Aminoacidos y Proteinas - Gonzalez

UNIVERSIDAD PRIVADA ANTENOR ORREGO UNIVERSIDAD PRIVADA DEL NORTE UNIVERSIDAD CSAR VALLEJO UNIVERSDIAD ALAS PERUANAS
FACULTAD DE CIENCIAS / MEDICINA CTEDRA DE MICROBIOLOGA Y BIOTECNOLOGA
AMINOACIDOS Y PROTEINAS
Blgo. Dr. Jos Gonzlez Cabeza
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01
Concepto
02
Clasificacin de las Protenas
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Aminocidos: Unidades Estructurales de las Proteinas
04
Clasificacin de los Aminocidos.
05
Aminocidos Esenciales.
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CONTENIDO
Concepto Clasificacin de las Protenas Aminocidos: Unidades Estructurales de las Proteinas Clasificacin de los Aminocidos. Aminocidos Esenciales. Propiedades de los Aminocidos.
CONCEPTO DE PROTENAS
La palabra protena viene del griego = protos que significa "lo ms antiguo, lo primero. Las protenas son biopolmeros (macromolculas orgnicas) de elevado peso molecular; compuestos qumicos muy complejos que se encuentran en todas las clulas vivas. Hay ciertos elementos qumicos que todas ellas poseen, pero los diversos tipos de protenas los contienen en diferentes cantidades. Estn constituidas bsicamente por carbono (C), hidrgeno (H), oxgeno (O) y nitrgeno (N); aunque pueden contener tambin azufre (S) y fsforo (P) y, en menor proporcin, hierro (Fe), cobre (Cu), magnesio (Mg), yodo (Y).
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Las protenas son las molculas orgnicas ms abundantes en las clulas; constituyen alrededor del 50% de su peso seco o ms en algunos casos. Una bacteria puede tener cerca de 1000 protenas diferentes, pero en una clula humana puede haber 10.000 clases de protenas distintas. Qumicamente, las protenas estn formadas por la unin de muchas molculas relativamente sencillas y no hidrolizables, denominadas Aminocidos (Aa). Los aminocidos se unen entre s originando pptidos. Segn su tamao molecular, pueden ser oligopptidos, formados por no ms de 10 Aa y polipptidos, constituidos por ms de 10 Aa. Cuando el nmero de Aa supera los 50 y el polipptido tiene una estructura tridimensional especfica, entonces se habla propiamente de protenas.
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CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS

Protenas filamentosas
Holoprotenas
Protenas globulares Cromo protenas
PROTENAS
Heteroprotenas
Glucoprotenas Lipoprotenas Nucleoprotenas Fosfoprotenas

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Aminocidos: Unidades Estructurales de las Protenas

Los AA son compuestos orgnicos de bajo peso molecular. Estn compuestos siempre de C, H, O y N y adems pueden presentar otros elementos. Se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (COOH) y un grupo amino (NH2) que se unen al mismo carbono (carbono ). Las otras dos valencias del carbono se saturan con un tomo de H y con un grupo variable denominado radical R.
Este radical es el que determina las propiedades qumicas y biolgicas de cada aminocido. Segn ste se distinguen 20 tipos de aminocidos.
Numeracin de los tomos de carbono de un aminocido

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Clasificacin de Aminocidos
Hidrfobos Hidrfilos cidos Bsicos Segn la polaridad del radical
AMINOCIDOS
Alifticos
Segn la estructura del radical Aromticos Heterocclicos
Neutros
cidos
Bsicos
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Clasificacin de aminocidos
- Segn la polaridad del Radical 1. Aminocidos con R no polar Hidrfobo. 2. Aminocidos con R polar Sin carga, hidrfilos y pueden establecer puentes de hidrgeno con el agua, favoreciendo su solubilidad. 3. Aminocidos cidos. Presentan carboxilos en el radical R, que normalmente est ionizado negativamente. 4. Aminocidos Bsicos. Presentan un grupo amino en el radical R que se ioniza positivamente.
De los 20 aminocidos proteicos (hay otros 200 que no forman parte de las protenas), hay 8 que son esenciales para la especie humana y que deben ser incorporados en la dieta. Slo los vegetales y las bacterias pueden sintetizarlos, aunque todos los seres vivos los necesitan para fabricar sus protenas.
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Clasificacin de Aminocidos
- Segn la Estructura del Radical 1. Aminocidos Alifticos. Son los aminocidos en los que el radical R es una cadena hidrocarbonada abierta, que puede tener, adems, grupos COOH y NH2. Los aminocidos alifticos se clasifican en neutros, cidos y bsicos. 1. Neutros. Si el radical R no posee grupos carboxilo ni amino. 2. cidos. Si el radical R presenta grupos carboxilo, pero no amino. 3. Bsicos. Si el radical R tiene grupos amino, pero no grupos carboxilo 2. Aminocidos Aromticos. Son aquellos cuyo radical R es una cadena cerrada, generalmente relacionada con el benceno. 3. Aminocidos Heterocclicos. Aquellos cuyo radical R es una cadena cerrada, generalmente compleja y con algunos tomos distintos del carbono y del hidrgeno.
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AMINOCIDOS ESENCIALES
Son aquellos que los organismos hetertrofos deben tomar de su dieta ya que no pueden sintetizarlos en su cuerpo (los auttrofos pueden sintetizarlos todos) Las rutas metablicas para su obtencin suelen ser largas y energticamente costosas, por lo que los vertebrados las han ido perdiendo a lo largo de la evolucin (resulta menos costoso obtenerlos en los alimentos). EN ADULTOS: 8 Fenilalanina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Treonina Triptfano Valina EN NIOS los anteriores y: Arginina Histidina
AMINOACIDOS ESENCIALES Metionina
Valina (Histidina)
Valina (V) Leucina (L) Treonina (T) Metionina (M) Treonina Fenilalanina Maiz Leucina Isoleucina Triftfano Lisina Triptfano (W) Isoleucina (I) Fenilalanina (F) Lisina (K) Frejol y otras leguminosas
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PROPIEDADES DE LOS AMINOCIDOS

