CIDOS NUCLEICOS

MOLCULAS DE HERENCIA PASADO, PRESENTE Y FUTURO

NICAS SUSTANCIAS BIOLGICAS QUE POSEEN LA PROPIEDAD DE LA AUTODUPLICACIN.

SON DEPOSITARIOS Y TRANSMISORES DE LA INFORMACIN GENTICA DE CADA CLULA, TEJIDO Y ORGANISMO

LA CONSTRUCCIN Y EL DESARROLLO DE CADA ORGANISMO ESTA CODIFICADO EN ESTAS MOLCULAS

CIDOS NUCLEICOS
Existen dos tipos de cidos nucleicos Entre estos dos tipos hay similitudes y diferencias.

ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO (ADN DNA) ACIDO RIBONUCLEICO (ARN RNA)

IMPORTANCIA

Es el almacenamiento y la transmisin de la informacin gentica

GENOMA
Contenido total de la informacin Segmentos que se transcriben

GEN

CIDOS NUCLEICOS

Cadenas polimricas Formadas por unidades monomricas llamadas nucletidos Unidas por enlaces covalentes Los nucletidos estn constituidos de tres componentes orgnicos.

Grupo fosfato Azcar (Ribosa o Desoxirribosa) Base nitrogenada

Purina

Adenina A Guanina G Citosina C Timina T Uracilo U

Pirimidina

CIDOS NUCLEICOS
Fosfato 2 desoxirribosa 5C Purinas: adenina y guanina

ADN cidos Nucleicos ARN

Pirimidinas: citosina y timina Bicatenario

Fosfato Ribosa 5C Purinas: adenina y guanina Pirimidinas: citosina y uracilo Monocatenario

GRUPO FOSFATO
Es un cido fuerte Tiene un valor aproximado de un pKa aprox 1 Debido a esto se les denomina cidos nucleicos. A pH fisiolgico cada residuo de una molcula de ADN ARN lleva una carga negativa.

RIBOSA Y DESOXIRRIBOSA
La diferencia entre ambos radica nicamente en el grupo hidroxilo del carbono 2 de la ribosa. La conexin entre los sucesivos nucletidos se realiza mediante un residuo de FOSFATO unido al hidroxilo del carbono 5 del azcar del nucletido 1, al hidroxilo 3del azcar del nucletido 2. Este enlace se denomina FOSFODISTER

RNA

DNA

RIBOSA

2 DESOXIRIBOSA

RIBOSA Y DESOXIRRIBOSA

A esta unin de los nucletidos por medio del enlace fosfodister se le dice que es la estructura primaria de los cidos nucleicos

BASES NITROGENADAS

Cada monmero de la cadena contiene una base heterocclica que siempre va unida al C 1 del azcar. Existen dos tipos de estas bases, Purinas y Pirimidinas. Las purinas contienen 2 anillos heterocclicos y las pirimidinas 1 anillo Purinas: Adenina (A) y Guanina (G) Pirimidinas: Citosina (C), Timina (T) y Uracilo (U) Algunas de estas bases contienen modificaciones qumicas posteriores.

BASES NITROGENADAS
Las uniones en las purinas la unin se realiza con el nitrgeno 9 y el C 1 del azcar. En las pirimidinas es el nitrgeno 1 con el C 1 del azcar. Estos enlaces se denominan GLUCOSDICOS.

Tautomerizacin

NUCLEOSIDOS Molculas de ribosa o de desoxirribosa con bases puricas o pirimidinicas unidas a sus carbonos 1. En las purinas, la unin se realiza con el nitrgeno 9 y en las pirimidinicas con el nitrgeno 1.

NUCLEOTIDOS
Cada nucletido puede considerarse el derivado 5;monofosforilado de un azcar-base

NUCLETIDOS
Son los monmeros de los cidos nucleicos, compuestos por el grupo fosfato, el azcar y la base nitrogenada. Cada nucletido puede considerarse derivado del 5monofosforilado de un aducto azcar-base denominado NUCLESIDO. Los polmeros grandes se denominan polinucletidos, los polmeros pequeos se denominan oligonucletidos.

PROPIEDADES DE LOS NUCLETIDOS

Son cidos bastante fuertes. Son capaces de tautomerizarse G, T y U se tautomerizan a enol y A y C a imino Absorben intensamente la luz en la regin del espectro del ultravioleta cercano. Dependiente del pH y se utiliza en la cuantificacin. Excesos de luz ultravioleta causa daos qumicos a los cidos nucleicos.

