Universidad Autnoma de Zacatecas

Francisco Garca Salinas

rea de Ciencias de la Salud Unidad Acadmica de Ciencias Qumicas Programa Acadmico de Qumico Farmacutico Bilogo

Biologia Molecular:

CDIGO GENTICO Y SNTESIS DE PROTENAS

Flor de Mara Torres Jurez Griselda Aid Cabral Pacheco Pablo Eduardo Escobedo Galvn Claudia Alejandra Camacho Moreno

**El cdigo gentico**

INTRODUCCIN
En el ncleo del dogma central est el concepto de la transferencia de informacin desde la secuencia lineal del alfabeto de cuatro letras de la cadena de polinucletidos hasta el lenguaje de 20 aminocidos de la cadena polipeptdica.
La traduccin de la informacin gentica se produce en los ribosomas y esta mediada por tRNA, los cuales reconocen los grupos de tres nucletidos Codones. Permutaciones-----64.
61-----especifican un aminocido 3-------seales de terminacin de cadena

PROPIEDADES
Degeneracin Cdigo gentico no superpuesto

George Gamow Codones para los aminocidos eran tripletes de nucletidos.

DEGENERACIN
Degeneracin
Muchos aminocidos son especificados por mas de un codn. Los codones que especifican el mismo aminocido son sinnimos (UUU, UUC) para la fenilalanina.

Teora del bamboleo (wobble) en el anticodn (Francis Crick, 1966)

explica de modo operativo el porqu de la degeneracin del cdigo gentico.

Tres codnes dirigen la terminacion de la cadena polipeptdica Estos ( UAA,UAG y UGA) no los leen tRNA especiales sino que lo hacen protenas especificas conocidas como factores de liberacin (RF1 y RF2) en las bacterias y eRF1 en los eucariontes

Identificacion de los codones

Marshall Nirenberg y Heinrich Matthaei. Desarrollaron una tcnica para sintetizar sus propios mensajes genticos artificiales y luego determinar que protena codificaban.

Las asignaciones de los codones suministradas son en esencia universales, esto es, estn presentes en todos los organismos vivos.

Las primeras excepciones a la universalidad del cdigo gentico se identificaron en los codones de los mRNA mitocondriales

Esta carta universal de codificacin lista cada uno de los 64 codones de mRNA posibles y el aminocido correspondiente especificado por ese codn.

REGLAS QUE RIGEN EL CODIGO GENETICO

3. El mensaje se traduce en un marco de lectura fijo, establecido por el codn de iniciacin.

Mutacin en sentido errneo Cambia un codn especfico para un aminocido en un codn especfico para otro aminocido.

Mutacin sin sentido o mutacin de detencin Causada por una alteracin que produce un cambio al codn de terminacin de cadena.

Mutacin por cambio del marco de lectura Implica inserciones o deleciones de un par de bases que alteran el marco de lectura.

** SINTESIS DE PROTEINAS **

Es la actividad sinttica mas compleja en una clula.

mRNA

Ribosoma

La Maquinaria que tiene a su cargo la traduccin del lenguaje de los mRNA en el lenguaje de las protenas.

tRNA

Aminoacil tRNA sintetasas

RNA mensajero
La regin codificadora de protenas de cada mRNA esta compuesta por una hilera de codones no superpuestos contiguos que se conoce como marco de lectura abierto (ORF= open-reading frame).

RNA transferencia
Actan como adaptadores entre los codones y los aminocidos que especifican.

Las molculas de tRNA tienen entre 75 y 95 ribonucletidos de longitud.

2 Aspectos importantes
Todos los tRNA terminan en su extremo 3 con la secuencia 5CCA-3. Sitio al que se une el aminocido afin por la accin de la enzima aminoacil tRNA sintetasa. Es la presencia de varias bases inusuales en su estructura primaria.

La aminoacil tRNA sintetasas

Cargan los tRNA en dos pasos:
La adenililacin en la que el aminocido reacciona con ATP para adenililarce con la liberacin simultanea del pirofosfato.

Es la carga del tRNA en la cual el aminocido adenililado, que permanece unido con firmeza a la sintetasa, reacciona con el tRNA.

2 Clases de sintetasas

El ribosoma
Es la mquina macromolecular que dirige la sntesis de protenas esta compuesto por una subunidad mayor y una menor.

Sitio A Es el de unin para el aminoacil-tRNA

Hay tres sitios de unin para el tRNA en el ribosoma.

Etapas de la sntesis de protenas

Iniciacin Elongacin Terminacin

Iniciacin en procariontes
El ribosoma se recluta hacia el mRNA

Un tRNA cargado tiene que ubicarse en el sitio P del ribosoma.

El ribosoma tiene que posicionarse exactamente sobre el codn de inicio, de esta manera establecer el marco de lectura.

El ribosoma sobre el mRNA

La subunidad menor se asocia primero con el mRNA, mediada por interacciones de apareamiento de bases entre sitio de unin al ribosoma y el rRNA. La subunidad menor se posiciona sobre el mRNA, de manera que el codn de inicio este en el sitio P.

La subunidad mayor se une a su parejo solo al final del proceso de iniciacin.

tRNA especial de inicio

Los tRNA cargados normalmente entre en el ribosoma por el sitio A y luego al P. En la iniciacin un tRNA entra directamente al sitio P. Necesita un tRNA especial iniciador, se aparea con codon de inicio (AUG o GUG) este se encuentra cargado con una forma modificada de metionina.

