Tema 4 Ácidos Nucleicos

BLOQUE II: NCLEO E INFORMACIN GENTICA
TEMA 4
CIDOS NUCLEICOS
INTRODUCCIN A LA BIOLOGA CELULAR (ALBERTS) Captulo 5 DNA Y CROMOSOMAS
METABOLISMO DEL ADN
UNIDAD BSICA: NUCLETIDO
BASE
FOSFATO
AZCAR
Base + azcar : NUCLESIDO
Base + azcar + Fosfato: NUCLETIDO
GRUPO FOSFATO
MONONUCLETIDO POLINUCLETIDO
- 0
NH2
-0
0=P -
-En mononucletidos el grupo fosfato est esterificando el C5 del azcar Enlace fosfoester
-En polinucletidos, es a travs del grupo fosfato por donde se establece la unin entre dos nucletidos sucesivos. Concretamente el fosfato del C5 del azcar se une con el OH- del C3 del azcar siguiente Enlace fosfodiester
Biologa molecular de la clula, quinta edicin ( Garland Science 2008 y Ediciones Omega 2010)
- 0
AZCAR
El azcar constituyente de los cidos nucleicos es una pentosa en forma de beta furanosa
AZCAR
H
RIBOSA ARN DESOXIRIBOSA ADN
AZCAR
El anillo de pentosa no es plano, presenta distintas conformaciones: -C2 endo- C2 y C5 se encuentran en el mismo plano. - C3 endo- C3 y C5 se encuentran en el mismo plano.
BASE NITROGENADA
BASE NITROGENADA
ESTRUCTURA DEL ADN

Estructura primaria: est definida por la secuencia de nucletidos (dado por los enlaces fosfodiester).
Estructura secundaria: viene definida por la disposicin de unos nucletidos con respecto a otros. En 1953 Watson y Crick postularon un modelo para la estructura del ADN, que tena en cuenta los datos obtenidos mediante el anlisis de difraccin de rayos X. En este modelo postulan:
1- las cadenas que forman el ADN se disponen en forma de doble hlice dextrgira. Es doble porque es ms estable que la sencilla, ya que est estabilizada mediante puentes de hidrgeno cooperativos y otras fuerzas hidrofbicas. Y es una hlice porque la estructrua de la cadena (azcar-fosfodiester) favorece esta conformacin.
ESTRUCTURA DEL ADN

1. Doble hlice dextrgira
ESTRUCTURA DEL ADN
2. Datos de la doble hlice:

Mide 20 A de grosor Cada vuelta de hlice mide 36 A y contiene 10 pares de bases, siendo la distancia entre las bases de 3.4 A
ESTRUCTURA DEL ADN
3. Las bases nitrogenadas quedan hacia el interior (parte apolar o hidrfoba de la cadena), mientras que los fosfatos y el azcar (desoxiribosa) quedan hacia el exterior (parte polar o hidrfila)
ESTRUCTURA DEL ADN
4. Las bases nitrogenadas de una hebra se unen con las de la otra hebra. Esta unin entre bases es a travs de puentes de hidrgeno cooperativos intercatenarios: 2 entre adenina-timina y 3 entre citosina-guanina. 5. Las cadenas son complementarias y antiparalelas (5-3 y 3-5) conteniendo por tanto distinta secuencia y composicin.
ESTRUCTURA DEL ADN
ESTRUCTURA DEL ADN
5. Las cadenas son complementarias y antiparalelas (5-3 y 3-5) conteniendo por tanto distinta secuencia y composicin.
6. Las cadenas no estn diametralmente opuestas entre si, lo que hace, que en cada vuelta de hlice se aprecien dos surcos: -surco menor: punto de contacto con las histonas -surco mayor: punto de contacto con protenas reguladoras
ESTRUCTURA DEL ADN
ESTRUCTURA DEL ADN
En funcin de la estructura secundaria o tridimensional que adopte, podemos hablar de 3tipos de ADN: -DNA tipo B: es la forma predominante y la ms estable (doble hlice dextrgira).
ESTRUCTURA DEL ADN
-DNA tipo A: es muy parecido al B, ya que tambin es una doble hlice dextrgira, pero es ms ancho. Presenta 11pb por vuelta,por lo que no se aprecia la aparicin de dos surcos. Esta conformacin es tpica de los ARN bicatenarios y de los hbridos ADN-ARN
ESTRUCTURA DEL ADN
-DNA tipo Z: es una doble hlice levgira. Es ms estrecha que los otros tipos. Los grupos fosfatos se disponene en zig-zag y la unidad que se repite es un dinucletido. Su funcin es desconocida.
ESTRUCTURA DEL ARN
El ARN es un tipo de cido nucleico intermediario entre el ADN y la sntesis de protenas. A diferencia del ADN: -El ARN est constituido por una sla hebra monocatenario. Esta cadena de nucletidos es mucho ms corta que el ADN. - En cuanto a composicin de bases presenta adenina, guanina, citosina y uracilo (en vez de timina). - En cuanto a estructura el ADN no presenta una estructura secundaria regular.
ESTRUCTURA DEL ARN
Adems de la hebra simple, la cadena de ARN puede formar pares de bases con regiones complementarias. De esta manera a lo largo de la cadena de ARN pueden observarse regiones cortas con apareamiento intramolecular de Bases formndose una doble hlice. Tambin pueden apreciarse bases no apareadas o incorrectamente apareadas dando lugar a protuberancias o bucles internos.
ESTRUCTURA DEL ARN
DESNATURALIZACIN DEL ADN

