Professional Documents
Culture Documents
F. Miescher (1865)
Estudia la composicin qumica del pus:
encuentra una fraccin precipitable por cido diludo que denomina Nuclena. Encuentra un material parecido a la nuclena en la esperma de salmn, y lo fracciona en una componente proteico (protamina) y un componente que contiene P, de carcter cido, que Altmann denomina cido nucleico.
El neumococo tipo R (rough, rugoso) (colonias a la izda.) puede ser transformado en neumococo tipo S (smooth, liso) (colonias a la dcha.) por el DNA del neumococo S. Esta transformacin se transmite a la descendencia.
La hidrlisis qumica completa de un cido nucleico da lugar a una mezcla equimolar de: A. Una base nitrogenada heterocclica, purina o pirimidina B. Una pentosa, ribosa o desoxirribosa C. Fosfato La hidrlisis enzimtica completa de un cido nucleico da lugar a una mezcla de nucletidos Los cidos nucleicos son polmeros (de altsimo peso molecular) cuyos monmeros son los nucletidos.
Una sola molcula circular cuya circunferencia mide 1 mm Tiene un peso molecular de aproximadamente 109
NH2 O
-
N O H OH Base N N
O P O CH2 OH OH H
Pentosa Fosfato
Nuclesido Nucletido
NH2 N O P O CH2 O
-
Polinucletido
N N NH2 N O N N NH2 N O N N
OH O P O CH2 O
-
Enlace fosfodister
OH O P O CH2 O
-
Enlace -glicosdico
O OH
Purinas
2 2N 2 2 2
Pirimidinas
2 2 2 2
N NH
2
N N
2
2 2
NH2 N N N NH
O HN H2 N N N NH
NH2 N O N O HN O N O HN O N
Timina: CH2 2,4-dioxo 5-metil pirimidina
Uracilo: 2,4-dioxo pirimidina Citosina: 2-oxo 4-amino pirimidina
Nuclesidos, 1
Unin de una base a una pentosa a travs de un enlace de tipo -N-glicosdico:
H2 N N HOCH2 O N N N
Enlace -N-glicosdico
H2 N N N N
HOCH2
OH
OH
OH
Chem2 Embed D
Nuclesidos, 2
NH2
OH
OH
OH
Citidina
Desoxicitidina
Numeracin
H2 N
Nomenclatura
N2
Uridina 5 4 3 2 1
Conformacin de nuclesidos
Adenosina (anti-)
Adenosina (syn-)
Antibiticos nucleosdicos
NH2 N O N N N
Puromicina Antibitico inhibidor de la sntesis de protenas
NH2 N N N
HOCH2
OH
HOCH2
NH H2 C O CH2 CH NH2 C O
OH
Antivirales
N2 AZT, Zidovudina
D2 Estavudina T,
Nucletidos (ribonucletidos)
5-nucletido (5-CMP)
3-nucletido (3-CMP)
2-nucletido (2-CMP)
5-CMP
Chem2 Embed D
Nucletidos (desoxirribonucletidos)
5-dTMP
3-dCMP
Nucletidos cclicos
Nuclesido polifosfatos
1. Carcter cido debido al fosfato 2. Solubilidad incrementada respecto al nuclesido 3. Misma reactividad que bases y nuclesidos
Polinucletidos
Extremo 5
Enlace fosfodister
Polinucletido
Extremo 3
3 5
DNA y RNA
A Hombre, H.sapiens Bovino, Bos taurus Levadura, S.cerevisiae Mycobacterium sp. 0.29 0.26 0.30 0.12
El DNA-B
1. Estructura helicoidal 2. Periodicidad a 3.4 nm 3. Periodicidad a 0.34 nm 4. R.E.Franklin sugiere que el eje ribosa-fosfato est hacia fuera y las bases hacia dentro. Igualmente sugiere que se trata de una doble hlice, y no triple
3.4 nm
1. El DNA es una doble hlice plectonmica y dextrgira, con un paso de rosca de 3.4 nm
Modelo de Watson-Crick, B
5 3
2. Cada una de las dos hlices es un polinucletido entrelazado con el otro de manera que su polaridad es opuesta (es decir, corren en sentido antiparalelo)
3. El eje ribosa-fosfato se sita hacia el exterior de la doble hlice, en contacto con el solvente
Modelo de Watson-Crick, C
4. Mientras que las bases nitrogenadas (anillos planares) se sitan, apiladas, hacia el interior de la estructura, en un entorno hidrofbico
Modelo de Watson-Crick, D
0.34 nm
5. Las bases estn situadas en planos aproximadamente perpendiculares al eje mayor de la doble hlice. La distancia entre planos es de 0.34 nm
Modelo de Watson-Crick, E