CUANTIFICACIN DE LOS CIDOS NUCLEICOS

Se realiza por medio de un haz de luz ultravioleta. Donde se mide la absorbancia o transmitancia de la sustancia. Se realiza generalmente en un espectrofotmetro a la longitud de onda especifica para la solucin.

Longitud de onda

Gel de agarosa con muestras de ADN teidas con bromuro de etidio

M
m1m2m3m4m5m6 M

ESTABILIDAD Y FORMACIN DEL ENLACE FOSFODISTER

Un polinucletido podra generarse a partir de sus monmeros nucletidos mediante la eliminacin de una molcula de agua entre cada par de monmeros. La Hidrlisis de los polinucletidos a nucletidos es un proceso favorecido termodinmicamente Hidrlisis lenta Funcin til para deposito de informacin gentica

ESTABILIDAD Y FORMACIN DEL ENLACE FOSFODISTER

La catlisis acida se da rpidamente rompiendo el enlace glucosdico. Nucleasas hidrolizan el enlace fosfodister Si la reaccin de sntesis no es favorable, entonces existe otro proceso mas fcil de sntesis. Para la sntesis se necesitan los nuclesido trifosfatados. (nucletidos) ATP, GTP, CTP, UTP dATP, dGTP, dCTP, dTTP

ESTRUCTURA PRIMARIA SECUENCIA

Posee sentido o direccionalidad 5 a 3. El extremo 5 esta fosfatado y el extremo 3 esta hidroxilado Posee individualidad La informacin se codifica en un lenguaje de 4 letras ATCG ADN AUCG ARN

ACGTT

ESTRUCTURA PRIMARIA SECUENCIA

La importancia de la estructura primaria o secuencia es que almacena la informacin gentica Un gen es una secuencia concreta de ADN

Composicin de bases nucleotdicas de los ADN de varios organismos.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
UN POCO DE HISTORIA NO HACE DAO Friedrich Miescher en 1869 asla compuestos ricos en fosfatos llamados nuclenas ( del ncleo de las clulas del salmn). Albrecht Kossel en 1910 se le da el premio Nobel por descubrir que existen los cidos nucleicos. Se sospecha que el ADN es el material gentico. Erwin Chargaff realizo estudios sobre la relacin de concentracin de las bases. Se pensaba que estos cidos estaban formados de protenas.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
Despus se descubri que no eran protenas sino molculas mas complejas Entre 1944 y 1952 se descubri que el ADN era el material gentico. En 1944 Avery, MacLeod y McCarty descubrieron que el ADN de clulas patgenas se poda transferir a clulas no patgenas. Hershey y Chase descubrieron la infeccin de E. coli x un virus (bacterifago).

ESTRUCTURA SECUNDARIA

En 1953 Watson y Crick propusieron la estructura del ADN Por medio de la tcnica de difraccin de rayos X (Rosalind Franklin) Estructura tridimensional repetitiva regular, lo que se denomina Estructura secundaria

ESTRUCTURA SECUNDARIA

En la figura se observa que como el espaciamiento de la lnea de capa era una dcima parte de la repeticin del patrn, debera de tener 10 residuos por vuelta. Los datos relativos a la densidad de la fibra sugirieron que deba de haber 2 cadenas de ADN en cada molcula helicoidal. Esta hlice de doble cadena se estabiliza mediante puentes de Hidrogeno entre las bases de las cadenas opuestas, aparendose de una manera concreta.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
La distancia entre la los carbonos 1 de las desoxirribosas es el mismo siempre 1.1 nm Por tanto se tenia siempre un dimetro regular De ah se deduce que las purinas se tenan que aparear con pirimidinas y viceversa, para poder respetar el dimetro.

AT GC

Elementos fundamentales de la estructura de la doble hlice de ADN

Estructura Secundaria

Bases apareadas: A-T y G-C Rotacin de 36 10 pares de bases en cada vuelta Distancia entre las bases de 0.34 nm (elevacin de la hlice) 2 Surcos principal y secundario El esqueleto de fosfato desoxirribosa se encuentran hacia el exterior (hidroflicos) Pares de bases hacia el interior apiladas unas sobre otras en plano perpendicular a eje de la hlice (hidrofbicos) Cadenas en direcciones opuestas Por apareamiento siempre complementarias

Modelo de relleno espacial del ADN

Los

azucares (ribosa y desoxirribosa) unidos por el grupo fosfato forman el esqueleto del cilindro Las bases nitrogenadas estn orientadas hacia la regin central del cilindro formadas por las dos cadenas