1. Los AA son compuestos slidos. 2. Compuestos cristalinos. 3. Presentan un elevado punto de fusin. 4. Son solubles en agua. 5. Tienen actividad ptica. 6. Presentan un comportamiento qumico anftero. Esto se debe a que a pH=7 presentan una ionizacin dipolar, llamada zwitterion, que permanece en equilibrio con la forma no inica. Este estado vara con el pH. A pH alcalino, el grupo carboxilo est ionizado (-COO-) y el grupo amino no. A pH cido, el grupo amino est ionizado (NH3+) y el grupo carboxilo no.
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pH BAJO = ACIDO
pH ALTO = ALCALINO
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Actividad ptica de los Aminocidos

Todos los aminocidos, salvo la glicocola o glicina, presentan el carbono asimtrico, ya que est enlazado a cuatro radicales diferentes: un grupo amino, un grupo carboxilo. un radical R y un hidrgeno. Debido a esta caracterstica, los aminocidos presentan actividad ptica, es decir, son capaces de desviar el plano de luz polarizada que atraviesa una disolucin de aminocidos. Si un aminocido desva el plano de luz polarizada hacia la derecha, se denomina dextrgiro (+), y si lo hace hacia la izquierda, levgiro ().
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Estereoisomera de los Aminocidos

Debido a la presencia del carbono asimtrico, los aminocidos pueden presentar dos configuraciones espaciales. Un aminocido tendr una configuracin D si al disponerlo en el espacio, de forma que el grupo carboxilo quede arriba, el grupo NH2 queda situado a la derecha, mientras que, si se encuentra a la izquierda, poseer una configuracin L.
La disposicin L o D es independiente de la actividad ptica. Por ello, un L-aminocido podr ser levgiro o dextrgiro, e igual ocurrir con la configuracin D. En la naturaleza, la forma L es la ms abundante, y todas las protenas estn formadas por aminocidos L.
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Comportamiento Qumico: Propiedades cido-bsicas

En disolucin acuosa, los aminocidos muestran un comportamiento anftero, es decir, pueden ionizarse, dependiendo del pH, como un cido (los grupos -COOH liberan protones, quedando como -COO), como una base (los grupos -NH2 captan protones, quedando como -NH3+) o como un cido y una base a la vez. En el ltimo caso los aminocidos se ionizan doblemente, apareciendo una forma dipolar inica llamada zwitterion.
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La forma dipolar, en un medio cido, capta protones y se comporta como una base y en un medio bsico libera protones y se comporta como un cido.
El pH en el cual el aminocido tiende a adoptar una forma dipolar neutra, con tantas cargas positivas como negativas, se denomina punto isoelctrico.
El carcter anftero de los aminocidos permite la regulacin del pH, ya que se comporta como un cido o como una base segn le convenga al organismo.
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El punto isoelctrico es el valor de pH al que el aminocido presenta una carga neta igual al cero
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Enlace Peptdico
1. En un enlace peptdico, los tomos del grupo carboxilo y del grupo amino se sitan en un mismo plano, con distancias y ngulos fijos. 2. Los grupos de aminocidos unidos por este enlace se denominan residuos para resaltar la prdida de una molcula de agua en cada enlace. 3. El amino libre de un extremo y el carboxilo libre del otro extremo de la cadena reciben el nombre de N-terminal y C-terminal respectivamente. Por convenio, los aminocidos se numeran desde el N-terminal.
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Enlace Peptdico
4. El enlace peptdico tiene un comportamiento similar al de un enlace doble, es decir, presenta una cierta rigidez que inmoviliza en un plano los tomos que lo forman. 5. Adems es un enlace ms corto que otros enlaces C-N. Esto le impide girar libremente, los nicos enlaces que pueden girar son los C-C y los C-N que no corresponden al enlace peptdico.
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Debido a que solamente se encuentran 20 aminocidos en la protenas y a que la cadena de protenas puede estar formada por cientos de aminocidos, el numero de arreglos posibles de aminocidos va mas a la de la imaginacin. La naturaleza hace solo uso de algunas de estas combinaciones, pero aun en este caso, el numero de combinaciones de 30 las protenas es muy grande.
Pptidos y Oligopptidos de Inters Biolgico

