucho mayor al de la mosca de la fruta o con menos del doble que un simple gusano? Todo indicaba que la complejidad del organismo humano est ms all del nmero de genes. La respuesta se encontr en un proceso de modificacin postranscripcional denominado "splicing alternativo". Es un
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mecanismo de modificacin del ARN mensajero que genera diversidad proteica a partir de un nmero limitado de genes, en el cual mltiples zonas del ARNm, denominadas intrones, son eliminadas del ARN mensajero maduro, mientras que otras regiones, llamadas exones, son cortadas y re-empalmadas de distintas formas. Es algo as como la edicin que puede hacerse de un video para obtener versiones ms cortas y diferentes al video original. Ha ido extendindose la idea de que el splicing alternativo, que antes se consideraba excepcional, es cosa comn. Generalmente, un gen slo permite unos pocos splicings alternativos, pero en ciertos casos esto no es as. En los humanos, un buen ejemplo es el gen de la tropomiosina, una protena estructural. El splicing alternativo produce cinco versiones distintas de esta molcula que se expresan en cinco tejidos diferentes del cuerpo: el msculo esqueltico, el msculo liso, los fibroblastos, el hgado y el cerebro. Las clulas, en cada tipo de tejido, ensamblan de forma diferente los 11 exones que conforman el gen, produciendo las distintas formas de la protena. Hay un ejemplo excepcional en la mosca de la fruta: posee un gen que puede generar 38.000 versiones diferentes a partir del mismo ARNm, una cantidad que excede de lejos la cantidad total de genes (~14.500) en dicho organismo. En conjunto, esto significa que hay mucha ms informacin codificada en el genoma de lo que se crea anteriormente. La cantidad de protenas funcionalmente distintas que podran estar codificadas por el genoma es inmensa, siendo el splicing alternativo una de las principales fuentes de la diversidad de protenas en los eucariotas pluricelulares. La sntesis de protenas y la biotecnologa La posibilidad de aislar un gen de una especie, insertarlo en otra y lograr que sta sintetice una nueva protena, o protena recombinante (ver Cuaderno n 49) es lo que se conoce como ingeniera gentica o tecnologa del ADN recombinante y es parte fundamental de la biotecnologa moderna (ver cuadernos n 4, 20, 65, 67). As, y tras el trascendental descubrimiento de las enzimas de restriccin en los aos 70 (ver cuadernos n 34 y 49) y luego de varios aos de experimentacin y desarrollo de nuevas tecnologas, hoy es posible, por ejemplo, producir en diversos sistemas biolgicos protenas potencialmente teraputicas y en grandes cantidades (ver Cuaderno n 21, 25). La insulina fue el primer caso de protena producida por ingeniera gentica aprobada para uso en humanos. En la actualidad, varios laboratorios farmacuticos producen insulina humana, tanto a partir de bacterias como de levaduras, y sin ningn riesgo para la salud. Existen ms de 30 protenas recombinantes aprobadas para su uso clnico y esperan en la gatera otras cientas a ser testeadas en su adecuacin clnica (ver cuaderno n 49). Vacunas contra la hepatitipis B, hormona de crecimiento humano, enzimas utilizadas en polvos para lavar la ropa y para la industria alimenticia, plantas resistentes a enfermedades, a herbicidas, al fro o a la sequa, vacas productoras de medicamentos, son algunos de los muchos logros desarrollados hasta el momento y, sin embargo, son slo la punta del iceberg de lo que puede alcanzarse a partir del conocimiento de procesos y
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mecanismos tan bsicos y esenciales como el cdigo gentico, el ADN y la sntesis proteica.
