Escuela Politcnica del Ejrcito

Abata L., Ayala P., Iturralde P.

AFLPs
Polimorfismos de longitud de fragmentos amplificados

Amplified Fragment Length Polymorphism

AFLPs
Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

PM

actividad enzimtica

Marcadores genticos de ADN

estructura sitios de restriccin

ser polimrficos
en el ADN de individuos de una poblacin

patrones de distancia

longitud

disposicin

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados Avances de la tecnologa del DNA recombinante

Agrupar 3 categoras:
RFLP MAAP STS.

han permitido el desarrollo de los M-M basados en el DNA

de tcnicas descritas es c/>

consiguiendo estabilidad en la identificacin de especies y variedades.

RFLP
Polimorfismo en el tamao de los fragmentos de restriccin.

MAAP
Mltiples perfiles arbitrarios de amplificacin

STS
Sitios etiquetados por la secuencia o SSLP (Polimorfismo de longitud en las secuencias discretas)
1989

finales de los 70

Termino genrico acuado en 1994

Use sec know, nicas dentro del genoma, > vel X det los oligonucletidos y x la forma de analizar los polimorfismos, esta tcnica: SSR (Repeticin de secuencias discretas) EST (Sitios etiquetados por la expresin)

basa en la deteccin de fragmentos de DNA de PM(por digestin con la misma enzima de restriccin) en diferentes organismos

tcnicas que emplean oligonucletidos arbitrarios para generar huellas dactilares complejas

RAPD (DNA polimrfico amplificado al azar)

CAPS (Secuencia polimrfica amplificada y cortada)

AP-PCR (PCR con oligonucletidos arbitrarios)

SCAR (Regiones amplificadas caracterizadas y secuenciadas)

AFLP (Polimorfismo de la longitud de los fragmentos amplificados)

D/TGGE (Geles de electroforesis en gradiente desnaturalizante/trmico) SSCP (Polimorfismo de conformaciones monocatenarias)

AFLPs

Polimorfismos de longitud de fragmentos amplificados

Amplified Fragment Length Polymorphism

Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

1990

KeyGene

Labs. Shanghai, China. filial en Rockville, Maryland, EE.UU.

Wageningen, Pases Bajos

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

Enzimas de restriccin

M-M muy especficos

Oligonucletidos para PCR

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

Tcnica consiste en tres etapas: 1 la restriccin del ADN y ligacin de adaptadores de oligonucletidos 2 amplificacin selectiva de los conjuntos de fragmentos de restriccin 3 anlisis en gel de los fragmentos amplificados.

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

El DNA se :x con 2 Enz. R.

2 corte poco frecuente.

1 una de corte muy frecuente

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados
A los fragmentos se les ligan oligonucletidos de extremos compatibles con las enzimas usadas.

gel de poliacrilamida

amplifica por PCR.

Generar muchos marcadores moleculares en una sola Rx

oligonucletidos con el sitio de restriccin

o de bandas amplificada

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Presencia-ausencia de polimorfismos en fragmentos amplificados

FLP-PCR es un mtodo altamente sensible para detectar polimorfismos en ADN La tcnica fue descrita originalmente por Vos y Zabeau en 1993. Una variacin de AFLP ADNc-AFLP Usado para cuantificar las en los niveles de expresin gnica. TE Display utilizado para detectar la movilidad elemento transponible