Existen algunos pptidos cortos con funcin biolgica. Entre ellos podemos citar: El tripptido glutatin (que acta como transportador de hidrgeno en algunas reacciones metablicas). Los nanopptidos oxitocina y vasopresina (con actividad hormonal), la insulina y el glucagn que regulan la concentracin de glucosa en sangre. Los decapptidos tirocidina, gramicidina y valinomicina (antibiticos).
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ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS

La organizacin de una protena viene definida por cuatro niveles estructurales ( o cuatro niveles de organizacin) denominados: 1. ESTRUCTURA PRIMARIA 2. ESTRUCTURA SECUNDARIA 3. ESTRUCTURA TERCIARIA 4. ESTRUCTURA CUATERNARIA Cada una de estas estructuras informa de la disposicin de la anterior en el espacio.
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Estructura Primaria
La estructura primaria es la secuencia de aminocidos de la protena. Nos indica qu aminocidos componen la cadena polipeptdica y el orden en que dichos aminocidos se encuentran. La secuencia de una protena se escribe enumerando los aminocidos desde el extremo N-terminal hasta el C-terminal.
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Estructura Primaria
La funcin de una protena depende de su secuencia de aminocidos y de la forma que sta adopte. El cambio de un solo aa de la secuencia de la protena puede tener efectos muy importantes, como el cambio de un solo aa en la hemoglobina humana que provoca la anemia falciforme.
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(a) Eritrocito normal
Hemoglobina normal
3 4 5
146
(b) Clula falciforme
Hemoglobina de clula falciforme
3 4 5
.146
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Estructura Primaria
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Estructura Secundaria
La estructura secundaria es la disposicin de la secuencia de aminocidos o estructura primaria en el espacio. Los aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante la sntesis de las protenas, y gracias a la capacidad de giro de sus enlaces, adquieren una disposicin espacial estable, la estructura secundaria. Son conocidos tres tipos de estructura secundaria: la -hlice, la hlice de colgeno y la conformacin o lmina plegada . La estructura secundaria de la cadena polipeptdica depende de los aminocidos que la forman.
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Estructura Secundaria
Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los aminocidos dan origen a la estructura secundaria. Esta conformacin viene dada por puentes de hidrgeno intercatenarios. La estructura secundaria puede ser: Conformacin (Hlice). Conformacin (Hoja plegada). Si bien las conformaciones anteriores son las ms usuales, existen otras menos frecuentes. Existen sectores de los polipptidos cuya estructura no est bien definida: los enroscamientos aleatorios o ad-random.
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En la estructura terciaria de una protena globular tpica se mezclan segmentos de hlice con segmentos de enrollamiento al azar en los puntos donde se dobla la hlice.
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-hlice
Estructura en forma de bastn.
Los restos laterales de los aminocidos se ubican de forma perpendicular al eje de la hlice.
Los enlaces puente de hidrgeno se establecen entre el hidrgeno unido al nitrgeno y el oxgeno del primitivo carboxilo.
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Hlice alfa
Lamina Beta
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-hlice
La estructura secundaria en -hlice se forma al enrollarse helicoidalmente sobre s misma la estructura primaria.
Esto se debe a la formacin espontnea de enlaces de hidrgeno entre el CO de un aminocido y el NH del cuarto aminocido que le sigue. En la -hlice, los oxgenos de todos los grupos CO quedan orientados en el mismo sentido, y los hidrgenos de todos los grupos NH quedan orientados justo en el sentido contrario. La -hlice presenta 3,6 aminocidos por vuelta y la rotacin es hacia la derecha.
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Hlice de colgeno
El colgeno posee una disposicin en hlice especial, mas alargada que la -hlice, debido a la abundancia de prolina e hidroxiprolina.
Estos aa poseen una estructura que dificulta la formacin de enlaces de hidrgeno, por lo que se forma una hlice ms extendida, con slo tres aminocidos por vuelta.
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Hlice de colgeno
Su estabilidad viene dada por la asociacin de tres hlices empaquetadas, para formar la triple hlice o superhlice que es la responsable de la gran fuerza de tensin del colgeno. Las tres hlices se unen mediante enlaces covalentes y enlaces dbiles de tipo puente de hidrgeno. Las maromas y cables se construyen de forma semejante a esta triple hlice. Hay algunas alteraciones del colgeno que provocan sndromes como el del hombre de goma o el Sndrome de Marfn que padeca Paganini y que explicaba sus dedos largos e hiperextensibles.
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Hlice de colgeno
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Conformacin-
Son estructuras flexibles que no se pueden estirar. Los restos laterales se ubican hacia arriba y hacia abajo del plano de 48 las hojas.
Conformacin-
Los aminocidos forman una cadena en forma de zig-zag. No existen enlaces de hidrgeno entre los aminocidos prximos de la cadena polipeptdica. Si que existen enlaces de hidrgeno intercatenarios, en los que participan todos los enlaces peptdicos, dando una gran estabilidad a la estructura. Las dos cadenas se pueden unir de dos formas distintas; paralela y antiparalela. Esta ltima es un poco mas compacta y aparece con mayor frecuencia en las protenas. Si la cadena con conformacin se repliega sobre si misma, se pueden establecer puentes de hidrgeno entre segmentos, antes distantes, que ahora han quedado prximos. Esto da lugar a una lmina en zig-zag muy estable denominada -lmina plegada. Esta estructura tambin se puede formar entre dos o mas cadenas polipeptdicas diferentes.
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Conformacin-
ANTIPARALELA PARALELA
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Cada grupo carbonilo peptdico est unido mediante enlace de hidrgeno al hidrgeno del grupo N-H de una cadena peptdica adyacente.
Este ordenamiento puede hacer que se alineen muchas molculas de pptidos unas al lado de las otras, dando lugar a una lmina bidimensional.
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Conformacin-
Muchas protenas globulares presentan segmentos con conformacin alternados con segmentos de estructura en hlice. En general, las protenas que se quedan en la estructura secundaria, dan lugar a protenas filamentosas alargadas. Son insolubles en agua y soluciones salinas y realizan funciones esquelticas. Ej.: La -queratina del pelo, plumas, uas, cuernos, etc, la fibrona del hilo de seda y de las telaraas, y la elastina del tejido conjuntivo, que forma una red deformable por la tensin.
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Conformacin-
Caractersticas de la Hoja plegada (beta-lamina): Los grupos C=O y N-H de los enlaces peptdicos de cadenas adyacentes (o de segmentos adyacentes de una misma cadena) estn en el mismo plano apuntando uno hacia el otro, de tal forma que se hace posible el enlace de hidrogeno entre ellos. Los puentes de hidrogeno son mas o menos perpendiculares al eje principal de la estructura en hoja plegada. Todos los grupos R en cada una de las cadenas alternan, primero arriba del eje de la lamina, despus abajo del mismo, y as sucesivamente.
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Giros
Secuencias de la cadena polipeptdica con estructura o a menudo estn conectadas entre s por medio de los llamados giros . Son secuencias cortas, con una conformacin caracterstica que impone un brusco giro de 180o a la cadena principal de un polipptido. AA como Asn, Gly y Pro (que se acomodan mal en estructuras de tipo o ) aparecen con frecuencia en este tipo de estructura. La conformacin de los giros est estabilizada generalmente por medio de un puente de hidrgeno entre los residuos 1 y 4 del giro . Sirven para que la protena adopte estructuras ms compactas. 54
Estructura Terciaria
La conformacin terciaria de una protena globular es la conformacin tridimensional del polipptido plegado. Las interacciones en el plegamiento de la estructura secundaria son: Interacciones hidrofbicas entre restos laterales no polares. Uniones de Van der Waals. Puentes de Hidrgeno. Interacciones salinas. Puentes Disulfuro. Funciones de las protenas dependen del plegamiento que adopten. Esta estructura est altamente influenciada por la estructura
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Es disposicin espacial de la estructura secundaria de un polipptido al plegarse sobre s misma originando una conformacin globular. La conformacin globular en las protenas facilita su solubilidad en agua y en disoluciones salinas. Esto les permite realizar funciones de transporte, enzimticas, hormonales, etc. Las conformaciones globulares se mantienen estables por la existencia de enlaces entre los radicales R de los aminocidos.
Estructura Terciaria
Lmina
Hlice
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Residuos hidrofbicos
Residuos polares
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Enlaces de hidrgeno en estructura terciaria