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CONSIDERACIONES METODOLGICAS A lo largo del Cuaderno se han analizado diferentes aspectos vinculados con la sntesis de protenas, que es interesante repasar con los alumnos, adems de las etapas del proceso mismo. Existe un cdigo gentico universal. Esto significa que el ADN de todos los seres vivos, de los ms simples a los ms complejos, est escrito en el mismo lenguaje de nucletidos. Y esto implica que slo 4 nucletidos, en sus diferentes combinaciones, determinan la enorme diversidad de seres vivos que existen y existieron en el planeta. Esto lleva, a su vez, a dos reflexiones interesantes en el plano de la biologa: 1. sostiene la idea acerca de un origen comn de los seres vivos que habra aparecido en la Tierra hace 3.500 millones de aos, y del cual han evolucionado todos los dems tipos de organismos. 2. la similitud en el cdigo gentico hace posible la transgnesis, es decir que el ADN de un humano pueda ser insertado, por ejemplo, en una bacteria, y que este microorganismo reconozca el ADN y pueda fabricar la protena, igual a la que se obtendra en el organismo original. Todas las clulas de un organismo tienen el mismo ADN, es decir la misma cantidad de molculas de ADN y con la misma informacin gentica. Sin embargo, las clulas de un mismo organismo no son todas iguales ni cumplen la misma funcin. Esto se debe a que los genes, fragmentos de ADN, se expresan de diferente manera en diferentes clulas. Determinados genes estn activos en unas clulas e inactivos en otras. Esta diferenciacin y especiacin ocurre ya en la etapa embrionaria (en organismos pluricelulares). No es lo mismo un polipptido que una protena. El polipptido es la molcula formada a partir de la unin de aminocidos pero sin su estructura tridimensional que le permite cumplir con su funcin. Es decir que slo se llamar protena al polipptido funcional, es decir a aquel que tiene la estructura espacial que le permite funcionar. Si la protena pierde esta estructura terciaria (se desnaturaliza) se pierde la funcin. Esto puede ocurrir, por ejemplo, si la protena se expone a temperaturas altas respecto de las habituales para su funcionamiento. Si bien habitualmente se hace referencia a la sntesis de un tipo de protena particular a partir de un gen, hoy se sabe que un mismo gen puede ser procesado de diferentes formas y esto dar lugar a muchas protenas diferentes a partir de una nica secuencia de ADN. Esto explica la enorme diversidad de protenas, a pesar de no haber tantos genes en el genoma que las codifiquen. El ADN slo codifica para la sntesis de protenas. Sin embargo, las clulas estn compuestas por otros tipos de sustancias, como carbohidratos y lpidos. Estas sustancias no estn codificadas en el ADN. Sin embargo, las protenas que se fabrican a partir del ADN cumplen funciones muy variadas, entre ellas estn las enzimas, catalizadores biolgicos que aceleran reacciones qumicas. Estas enzimas
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son las que harn posible que las clulas fabriquen el resto de los componentes celulares. Otro aspecto importante del trabajo en el aula es que, en ocasiones, se interpreta que el ADN se convierte en ARN en el proceso de transcripcin. Es importante que quede en claro que el ADN nunca sale del ncleo. La molcula de ARN mensajero es una nueva molcula que se forma a partir de ribonucletidos, tomando como molde una de las hebras de la molcula de ADN. El ADN sera el libro de recetas que la clula consulta para fabricar sus protenas, pero el ADN no se convierte en el producto final de esa receta, sino que queda en su lugar para ser consultado cada vez que la clula lo requiera. Otro aspecto que puede generar confusin entre los alumnos es la relacin entre ADN, informacin gentica y cromosomas. A pesar de hablar del ADN como sinnimo de informacin gentica, el ADN es una macromolcula, mientras que la informacin gentica involucra a todas las molculas de ADN que hay en una clula. Cada molcula de ADN se enrolla y se comprime formando un cromosoma. Es decir que cada cromosoma es una molcula de ADN. Y lo que se menciona habitualmente como ADN es todo el conjunto de cromosomas, y no una nica molcula de ADN. Es importante que estos conceptos queden claros para que no generen confusin en los alumnos y en su expresin.
