Metaboloma

Equipo 6:
Marisol Bauelos Arellano
Miguel ngel Rubio Snchez
Jos Emmanuel Olivarria Daz
Jos Nabor Haro Gonzales

Definicin
Es el conjunto dinmico de molculas y
elementos qumicos presentes en un organismo
vivo, sean sintetizados de nuevo por el propio
organismo o incorporados desde el exterior.
El metaboloma refleja el estado metablico de un
sistema vivo y se ve influido tanto por factores
internos como el estado hormonal del individuo o
la hora de da como por factores externos. El
metaboloma es algo totalmente cambiante.

 La informacin est codificada en el ADN se transcribe a

continuacin, en una molcula de ARNm.Durante el proceso de
traduccin, la molcula de ARNm se traduce en una protena que
cataliza una o ms reacciones dentro y fuera de la clula y por lo
tanto es responsable de la transformacin de molculas qumicas
pequeas, metabolitos.

 Estos metabolitos regulan la actividad de las protenas

implicadas en los procesos de transcripcin y traduccin. El
nivel de metabolitos es una informacin de la funcin celular
de cualquier cambio ambiental y/o gentico e incluso es
capaz de caracterizar las mutaciones silenciosas. Por lo tanto,
la identificacin del nivel de metabolitos es importante en la
determinacin de la funcin del gen.

 La mejora de las tcnicas de medicin

de los distintos metabolitos permitir
utilizar el metaboloma como
herramienta diagnstica y de ayuda a la
medicina personalizada.

Metabolomica
La metabolmica es el estudio y
comparacin de los metabolomas, es
decir, la coleccin de todos los
metabolitos (molculas de bajo peso
molecular) presentes en una clula,
tejido u organismo en un momento
dado.

 El anlisis del metaboloma humano permite

describir el estado del organismo haciendo
posible el estudio de respuestas celulares,
mecanismos de defensa y mecanismos de
homeostasis.
Dentro del proyecto metaboloma humano se
han catalogado 2.500 metabolitos, 1200
drogas y 3500 componentes de alimentos
como principales componentes del
metaboloma humano.

 En 2007, los
cientficos lograron
completar el primer
borrador del
metaboloma
humano.

Metabolitos

2500

Drogas

1200

Componentes
alimenticios

3500

Diferencias entre metabolmica y

metabonmica
La metabolmica

La metabonmica

Cataloga y cuantifica a
las molculas pequeas
que se encuentran en
los sistemas biolgicos

Estudia cmo cambian

los perfiles metablicos
como respuesta a
estreses, tales como
enfermedades, txicos o
cambios en la dieta.

Aplicaciones
Realizar estudios toxicolgicos, ya que se podra
estudiar el metaboloma de la orina y otros fluidos
corporales paradetectar los cambios fisiolgicos
causados por la exposicin a un posible txico.
Estudiar la funcin de los genes, a travs de la
mutacin, delecin o insercin de los mismos.
Correlacionar los perfiles de metabolitos de fluidos y
rganos con patologas, constitucin gentica y
dietas.

Metabolitos
Los Metabilitos son los productos intermedios
de las reacciones metablicas catalizadas por
las diversas enzimas que ocurren
naturalmente dentro de las clulas. Este
trmino se utiliza generalmente para describir
las pequeas molculas, aunque una
aplicacin ms amplia se practique a menudo.

Metabolitos
Unmetabolitoes
cualquiermolculautilizada, o producida
durante elmetabolismo. As, dada laruta
metablica:
A B C D E
A, B, C, D, E son los metabolitos; el primer
metabolito de la ruta (A) suele
denominarsesustrato, el ltimo (E)productoy
el resto (B, C, D) metabolitos intermediarios.

Caracteristicas
Los metabolitos son molculas de tamao pequeo que
proceden de las reacciones bioqumicas que se producen en los
seres vivos y que llamamos metabolismo.
Aunque los metabolitos forman parte del crecimiento y
desarrollo normales de los organismos vivos, muchas veces son
indicadores de enfermedades y disfunciones.

Clasificacion
Dos tipos primarios y secundarios
El primero se refiere aquellos como los
cidoscarboxilicos, alfa-aminocidos, carbohidratos,
grasas, protenas y cidos nucleicos implicados en los
procesos vitales.
Los metabilitos Primarios son sintetizados por la clula
porque son imprescindibles para su incremento. Los
representantes Importantes son aminocidos,
alcoholes, vitaminas (B2 y B12), polioles, cidos
orgnicos, as como nucletidos

Metabolitos secundarios
Los

metabolitos secundarios son, en principio, no

esenciales para la vida pero contribuyen
definitivamente a la adaptacin de las especies y su
supervivencia.

No obstante, no hay una lnea divisoria clara entre

metabolitos bioqumicos primarios y metabolitos
secundarios.

 Los metabilitos secundarios son las pastas

producidas por un organismo que no se requieren
para los procesos metablicos primarios, aunque
puedan tener funciones ecolgicas y otras
importantes. Incluyen las drogas, las fragancias,
sabor, el tinte, los pigmentos, los pesticidas y los
aditivos alimenticios con aplicaciones en
agricultura, industria y productos farmacuticos.

Mtodos de anlisis
En aquellos casos en los que se conozca el
nmero y tipo de metabolitos de inters, se
puede realizar una aproximacin dirigida. Por
el contrario, en los casos en los que no se
tenga informacin previa de los metabolitos
que puedan estar implicados en un proceso
biolgico/bioqumico en concreto, se llevan
acabo aproximaciones No-dirigidas.