En los procesos biolgicos en los que participa el ADN, las hebras de la doble hlice se separan. Este fenmeno tambin se puede forzar en el laboratorio: los principales agentes desnaturalizantes usados son el ph o la temperatura. Cada especie de ADN tendr, por tanto, una temperatura de desnaturalizacin o temperatura de fusin (TM), que se define como: -Aquella temperatura con la que se alcanza el punto medio de la transicin de la forma bicaternaria a la monocatenaria. La TM es: -Inversamente proporcional al contenido A/T -Directamente proporcional al contenido G/C

Efecto hipercrmico del ADN En condiciones normales se ha visto que los cidos nucleicos absorben luz a 260nm, lo cual se puede cuantificar. -Se ha observado que el valor de la abosorbancia del ADN nativo o no desnaturalizado es menor que el que correspondera a la suma de las absorbancias de las bases nitrogenadas que lo constituyen. Esto se denomina efecto hipocrmico de los cidos nucleicos. -En contraposicin la desnaturalizacin del ADN provoca un efecto hipercrmico
ESTRUCTURA DEL ADN

Estructura terciaria: est definida por el plegamiento complejo de la cadena de ADN.
Las protenas que se unen al ADN y forman los cromosomas se dividen en dos grupos: - histonas - protenas no histonas La unidad bsica del cromosoma, o el primer nivel de empaquetamiento es el nucleosoma collar de perlas, donde el ADN sera el hilo y las perlas seran un centro de protenas histonas o lo que se denomina partcula central del nucleosoma
ESTRUCTURA DEL ADN
El ADN expuesto entre los nucleosomas se denomina ADN espaciador
ESTRUCTURA DEL ADN

En cuanto a la partcula central del nucleosoma es un complejo formado por 8 protenas histonas. El ADN se enrrolla alrededor del octmero.
Las histonas son protenas pequeas con gran proporcin de aa positivos, lo que facilita la unin al esqueleto de pentosa-fosfato del ADN
ESTRUCTURA DEL ADN
Cada una de las histonas centrales posee una cola de aa en su extremo N-terminal que sobresale de la estructura central. Estas colas, son sometidas a distintas modificaciones qumicas controlando muchos aspectos de la estructura de la cromatina.
ESTRUCTURA DEL ADN
En un segundo nivel de compactacin, los nucleosomas se empaquetan formando fibras de unos 30nm de grosor.
ESTRUCTURA DEL ADN
No se sabe muy bien como ocurre este empaquetamiento, pero se piensa que es provocado por las interacciones establecidas entre las colas de las histonas de los distintos nucleosomas. Otro factor importante en la compactacin es la Histona H1 tambin llamada histona de enlace. Provoca un cambio de sentido en el ADN que sale de la histona lo cual parece ser crucial para este nivel de empaquetamiento.
REGULACIN DE LA ESTRUCTURA CROMOSMICA

1) Complejos de remodelacin de la cromatina: utilizan la energa de la hidrlisis del ATP para cambiar la posicin del ADN enrrollado alrededor de los nucleosomas.
REGULACIN DE LA ESTRUCTURA CROMOSMICA

1) Modificacin qumica de las colas de las histonas: existen enzimas que residen en el ncleo y que pueden aadir grupos acetilo, fosfato o metilo a las colas de las histonas y de esta forma, alterar la compactacin de la fibra. La adicin de estos grupos tambin puede alterar la capacidad de las histonas de unirse a protenas especficas y reclutarlas hacia zonas concretas de la cromatina.
OTROS NIVELES DE COMPACTACIN
OTROS NIVELES DE COMPACTACIN

COHESINAS
LOS CROMOSOMAS INTERFSICOS CONTIENEN FORMAS DE CROMATINA TANTO CONDENSADA COMO MS EXTENDIDA
ORGANIZACIN DE LOS GENES EN LOS CROMOSOMAS

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METABOLISMO DEL ADN

UNIDAD BSICA: NUCLETIDO

Base + azcar + Fosfato: NUCLETIDO

ESTRUCTURA DEL ADN

ESTRUCTURA DEL ADN

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2. Datos de la doble hlice:

ESTRUCTURA DEL ADN

ESTRUCTURA DEL ADN

ESTRUCTURA DEL ADN

ESTRUCTURA DEL ADN

ESTRUCTURA DEL ADN

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ESTRUCTURA DEL ADN

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ESTRUCTURA DEL ARN

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DESNATURALIZACIN DEL ADN

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ESTRUCTURA DEL ADN

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El ADN expuesto entre los nucleosomas se denomina ADN espaciador

ESTRUCTURA DEL ADN

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REGULACIN DE LA ESTRUCTURA CROMOSMICA

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OTROS NIVELES DE COMPACTACIN

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