H
CH2 HO H CH2
Aceptores
HN N HO CH R
S,T
Donadores
H N CH2 H H H N H C NH
C,M
CH2
S R
NH2+ O H H R H O N C
E,G,N,Q
N,Q
Enlaces salinos o inicos en estructura terciaria
K R
CH2
NH3
CH2 NH NH2 C NH2
D,E
OOC CH2
H
CH2 NH HN
Enlaces covalentes en estructura terciaria: disulfuro
S S
Enlaces covalentes en estructura terciaria: amida
H N
H C N H O N
H N C O
D,E
O C R C O H N R
K
N H O C R H N C O
Interacciones que intervienen en el plegamiento de la estructura terciaria

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En los tramos rectos, la cadena polipeptdica posee estructura secundaria de tipo -hlice o -lmina. En los codos o giros presenta secuencias sin estructura precisa. Existen combinaciones estables, compactas y de aspecto globular de -hlice y conformacin- que aparecen repetidamente en protenas distintas. Reciben el nombre de dominios estructurales y cada dominio se pliega y se desnaturaliza casi independientemente de los dems. Evolutivamente, se considera que los dominios estructurales han servido como unidades modulares para constituir diferentes tipos de protenas globulares. Los distintos dominios suelen estar unidos por zonas estrechas o cuellos, lo que posibilita un cierto movimiento rotacional. As, al separarse dos dominios, permiten la introduccin de la molcula de sustrato y, al acercarse, la fijan para actuar sobre ella.
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Funciones de los Dominios:

A menudo un dominio realiza una funcin especifica y separada para la protena:
Enlaza a un pequeo ligando. Atravesar la membrana plasmtica. Contiene el sitio cataltico (enzimas). Enlazar al DNA (en factores de transcripcin). Provee una superficie para enlazarse especficamente a otra protena.
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Estructura cuaternaria
1. La estructura cuaternaria es la unin mediante enlaces dbiles (no covalentes) de varias cadenas polipeptdicas con estructura terciana, idnticas o no, para formar un complejo proteico. 2. Cada una de estas cadenas polipeptdicas recibe el nombre de protmero (subunidad o monmero) 3. Segn el nmero de protmeros que se asocian. las protenas que tienen estructura cuaternaria se denominan: Dmeros, como la hexoquinasa. Tetrmero como la hemoglobina. Pentmeros, como la RNA-polimerasa. Polmeros, cuando en su composicin intervienen gran nmero de protmeros. (cpsida del virus de la poliomielitis, que consta de 60 subunidades proteicas; los filamentos de actina y miosina de las clulas musculares, etc).
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Estructura Cuaternaria
Las interacciones que estabilizan esta estructura son en general uniones dbiles: Interacciones hidrofbicas. Puentes de hidrgeno. Interacciones salinas. Fuerza de Van der Waals. En algunas ocasiones puede haber enlaces fuertes tipo puentes disulfuro, en el caso de las inmunoglobulinas.
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El uso de subunidades menores para construir grandes estructuras presenta varias ventajas: Reduce la cantidad de informacin gentica necesaria. El ensamblaje y la disgregacin se controlan fcilmente, ya que las subunidades se asocian por enlaces dbiles. Los mecanismos de correccin pueden excluir durante el ensamblaje las subunidades defectuosas, con lo que disminuyen los errores en la sntesis de la estructura. Se pueden distinguir dentro de las estructuras cuaternarias dos tipos: Homotpicas: Las cadenas polipeptdicas son idnticas o casi idnticas. Heterotpicas: Las subunidades poseen estructuras muy diferentes.
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EN RESUMEN, LA ESTRUCTURA DE UNA PROTENA.
PRIMARIA
Combinacin ilimitada de aminocidos.
SECUNDARIA
Hlice Hoja Plegada Puente de Hidrgeno
TERCIARIA
Globular Fibrosa
Puente de Hidrgeno, Interacciones hidrofbicas, salinas, electrostticas.
CUATERNARIA
Subunidades iguales Subunidades distintas Fuerzas diversas no covalentes.
Unin Peptdica
Secuencia
Conformacin Blgo. Dr. Jos Gonzlez Cabeza
Asociacin
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PROPIEDADES DE LAS PROTEINAS

Las propiedades de las protenas dependen sobre todo de los radicales R libres y de que stos sobresalgan de la molcula y, por tanto, tengan la posibilidad de reaccionar con otras molculas. El conjunto de aminocidos de una protena cuyos radicales poseen la capacidad de unirse a otras molculas y de reaccionar con stas se denomina centro activo de la protena.
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PROPIEDADES DE LAS PROTENAS
Solubilidad
Desnaturalizacin y renaturalizacin
Especificidad
Capacidad amortiguadora
De funcin
De especie
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Solubilidad
Las protenas globulares poseen un elevado tamao molecular, por lo que al disolverse, dan lugar a disoluciones coloidales. La solubilidad de estas molculas se debe a los radicales R que, al ionizarse, establecen puentes de hidrgeno con las molculas de agua. As, la protena queda recubierta de una capa de molculas de agua que impide que se pueda unir a otras protenas, lo que provocara su precipitacin. La solubilidad depende del pH, temperatura, concentracin inica. A pesar de ser solubles, la mayora de las membranas biolgicas son impermeables al paso de protenas.
Capa de molculas de agua
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Desnaturalizacin y Renaturalizacin
Consiste en la prdida de todas las estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y cuaternaria) quedando la protena reducida a un polmero con estructura primaria. Consecuencias inmediatas son:
Disminucin drstica de la solubilidad de la protena, acompaada frecuentemente de precipitacin. Prdida de todas sus funciones biolgicas. Alteracin de sus propiedades hidrodinmicas.
Agentes Desnaturalizantes
I. FSICOS
1.Calor. La mayor parte de las protenas experimentan desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60C; otras se desnaturalizan tambin cuando se enfran por debajo de los 10 a 15C. 2.Radiaciones. II. QUMICOS: Todos los agentes que rompen interacciones o enlaces presentes en la estructura nativa de la protena: 1.Detergentes. 2.Urea y guanidina a altas concentraciones. 3.Altas concentraciones de sal y extremos de pH. 4.Reactivos de grupos -SH
Agentes desnaturalizantes
HOCH2 CH2 SH
2-mercaptoetanol
NH2 C O Urea NH2
CH2 SH HOCH HCOH CH2 SH