El tRNA recibe el nombre de fMet-tRNA

Factores de iniciacin
IF-1. impide que los tRNA se unan a la porcin de la subunidad menor que se convertir en parte del sitio A. IF-2 es una GTPasa. Facilita la asociacin ulterior del fMettRNA, con la subunidad menor e impide que otros tRNA se asocien. IF-3 se unen a la subunidad menor y la bloquean con su reasociacin con la subunidad mayor o contra la unin a tRNA cargados, solo al final de traduccin y contribuye a la disociacin del ribosoma en sus subunidades.

Unin de los factores de iniciacin en el ribosoma

IF-1 se une en la subunidad menor en el que ser el sitio A. IF-2 se une al IF-1 pasa el sitio A hasta el sitio P. IF-3 ocupa lo que sera el sitio E.

Iniciacin en procariontes
Unidos los tres factores de iniciacion

Estimula GTPasa, hidrolisa IF2GTP en IF2-GDP

IF2-GDP menos afinidad del ribosoma y tRNA iniciador

Union del codon de inicio y fMettRNA

Subunidad mayor se une al IF-1, IF-2, mRNA y fMet-tRNA

Conduce a la liberacion del IF2-GDP y del IF1

Produce un cambio conformacional

IF-3 es liberado

Complejo de iniciacion 70S

Eucariontes
Similitudes con procariontas
Usan codn de inicio Un tRNA iniciador dedicado Factores de iniciacin

Diferencias
Reconocimiento del mRNA y el codn de inicio mRNA monocistrnicos.

Eucariontes
eIF3 y eIF1A disocian al ribosoma en sus subunidades
RECONOCIMIENTO DEL mRNA El reconocimiento del capuchn est mediado por eIF4F dividida en tres unidades

El eIF5B asociado a subunidad menor, dependiente de eIF1A

Recluta complejo de eIF2-GTP y Met-tRNA a subunidad menor

Una de las cuales se une al capuchn 5 del mRNA

el eIF2-GTP y eIF5B-GTP Ubican el Met-tRNA en el sitio P

Se une el eIF4B en una de sus subunidades, activando la helicasa

Complejo de preiniciacin 43S

El mRNA unido al eIF4F/B, recluta complejo de preiniciacin.

Encontrando el codn de inicio

Una vez armados en el extremo 5 del mRNA Desplazamiento 5 a 3 dependiente de ATP hidrolisis de GTP por eIF5B Libera el resto de los factores de iniciacin

Lleva a la unin de la subunidad mayor.

El Met-tRNA se une al sitio P

Encontrar el primer codn de inicio

Desencadena liberacin del eIF2 y eIF3

Listo para aceptar en sitio A un tRNA

Mediante el apareamiento codn de inicioanticodn

Apareamiento correcto

Forma circular del mRNA

Los factores de iniciacin tambin se unen al extremo 3 del mRNA por su cola poli-A

Mediado por interaccin eIF4F y la protena de unin a poli-A

Produce el mRNA en configuracin circular. Lleva a la conclusin de que una vez que termina de traducir esta en posicin para reiniciar la traduccin del mismo mRNA.

Prolongacin

Acontecimientos fundamentales
El aminoacil-tRNA se carga en el sitio A Se forma enlace peptdico entre el aminoacil-tRNA en sitio A y la cadena peptdica unida al peptidil-tRNA en el sitio P El peptidil-tRNA resultante en sitio A y su codn se traslocan al sitio P

Factor de prolongacin EF-Tu

EF-Tu se une al extremo 3 del tRNA EF-Tu interactura con subunidad ribosomal mayor Activa GTPasa del IF-2 que hidroliza GTP en GDP

Lo gua al ribosoma el tRNA

Centro fijador de factores

El GDP tiene poca afinidad con el aminoacil -tRNA

Entra en el sitio A

Apareamiento codon-anticodon

Libera EF-Tu del tRNA y del ribosoma

Mecanismos para aminoacil-tRNA correctos

El ribosoma es una ribozima

Ribozima
Enzima compuesta de RNA.

Produce en enlace peptdico por el componente de rRNA 23S de la subunidad mayor. Mecanismo aun no se conoce.

Estimulacin de la translocacin por el EF-G (ATP)

Cadena polipeptdica se desacetila Cadena polipeptdica se une al tRNA del sitio A tRNA en sitio A introduce extremo 3 al sitio P y el P al E

Estimula la hidrolisis de GTP produciendo EFGGDP

El EFG-GTP entra en contacto con el centro fijador de factores

El tRNA en sitio A descubre un sitio de unin donde entra el EFG-GTP

Genera la translocacin de los codones y al mismo tiempo del mRNA

El EFG-GDP pierde afinidad por el sitio A libre y se libera

El tRNA descargado en el sitio E queda libre para disociarse

El EF-Tu y el EF-G
Se usan una sola vez, despus de la hidrolisis tienen que librera el GDP y fijar GTP. El EF- Tu necesita un factor intercambiador de GTP EF-Ts
ES menos afin al GDP que al GTP
Se libera EF-Tu del ribosoma El EF-Ts se une al EF-Tu

EF-Tu

EF-G

Lo libera rpido despus de la hidrolisis

Forma el complejo EF-TuEF-Ts

Desplazamiento del GDP

Fija por afinidad una GTP nueva

El cual se une al GTP

Produce la disociacin de EF-Tu-GTP y EF-Ts

Continuara..

Bibliografa