Aproximacin dirigida
El hecho de conocer de antemano los metabolitos de
inters es de gran ayuda a la hora de escoger el mejor
mtodo para su deteccin, ya que desde un inicio
permite optimizar tanto el mtodo de extraccin como
la tcnica analtica a utilizar para su medida.
Dependiendo del tipo y concentracin de los
metabolitos de inters, una simple medida directa por
RMN puede ser suficiente para detectar y cuantificar
de manera prcticamente absoluta los metabolitos
mayoritarios presentes en la muestra

Ejemplos de anlisis metabolmico por espectroscopa RMN de

componentes puros y fluidos biolgicos.

Aproximacin No-Dirigida
En esta aproximacin se pretende determinar
simultneamente tantos metabolitos como sea
posible para obtener una visin global del problema
de inters . En este caso no se parte de ninguna
informacin previa sobre qu metabolitos pueden
estar alterados, lo cual implica que para obtener la
informacin necesaria se procede de manera
completamente diferente a los estudios dirigidos de
metabolmica.

El primer paso que se realiza en la extraccin de una muestra es una

homogenizacin de la misma y una precipitacin de protenas y, en
algunos casos, la medida ya se realiza directamente sobre el sobrenadante
obtenido. En otras situaciones, el sobrenadante se somete a posteriores
tratamientos dependiendo del estudio en concreto. En el caso de LC-MS, el
equipo ms utilizado es un Quadrupolo-Tiempo de Vuelo (Q-TOF) ya que
permite la medida de la masa exacta y la posterior identificacin de los
metabolitos en el mismo instrumento.

Para el caso de RMN, una vez realizada la comparacin entre los grupos se
obtienen los puntos espectrales que varan entre los distintos grupos
mientras que en el caso de LC-MS, lo que se obtiene despus de la
comparacin son las masas as como sus tiempos de retencin.

 Identificacin de metabolitos En RMN una vez obtenidos los

puntos espectrales que difieren entre las distintas condiciones,
se procede a asignar a qu metabolitos pertenecen dichas
seales para su posterior identificacin. En el caso de LC-MS la
identificacin no es tan directa como en RMN. Para LC-MS, una
vez se conocen cules son las masas y los tiempos de retencin
que varan entre los grupos, se vuelve a analizar la muestra para
producir la rotura de dicho compuesto y obtener su patrn de
fragmentacin. A continuacin (y en el mejor de los casos), se
compara dicho patrn de fragmentacin con patrones
disponibles en algunas bases de datos.

En el caso que no aparezca el patrn de fragmentacin, se tiene que

recurrir a mtodos de elucidacin estructural para identificar el
metabolito [1]. En cualquier caso, para la confirmacin inequvoca del
metabolito candidato, se analiza un estndar puro del compuesto y, en
el caso de RMN, tienen que aparecer las mismas seales que en el
espectro de la muestra. En el caso de LC-MS, lo que tiene que coincidir
es el tiempo de retencin del compuesto desconocido con el estndar
as como los fragmentos obtenidos y la relacin de intensidades entre
los mismos

Espectroscopia de luz infrarroja

Esta espectroscopia se fundamenta en la absorcin de
laradiacin IRpor las molculas en vibracin. Una
molcula absorber la energa de un haz de luz
infrarroja cuando dicha energa incidente sea igual a
la necesaria para que se de una transicin vibracional
de la molcula. Es decir, la molcula comienza a
vibrar de una determinada manera gracias a la
energa que se le suministra mediante luz infrarroja.

Identificacin de metabolitos
Espectroscopa IR:
grupos funcionales
E = h
= c/

La espectrometra de masa es
una tcnica diferente ya que
por lo general no involucra
interaccin de la materia con
energa electromagntica.

Espectroscopa RMN:
tomos individuales y su entorno

Todas las sustancias

coloreadas tienen un
sistema de enlaces
conjugados.

La regin que se utiliza del espectro infrarojo es

entre 2500 y 16000 nm

Los enlaces
covalentes se
asemejan a
resortes

En
e
exc sta zo
n
i
vibr tar tra a se c
n
o
a
esti ciona sicion nsigue
e
le
r
n
los amien s de l s
am
e nl a
tos
y
ces
flex olcu
la:
ione
s de

 Todos los enlaces de una molcula van a sufrir transiciones

vibracionales, cada una con una frecuencia determinada y
caracterstica, y cada una de estas transiciones va a
provocar una banda de absorcin.
El espectro IR va a registrar todas estas bandas

 La complejidad de un espectro IR permite su

uso para identificar sustancias ya que se
transforma en una especie de huella digital
del compuesto

Por otra parte la identificacin de ciertas

bandas caractersticas brinda informacin
sobre la presencia de grupos funcionales

RMN (resonancia magn (resonancia magntica

nuclear) tica nuclear)

Esta tcnica espectroscpica se utiliza para estudiar

compuestos con un nmero impar de protones (1H, 13C,
31P, 19F) Estos ncleos poseen una carga neta positiva y
se pueden comportar como imanes, por lo que cuando se
les aplica un campo magntico pueden orientarse en su
misma direccin o en contra.

ORIGEN DEL FENOMENO DE LA RMN

Un protn, como un electrn, posee la propiedad del espin
Tambin como un electrn, un protn tiene dos estados de espin
(nuclear): +1/2 y -1/2
No hay diferencia de energa entre estos dos estados de espin nuclear
Es necesaria tener una idea de la estructura del compuesto
Es una tecnologa muy cara.

 Un ncleo con espin, da lugar a un

pequeo campo magntico, que se
representa por un vector
denominado Momento Magntico

 En presencia de un Campo Magntico externo Ho, los

dos estados de espin nuclear dejan de tener la misma
energa
El estado en el que el Momento Magntico Nuclear se
almea con el campo externo es menor en energa que
el estado en el que se opone al campo aplicado