ESTRUCTURA SECUNDARIA
La complementariedad de las bases tambin da proteccin a la estructura de los cidos nucleicos por que las bases complementarias se unen por medio de puentes de Hidrogeno
A-T G-C 2 puentes de H 3 puentes de H

ESTRUCTURA SECUNDARIA

Si las cadenas de ADN se separaran y se sintetizaran de nuevo a lo largo de cada una de ellas seguira siendo la misma secuencia, por tanto se obtienen 2 molculas de ADN que serian copia original exacta de la primera. Se le denomina AUTORREPLICACIN No ha escapado a nuestra apreciacin que el apareamiento especifico que proponemos sugiere inmediatamente un posible mecanismo para copiar el material gentico Watson

NATURALEZA SEMICONSERVATIVA DE LA REPLICACIN DEL ADN

El mecanismo de copia del ADN, parte del desenrollamiento de las dos cadenas, y cada una sirve de molde para la nueva molcula.

NATURALEZA SEMICONSERVATIVA DE LA REPLICACIN DEL ADN

La replicacin completa de una molcula producir dos dobles cadenas hijas. A esta replicacin se le llama semiconservativa. Descubierto por Meselson y Stahl

NATURALEZA SEMICONSERVATIVA DE LA REPLICACIN DEL ADN

ESTRUCTURAS ALTERNATIVAS DE LOS CIDOS NUCLEICOS HLICES B Y A Por los patrones de difraccin de Rayos X se logro saber que existe mas de una forma de la hlice. La forma B, se encuentra en condiciones de humedad elevada. La forma A se encuentra en condiciones de humedad baja ( En su mayora de ARN) La mayor parte del ADN se encuentra en la forma B. (in vivo e in vitro)

ESTRUCTURAS ALTERNATIVAS DE LOS CIDOS NUCLEICOS HLICES B Y A Las molculas de ADN-ARN (hibridas) forman hlices A Existe adems la forma Z de la cual se hablara mas adelante.

ESTRUCTURAS ALTERNATIVAS
A
B

Presente en DNA Bases estn prximas al eje de la hlice Surcos principal y menor son distinguibles

Presente en RNA
Bases inclinadas con respecto al eje de la hlice Surcos casi iguales

Formas B y A de los cidos nucleicos

Formas reveladas por cristalografa de rayos X

Molculas de ADN

Existen molculas circulares llamada Plsmidos, no tiene extremos 5 ni 3

ESTRUCTURA TERCIARIA

Es el plegado de orden superior de los elementos de una estructura secundaria regular . Se le llama tambin superenrrollamiento. Superenrrollamiento positivo a la derecha Superenrrollamiento negativo a la izquierda

Molcula de ADN relajada y superenrollada.

ESTRUCTURA TERCIARIA
Las molculas anteriores solo difieren en su topologa. (forma, densidad, espacio, arreglo) A estos se les denomina TOPOISOMEROS Existen las protenas topoisomerasas que son las enzimas que se encargan de este cambio por medio de un corte y nueva unin. Regulando la superhelicoidalidad La topoisomerasa de E.coli se llama DNAgirasa

ESTRUCTURA TERCIARIA

ESTRUCTURA DE LOS POLINUCLETIDOS DE UNA SOLA CADENA

Pueden adoptar varias estructuras que dependen de la secuencia y de las condiciones del medio. A altas temperaturas o con sustancias desnaturalizantes se encontrara como ovillo aleatorio En condiciones parecidas a las de in vivo se encontrara en forma apilada Si tiene regiones de autocomplementariedad se forma una horquilla de doble cadena (tRNA), esto es plegada sobre si misma

Estructura del RNA

Suele tener una nica cadena Tiene uracilo en lugar de timina RNA mensajero, RNA ribosmico y RNA de transferencia

FUNCIONES BIOLGICAS BIOLOGA MOLECULAR

ALMACENAMIENTO DE LA INFORMACIN GENTICA : GENOMA REPLICACIN: ADN a ADN TRANSCRIPCIN: del ADN al ARN TRADUCCIN: del ARN a la PROTENA MANIPULACIN DEL ADN

FUNCIONES BIOLGICAS

ALMACENAMIENTO DE LA INFORMACIN GENTICA: GENOMA

Cada organismo lleva al menos una copia en cada una de sus clulas de toda su informacin gentica llamada genoma Codificada en el ADN, a veces en el ARN En 1977 Maxam y Gilbert disearon un mtodo de secuenciacin. Sanger mejoro la tcnica que se utiliza aun en la actualidad. No todo el genoma se transcribe, solo los fragmentos que codifican proteinas llamadas genes