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ACTIVIDADES
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Actividad 1: Completar los espacios en blanco con una de las opciones dadas 1. Las protenas son -------------- (macromolculas/aminocidos/nucletidos) formadas por polmeros de --------------------------(cidos nucleicos/aminocidos). 2. Para que la sntesis de protenas pueda ocurrir, en una primera etapa se debe traspasar la informacin del gen a un ------------- (ARNt/ARNm/ARNr). Este proceso es catalizado por la enzima------- (ADNpolimerasa/ARNpolimerasa) y se denomina--------- (transcripcin/traduccin). El ARNm sintetizado atraviesa los poros de la membrana ------------ (plasmtica/nuclear) y se dirige hacia los ribosomas donde se lee el mensaje del ARNm para comenzar la -------------(transcripcin, traduccin). 3. La unin de un grupo amino de un -----------(gen/aminocido/nucletido) con un grupo carboxilo de otro, es lo que se denomina unin ----------------------(peptdica/aminoacdica) unin qumica muy ----------(dbil/fuerte) y es la manera en que se forma la cadena polipeptdica o collar de aminocidos. Esta reaccin es catalizada por la ---------------(aminoacil-ARNt sintetasa/peptidil transferasa). 4. Los cuatro niveles de organizacin estructural de las protenas son: estructura ---------(1ria/ 2ria/ 3ria/ 4ria) (o cadena lineal de aminocidos), estructura ------(1ria/ 2ria/ 3ria/ 4ria) es el plegamiento regular local entre residuos aminoacdicos --------(lejanos/cercanos) de la cadena polipeptdica y pueden formar conformaciones de lmina ------(achatada/plegada/alargada) beta y hlice alfa), estructura -----(1ria/ 2ria/3ria/ 4ria) (subunidad proteica tridimensional) y estructura 4ria (protena formada por---------(solo una/ ms de una/ms de tres) subunidades). 5. El dogma central de la biologa postula que la informacin gentica se transmite mediante un flujo ----------- (bidireccional/unidireccional), que va del --------(ARN/ARNm/ADN/ARNt) hacia el -----------(gen/ARN/ARNt/protena) y de este a las --------------(aminocidos/nucletidos/protenas). 6. La informacin del ARNm se divide en tripletes de bases nitrogenadas llamadas -------------(codones/anticodones) que tienen informacin para un ---------------(aminocido/monosacrido/nucletido) de los que formarn a la protena. Para sintetizar la protena en los ribosomas es necesario que tengan los aminocidos especificados por el ARNm. La molcula encargada de llevar un aminocido es el ----------- (ARNt/ARNm/ARNr) y la enzima que cataliza la unin del aminocido con el --------(ARNt/ARNm/ARNr) se llama--------- (aminoacil-ARNt sintetasa /peptidil transferasa). Al llegar al ribosoma es reconocido por su triplete llamado-------------(codn/anticodn) que es complementario con el del ARNm. 7. El cdigo gentico es universal porque los mismos--------- (anticodones/codones) en diferentes especies codifican para los mismos ------------------------------(nucletidos/aminocidos/protenas). Es degenerado puesto que hay ----(menos/ms) --------(codones/anticodones) que---------- (protenas/aminocidos), de forma que un determinado aminocido puede estar codificado por ms de un-------------(anticodn/codn).
