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Esame scritto
Dipartimento di Biologia
Unità di Biochimica
Materiale didattico reperibile su:
Via S.Zeno, 51
E-learning-MOODLE
Tel: 0502211450-458
E-mail: mcamici@biologia.unipi.it
marcella.camici@unipi.it
Ricevimento: su appuntamento
LAUREA IN CHIMICA E CHIMICA PER L’INDUSTRIA E L’AMBIENTE
AA 2017– 2018
CORSO DI BIOCHIMICA (6CFU)
introduzione al corso
1) Considerazioni generali su molecole d’interesse biologico
2) Le membrane biologiche e i meccanismi di trasporto cellulare
3) Elementi di struttura cellulare
4) Le proteine:
elementi strutturali
struttura e funzione
5) Gli enzimi:
la catalisi enzimatica
meccanismo d’azione
la cinetica enzimatica
la regolazione degli enzimi
IV / 2017
VII / 2012
1) Scrivere la formula di struttura dei seguenti composti e, ad eccezione dell’esapeptide, indicare per ciascuno
di essi almeno un ruolo nel metabolismo:
2 )Fenomeni di “cooperatività apparente” e di “amplificazione del segnale”: definizione, cause, significato, e loro
rilevanza nei meccanismi di regolazione a cascata.
3) Struttura di tipo secondario delle proteine: definizione, forze e fattori che lo determinano e lo condizionano.
4) Descrivere il meccanismo d’azione delle proteasi a serina quale esempio di catalisi nucleofila covalente
discutendo la concertazione che nello specifico si realizza tra gruppi funzionali di residui amminoacidici che
assistono alla catalisi.
6) La struttura del glicogeno, le reazioni che portano alla sua sintesi a partire dal glucosio e il meccanismo di
controllo della sua omeostasi.
7) Il processo di “attivazione” degli amminoacidi ed il meccanismo che permette il loro corretto inserimento nella
biosintesi delle proteine.
9) L’azione concertata della concentrazione idrogenionica e della CO2 nella regolazione del trasporto
dell’ossigeno dai polmoni ai tessuti.
10) Ricavare l’equazione che descrive il modello d’inibizione enzimatica di tipo misto e discutere l’effetto della
stabilità dei complessi che l’inibitore è in grado di formare sul valore dei parametri cinetici della reazione.
le molecole della vita
Fatty acids
lipids
La gerarchia nell’organizzazione molecolare
delle cellule
• Organelli nucleo, mitocondri, cloroplasti
e tra un gruppo
carbonilico ed
una ammina?
più gruppi funzionali sulla stessa molecola: i monosaccaridi
I polisaccaridi
tirosina
fosfocolina
fosfolipide
le molecole della vita
le molecole della vita
Androgeni e estrogeni:
testosterone e β-estradiolo,
sviluppo e funzione sessuale
(gonadi maschili e femminili e
placenta)
le molecole della vita
le basi azotate 1
2
6
3
5
4
7
9
8
pirimidine 4
3 5
2 16
Uracile (U)
• Definizione di nucleotide
γ β α
La bio-energetica è associabile al
consumo e alla sintesi di ATP
…..ma come
facciamo ad usare
l’energia di una
molecola?
Sintesi di una ammide ?
!
La sintesi della glutammina
…..potremmo
attivare l’acido
glutammico
H
_
H
+
H-N-H
H Asp50
_
molecole ad “alta” e “bassa” energia
le molecole della vita
H H
O
O H H O
H H O
C O OH E
C C
NH2
NH2 + C + H+
N+
:
CH3 N
CH3
R R
NAD+ NADH
O2
La gliceraldeide 3 fosfato deidrogenasi
-O O-
P
H++
NADH ++ H
NADH
OO O-
O H O O
NAD++
NAD
CC E
C
E
H C OH HH CC OH
OH
O- CH
CH2 2 OO
--
OO
C H2 O H2O
HO O- PP
P
-O P
--OO OO
O
-O O
Fosforilazione a livello
+
ADP
+
ATP
di substrato
le molecole della vita
il coenzima A (CoASH)
La lista delle molecole della vita continua …
Vit A
…… continua
Vit B8 biotina
Vit B3
Vit C
…… continua