Ditiotreitol (DTT)
NH2 C NH Guanidina NH2 O O S OO
Dodecilsulfato sdico (SDS, laurilsulfato) Blgo. Dr. Jos Gonzlez Cabeza
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Especificidad
La especificidad es doble: De Especie. De Funcin. Especificidad de Especie En su secuencia de aminocidos, las protenas presentan dos tipos de sectores: Sectores estables Sectores variables. Algunos aminocidos pueden ser sustituidos por otros distintos sin que se altere la funcionalidad de la molcula. Ello ha dado lugar, durante la evolucin, a una gran variabilidad de protenas, lo que permite que cada especie tenga sus protenas especficas y que, incluso, aparezcan diferencias entre individuos de la misma especie (rechazo en trasplantes de tejidos). Las diferencias entre protenas homologas, es decir, con la misma funcin, son grandes entre especies alejadas evolutivamente y escasas 80 Blgo. Dr. Jos Gonzlez Cabeza entre especies emparentadas.
Especificidad de Funcin La especificidad tambin se refiere a la funcin.
Cada protena realiza una determinada funcin exclusivamente, por

ejemplo, catalizar cierta reaccin qumica sobre cierto substrato y no sobre otro.
La especificidad se debe a que su actuacin se realiza mediante

interacciones selectivas con otras molculas, para lo que necesitan una determinada secuencia de aa y una conformacin concreta.
Un cambio en la secuencia o conformacin puede impedir la unin y

por lo tanto dificultar la funcin.
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Capacidad Amortiguadora
Las protenas, al estar constituidas por aminocidos, tienen un comportamiento anftero. Tienden a neutralizar las variaciones de pH del medio, ya que pueden comportarse como un cido o una base y, por tanto, liberar o retirar protones (H+) del medio.
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CLASIFICACIN DE PROTENAS
Se clasifican en: Holoprotenas: Formadas solamente por aminocidos. Heteroprotenas: Formadas por una fraccin protenica y por un grupo no protenico, que se denomina "grupo prosttico. Se clasifican segn la naturaleza del grupo prosttico.
Protenas filamentosas
Holoprotenas
Protenas globulares Cromoprotenas
PROTENAS
Glucoprotenas
Heteroprotenas
Lipoprotenas Nucleoprotenas Fosfoprotenas

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CARACTERSTICAS PROTENA
EJEMPLOS
Ovoalbmina Lactoalbmina Ovoglobulina Lactoglobulina H1, H2A, H2B, H3, H4 Colgeno Elastina
PROTEINAS SIMPLES
ALBUMINAS
Son solubles en agua, pueden ser precipitadas de la solucin por el agregado de sales a alta concentracin. Son ricas en S. Son insolubles en agua, pero se disuelven en soluciones salinas diluidas. Precipitan ms fcilmente que las albminas por adicin de sales. Son solubles en soluciones salinas, fuertemente bsicas, con gran proporcin de aminocidos como lisina y arginina. Estn unidas al DNA. Son muy insolubles. Son molculas largas y fibrosas que se agregan para formar fibras grandes. Forman parte de tejidos de sostn y estructuras de gran resistencia fsica
GLOBULINAS
HISTONAS
ESCLEROPROTEINAS
PROTEINAS COMJUGADAS
PROTEINA
NUCLEOPROTEINAS RNA
GRUPO PROSTETICO
Fosfolpidos, colesterol, lpidos neutros
Hexosamina, galactosa, manosa, c. silico Fosfato esterificado a restos de serina Flavn nuceltido Fe (OH)3 Fe y Cu Zn
EJEMPLOS
Ribosomas
LIPOPROTEINAS
GLUCOPROTEINAS FOSFOPROTEINAS FLAVOPROTEINAS METALOPROTEINAS
- Lipoproteinas
-Globulinas Casena, Vitelina Succinato Dhasa D-aminocido oxidasa Citocromo oxidasa Alcohol deshidrogenasa 84
CLASIFICACION DE ACUERDO CON SU FUNCION

Tipos y ejemplos
Enzimas Hexocinasa Lactato Deshidrogenasa Ribonucleasa Tripsina Hormonas Fosforila a la glucosa Deshidrogena al lactato Cataliza la hidrlisis del c. ribonucleico Hidroliza algunos pptidos
Localizacin y funcin
Horm. adrenocorticotropa
Hormona del crecimiento Insulina Protenas reguladoras Calmodulina Troponina C Protenas de reserva Casena Ferritina Ovoalbmina
Regula la sntesis de corticosteroides