6. Cada base interacciona con su opuesta a travs de enlaces de hidrgeno, y de manera que:
(a) Adenina (A) slo puede interaccionar con timina (T) (y viceversa), a travs de dos puentes de hidrgeno, y
(b) Guanina (G) slo puede interaccionar con citosina (C) (y viceversa), a travs de tres puentes de hidrgeno
Modelo de Watson-Crick, F 8. La desoxirribosa en forma furansica 7. La base est situada en posicin anti-
5 4 3
Surco estrecho 10. El eje de la doble hlice no pasa por el centro geomtrico del par de bases. Esto determina que la hlice presente un surco ancho y un surco estrecho Surco ancho
Modelo de Watson-Crick, G
Paso de rosca 3.4 0.34 Distancia entre planos de bases Pares de bases/vuelta Anchura
2.4
ADN B
Chem3D Embed
DNA-A
1.Doble hlice plectonmica y dextrgira 2. Planos de bases oblicuos respecto al eje de la doble hlica 3. Propio de RNAs en doble hlice, o de hbridos DNA-RNA 4. Ms ancha y corta que DNA-B
DNA-Z
1. Doble hlice plectonmica y levgira 2. Zonas de secuencia alternante -GCGC3. Conformacin de G es syn- en lugar de anti4. Ms estrecha y larga que DNA-B
A Grosor Giro Bases/vuelta P.de rosca Inclinacin plano bases 2.6 Dextro 11 2.5 19
Tipos de ADN
ADN-A ADN-B ADN-Z
Ms corta
Ms larga
el surco mayor no existe, es muy poco profundo
19
dextrgira
levgira
Superhlices de DNA
El DNA se presenta habitualmente en forma de superhlices, cuando la doble hlice, a su vez, se enrolla sobre s misma. Esto permite el empaquetamiento de la molcula en el interior de la clula o del ncleo celular.
Estructura secundaria
Formada por la disposicin relativa espacial de los nucletidos que se encuentran prximos en la secuencia. DNA estructura definida por la unin de las dos cadenas polinucletidicas a travs de las bases nitrogenadas. RNA presente en determinadas regiones de la molcula
El ncleo en interfase de las clulas eucariotas, el ADN se encuentra asociado a protenas y fuertemente empaquetado.
Cromatina del ncleo de una clula eucariota. Si se rompe la clula y se asla y purifica la cromatina del ncleo celular se observan unas estructuras filamentosas llamadas fibras nucleosmicas.
Cromatina del ncleo de una clula eucariota. Se observa una fibra nuclosmica, collar de perlas y una fibra de 30 nm.
El nucleosoma
Histonas: 2H2a, 2H2b, 2H3, 2H4 DNA: aprox. 196 pares de bases El nucleosoma es una estructura que constituye la unidad fundamental y esencial de cromatina, que es la forma de organizacin del ADN en los eucariotes.
5
-
O P
O O O H2 C N O O P H O H2 C O N OH O N O O P N H O N OH N H N O N N N H H H
2-OH en la pentosa
O P
O H2 C
OH H H N N O N OH N O N OH N N N
O H2 C
O P
O N
H H N H
RNA
O H2 C
Reactividad qumica: El RNA, al tener el grupo 2-OH, es mucho ms reactivo qumicamente que el DNA. En concreto, puede ser completamente hidrolizado por lcali a una mezcla de 2- y 3-nucletidos.
Estructura tridimensional Las formas en doble hlice del RNA adoptan la configuracin A (en lugar de la B, propia del DNA), as como los hbridos DNA-RNA. La pentosa aparece en forma endo-3 (y no endo-2)
DNA
RNA
5 5 4 3 2 1 4 3 1 2
RNA como enzima Algunos RNA son capaces de catalizar reacciones qumicas del mismo modo que las enzimas: son las ribozimas
Participan en el procesado del RNA transcrito primario y en la formacin de enlace peptdico en la sntesis de protenas. Ribozima hammerhead
Extremo aceptor
Lazo T--C
Lazo DHU
Lazo variable
tRNA
Lazo anticodon
O P
O O O H2 C N O O P H O H2 C O N OH H N N O O P N O N OH N H N O N N N H H H
C C
N
O P
O H2 C
OH H H N N O N OH N
O H2 C H
O O
H2 C C N R
Lazo anticodon
3 5
Lazo anticodon
5 A U G I C C mRNA
rRNA 23s