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8. Mediante un proceso de modificacin -----------------------------------(postraduccional/postranscripcional) denominado "splicing alternativo, se obtienen ms de una protena a partir de una sola regin codificante. Es un mecanismo de modificacin del --------------(ADN/ARNt/ARNm) que genera diversidad ----------(nucleica/proteica) a partir de un nmero limitado de genes, en el cual mltiples zonas del ---------(ADN/ARNm/ARNt) denominadas --------(intrones/exones) son eliminadas del mensajero maduro, mientras que otras regiones, llamadas---------(intrones/exones), son cortadas y re-empalmadas de distintas formas. Respuestas 1. Las protenas son macromolculas formadas por polmeros de aminocidos. 2. Para que la sntesis de protenas pueda ocurrir, en una primera etapa se debe traspasar la informacin del gen a un ARNm. Este proceso es catalizado por la enzima ADNpolimerasa y se denomina transcripcin. El ARNm sintetizado atraviesa los poros de la membrana nuclear y se dirige hacia los ribosomas donde se lee el mensaje del ARNm para comenzar la traduccin. 3. La unin de un grupo amino de un aminocido con un grupo carboxilo de otro, es lo que se denomina unin peptdica (unin qumica muy fuerte) y es la manera en que se forma la cadena polipeptdica o collar de aminocidos. Esta reaccin es catalizada por la peptidil transferasa. 4. Los cuatro niveles de organizacin estructural de las protenas son: estructura 1ria (o cadena lineal de aminocidos), estructura 2ria (es el plegamiento regular local entre residuos aminoacdicos cercanos de la cadena polipeptdica y pueden formar conformaciones de lmina plegada beta y hlice alfa), estructura 3ria (subunidad proteica tridimensional) y estructura 4ria (protena formada por ms de una subunidades). 5. El dogma central de la biologa postula que la informacin gentica se transmite mediante un flujo unidireccional, que va del ADN hacia el ARN y de este a las protenas. 6. La informacin del ARNm se divide en tripletes de bases nitrogenadas llamadas codones que tienen informacin para un aminocido de los que formarn a la protena. Para sintetizar la protena en los ribosomas es necesario que tengan los aminocidos especificados por el ARNm. La molcula encargada de llevar un aminocido es el ARNt y la enzima que cataliza la unin del aminocido con el ARNt se llama aminoacilARNt sintetasa. Al llegar al ribosoma es reconocido por su triplete llamado anticodn que es complementario con el del ARNm. 7. El cdigo gentico es universal porque los mismos codones en diferentes especies codifican para los mismos aminocidos. Es degenerado puesto que hay ms codones que aminocidos, de forma que un determinado aminocido puede estar codificado por ms de un codn. 8. Mediante un proceso de modificacin postranscripcional denominado "splicing alternativo, se obtienen ms de una protena a partir de una sola regin codificante. Es un mecanismo de modificacin del ARNm que genera diversidad proteica a partir
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de un nmero limitado de genes, en el cual mltiples zonas del ARNm denominadas -intrones son eliminadas del mensajero maduro, mientras que otras regiones, llamadas exones, son cortadas y re-empalmadas de distintas formas. Actividad 2: Completar las letras rojas en el proceso de traduccin
(Modificacin del grfico obtenido de: http://www.monografias.com/trabajos/sinteproteinas/Image172.gif)
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Respuestas: A: aminoacil-tRNA sintetasa, B: metionina (fmet), C: ARNt, D: codn, E: anticodn, F: pequea, G: ARNm, I: P, J: A, K: grande, L: iniciacin, M: peptidiltransferasa, N: peptdico, O: valina (val), P: fenilalanina (phe), Q: CAG, R: UUC, S: alargamiento o elongacin, T: terminacin o liberacin, U: terminacin, V: primaria. Actividad 3: A pensar como cientfico! Resolver el siguiente problema 1. Luego de una larga jornada de trabajo, un investigador obtuvo en su laboratorio una secuencia de ADN y decidi, a partir de ella, deducir la secuencia del ARNm y anotarla en una tabla. a) Cmo se llama el proceso terico realizado, es decir, la sntesis de ARNm a partir del ADN? Rta: Transcripcin. Cuando quiso seguir completando la tabla, se dio cuenta que no tena a mano el cdigo gentico, y por lo tanto no pudo deducir cul era la secuencia proteica codificada. b) Ya que cuentan con el cdigo gentico, ayuden al investigador y completen la secuencia proteica. Rta: ver tabla. c) Cmo se llama el proceso terico realizado, es decir, la sntesis de protenas a partir del ARNm? Rta: Traduccin. ARNm Pptido (pequea protena) AUGAGGGGGAUGCUGCCCCUCUUUGAGUGA Met-Arg-Gly-Met-Leu-Pro-Leu-Phe-Glu.