Estimula el crecimiento de huesos Regula el metabolismo de la glucosa Modulador intracelular fijador de calcio Fijador de calcio que regula la contraccin en el msculo Protena de la leche Almacenamiento de hierro en bazo Protena de la clara de huevo
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Tipos y ejemplos
Protenas transportadoras Albmina srica Beta-lipoprotena Hemoglobina Mioglobina Protenas contrctiles Actina Dinena Miosina Anticuerpos Fibringeno Trombina Protenas estructurales Colgeno Elastina
Localizacin y funcin
Transporta cidos grasos en la sangre Transporte de lpidos en sangre Transporte de O2 en la sangre. Transporte de O2 en msculo Filamentos mviles de las miofibrillas Cilios y flagelos Filamentos estticos de las miofibrillas Forman complejos con las protenas extraas Precursor de la fibrina en la coagulac. sangunea Componente del mecanismo de coagulacin Tj. conectivo fibroso (tendones, hueso y cartlago) Tejido conectivo elstico (ligamentos)
Protenas relacionadas con la inmunidad y la defensa
a- Queratina
Piel, plumas, uas y pezuas
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HOLOPROTENAS
Globulares: Ms complejas que las fibrosas.
Forman estructuras compactas, casi esfricas, solubles en agua o disolventes polares. Son responsables de la actividad celular
1. Prolaminas: Zena (maza), gliadina (trigo), hordena (cebada) 2. Gluteninas: Glutenina (trigo), orizanina (arroz). 3. Albminas: Seroalbmina (sangre), ovoalbmina (huevo), lactoalbmina (leche) 4. Hormonas: Insulina, HMG, prolactina, tirotropina 5. Enzimas: Hidrolasas, Oxidasas, Ligasas, Liasas, Transferasas .
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HOLOPROTENAS
Ms simples que las globulares. Forman estructuras alargadas, ordenadas en una Fibrosas: sola dimensin, formando haces paralelos. Son responsables de funciones estructurales y protectoras
1. Colgenos: en tejidos conjuntivos, cartilaginosos 2. Queratinas: En formaciones epidrmicas: pelos, uas, plumas, cuernos. 3. Elastinas: En tendones y vasos sanguneos 4. Fibronas: En hilos de seda, (araas, insectos)
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HETEROPROTENAS
1. Glucoprotenas: Ribonucleasa mucoprotenas, anticuerpos, hormona luteinizante. 2. Lipoprotenas: De alta, baja y muy baja densidad, que transportan lpidos en la sangre. 3. Nucleoprotenas: Nucleosomas de la cromatina, ribosomas, histonas y protaminas de eucariotas. 4. Cromoprotenas: Pueden ser de dos tipos: a) Porfirnicas: Hemoglobina, mioglobina que transportan oxgeno, citocromos, que transportan electrones b) No Profirnicas: Como la hemocianina (pigmento respiratorio de crustceos y moluscos, de color azul y que contiene cobre). 5. Fosfoprotenas: Tienen PO4H3 en el grupo prosttico. La casena de la leche.
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FUNCIONES Y EJEMPLOS DE PROTENAS:

1. Estructural 2. Enzimtica
3. Hormonal
4. Defensiva 5. Transporte 6. Reserva 7. Funcin homeosttica 8. Anticongelante 9. Actividad contrctil
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Estructural
Es una de las funciones ms caractersticas:
Algunas glucoprotenas forman parte de las membranas celulares.

Intervienen en el transporte selectivo de iones (bomba de Na-K). Otras protenas forman el citoesqueleto de las clulas, las fibras del huso, de los cilios y flagelos. Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas eucariotas. El colgeno, que mantiene unidos los tejidos animales y forma los tendones y la matriz de los huesos y cartlagos. La elastina, en el tejido conjuntivo elstico (ligamentos paredes de vasos sanguneos). La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte de pelos, uas, escamas de reptiles, plumas, etc. La fibrona, que forma la seda y las telas de araas. Es una disolucin 91 viscosa que solidifica rpidamente al contacto con el aire.
Enzimtica
Es la funcin ms importante. Las enzimas son las protenas ms numerosas y especializadas y actan como biocatalizadores de las reacciones que constituyen el metabolismo celular. Se diferencian de los catalizadores no biolgicos porque las enzimas son especficas de la reaccin que catalizan y de los sustratos que intervienen en ellas.
Hormonal
Insulina y glucagn. Hormona del crecimiento segregada por la hipfisis. Calcitonina.
Defensiva
Inmunoglobulina, trombina fibringeno Blgo. Dr.yJos Gonzlez Cabeza
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Transporte
Adems de las protenas transportadoras de las membranas, existen otras extracelulares que transportan sustancias a lugares diferentes del organismo. Hemoglobina, la hemocianina y la mioglobina del msculo estriado. Los citocromos transportan electrones en la cadena respiratoria (mitocondrias) y en la fase luminosa de la fotosntesis (cloroplastos). La seroalbmina transporta cidos grasos, frmacos y productos txicos por la sangre. Las lipoprotenas transportan el colesterol y los triacilglicridos por la sangre.
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Reserva
En general, las protenas no se utilizan para la obtencin de energa. No obstante, algunas como la ovoalbmina de la clara de huevo, la casena de la leche o la gliadina de la semilla de trigo, son utilizadas por el embrin en desarrollo como nutrientes.
Funcin homeosttica
Las protenas intracelulares y del medio interno intervienen en el mantenimiento del equilibrio osmtico en coordinacin con los tampones. 94
Funcin contrctil
El movimiento y la locomocin en los organismos unicelulares y pluricelulares dependen de las protenas contrctiles: la dinena, en cilios y flagelos, la actina y miosina, responsables de la contraccin muscular.
Anticongelante
Presentes en el citoplasma de ciertos peces antrticos.
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El plegamiento de las protenas in vivo requiere la ayuda de dos tipos de protenas especiales: Las chaperonas moleculares (protenas Hsp 70) se fijan a los poliptidos nacientes que emergen de los ribosomas e impiden su plegamiento errneo. Las chaperoninas, cubren las protenas parcialmente plegadas o mal plegadas en una cavidad semejante a un barril, y le proporcionan tiempo adicional para que alcancen un plegamiento correcto.
PLEGAMIENTO, MODIFICACION Y DEGRADACION DE LAS PROTEINAS