Gel de secuenciacin

REPLICACIN
Proceso esencial para la continuidad de la vida Pasa la informacin gentica de clula a clula y de organismo a organismo Se construye una copia complementaria de cada una de las cadenas (hijas) El proceso es exacto, puede cometer como mximo un error cada 100,000,000 de pb Los errores provocan mutaciones

REPLICACIN
Es necesaria una gran cantidad de enzimas (batera de enzimas) La enzima principal de este proceso es la DNA polimerasa

TRANSCRIPCIN
La expresin de la informacin gentica se da transcribiendo los genes a molculas de ARN complementarias. Utiliza un copiado de una hebra de DNA molde mediante la RNA polimerasa y ribonucletidos trifosfatados Hay 3 RNA polimerasas principales:

RNA polimerasa I sintetiza el rRNA RNA polimerasa II sintetiza el mRNA RNA polimerasa III sintetiza la tRNA.

TRANSCRIPCIN
1.

2.

3.

El ADN se tiene que abrir para ser copiado La enzima ARN polimerasa coloca los nucletidos para formar ARN (mensajero mRNA, ribosomal rRNA o de transferencia tRNA) Se coloca
1.
2. 3. 4.

adenina por timina guanina por citosina uracilo por adenina citosina por guanina

4.

Se desprende el mARN sale del ncleo para realizar su actividad en el citoplasma

TRANSCRIPCIN

TRADUCCIN

La secuencia de nucletidos del mRNA se traduce en la secuencia de aminocidos de una cadena polipeptdica. Esta traduccin se da o se lee en tripletes llamados Codones La activacin de los aminocidos, es un proceso en el cual las molculas de tRNA se unen a los aminocidos. Estos tRNA trasladan a los aminocidos a los ribosomas ( constituido de protenas y rRNA) donde se esta leyendo el mRNA Sntesis de protenas Necesaria otra batera de protenas y enzimas.

CDIGO GENTICO

TRADUCCIN SNTESIS DE PROTENAS

Se lleva a cabo en cinco pasos 1er paso: el ARNm inicia la interpretacin del mensaje 2do paso: la informacin del ARNm se lee por tripletes (codones) 3er paso: tARN acarrea los aminocidos y los ordena de acuerdo al mARN 4to paso: los aminocidos acarreados y colocados en los ribosomas se unen en enlaces peptdicos 5to paso: cuando se termina la interpretacin, la protena se pliega y se libera

TRADUCCIN

MANIPULACIN DEL ADN

1.
2.

La manipulacin del ADN es la posibilidad de introducir modificaciones genticas en los organismos vivos mediante tcnicas de ADN recombinante. Pueden recuperarse genes o secuencias a partir del genoma completo y clonarse Puede fabricarse un ADN de transporte de genes especficos ( plasmido) para luego producirse en grandes cantidades en otros organismos

MANIPULACIN DEL ADN

3.

4.

5.

Pueden modificarse los ADN clonados y estudiar el producto de sus modificaciones Puede reinsertase genes modificados en los organismos ( terapia gnica) Puede hacerse una combinacin de genes o insertar genes de un organismo en otro y ver los efectos que produce.

DIFERENCIAS Y SIMILITUDES ENTRE ADN Y ARN

ADN
FORMADO POR DOS CADENAS UNIDAS ENTRE ELLAS POR PUENTES DE HIDROGENO LOS NUCLETIDOS CONTIENEN EL AZCAR DESOXIRRIBOSA LAS BASES NITROGENADAS SON ADENINA, TIMINA, GUANINA, CITOSINA

ARN
FORMADO POR UNA SOLA CADENA

LOS NUCLETIDOS CONTIENE AZCAR RIBOSA LLEVA LAS MISMAS SOLO QUE EN LUGAR DE TIMINA LLEVA URACILO

SIEMPRE ESTA EN EL NCLEO

ES DE UN SOLO TIPO PARA UN MISMO ORGANISMO

SE PRODUCE EN EL NCLEO O EN EL NUCLEOLO Y SALE AL CITOPLASMA

HAY TRES TIPOS; RIBOSOMAL, MENSAJERO Y DE TRANSFERENCIA EXISTE UN CUARTO TIPO, EN PRINCIPIOS DE ESTUDIO LLAMADO ARN DE INTERFERENCIA iRNA (RNAi)