Nota para el docente: es importante destacar que los ARNm no estn delimitados por un AUG y un codn stop, sino que existe secuencia antes y despus de estos nucletidos. Aqu se omiti dicha secuencia con fines didcticos.
d) De paso, y para quedar bien con el investigador, dibujen los ARNt que se habran utilizado para esta traduccin, con sus anticodones y sus aminocidos correspondientes. Rta:
MET ARG GLY MET LEU PRO LEU PHE GLU
UAC UCC CCC UAC GAC GGG GAG AAA CUC
El ltimo codn (UGA) es de terminacin y no existe ARNt para l. e) Qu informacin le est aportando al investigador en relacin a la estructura de la protena? Rta: Se le est informando la estructura primaria de la protena, es decir, la cadena lineal de aminocidos que la componen.
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2. A la maana siguiente, un ayudante del investigador que lleg temprano y medio dormido, estaba desayunando en la mesada y volc su caf sobre el cuaderno del investigador. Debido a la mancha, en la tabla slo poda distinguirse la secuencia de la protena. El ayudante decidi (adems de limpiar) tratar de enmendar su error reescribiendo la secuencia de ARNm de la que deriva este pptido: a) Pudo el ayudante disimular su descuido y reescribir la secuencia de ARNm de la que deriv la protena? Rta: No pudo, ya que la protena puede derivar de varias posibles secuencias de ARNm, debido a que el cdigo gentico es degenerado, es decir, que existe ms de un codn que codifica para el mismo aminocido. b) Si fueran ese ayudante, cmo completaran la tabla para demostrar que fue un error desayunar sobre la mesada del jefe? ARNm AUG-(CGU/CGC/CGA/CGG/AGA/AGG)- (GGU/GGC/GGA/GGG)-AUGMetArg Gly - Met(CUU/CUC/CUA/CUG/UUA/UUG)-(CCU/CCC/CCA/CCG)Leu Pro (CUU/CUC/CUA/CUG/UUA/UUG)- (UUU/UUC)- (GAA/GAG). Leu Phe Glu . Met-Arg-Gly-Met-Leu-Pro-Leu-Phe-Glu.
Pptido (pequea protena)
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MATERIAL DE CONSULTA
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1. Biologa Molecular de la Clula. Alberts et al. (Versin en espaol de la 4a. edicin). Editorial Omega, Barcelona (2004). 2. Fundamentos de biologa celular y molecular de De Robertis. Eduardo M. F. De Robertis, Jos Hib. Editorial El Ateneo (2004). 3. Animacin sntesis de protenas: o o o http://www.dailymotion.com/video/xc5gxg_sintesis-de-proteinasanimacion-3d_school http://www.dailymotion.com/video/x9jb9j_sintesis-de-proteinas-v-osubtitula_school http://www.youtube.com/watch?v=FNqmh4PoMPQ
4. Sitios educativos con material didctico: o o http://www.educa.madrid.org/web/cc.nsdelasabiduria.madrid/Ejercicio s/2b/Biologia/proteinas/estruc_prot2.htm http://www.educa.madrid.org/web/ies.sanisidro.madrid/Cienciasnatura les/2BIO/2bio_pdf/2bio_pdf15/sintesisselectividad.pdf

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El dogma enuncia lo siguiente: cuando en una clula se requiere la sntesis de una

(Modificacin del grfico obtenido de: http://www.monografias.com/trabajos/sinteproteinas/Image172.gif)

UAC UCC CCC UAC GAC GGG GAG AAA CUC

Pptido (pequea protena)

4. Sitios educativos con material didctico: o o http://www.educa.madrid.org/web/cc.nsdelasabiduria.madrid/Ejercicio s/2b/Biologia/proteinas/estruc_prot2.htm http://www.educa.madrid.org/web/ies.sanisidro.madrid/Cienciasnatura les/2BIO/2bio_pdf/2bio_pdf15/sintesisselectividad.pdf

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