Protena plegada Chaperonas Polipptido Completo liberado
muchas gracias.
Blgo. Dr. Jos Gonzlez Cabeza gonzalezbiotec@hotmail.com www.gonzalezcabeza.com
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Las alteraciones de las protenas pueden ser de dos categoras: modificacin qumica y procesamiento. La modificacin qumica incluye la unin de un grupo qumico a los grupos terminales amino o carboxilo, o a los grupos reactivos de las cadenas laterales de los residuos internos
Modificacin Fosforilacin Glicosilacin Metilacin Hidroxilacin Prenilacin Palmitoilacin Miristoilacin Sitio Target Ser, Tre, Tri Asn, Ser, Tre Arg, Lis, His, Glu Pro, Lis, Asn, Asp Cis Cis N-terminal
OH O C CH NH 2 H2 C H2 C H2 C H2 C NH 2 O
Proceso celular Sealizacin activacin Actividad proteica Reparacin proteica, quimiotaxis Estructura del colgeno Sealizacin, oncogenesis Asociacin a membrana Asociacin a membrana
OH C CH NH 2 H2 C H2 C H2 C H2 C H N C
Ej. Acetilacin de lisina
El procesamiento incluye eliminacin de segmentos peptdicos y suele ser irreversible La degradacin de protenas puede realizarse por vas extra e intracelulares. La principal va extracelular es el sistema de proteasas digestivas, que en el intestino degradan las protenas ingeridas a polipptidos Ej. exopeptidasas. Las clulas poseen varas vas proteolticas intracelulares para degradar protenas mal plegadas o desnaturalizadas o protenas normales cuya concentracin debe disminuir. Una de las principales vas intracelulares es la degradacin por enzimas lisosomales. Los mecanismos citoslicos para la degradacin de protenas involucra que ciertas secuencias internas marquen las protenas del citosol para el agregado de ubiquitina y la posterior protelisis dentro de un proteosoma.
IMPORTANCIA DE LAS PROTEINAS

1. 2. 2. 3. Energtica: 4 kcal/g Funcin estructural o plstica, no reemplazable por otros principios de la dieta. Las miles de protenas presentes en el cuerpo humano realizan diversas funciones (estructurales, contrctiles y mviles, enzimas, etc. Las hormonas importantes son pptidos, y pueden emplearse para corregir los estados de deficiencias correspondientes (ej. administracin de insulina a pacientes con diabetes mellitus). Cambios en la estructura secundaria-terciaria, son responsables de enfermedades importantes, como la enferm. de Creutzfeldt-Jakob y la encefalopata espongiforme bovina, cada una caracterizada por cambios neurolgicos patolgicos, que se traducen en la deposicin, en las fibrillas amiloides, de protenas insolubles.
4.
PURIFICACION Y DETECCION DE PROTEINAS

Es posible aislar protenas sobre la base de diferencias de las propiedades fsicas y qumicas.
Las tcnicas ms comunes para purificar y analizar protenas son la centrifugacin, la electroforesis y la cromatografa.
* La centrifugacin separa las protenas sobre la base de la velocidad de sedimentacin, que depende de la masa y de la forma.
La cromatografa lquida separa las protenas sobre la base de la velocidad de desplazamiento a trves de una columna en la que hay perlas esfricas empaquetadas. Las protenas que difieren en masa se separan en columnas de filtracin en gel; las que difieren en carga, en columnas de intercambio inico y las que difieren en las propiedades de fijacin del ligando, en columna de afinidad.
La electroforesis en gel separa las protenas sobre la base de la velocidad del desplazamiento ante la aplicacin de un campo elctrico. La electroforesis en gel de poliacrilamida puede separar cadenas polipeptdicas que difieren en un 10% en el PM, o incluso menos.

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(a) Eritrocito normal

(b) Clula falciforme

Hemoglobina de clula falciforme

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